MSTRG.15782.10.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15782.10.p1
Unique NameMSTRG.15782.10.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000143_pilon:191611..215515-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15782.10.p1 ID=MSTRG.15782.10.p1|Name=MSTRG.15782.10.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=23905bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000143_pilon:191611..215515- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCACAGGTGCCAAAAATAAGGGCCGTGTGAAATGTGGCAATTTCATTGGT GCAAATTTGATAAACAGCTACAAAGGAGCGCTGGGAAGCAATCAGTAGAA GAGACCACTTCCATTTTTGTTGCAGATTTCAGTATAAACTTCTCTCAGGA ATTACTTGTCAATGTGTTGTGTCAACTTGTCAGCATTGAAAGAGGTAAGA CTAGTTTTCTAGTTTCTAATCCTGATATAGAAGTTTAAGCTTAGACTGAC TGGTGTAAAAATAAATGGGGATAGAAATAGAAATAACTGTGTAATTGTCC GCTTACAGCCTTGGGAGAGTCAAGTGCACAATTAAGAGGATTTCTCTCTC TCAGACTGTCTAAAGTAGTAAAGAAGGATTGTGAAATTAGAAGAAGGGAT GTTGACACCAGACCAACTGGCGGTATGTGAGAGTCTTGCTAGTCTTGCAG CTTATTTTACGGAAAAATGTACATATGTATCCTTTGGATTAATTCATAAT AGAAATAGACATAGAAGAGAGCATCCCGTTGCTAAGATGCTGGCTTGAAA TGGAAAATGGAAAATGAAACCTCTGCACTCCAAATAAACCTTTTCGCCTT TCCATCCGCCATATTGAATTGTATGCAAAAATTATGGTGGCTGAATTGCC ATGGTGAAATTCAATTAGAAAGTATGCAAAACATATGCAAAAAGAAAGTA TTAATATAAAACTTACATGCATAATTGGCATTATATTAACCCTTTCCGGA CACATGATTTCACGGCTATATGACGCGAACAAAAATTTAATTTTTGACTG GCTTCACTAAAATTGCAATAGAAAGTGATTGATAAAAGATATCACGATTA CCTCATTTTTTTCACATGTAATAGGGGTTTTGAAATACCAAAAAAGAATT TTAAATATGGCTGACACCTGGTCACGTGACCGAAAAATCGGCAGATTTTT 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AAAAAAACACAACTTAACAAAATTTAGTTGAATGATGCTTCTGTGAAGCC AATAGTCAAACATTGACATATGTAGTAACGTTGCTATTTTGGGTGTGTGA ATCTTAGATAGTGTGGATGTGAAGCTTTGTCTGATTGTTGTAGAGTCTCT TCGAGTCTGAATAACAGTGACCTTGTGTACATTTTTCCTGTTGCTTTAAG TTGCTTTAAGTAAGCCTATGTTCATTGAACAGTGGAGTCTATTTACTCGG ACCTTTATAACTCAAATGGCTCCTTGACTCGAATGAGGTTTATGGTCCCT TCAGTTAACAATGCCTTCTAAACCTTATTCTATGACTCAATATTTTCTTA ACAAATTAGTGTTCGAGTTAGGGAGACCCAAACCGTAAAACCCATTTGTT TTTTTCCTGTTTGGCAATATCAGATTACACCATACAATAAATATTTGCAC AGCTTAAATCTATATATTGTTTTCTCTTCTAGCAACAATGTGTGTACAGA ACCACTGTTCGATCTCTGTCAACAGCAAGAACTGTATCCTGCAAAGTCAC CGATAAAGGTATGACATAAAGGTGTTTTGAATAAAACACTAGTTTAAAAT ACCAAAATTAAAGATGTTGTAGTATTACTTTTATTTTTAAACTACTAAGT ATATTATGTATTTAGTTTTAGCTAAACTTTACTCTCTTAAATAATCTGCA TTGTCAATAACTTATTCTTCTTTTAGCATCTACACCAGTAGTTGAAGTCG CTGCTGAAAACGCGAAATGTATGATTTGTTGTTTTTAACTTTGGTTACAG TTCTTTAATTTGTTACTTTAGTTTTCCCATCTTTACGAGATTCCTGTATA TGTATCCATCAGGAAAACTCTTCCAGCCCTAGTTATTGCTTTAGGGCCTT ACTTGCACTACATAGTAGTTGACATCCATTGTATATTAGTACGAGTAGAG GTGGATTCGTGTCACCAATGAAAAGTGCTCTAAAAAAGAAGCAATATAAT AATATCCATTGTATAGCGTAGTTAGCCTTTTTAAGATGCCCAAATGCAGA GAAGTGTCGTTCTGGAGGGAATTGATTGTTGGATATGGCTGCCACACATT GTTTGGAGTGATTGTCGAGCTGCCTAAGGCTAGGGTTCCTGGTCCGAGAT AACTGAATTATCCACTCAAAACATCGAAGATCAAACTGCTCACTTCATAT GTCTATTCTCTTCTTTTAGCTACAACGCCTATAGTGGAGGCTGTAGCAGA GGCAATTGCTGATCCCATGCCAGCGGAGTGTAAGATGTGTCTTCTTTTCG ACGCTTAGGTCGTCCCTCTGTTAGAATCAGAGAACAGACACATCACGCAC ACACACCATTCATTTGTTTCTTCTATCTTGCTATATTAACTCGGTAAGTT CTGGTTTTGACGGTAGAATTTCCTCCCTGCCTATTAATTATTAGTAGAGT AGGCGGAAAATTGGTGTTTAAAATCTTTGCTTGAAAAGGATTGGTCATTG CATTGACGTCAAAAAAGGACAACTTTTACCAACTTTAGTTCACAACTGGA ATAGGCAGGACAAAAGGTAGGCCGTCCAAACCAGAGCTAATTCATTACAT TGTTTGTCACCAGTATCTTATCTATTCAGTATATTTCATGATATATCAAG TAACTACCATCGTAACCTCTACTAATTTATAGAAACCCAATAACAATCTA CTTACACTTATAACATAGAAATAATAATTTAACCTTATATCAGCTTAGAC AGCTTATCAATGATCACGTCAGGTGACTTTCCAACAGATAAATATAATTT TTGATACGAACAACCATAATCTTTTCAATCATAGCTGTCGCAATAGAATC GGAAGCAGTCGCCGAAGAAACCGTCGAAGCTGTCTCTGAAGTTGCCGAAG CCGTTGAATGTATGCAAAACAATTAACAGTTTAGACGTTTAGAAACTCTC TCTTAGTATGAGAAGTTTATAGCATACACGTACACCGTTCGTCTGTATTT TCCATACAAAGTGTATACTGTAGTACCATAGTAATATCTTTTGATCTAGC TATCTTGTCTGCTTTATTTACCTGCTTTATCGTTGTCATCGCGTGTAATG TAGACGTTTTGCAATATTCTCTTAGAACGAGAAGAAGGGGTCGAACATAC ACACACAACATTTGTTATGAACTTGTATTAAGTTCAACTCTAAAGTGTGT TTCAATATTCTTGTAGCAGTTGTCGAGGAAGTTGCTGCCGAAACTGCAGT TGTTGAGGAAGCTGTTGCCGAAACTACAGTTGTCGAGGAGGTAGCTGTTG AAACTGAAGCAGTCGTCGAGGAGGTAGCTGCCGAAACTGCAGTTGTTGAG GAAGTTGCTGCCGAAACTGAAGCCATCGTCGAAGAGGCTGCTGCTGAAAC TGAAGCAGTCGTCGAGGAAGTTGTTGCCGAAACTGAAGCCATCGTCGAGG AGGCTGCTGCTGAAACTGAAGCCATCGTCGAAGAGGTTGTTGCTGAAGGT GAAGCCATCGTCGAAGAGGTTGTTGCTGAAACTGAAGCAGTTGTCGAGGA AGTTGTTGCCGAAACTGAAGCCATCGTCGAAGAGGCTGCTGCTGAAACTG AAGCAGTCGTCGAGGAAGTTGTTGCCGAAACTGAAGCCATCGTCGAGGAG GCTGCTGCTGAAACTGAAGCAGTCGTCGAGGAAGTTGTTGCCGAAACCGA AGCCATCGTCGAAGAGGCTGCTGCTGAAACTGAAGCAGTCGTTGAGGAAG TTGTTGCCGAAACTGAAGCCATCGTCGAAGAGGTTGCTGTTGAAACTGAA GCTGTTGTCGAAGAGGCTGCTGCCGAGACTGAAGCAGTTGTTGAGGAAGT TGCTGCCGAAACTGAAGCCATCGTCGAAGAGGTTGTTGCTGAAACTGAAG CAGTCGTTGAGGAGGCTGCTGCCGAGACTGAAGCAGTTGTTGAGGAAGTT GCTGCCGAAACTGAAGCCATCGTCGAAGAGGTTGTTGCTGAAGCTGAAGC AGTCGTCGAGGAAGTTGTTGCTGAAACTGAAGCAGTCATCGAAGAGGCTG CTGCTGAAACTGAAACAGTTATTGAGGAAGTTGCTGTCGAAGCTGAAGTA GTCGTCGAGGAGGTAGCTGCTGCTGCTGCTGAAACTGAAGCTGTTGTTAA GGAGGCTGCTGCTGAAACTGAAGCAGTCATCGTAGAAGTTGCCGCTGAGA CTGAAGCAGTTGTCGAGGAAGTCGCTGCCGAAACTGAAGCAGTTGTCGAG GAAGTCGCTGCCGAAACTGAAGCGGTTGTCGAGGAGGCTGCTGCTGAAAC TGAAGCAGTCATCGTAGAAGTTGCCGCTGAGACTGAAGCAGTTGTCGAGG AAGTCGCTGCCGAAACTGAAGCGGTTGTCGAGGAGGCTGCCGCTGAAACT GAAGCAGTCGTCGAGGAAGTCGCTGCCGAAACTGAAGCGGTTGTCGAGGA GGCTGCCGCTGAAACTGAAGCAGTTGTCGAGGAGGCTGCCGCTGAAACTG AAGCAGTTGTCGAGGAGGCTGCCGCTGAAACCGAAGCAGTCGTCGAGGAG GCTGCCGCTGAAACTGAAGCAGTCGTAGAGGAAGTTGTTGCTGAGACTGA AGCAGTCGTCGAAGAAGTTACTGCATATTCTGAAGCAGTCATCGAAGAGG CAGCTACTGAAACTGAAACAGTCGTCGATGAGGTAGCCCCTGAAGTAGAA GCAGTCGCTGAAGATGCAGCCCCTGAAGTAGAAGCAGTCGCTGAAGAGGC AGCCCCTGAAGTAGAAGCCGTCGATGAGGAGGCAGCCCCTGAAGTAGAAG CCGTCGTTGAGGAGGCAGCTCCTGAAGTAGAAGCAGTTGTTGAGGAGGCA GCCCCTGAAGTAGAAGCAGTCGCTGAGGAGGTAGCTCCTGAGCCAGAGGT TGTAGCAGAAGAGGCATCTGCTGGACCAGAGAGTATGTTGTTAATGCTCT TAAATTTTTACGCCCTTAATAGTTGTCTTTGGTTTGATTTTCCCAGCAAT CTCGAGTTCGTTATCCTCTGATCTTTAATAAAGTGCGTCTGAACTTTGCT TTTCTTTCTCTTCCCTTAGAAAAGGGCAAATGAATTGAACTTAACTGCTG CTTTCTTCATCTCCTGCGATTTTCTGAGTCCTTTTCCTAGCTCTACTTTT CCTATCCACTAATACTGAATACTGATAATAATTTTCTGTAATTTATTTGT CCTTTTCTAGAACCAGAGCCGAAAACTCTTTGGGAAAAGATTAAACGAAT CTTCAATTTTTAAGTCGTCGGCAAACTCAGTTGACGGCGTAGTAGTGAAG TATGTCGTGTTTTATCGTTATATTTAACCTTAGATTAGATTTTCAACTTG GTTGGACTTGAATAATTCTAACGAGGGAAATCTGTATATTATTTCCACGA TTTCTTATATCAACTTGGCTACTTCTTCTCTTGCAATGTTAAGGGTGTCA ATATTGTCTGTTTTTTTCTTTTCAAATAACGTCATTCATCGTCAATTATG ATTACAGACCTTTATAAACCCTGGACCGAACTATTTCCACCATATTTGAT CGGAGTTTTTATGAAAGTGGTACCCGCAAGGAATTTATAGTTAAGATTTT GCCTGACAAATGGCGCTACTTCACTAGTATGCAATAAAAAGTAGATCTAG CGCTCTCGATGCGGGTACCACTCTCAAAAATATTCCGATCAAAACATGTT GGTACGCCGGGACTGAGAAACTGCCTCCGGGGTTTATGTAAAGCTCAATC AACTATGAATTATGAATCATTTCTAAGTTCAACATATTCTGAAAATTGAA TATCAAGTCTCAAATTGAATGCATTCCCCCTGTATCTTTCAATGATCGGA GGGCTTCTTTGAGTCAGTAATGTTTTTCAGGTAATTAACGCTCATTACCA TATCTAGGCTTTGCTTACTTTTAGGTGTACAAACTTTCACGAGCAGAAAC TTTCGCGAGGTCGAAAAATCGTAACATTTACTTTCGCGAATTTGACAAAA AAAATTTTCGTGAGCATAAACTTTCGCTAATAAGGTATATTTTTAGTAGT AAATTCAAGTTTTCGGTGCATAAAACCAGTGTTTGATGGACTTTCGCATA ATACCTACACTAAATTTTATCCTTGTTATCATCAAGACGTTTACTTTCGC GAAAAGGGCTAAAATTCGCGAAAATCGTGAAAGTTTCTGCTCGCGAAAGT TTGTACGCCTAAAATAGTTGCCTAACAACAGTAATATTGTTAAAAGGTTT TTAGGCCGCTAATGATAAAGAATATTGTGTGAGGTATTTCAAATGATCTA CAACTTATATAGCTCGCCTATAACATATCACACAAGAATAACTGTGCCGT AGTGTACTTTTCAGACTTTTTCACTCAGGTTTATTTATCTCAATTTTAAA AGTTTTTCTAATCTTTCTACTAGTTTTGCCTTAAAATGGAAAGACGTGAA AGATTTTAAAGGTATAATGAGATATTTGGCCTCCAGATATTTTTCAAAGT CCTGGGAGAAACAACCGAAAACCTTTCAGGACTTATGTGCGGATAAGCAC AATATAAAAACTTATCTGATTATACCTTTAATTATTTAAACAACTTTCCA TTTCAAAGCAAATCTTTAGGTATTAAGGTATGTTTACACCTTTCTTAACA CAATATTTTTAATTGGTCATATCTACGTCAAAAGTATTTTCTGACAAAAA AATCAAAAAATAGGTGTACACATACCTTACTCTTTCAGGTGCCAAATTAA CGGGGGGGGGGGGGGGGGTTGGAAAATTTTCAAAATTTTAATAAACGGGG GTGACTTAATTGCCGGGGGGTTGGGAATTGTACTTCTGAAAACCCAAAAA TAAGGTAAATATAGGCTAAAATCAGGCTATTTAGAGCAAAATAAGGGACC TTCTCTTTGACAGCTTAAAGTATTCTTTTTCCGTTCCGGGTTGGGGGGGG GGGGGGGTTTAGAAATTTCTCGAAAAATTAACAATTCCGGGTTGAGGGGA CCCGTTTACTTGGCACCTAAGTGTAATCTTGAAAAAGGGTTGGAATGAAG AAAAGAAAGGCACAAAATAGTTCGCCCTAAGATTAAGAGCTGATAGTAGT ACGCGCTCATTATCATAATAACTATTTATCATTTTTCTTTGTTTGTCACT TTTCTCAGGTAGCGTAGATGTAGGAGCCAAACAGCCATCGCCAGCAGCTG AACCATCCATTCCACAAGACCAAGCAGCATTCGACGAGTACAATGCAAAT TACAAATGTCCGGAATATTACAAATACGATGAATTCGCGTTTTACGATAT CGAAAACGATATGCAATCGAGTCGAATCGAGCAACCTAGTGCTTTATAAT AATTGTAGTTTTAGTCAAAAAAAATTGGTGTTTTTTAGATTTTGTTGCTA ACTTGGAACTTGTTCATACTATTTGAAATGTAGATTCTGGTGTTTGATTG TACAATAACTCAATAAATTGGATCTTGGAGATTTATGTTCGCGTTGAAAT AATGTTTTGGGTAAATAGCAGTAGATTTTCAAACAATCTCTAGTGATAGA CCTTGGAGATGGAAACACCATTTTGATTGATGGATGTCGCTGATTGGTTC TGTAGAAATTTTTTTTACATTTTAGGTGTTAGTTTTTACAACGAAACTGG TAGATAGCAAACCTTTTATGATGAACCTAGGTTAGGTTATTAAAATTTCC AAATTGTGGAAAATTGAATAGATGCTTATTTGAAAACTATAATGTAAATA CATTACTTTTCTTAAGTAAAACTGAATATGTTATATGGCTGATTGCGTCG ATTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000143_pilon:191611..215515-

>MSTRG.15782.10.p1 ID=MSTRG.15782.10.p1|Name=MSTRG.15782.10.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=927bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000143_pilon:191611..215515- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTAGCGTAGATGTAGGAGCCAAACAGCCATCGCCAGCAGCTGAACCATCC
ATTCCACAAGACCAAGCAGCATTCGACGAGTACAATGCAAATTACAAATG
TCCGGAATATTACAAATACGATGAATTCGCGTTTTACGATATCGAAAACG
ATATGCAATCGAGTCGAATCGAGCAACCTAGTGCTTTATAACAACAATGT
GTGTACAGAACCACTGTTCGATCTCTGTCAACAGCAAGAACTGTATCCTG
CAAAGTCACCGATAAAGATGTCTTCCACACAACTCATCAGATCTCTTCGA
CAACCATTGGTAGCGTAGATGTAGGAGCCAAACAGCCATCGCCAGCAGCT
GAACCATCCATTCCACAAGACCAAGCAGCATTCGACGAGTACAATGCAAA
TTACAAATGTCCGGAATATTACAAATACGATGAATTCGCGTTTTACGATA
TCGAAAACGATATGCAATCGAGTCGAATCGAGCAACCTAGTGCTTTATAA
CAACAATGTGTGTACAGAACCACTGTTCGATCTCTGTCAACAGCAAGAAC
TGTATCCTGCAAAGTCACCGATAAAGATGTCTTCCACACAACTCATCAGA
TCTCTTCGACAACCATTGGTAGCGTAGATGTAGGAGCCAAACAGCCATCG
CCAGCAGCTGAACCATCCATTCCACAAGACCAAGCAGCATTCGACGAGTA
CAATGCAAATTACAAATGTCCGGAATATTACAAATACGATGAATTCGCGT
TTTACGATATCGAAAACGATATGCAATCGAGTCGAATCGAGCAACCTAGT
GCTTTATAACAACAATGTGTGTACAGAACCACTGTTCGATCTCTGTCAAC
AGCAAGAACTGTATCCTGCAAAGTCACCGATAAAGATGTCTTCCACACAA
CTCATCAGATCTCTTCGACAACCATTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15782MSTRG.15782Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15782.10.p1MSTRG.15782.10.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15782.10.p1.exon4MSTRG.15782.10.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15782.10.p1.exon3MSTRG.15782.10.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15782.10.p1.exon2MSTRG.15782.10.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15782.10.p1.exon1MSTRG.15782.10.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000143_pilongenomesc0000143_pilon:191611..215515 -