MSTRG.15840.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15840.3.p1
Unique NameMSTRG.15840.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000144_pilon:192268..208771-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
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>MSTRG.15840.3.p1 ID=MSTRG.15840.3.p1|Name=MSTRG.15840.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16504bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000144_pilon:192268..208771- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTAGCTACCGTAGCTTGTCTAATTCCGCCATAGCAACTATAGATGTGGT
CTGCAAGTTAGTTACAGGAAGTTTTAGCTGTATCAAGTCAAAAATGACCA
ATCTTACACCTTTTGGAAAAAAATGGGCTATTGGGCCGATTTGGGCCATT
CCAGAATTTGTCTGTCGTAACAGGGGGCGGACGACACAGGATTTCCGAGG
GCAAAAGTTTTCACCAAAGTTCAAAATTTCCAAGGCGAGAGAAGAAAATG
TATAAATTTCCAAGGTAATTGAATTAAAAAAGGCAAAAAAGAGTGGATTT
TCCGATGCATTTTGCAAAAGTGCATGGATTTTTATCGGAATTTCCGATCA
CCACTGGAAAAGAAAAATTATTTCCGAGGCTAGGAAAAATTTTAAAATGC
ACGTCGTCCGACGGGGGGTAACAAAAATTTTCTGGAATGGCCCTTTAGTA
AATGACATATACCAGACGGTACTAATCAAAAGTTCGATTGTGATCGCAGT
AATCAATAATGATCGATAACAATCGAGGGTGATCAGTAACCACTTATAGA
TTCTATCGGTGATCAAATACTCACTCAACTCAAAATCATGGCATTTTTAC
TGACCATTTTCGATTTGTTCGATCGTTTCGATTACTGTTCGATTACTTTC
AATCACTTTCGATCATATTAAATACCTTCCATTGTGTCGGATATGTTTCC
TGTAGCAAAGCGACGGAATCTGAAACCAAGTTTATCTCGTCCAATAAAAT
ATGAGACTGAGTTTATTTCGTCCAATAAAAACACGCGATTTACGCGCCAA
AACCACTTTCACTTTCTCCGACTAATCAGAATGCGCGATATGGGTTATTT
GAGGAAACCCAGGGCAAGCACACTCAAAATGGCAGGGAAGTACTGAAGGT
GATTCTTATAGCTTCTTTTTGTGGTTTTGTTTTAGGTCAATGTTTTCAGG
GATCGAATTATAAATTTTAGGAGCTTCGCTATTTTTCTGAGTTTAGTATT
TTGCGATGTTGTTTGGAAGAAAATGCGAATTCAATTCATTTCTCTAGAAA
AGCGAAGTAAGAGATTGTAGACAAAGTAAAGTATAGTGAAATAATAGATA
AACGAGTAGATAAAGCAATCAATAAACGAGTGAATAAAGTTGCAAGTTTA
TAAAGCAATAGATAAACGAATGAAGGAAGTAGCGAAGTGGCGAAAATATA
AAGCAATGGATAAACGAATGAAGAAAGTAGCGTAGTGGCGAAAATATAAA
GCAATAGATAAACGAATGAGGAAAGTAGTGAAGTTACCAAGTATATAAAG
TAATAGATAAACGAATAAATAAAGTAGTGAAGTAGCGAGTTAATAAAGCA
TTAGATGAAGGAGTGAATAAAGTAGTGAAGTGGTAAGTAGATAAAGCAAT
AGATAAACAAATGAATAAAGTAGCGAAGTGGCAACACAAGTGTTTCAACC
GGTATTCCAACGAAGCCATATTTTGGTTTGTACAGAAATTTTGCCCGCTC
AAATCATCATAACAAAATGGTCAATCTCACTAAAGCAAAACATTGCGGCC
ACGGCATTTCCCTGGATAAAAATTCTGGTCACGTGACCATCCGTGATTTT
AGACCAATGAAAACGCTTCATTTCCCCGGATTAAAGTTGTGTCTACACTA
ACGCGCGGGAATTTGTTAGAAAAAGAGAGAAAAAACCGGGGGTCAAATTA
AATGTTTCTCCCTTCTTGCGGCAAACATAAAAGACTTTAAGAAGCCATTT
ATTTAAGAAAGGGGTGTTATATCATATATAAATTATGTAAGTAAGTGATA
TTTTAAGTAAGAAGTTCATTAACAATTTTATTTTGAAGTTTGTTTTTAAA
AACAAAACCCCCGTGCTCTATGATAATCTCATTTTCTTAACTTATGGACC
CATTTGGAAGTCTTTGTAATACAGATCATCTGGCAGTGTAGTTGCAGCCT
ATACAAGAATTGGAATCTAAAGTCTGAAGTCGTAACTCCTTGCCAGTGAA
CCCGCAGAGAAATTTTTAGTTGGCAGACACTGACTTTAGGTTGGTTTGGA
AATCGTTTTATTTTGAAATGTAATCTTCACTTTAGATGAATACCTTTATT
TATTTGGATTCATGAAAGGTTCAAGGTTTGTTTACTTTTTATTTCAAATA
ATTTCATTGATTTATTGAGCTGCAATAGCTGATTGAAAAACGAAGATTTT
TGATAGTTATCAGCGTGGGCTTAGCCGCCATTTTGAATTTCGATTTTTTT
TCTCCTGTACTCGGCAATTTAGAGGTTGTTCGTAATACGCGATTTGGCTT
ACGCGTAACACTTGTGGCAAGCACATAAAGTAATAGATAAATGGATGAAT
ACAGTAGCGAAGTGGCAAGTAGATAAAGCAACAGATAAACGAATGAATAA
AGTAGCGAAGTAGCCAGTATATAAAGCAAAAGATAAACGAATGAATAAAG
TAGCGAAGTTACCAAGTAGATAAAGCAATAGATAAAAACGAATGAAGAAA
GTTGCGAGGTAGCAAGTTGATAAAGCAATTAGATTATAAGATTAAAGGAG
TAGCAAAATATATGGTTTCTTATAGTTTTTTAACTTCGCATTTTTTAGTT
AGGAAATCTTTTTGGGTTGCTAAATCTAAAATTCACTTCGCATTTTGCGA
TATATAATTCGAACCCTTGTTTTTGGTTTTTCCAAGGTATCTATGTAATC
AACTGGTTATTGAAGAAATCAATGGTTATCAAAGTTATCGAAAGTAATCA
ATAACAATCAAAGTATATACTCAAACGGTTATCGAGTCTTCGAAGGGTTG
TTAAAAGAAAGTGATTGAAGACTCGCAATTTTTTTGAACTTTTAGTACTC
GAAATTCGATTGTTAATCAATAAATGGTCGTTGGAGTACTTCGATCATTA
TTGATTACTTTGATAATCGAATTTATCGATTAGTACCGTCTGGCATATAT
CAACCGGCAGGCGCTCCAGAAACTTCCGGAGTTTTCCGGAGTAGCTAAAA
AAACACTCTTTTTCTTTCCGGAAAGTTCTGGTGCTTCCGGAGCAAGTGAT
TTTTAAAAGTTCTAAACAACCGTTTAAACATGGTGATGGACTTTGGTCAA
ACATTCTTTGAGGATGATGAGTTTGTCACATTATATTTGAAAGCAAACAC
TGGAACGTTCCGGAGTTCCGGTGCAGACCAATTGCCGAAAATTGTGCTCC
GGAATCTTCTGGTGTTCTGGAGCACAAAAAAAAACGGTATTTTTTGCTCC
AGATGTTTCCGGAGCGCCAAGAGGGTCCTACATATCATTGAAATTGCAAA
CCGGGATTCTTTAGATAGGATAATGTGAGTATCTCCAAAAAATTTCAGAT
CTATATATTTTTTACTTTTTGAAATATTTTAATGAAAGTGTAAAACTATA
GAGGTTAAATCCTCAATTTTAGAGGTGGTTAACAGCATACCACCCCTCAG
TCCAAACCCGAAATCTTTCAATTCCATACTTTTTGATCTTGCTAACATTA
AAATTTGCACTCTACATAAAATTTGGAATCTTTTGGTATATAATTTCTCT
GGTAACCTCATTGAGCCCAAAATCTCAAAATTTAGCCCTCAGCTCATGGA
TTATAGGGTTTTTGCAAAAATGCTGATTTTGAATTATTCACAAGGATAAA
AGGCAAAAATGCTCAAGATTTGCAGAAATTAATCCTACAAAAATTTTAAT
CCACTGGAGGGTACTGGCTGAGGGCATACGTAACGCTGTAGTAATTTGTT
ATCCAATAGACTTTTTGCTAATCAGGATGTCATGATGAATGATTAAAAAC
TCGATGAATGATTAATGACACATTAATGCATAATATTATAAATGTGCACT
AATTTTTTATCATTGTTTTATCATTGATGCTGGAGTTTTAATTATTCAAC
GTGACATTTGACAAATAGAAAAGTGTATTTCTGATTGCTCTTTCTTGGCC
CTAAATTGATCATGAATTGGGAGACGAGTTAGATTAACAAAACAAACAAT
TAGATTAACTGAAATTTTTATCATTGTACCTGATCATACCATAAAATTCT
TGTTTAAAGTTCATCTGCCTGAGTCTAGAGAAATTTCTTTCTTTCTTCCA
GTGTGTCAAGCATGTGCAGAGTATGGTTTTGAGTTGCAAGATCAAACTGA
TGATAATTGGTATTTTTTATATTTTTAACCTCTAGTCAAACATTCACAAG
ATCACATTTTTTTGTCTTTTTTTTACTTCTTGGTATTCAGTCGTTACTAT
AAATTACAATAACAAAATTTGGTATAATCATTTGACTTTTTCAGCCATTT
TATCTGGAAGGCCATTCTGCACAATGATGAACTTGCAGAACTCAAACCAC
ATCAGGTATGAAATTGACTGATTATATTTTTTGCTTTTTTCATTGTTATG
CTATATCAGTAAAATATCCAATTCCCCATTCATTCAGGAATTTTATCTTT
CTTCTGGCCTGTAAAAAAGTTAATTCAAACTGGTGATAGAGGGGGAAAAC
AATTATTTTAGAAAAGATTTTAATGATTTTCTAATGTGGAATTTAACATT
GTCTGGTCAACACTTACTTAGAATAAGAGACCTATTTGACCTAGTAAGTA
ATCCTTCTTAGTTTATAGCACTCTTGCAAATGGAATACTCTATATGCAAC
TTTTTACAAAGATTTTATCCATTAAAAGTCTAAATTAAGTTTATTGTATT
TCGTTTACTAAATTATTATACACTATACAGTAGTCCTAATATTCTTTTTA
TAACAGAAAATCAATAAATTACCAAATGCACAAATTGTCACCCATAAGCA
AAAGCTAGCAAACACATTGAAAAGGTAAAATTCAGTTACACTCTTTTGTT
ACCCATTCATGTTTAGAAAATTTCTTCTTCATTTTTTTTCTCTTTCTTTT
CTAGGGTTCAAAGGCTTACTAAAGATAATTTTGAATTTATACCAAAAAGT
TGGGATATACCTGATGAGTATCCTTTTATATTATATAGTTCTTAATTGAC
TATTATTTTAATTCACTGTTTCTTAAAATTTCCTTTGAAATAGAGTTTGT
GCTTTTTGGCCAAGTACCAGGCTTTTCATTAGCATGTCCCAGTCTGTGAT
GCTGTTTGTCTGTTTTTGAAGAAGCAGCAGTTCCTTATGGGGCCTTTTAC
GAACAAACATTTGGCTATTGCTCAGTCGCTGGGCCTTCATGCCCCGTTTT
TGTACTTATTAAAGATAACAAAATCTTGATAACTTTAACATAATAATATT
GAATACAAATAAAGATTACCAGCGTTGTTAAGAAGTCATGGTACAAAACA
AGATAAATTTTATATTTTGAAGCCTTCTGTTGGAAGCTGTGCTTCAGGGT
CAGTATTTCCCATTTTATTGTTTTCTTTTTATCCTACTTTGTATATGAGC
TACTACAATGTAAAATCACATTGTTACAATGTAAAATCACATTGTTCGTC
CGTCAAAAATTATCAATATTCTGTTACCTATATTGAAGATCTTTTACAGT
TTCAATTTTTGGACCTACCCCGGTGGGCTGTAGGTCCTATAAATTAACCT
CTGTTCGTTCGTCCGTTCGTCCGTTCGTTCGTCCGTTCGTTTCTAGCTTT
TCTCGGGATTGGCTCATTAGTTTTTCCTAATTTTTGGCACAAAGATGCAA
AATGGTAATGCCCAAAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAATTCAT
TTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAAACCGGTTTTTTGGCAT
TTTCTCGAGATTTCATCATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGC
GTATTAGCAATGCCTAAAACATGGATTAGTCCGATTTTTGAGAAAAATTC
TATTCCGGCTGAAAATGCCGGAAATATCCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAG
ATTTTCATTGGACTTTTTCCTTATATTTCGTTGTTTTTTTCACACAAAAA
CATTATTTGTAGCAATGCCCACCATCAAGCATGGTTTAATTGTCAATAAA
AGTGATTTTTGAAGCCGGAACTTTCTAAAAATCGCCGGAACAGCCTATTT
TCGCCGGAAAAACGGTAATTCTTGAATTTCTCAAGCTGTACTTTATATTT
TTTCATGAAATTTTGCACACTGATGCAAAATGGCAATACCTAAAATATGA
CAGAGCCTGATTTTCAATTAACGTACTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAA
TATGCCGGAAAAACCGTTTTTTTGGCAGTTTCTCGAGATTTCATTATTAG
TTTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGCGTATTAACAATGTCTAAAACAT
GGCCTAGTCCGATTTTTGAGAAAAATTCTATTCCGGCTGAAAATGCCGGA
AATATCCCGGAAATCGCCGTTTTTGCAGATTTTCATCGGACTTTTTCCTT
ATATTTCGTTGTTTTTTCACACAAAAACATTATTGATAGCAATGCCCACC
ATCAAGCATGGTTTAATTGTCAATAAAAGTGATTTTTGAAGCCGGAACTT
TCTAAAAATCGCCGGAACAGCCTATTTTCGCCGGAAAAACGGTAATTCTT
GAATTTCTCGAGCTGTACTTTATATTTTTTCATGAAATTTTGCACACTGA
TGCAAAATGGCAATACCTAAAATATGACAGAGCCTGATTTTCAATTAACG
TACTTTTCCGGCCGAAAATGCCGGAAATATGCCGGAAAAACCGTTTTTTT
GGCAGTTTCTCGAGATTTCATTATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAAA
GATGCGTATTAACAATGTCTAAAACATGGCCTAGTCCGATTTTTGAGAAA
AATTCTATTCCGGCTGAAAATGCCGGAAATATCCCGGAAATCGCCGTTTT
TGCAGATTTTCATCGGACTTTTTCCTTATATTTCGTTGTTTTTTCACACA
AAAACATTATTGATAGCAATGCCCACCATCAAGCATAGTTTAATTGTCAA
TAAAAGTGATTTTTGAAGCCGGAACTTTCTAAAAATCGCCGCAACAGCCT
ATTTTCGCCGGAAAAACGGTAATTCTTGAATTTCTCGAGATGTACTTTAT
ATTTTTTCATGAAATTTTGCACACTGATGCAAAATGACAATACCTAAAAT
GTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAATATTTTTTCCCGGCCGAAAATGCCA
GAAATATGCCGGAAAACCGTTTTTTTTTACATTTTCTCGAATTTTCATCT
TTAGCTTTTTCTGATGGAAAAGATGCGTATTTGCAATGCTCAAAACATGG
CCGAGTTCGATTTTTGAGAAAAATTTTTTTCCGTTTGAAAATGCCGGAAA
TCGCCGTCTTTGCAGATTTTCATTATATGTTTTCCTTGTATTTCTATGTT
CTTCACACAAAAACATTATTGATAACAATGCTCACCATCAAGCATGATTC
AATTGTCAATAAAACTGATTTTTGCGACCAGAACTTTCTATTAATTTTTC
CCTACAACCCTTCCCTCTCCCCCCATCAACAATCAATGATGAATTTATTG
CGTTATGCATTTTCGCTAAACGATATATTTTCTGACTGATTTTTTTCTCC
TCGCATTGCTATCATCATCAGGTAGGTCCATTCAGCATCTAGCTTGTTTT
ATAGAATACGATTGCTAAACAGTTTTGATAATTTGGAAAAAGAAGAGCAA
TGCATCCTCCAGAATTACATAGATGAAGTATGATGGTCAATTTACCCTTA
TTCACGAAAATTAAGGTTTATTTATGTTGATGCTCTTTTGCTAATTTCAA
TTATCTTAAAAATAACATGCTAAAGATATTGACTCTTGAAACTTTCATAT
ATTTCTCTTCAAAAATTAAAAAGAAACATTACACTGTGTTTCACGCACAA
GGCGATCATCAGAAGTGGATAAAAAATTTTCTACGAACAAATTTTACTTG
TAGAAATCGAAATAACTAGTCCCAAAGGGAATATCTAAATAAAGCGCTAA
AATATAAAACATAATAGAATAGTGATTACATAATGTACATGATTAAAAAG
TTGAAAAGGTGCAAATAAAAGCTATTTGTCCGGAGGGACTGATTTATAGT
TCTTTAGAATGAATCTGTTTGTATGCCTGCATTTAGAGACTAATTCAGTT
TTTTTGTTCACTAGTTTGCGTTTTGATTTGACTCTTGAAACTTTTCTTCT
TTCAGCCTGCACTAATTGAGGGGAGAAAGTTCGACTTACGTTTATATGTT
CTTGTGTCATCAATTAAACCCTTGAAAATATTTCTTCATGGGCAAGGCAT
GGTTGGTCATATTTTTATTTTCATCTATGCCTACTTATAGATTTTCAACT
TATATTCTCAGCTTGATGACTGCCAGAGACTGATTTTTTCTTAGAATGAG
GATTTTATAAAAAAATTTGTACAACTTATGAAGATATTTCAACAAAGAGA
GCAAAAAGTATTCTGATTTTAATTAATTCCATAAAACTCAAATATTTATA
TCAAAACAAACAAAACAATTTTTCATTATTGCATACAATTTCTTATTCTT
TTTTACATGTCATTTTCTTTTTAACTATTTAGGTGCGTTTGGCAACTCAA
ACCTACAAGCCTCCAACCAATGAAAATAAGGTGCTTTTGGAATTGTATTT
TTAGTTTGATGTATATTTTTGTTTTGAGCATTTTAAATACATTATCTTGT
TGAGATCATCTTGCATGAAGAATATTATGCAACCTGAAATTCAAGTTTTA
AGTTTTAGAGGTATTCGAACAAGATTCGTTTATCCATTCATTAAGTTTGG
TACGCTTTTGTGTTTAAAATCGTGGTTTAATGCGTTTAAGCACGTCTAAC
ACTTTTAGAATTTTCAGACAGTACATTCACTTAGCACAGTTAAGCTCACT
TCTTAAATGTCTTGATTTTAAGGTGCACTTAAACGGACCTAGTCGCACAC
ACAATTCTTTTTTTGATATTTTGATGGAATCGTCAATGACACCATGTGTA
AACACTATTTAATTATTTTGAAATTTGCAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAG
GAATTCTTCTGTCGCATTTAACTGTGCTGAACTCTTTTTTCCCTATTTTT
AATTCAATTACTTTTAGTGAGTACAGAAATATTGTTTAGAAGTGTACCTA
ACTGATAAAAGCACTTAGGCGCAATCTTTTACACAATCGAGTACCATTTG
ATTTTATTAATGTTATCATGAATTTTTATATTTTTTTACAGGATGATTTC
TTCATACACTTGACCAATACAACACTGAATAAGAAAAACAAAACTGAAAA
TAGTGGTTTGACAAGGTAACTAATTTTGCCAAGAATGCTTCACATCCTAC
TCTAACGATGATAAAATTGACAAAATAAAGCTTGTTATTTCTTTGTTGTT
ATTTTTGCTTCTTTAGAAAATTAGATTGGTATAAGGGGCATCTTAAGGAG
CAAGGTCATAATTTTGAAGCAGTTTTGGAACAAGTTAAGGTAAGTAAGAT
TTATTATATGAGAATCACAGAATGTTAGGGATTCACATGAAATTTTCTTG
ATTAAAAGCATGTTTGAAGAACTTTCTATTTTTTGAGATCTAATGGTTGA
AAGATACATCACTCTGCAGCTTTATGAAGCTCGTCAGCCTTTTTCATCTT
TTTCAACCACTGATATAAGGCCCAACTAAGAATTCGGTCCAGCAAATCAG
ACAAAATGTTACTAAATCTTTCATGTAATAAGCAATTGTATTATACCGTC
TTTAATTATATGTTAAGGAATAAAGTTTTAAAATAAAAGTTGAAATGAAA
CGAAAATATCAAAATTCTTGGTTTTTCCAAGCATTCACTCAAAGCAGGCT
GGCCTTCATGGAATTCAAATTACGGATTAAAGTATAATTTTACAACCTCT
AGGATGTCTTGGTTAAAACAATGTTGGCAGGCCACCCGTACATGAATTAC
AGTTATGAGAAACACAGACCAAAATCTGAGTCTGTTAATGGTAGCCACTG
CTTTCATCTGTTTGGTGTAGACGTAATTCTTGACCAACAGTTCAAACCCT
GGCTAATTGAAGTAGGTAGCAAAGTTTTTAAACTGCAAACTCAGTAACTC
ATGAGAAAACTTCCGAAATTAGATTCAGATTAGATTTTTCATTTTTTATC
TTAAGTATATACTTTTTTTTTTCAAAAGTTGTGCCCTTATTTTTTGAGAG
TGTCTTGTAGCCTAAAAATGCGAACAATAAATCAGAAATTCCCATACAAC
GAATCTAGATTTTGCCAGATCTAAGGAATAGAATGATTATTGATATTAAT
TATACTGTGATAATGCATCATATAATTTATCCACTCATTAGTGTAAGATT
ATACTTTTAGCTGAATGGTAATCCCAGTTTATTTGGACAACTCCCTGATA
TGAAAATGCAGATTTTCAAAGATGTCCTAAATGTTTTAAATTTAAGGTTA
GTTTTTAATAACTGTTAAGAATTGAGTAGTTTGTACACAGACCCAGTATC
TACGTCTAATTGCTCCGGCCTAGGAGCCTTAAATTCTCTCTCGTCCGAAG
ACGACGACAACAACGACGGTCAAGACATTTTTATTTGTTTATCTAATCCG
ATGATCTATTCCGATTTAATAAAGACGGATTATCTGGATTTCGATAATAT
TGCGAAAGTATTTAGAAAAAGATGGCTGCCGAAAGTGGGCTTAGCTGCAA
ATCTCAGTGAAAGATAGTGATCATTTTCATCATTATTCATGATGTTTTGG
ACATGATTTATGAGAAGTTTGATGCATACTGGTCTAACAATGTGGAAAGA
CTTTGGAGAAATTTTGACCATGAATCGTCAGCTGCTCGAGTGCTTAAATC
TTGCATATGGCCATATGGCTAACTTCTCTAGTTTTAAGGACGCACAAAAA
AAACCATAAGCATAAAACTCTGTAACTTGACAATGGAATGAAACTTTCAA
ACACACATCCATTGGAATTCGAAAGAGAATACTAAAATTACAACATTACA
GTGCAAATTTGAAAACGATCTGAGCAGTTTTTGTGGTGTTATGTGTATGG
CTGAAAATGATCCTGACTGGGCGACCGTTCCTTTTGATTTTTCAAACCCG
ACACAGATATTTTACAAACATTATCACTATGAGAATTCAATAAAGGATAT
TAAAACACAATTCCTGTGTAAATTTGAACAAGATTGGAGAAACTTTCACA
GTATTATGGCTTAAAATGATCGTTTTTGGACTTTGTCGTAATTTCATCAT
GGCTGGCGACCGTTCCTTTTGATTTTTCAAACCCGACACAGATTTTTTAC
AAACATATCACTATGAGAATTCAGTAAAAGGATACAAAAAAACAATTCCT
GTGTAAATTTGAACAAGATTGGAGTAATTTTCACAGTGTTATGGCTGAAA
ATGATCGTTTTTGGACTTTGTCGTAATTTCATCGCGGCTGGCGACCGTTC
CTTTGATTTTTCAAACCCAACACAGATTTTTTACAAACATATCACTATGA
GAATTCAGTAAAGGATACTAAAACACAATTCCTGTTTAAATTTGAACAAG
ATCGGAGAAATTTTCACAGTGTTATAACTGAAAATGATATTTTTTGGACT
TTGTCGTAATTTCATTTGCTGGGGCGACCATTCCTTTTGAAGATTTTTCA
AACCCGAAACAGGTTTTTTTCAAATATACCACTATTTATTACATACACAA
TATTGTACCATTTTATTTGGTTTATCCTACTCTCCCTCAAGTATTATCCC
AACAGAAAAAATAATGCTTAGCTAAAAGCCCGTGACCTCTAATTTAGGCT
TTTTTTCTCCCCAAAATTTTATCTGGACAATCAAATCAAGAACTTGGAGA
TATTGACTTCTAATGTTTATCTCCTTTAGCTCCAATTTTGAACTTTTTAG
TTGAGGATGAGTGGGCGGGGGTGGGGTTGGTTCTTTAGGCAAGAAAGTGC
ATGTGTAATCACTTAGAAGAGCTAAACTTCCAGCTGGTTTTTTTATTTGT
TAAGATTATTTCTCATACTCGCTTCTAATACTCGCTCTGCAATAGAAATC
AGGCTGCATCGTTTGAGGCGTGTGATAGCACGCGCACACCTCCACACACA
CCTAAAATCTTTGAGGAGAGTGATTAATCACAAACCATAAATTTGGATTT
TACTACTTTAAAGTTATGCATAGCACTCCTTATCACACGCCTAAAGTACT
TTTGAGGAGTGCGATTGACCACACGCCTGGAATTTTCCAATGACAAAGCC
TGAGAAATATTACTGGGCTTTCTGATCTGTTCTGATTAGCAGTTTGTGGG
CAACGTTCTAACACAACTAACTCAACAAGCTCATCTTTCACATCTTTTAA
TCTCTTAAGCCGGAGCTTCCAGCGCAGCTGGTTTATTTCAAAATTCATTG
CCGTAGAGGGTCTGTTGTAATTGTCTTTTCTGATTTCAGTTTTCAAACTA
ACTGCTAAGATGGAGTGCGGGTGAGAGAGAAGAAGGGAGACGACGAGAGA
AGTGTTGCTATTTATAAATCATACTTCATCACAGAGGTTTCTGTACAGGA
GTATTTTTTTCAAACAGACAATGCGCACACAGTGTACTACGAAGCAATTA
ACGTGAGATACACTCTGGTACAGAGTAAGAATGGAGCTGCATCTTTGAAA
TGCAACGTGAAAAATTATGCTTGTATTTTTCTTGCTCCAGTGAACCTTGA
TTCTTTTTGTTTTATCGATTTTCTTTTACTTCTACAGACCAGAAGATCGA
ACAGGGCCTTGTGAAGAAAAAACACCTGATCACAAGATTAACTTAGTACA
AACGCTTTGTTCCTTACATAGGATTTTTTATTGTCTTTATATTTTCTTGT
ATTTTTATTAAAAAAATGATCTCAGTGAGAGCTTAAAAAGACTGAAAATG
ATAGCCATACTCTCACGCTCAACTATCAATGTATCCTCAAGACGAGAAAA
AGATCATCTCTGACTTTGCTTTTTTTTGACTCTCTATAATTTTTTTTCAG
GGAGGTTTTGATCAAATTTATCCCTGCCTTGAAAAAGATGAATATTACAA
AGAACTTAATCAATATTGTGTGGATGCCAGTAAAGGTAGACTTTCCTTTT
ATATTGTATTATCTCACATTTAAATCTTTGCTTTTCATATCTCATTTTCA
TGTTAGATATTTGGACGTCTTTTATTACTTTTTACTCTTTAAAAATAATT
TTTCAAACGCATATTTATTACCTTTATATTAGATTATTTGCAAGAAGAAG
ACGACTACATAGAGGTTTAGTACTATTTCATTCTTATAACGACCTTCATC
ATAAAATATAAGCAGAAAATCGAAGTGTATTTTGGTATGTAACTGACCAG
GCCAATCCCGCACTTATTTCTATCATATGTGTAGTCTAGCAAGCTAGACG
ACTAATTTATACATAGTAGAAATAAAGCAAAAAGTAATGAATGGAACAAT
TTTAGTCGTCTAGAAACCTTTGTGCACTAACTCCAAACAAAAGAAAAGTG
TCAATATTGCAATTATAATTTTCTCCTGCTCATAAAAATTCTTGAGAAAA
AAGAATGTGTGGATTTGTATTGAAAGTTTTTCATTTTAGTTGATTTCGTT
TTGAGAGTTTGTTGTTGCTTGGTAAATTGTTTTCTCGCTACGCAAGTTTC
TGCGTAGCTAGCCCCTGTATCTATAAGGCTGGAACACCGGATTCTTCCAG
TCGTTTATACAAACTAAATCCCGTATTCATATTATTATTATTATTATTAG
AATTGGTATTATTAGTATTACACGCATTATAAACGACTCCAGTCTATCAT
ATGTGTAGATATGTAGAATCCGTAAATCTACCATATGTGTAGATATGTAA
AAATCCATTACCATATTGGTAGTTACGGTAAATTATCCAGACATTCTAAA
AAGAACGACAAATAAGTATTAAAAAGCAACAAAAAGAGCGGCAAACCCTA
ACCCTAACTATCAAAGAACGACATATTTCAAATCCTAACCCTAACCCTAA
CACTAACTATCAAAGAACGAAACGACATATCTATCGGCGAAATTCGCGAA
TCTTAATCCCCGCGAAAATTAATCCCATTAAAGTAGTATTGGTTTAATTG
TATCACATCTTTGTCTCTCTTTATAGAAATTTACCACAGAAAGGATAACA
ATGAATTCTATAAATCAAAGAGCACTGCATAGTAAGGTAAACTGTTACAC
GTTAAACTGTTTACACGCAGGATTCATACACGTGTATCCTGTCTGACCTT
TTTTTAGAAATTAAAAAAAAAGATTAACCCCCTAGGAATTTTGATCGTAA
GTTTGTCTTTCAATTGCTCCTGTGTTTTGAAATTTTCTTCAACTGCATTG
AGATTATATACAAATTGATCCAGAGTTTCATGTAAATTTCAAAGGTTCAA
CTGGGTACAATGGAGCGAGATAGAAATGTCTATTAGGAATAGCCACAATA
TTTTGACCCCTCTACAAAGAGGAAATTCGTAATCGACAGAAAACTGTGTT
TACAGACATTTTGCTTTCCAAATTTCGACCATCTATCGTTGTTGTAATCT
ATCTATCTTTCTATTCTTAAACTTTCTTCTATCACTTTGAAACTTTTTTT
GAATTTGTGCAAAATAGGTATTTTTTATAGCTAGCTATAGTTACTTTATT
ATCAGAGTTCACGCAATGACAGTTACGAGGGAAAGGTTTTATATTTCAAA
GAAGAACTGATGAGCATGGGATTAAACTCTGTTTCTTATACAACCCACGA
ATTGGATAAAATGGTAGAAGAGGTATAAACATTTATAATTCCTTTGTGCC
CAAGAAATTTTAGAAAAATACCTTTCTATATTATGAAAGAGAACGTTCGA
TTTAGCGTAAGGAATTGCTTCGATCATGGCGTATATTCTTGAAGATAATG
CAACTTTAATAAAACATGAAAACCCTTTTCCTACTGTCCCGATATTGCCT
GGAAATTACGCCAGCATGAAACACCGTCAAGGAATAATTTGAAGTTAGTT
TTTTATTTCTCGATAATTTCGTTTTTATTAGACAATTCAAAATAATTAAA
ATGGTTAAGAATTATTTTTCTTCTTCAGAGTCGACGAAATTTAAATATTA
ACATAGTACGAGGTTATTGGAATGGTTTAAGCCCCGAAGAACGAAACCAG
GTAAGAGGTCCAAACTTAGGCTTAAACCTAATGTGGTGTTGAAACTCTTT
TCATAGCTTGGGAGAAGGTCGTCCTCTTTAATATCTTGGCACCGCTTTTC
TAGAAAATGTCTACTTTCGAAGATTTCCATACTTTTTGATTAAGTTTTGA
CAGCTTACTGCTCCACTACCATTTCTTATTTGAGCCCCTTCACTTTTTCA
AACTATGTAAGAAGGGTTTCTTATGGCTTAGGATTTTATAAAGTTTTCTT
TTTCAGATGCATAAAGAACGTGAAAAATTTATTTTCGTTTCAATGCAAAG
ATCTTGGAAGGTTTTCACTAAGGATGATATGAAGGAAGTCAAATTATTTA
CCACGCTTCAAAAACTATTTCAATTCTTATCTTCGAATGATTGTAATGGC
TTATTAAAATGCTGTCTGTCTTCTGATAGGTATAATCATGTTATAATTCT
AGTCTTCAGATATTAGCCCTTAGAACAAGTATTTGAGTTAAAGGAATTTA
TTTTTGACCATTTTGTATTTTGTGGATTCTTCTCTACATGAAAAGTAGAC
TTCCAAACTAACTACAATCTACACTGTCAAAATTCTTCCTTACAAGTTTT
TTAATGAATAATTATGTTTTTCTTTTTTAGAGTTGATATTAACCCTTTTC
TTACAATCGTCAATCAAGAATTAAGTGAGGTAAAAATTTGATGCATTTAT
TTCGACTATTTGTGATATTCATGACGTAATTTTCAACTCGAATGTCTCTA
TAACCCGAACAAATTTGTGCTCCTCGTGCGTGTTCAAGTTATTGAGACTC
CGCTGTATTACAATCGCTGGTATTATCAATCACTTTTGATGGAATTGACT
TTTCCTGACCCATGGATAATCAAAATTACCCTCAAACAGAGCAAGTTTAC
CCTCCGGACAAGGCAGATTTTGTAGATTTTTCACTACCCCCCGGACACTA
TATCCTACACCCCCCATATACGCCCAATACGATAGGTTTATGTTTTGTTT
TTCTGAATAGGAAACTTTTTTGCTAACAATTATCTCGCCTTTCAACTAGG
ACGAGGTAGGGTGTATTAGAAGGATCTTGGAAATCTATCAAGCGGTCATT
TTGGTGAATTATGATTTATCAATCCATCAAAAAGATGATCAAACAGCTGT
ACACTATGCACCTTATTGAAAGAGCTCGTTTTTGTTGATTGGTTATGTTG
TCTTCCGTGGATCACTGATCACGATTGGTCATAAAAAGTCAAATCTTAGA
ATAGACTTTTCTTTCATCGAAGGGCTACTTAGACTACACAATATATTAAC
GAACAATATTTGACAATATGGTTAGCGGACGGTAATGTACGAAGATAACA
ATCTTATATTATTGGAATATTGAAAATGGAGCTGACAATATAATGTTTGA
CAAT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000144_pilon:192268..208771-

>MSTRG.15840.3.p1 ID=MSTRG.15840.3.p1|Name=MSTRG.15840.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5616bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000144_pilon:192268..208771- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTATTTGCAAGAAGAAGACGACTACATAGAGGTTTAGGGAGGTTTTGAT
CAAATTTATCCCTGCCTTGAAAAAGATGAATATTACAAAGAACTTAATCA
ATATTGTGTGGATGCCAGTAAAGACCAGAAGATCGAACAGGGCCTTGTGA
AGAAAAAACACCTGATCACAAGATTAACTTACTGAATGGTAATCCCAGTT
TATTTGGACAACTCCCTGATATGAAAATGCAGATTTTCAAAGATGTCCTA
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AGATTGGTATAAGGGGCATCTTAAGGAGCAAGGTCATAATTTTGAAGCAG
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GCAACTCAAACCTACAAGCCTCCAACCAATGAAAATAAGATGATTATTTG
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CAACTCCCTGATATGAAAATGCAGATTTTCAAAGATGTCCTAAATGTTTT
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TTCATACACTTGACCAATACAACACTGAATAAGAAAAACAAAACTGAAAA
TAGTGGTTTGACAAGGTGCGTTTGGCAACTCAAACCTACAAGCCTCCAAC
CAATGAAAATAAGATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15840MSTRG.15840Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15840.3.p1.exon22MSTRG.15840.3.p1.exon22Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon21MSTRG.15840.3.p1.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon20MSTRG.15840.3.p1.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon19MSTRG.15840.3.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon18MSTRG.15840.3.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon17MSTRG.15840.3.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon16MSTRG.15840.3.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon15MSTRG.15840.3.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon14MSTRG.15840.3.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon13MSTRG.15840.3.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon12MSTRG.15840.3.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon11MSTRG.15840.3.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon10MSTRG.15840.3.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon9MSTRG.15840.3.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon8MSTRG.15840.3.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon7MSTRG.15840.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon6MSTRG.15840.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon5MSTRG.15840.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon4MSTRG.15840.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon3MSTRG.15840.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon2MSTRG.15840.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15840.3.p1.exon1MSTRG.15840.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15840.3.p1MSTRG.15840.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000144_pilongenomesc0000144_pilon:192268..208771 -