MSTRG.15760.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15760.1.p2
Unique NameMSTRG.15760.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000142_pilon:570214..583002+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15760.1.p2 ID=MSTRG.15760.1.p2|Name=MSTRG.15760.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12789bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:570214..583002+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ggcagaaaatttcgcgaatttgtgGAATGGACAAAAATAATCTAATCACA TTAAATTATCCTTTAATTGTTTTCTATACTAGAAATAACAATTCCAAATT CACCGAGGCATGAGAGTCAACATCAATTTATATTTGATTCTTGTATCTTA TTTCATTATTATAAATTCCATAAATTGCAAGAGGAAAGATTGTCCTTTGC TTGGTACACAGCTGGTTAATACGTCACATGGTATAAAACAACCTGTTTGC AAGTGCAAACATAACAAGAGGAGTCATCACCATAACTATTTCTACTGCAG AGATACCAGGAAAGGTCCAAAGGTTTATATCcttaaaggtatttttatac ggaaacactcGGAAAAATTCCAGACTTTTTATTTGACTGACTTACCCTTT AACGACTGCGTAAATTACCGCGGCTTTTTTAAGAGCCGTGCCAAAAAGAc tgaatgggctcttccagaaaaaatccgttcatggggggggtggaggatga attgtcaaggggtattgaaaaaattgcaatgtccagggggtaaattccaa tgtccaggggtaattttttgtgtccacggggttgatttggtgtttgtcca ggggtataacccgtgtccagggggttaaaaatcaaaacgtccaggggtaa ttcatgaaataaataatatatcctccacccccccatgaacggattttttc tggaagagcccaatgataGAATAACGCGTCAgaaaacacccctttctcac agacccgattGGACCTTTTCCCATTAGTCATAATATCTTCCCCAGTGGAA AATATTCATCAGTTTTTGTCATCGCTGAAAAGGTTCAAATAAACAAAGCC TCAATTCCAAATAATTCTCCATCACCGTTGatttttctgacttaaaaaca gtGGAATTCAATCCCCAATCCATGGAAAACACATGGTGCCTAACCCGAGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000142_pilon:570214..583002+

>MSTRG.15760.1.p2 ID=MSTRG.15760.1.p2|Name=MSTRG.15760.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6624bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:570214..583002+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAGTCAACATCAATTTATATTTGATTCTTGTATCTTATTTCATTAT
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ggtcattccattttataaATGAGAGTCAACATCAATTTATATTTGATTCT
TGTATCTTATTTCATTATTATAAATTCCATAAATTGCAAGAGGAAAGATT
GTCCTTTGCTTGGTACACAGCTGGTTAATACGTCACATGGTATAAAACAA
CCTGTTTGCAAGTGCAAACATAACAAGAGGAGTCATCACCATAACTATTT
CTACTGCAGAGATACCAGGAAAGGTCCAAAGGTTTATATCcttaaagGTC
GTTGGTGGAACGAATCTCTCGGTAGCAAAACACTTCCATGCCCCTTCGGC
TATTGTCGAAATGACTCTACAAAAGGAGAAAGCGATTACCGCCTGTTAGA
TGTTAACAACCAATGTGCCGAAGGTCGAGAAGGCAGACTTTGTAGTCAGT
GTAAAAAGGGACTTAGTGTTATGTTCTTGAGTGAAGATTGTGAAAAATGC
ACCAATTATTTCATCCTTATCATCCCAGGATTTTTAATCTTGCTTTCTTT
GCTCATTCTGGTCATCATATATTTCAACGTAAACGCATTTTCAGGATATT
TTAACGCGTGTTTATATTCATATCAAGTAATGGGAGTTTTTATACCCAAG
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TCGTGCAGCATTTGTTGAATATTTGCATGGAAGCAAGCATATGGGATTAT
TTGCTTTTGCATTAGTTATTGGCTTTGTTTTTGTGGTAGGATTCCCCGTC
CTGCTTCTGGTCACGCCGTTCGTGGAGAACTGTTTTTCACGTCATATGAA
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AAATGATGGTGTTCTCTGCTTTCTATTTTATTTGTCGACTCAGCATTCTT
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AATGGTATCGTGtttatttttggtcatttttgctATATGCAAACCGTATC
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AGCGAGTGAGGGATTCTAACGAAAATGAAACATTTCAAAACTCTCTTCTG
AGattgggtcattccattttataa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15760MSTRG.15760Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15760.1.p2MSTRG.15760.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15760.1.p2.exon1MSTRG.15760.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15760.1.p2.exon2MSTRG.15760.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15760.1.p2.exon3MSTRG.15760.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15760.1.p2.exon4MSTRG.15760.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15760.1.p2.exon5MSTRG.15760.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15760.1.p2.exon6MSTRG.15760.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000142_pilongenomesc0000142_pilon:570214..583002 +