MSTRG.159.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.159.1.p2
Unique NameMSTRG.159.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000001_pilon:3186390..3200813+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.159.1.p2 ID=MSTRG.159.1.p2|Name=MSTRG.159.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14424bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:3186390..3200813+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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tattttttttttgccttagGTTAGACCAACCAACAATATTTTTAAGTCCC ATATCATTTCTCTCAATGAACAATActacaatattttgaaaaaactggtg ctcaaatttaattttacgaGTAATTTTCGCTTATCCATATATActttatt cttgaaattttttttcaacattagGAATTCAAAGATGATGCACAGCATGT TTCAACAGTTACCAAGATGTTTATCAGGTATGAGTTTGAACAATAGATCa cttcataaattacgtcacgaacatcacttgcctcgttttgaaatcattgc CAAATGGTCTATTGTTGCGTTAGCTAATTGTTGCgtgaactaattttagc gagaactaattttggcgaaaaaaaaaacttgaaaaaaatggaTTTGGCGA GGCAACAATTTCTTTCATATTGGCAATCTGCACTTTATCGGTGAATAATC TGGACAATTTTTCAAGTAAAATGTTAAATAGTTCAACAAATTACTCTCTA CCTCGAAAGAGATTTTACCTATCATGGcaataaatttgataaaacctTTG CTAaaagtttgtatttttgaaattcctttcAGGTTGAGACCAGATTTGGA GAATGATTTGGTGGCCCTTTGTAAAGGAGTATTGGGGGAGCTTTCTGGGC CAATCAAATCAATGTGCTCCAAGTAATGTATGATAGGTTTCTCTCATCAG ATAATTTTATACAACATATATAAAGGATTTtatgacaatttttttaacga atcatgttccatatatttttatacgttttcgattactttttgttttatgt ttttattttgctccatttttaAAAACCCATCTGATGAATAATCCAATAAA ATCCAGGTGCGAACAAACTAGCAAACGCAACAAAATGTTTCGGGTGTTTA AGTGAAGGTATTGAAACAGATTTAAACAAGTGAATAGCTATTTCCATATG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:3186390..3200813+

>MSTRG.159.1.p2 ID=MSTRG.159.1.p2|Name=MSTRG.159.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1884bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:3186390..3200813+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgaaaaaatactacGGTAAACGAACACCAAGTCTGCCAGTAGAGAAAGA
TGACAGAGTTTATGGTGATGATGACGAAGATTTCAATTCTTACGAATCCA
ACAGCCTCATATCACCAAGAGATAGTTTCCTACGCCAACACGGCTTAAAC
AGCAACTCCAAGGATGACTCAACCATTCACAGACGAGCACCTTACAACAA
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TCGTAGAGTTGTTATTAAGGATTCTACTTATATTTCAAGATTTAATTCGA
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GTTTTAACGGGCAAAATAATAACTTCAACAACAACTATAAACGACCGCGA
TTTGATAATTATGGGGATAAATTTCATTGGAACAAAAATGAGGCTGATAA
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CTGGTGACGGTGACGATGATGATGACAATGGTTCAAGGACGTCAAGTCAT
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TAGATATCATCctacaaaatatgaaaatggtGAGATAAATATTGTCGATA
ATACTGGcaagaaaataataattgaaagaaaatatttatccaaACACGAT
AGAAAACATCATAGGAGCTTTTCTACTGGTTGCCATCGTGATGATCACTA
TAGAAAAcagttcttcttcttcttcaaaacaTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.159MSTRG.159Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.159.1.p2MSTRG.159.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.159.1.p2.exon1MSTRG.159.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.159.1.p2.exon2MSTRG.159.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.159.1.p2.exon3MSTRG.159.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.159.1.p2.exon4MSTRG.159.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000001_pilongenomesc0000001_pilon:3186390..3200813 +