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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000142_pilon:523142..530993- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15756.2.p1 ID=MSTRG.15756.2.p1|Name=MSTRG.15756.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7852bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:523142..530993- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTACGGGTGGAGAGATGAACCATATGGTATGCTAGAAGAGTTTGATAA
ACACTTTTTTGTTAGAAGCTAGTTTGTAAGAAAATCAAGACTGTAATTTA
GAAAAAAATAAGAAGATCATAATCAGGTTTGATTATTTTTTCAATCTTTT
TTAATTTAAGGTAATTCTGTATATTTAGGTGAATTGCATTTCAAGAAACA
CCAATAAAATTATGTTGGACTCAAAATTGTCAAAAAAAAATCAGCACATC
AAGTCACAGCCGAAATACAGACGTTCGAATTAAAAGAAGTGTTTAGTTCT
TAGATAGTTGCCTTATAGGTGGGGGGCGTACGGTTTTACGGAATTGCGGA
AATCGACCCTTTTTTCTTCGGAATTTCGGAAATCAGGCAAAATTCCTTCG
GTATTTCGGAATTCTGAAATTGTTTCGGTATCGGAAATCCGTGAATTTTT
GCTTCGAAATTTCGGTATTATGAAGTTTTTATCCCCTTTTATCGGAATTC
ATACATGAAAAATAAAAAATTAGTCAAAACGGGGGAAAAAACCCCAAAAA
TAGGTATCGGAATTGCAAGTATTTTTTTACGGAATTTCGGAAATTTTGGC
AAAATTGTCCGGTATTTCGGAAATCACAAACCCCGTACGCCCCCCCCTTA
TAGTATAGTATTAATCTCGTAACAGATCACCAGTTCAAAAAGCAACTCGC
GATGCTTTTGTCTTGGTTTCAATTCAACGAATGTGATGATCTAACCTGCT
TGCGAAAACGTGAAAATGTAATGCATATGGAAAAAAATATGTATCAAAAT
TATGAATTGGTACGATTTCGCGTAACACGATGAAACGTTAGCGACTGGGC
TCTATGGTAAGGATTTCTGGTCGACGTATTTTTTGATGCGACTGTTTTTT
GTGAGACTTAAGCGTTACCGCCGGTTCCTTTCATGGAACTTTCGTAGTAA
AACGGATTGGGCTTTTCCAGAAAATTGTTTTACCCCCACTGTTGAGGATA
TTGATTTTTCGAAGTATCAAACCCCCTGGATATCCTACTTTATTAGTAAA
GACCCCCTGAATATCCTCTCTTAAAAAGATGCTTATCGTATTTTTTTACT
TGAAAAGACACTTTACTCCTTGGATATCCGCTCCCTTGTAAATATTTAAC
CCCCTGGATATCCACTTTTGAACAAAAATCGTTAACCCCCTGGATATCCG
ATATCCTCAACAGGGGGGGCAGGACTATTTCTGGAAAAGCCCATTAGCTC
AGGAAATCAGTACAGTACAAGAAATCAGCTAGTTCTGTTTTTCAAACAAA
AAAGACGACAGAAAACCGATTAGAGGCTAACAGCAGGATTCAAAGCCGGA
AAAACTAAATAGAAGCTCTCGAAAATATCATTCGAAAATGATGACCTTAT
TTGCGTCCTTTTTAACAATTAAAACCAAAAGGGTACAAGGGATTTTGTGA
AAACTCTAGATTGTTTTAATATTTACCGGAGATAAGAGTGGAAAAAACGG
TAATTAAAATCCCTCTCGGTGACGTCATAAGTTATCATGTTTTTCTTGTG
TTTAACATGGATGTTACTATTTACAAGGTGGGTGTAAGAAGGGAGTATTG
TAAAGCCAACAAAGTAAGAAAAACTTCGTAAACCGGGGGTTCCATAGGTA
AAAGGTGGGCGTAAAATGGCAAGAAAGAAGTCTCATATGAACCTTTAGAA
ACAATCTAAATGCGTGGGAAGAGAGAGTTTTACCGTGTCTGTTACGATTT
CAGAGAATATCTTTTCTGAGAGCCAGTGAATTGACATGAAAGACAAGACT
ATGGGGATCTTTTGGAGCAAGTAAAATCAAGTACCGTTTTTAAAGTCCTT
CTTGAAAGGATACAGCACACGTTTTATATAAGGATATTCAAAATTTTCAG
TCTTCGGATATTCGGATAAAGTTTTGTGTTTTAAGTCTAAAAATGTTATT
AAAAAATGTTCTTAACCACTTTGAGAGTATTTTTCTGCAATATTGCTAAG
GAATGGAATGTTTACGCAAGTCCACAAAGCATTAAAGTGTTAAGGTGGAG
GTTTTCTTAACATTTTAGCCATCTTATGTTCTCATTTAAAATCTGACTGA
AGACTGCCTGAAACGGCACGAAACTCCGAATATCAGAAAATAAACTAGTC
TCTATTATTGACTGATACACTAACTTTTATATTTACCATGGACCAAGTTT
CTCAATCCCGGCCAAGTAAAATCTTTGATCGGAGTTTTTTGAAAAGTGGT
ACCCTAATGGGAGCACTACTCAATGTTGTTGAAAATGCATCGAGAACGCT
AGATCTACTTTTCCTCGAATACTGTTGATGATGTAGCGCCGTTAAACGTT
AATTTTTAACATTGCAATGGCTTCTTCTCGGGTACCAATTCCAAAAAAAC
TGCGATCAAAGATGGCGGATATAGCTTGGTCCAGGGATATATAAAGGTCA
GATTAAAAGGTGTGAAAGAGAATTCCGAAATTCAACTATTAGCTGAAACT
TTGACACTGTAATTTGACACTGTGTGACGTTAAAACAAGGAGAATATGAG
GTCATTGTGAAGAGGCAGATTTTTCTTAAAAAGATAATTCAATATTCCAG
CGGAATTTATTGGGAAATACTTGAGATCCTAAAAGACAGGTGAATTTTTA
GAGGGGAAGAGCTAAATCTATAAAGAATGATTGGAAAAGTAATAATGAAA
TTTATTGAAATTATTTTTTCCATTGTTTGTTTAAAAATATTGAAACATAA
AGTTTTTCCTATATTCATCTTTCTAATCTATCTGGGACATTGGTGAAATT
GAGCTTTTGATAAAAGTTTCAAGATGGCGTCTGAAAGATATATCGATTCA
AAAACTATAAAAAGTGAGATTTTGAAAAAATTCCATGATTTTTTGGAGTC
ACTTATTTGGGTCCAGAAGATGTATTTTGAAGATTAAATCAGCAATGACA
AAACTTTAAAGCACCAGCAATGATAGACTAAACTTTAAAACACAAGAGAA
CCTTTATGTTTGGAAGGGAAGTATATGACAATTTTGTGTAGTCATTTATT
TGGGTCCGGATAATGTATCTTCGATAGAAATGGGGTCCGAAGCGAAGCGA
AGTCGATTATATTTCCAGTTAGATTCAGGCACCTCGAAGAACTTAGAATA
TCTTTATCGAACACATCACAATATTACTGTAAAGGTTGACTAAAATTCTG
ATTTCAAACTTAGAGTTTCATAGTGCTTTTAGAGTCATAGATCTTTAGTG
AATTTAAAAAGCACCGCTTAGATCTGGGAATTTTTTAAATATTATGCTCC
TGATAATGGGGTGTATAATTGACAAAGTTAATTTACTCTCGAATCTCCAG
CAGTTTTCGAGTGAATCGATTTGAGTTTTTGAGCATATATAACCCTGGTG
CACTAAAAACAACAAGGAAAGGCTTTCAGTGTTTTTAGATGTTTAAAGAA
GCGTTGGAACTTTTTTCTATTTTGAACAAAAATATAGACGTATTTCGGCT
ATATGGGAATGATATATTTCTCCTATGCAATTAATAAAGACTTAATTTTC
GAACCTCTGCAGAGCTTTAGTAAAGTTATATTGAGAAAGAGAAAGCTATT
TCTTGGCCTTATACATTAAAGGCTTCTGGCCCTAAATGTATGAAATTGGT
AAAATAATATTAGTACAGTGAGATAGGAAACAAATTTTATTAACATAGTC
GTGAGAGATTTCCTATCAAAATGGAAAAGCATCCGAAAAGCGAAAATTTT
GAAAATTATTATTGGAATAGACTTTTATATATCAATAACAACATAATGGT
ACGAGAACTTTCATGTTTTTGTTGAAGGCTAGCAAACAAGTGCGTGTGAG
TAGGAAAGGGAACCCGAAGGAACAAACAGCGTTTGGTTCATTTGAAAATT
CTATATTTTCTATGATACACTTTATTGCAAATTACTGTATATTACACATC
CCAGATGGCACACGACGTCCATATAACGTTAGGTGAACGTCGAAACAACG
TTGTGTGCCAGCTGGGATATAGCATTTCTCTATATCGAGGTCTTTCATAT
TTTATTAAGTTACGTAACTTCCACCATTATGAAGAAAGCGTTCGATCTGG
GTAAGGGATCACCTCTTTGCTACCATTATGGTGGAAAATCCACAACTCAA
GAAATCATGAAAAACCTCTATAGCAAAAAAAACAAAGATCCGTTTCGAAC
CCAATATTTTAGGTTATGACAAGTTCTATAACGACGATTTTGGAAATGTT
TTTAATTTATTGGCTTTTGATGTAATAGTATGTAAGTGCATTTGAGAAGA
CAAAAATTTGTTGATAAGCCCAAGGCATACATAGCGTCAGCCCCCCCCCG
GGTTACACCTTCCAAAAGGCCAAAAAAAGGTGGGGGATGGTTTCATCCAT
GATTTTGAGTCCCCCCTTAAAACACAAATCACCCCTTATCAATTTATCCC
CCCTTAAAGCTTAAAGATGGTTTTGAGGTGCCCATTAAGTCTTACTGCCC
CCTTAAATTTGCAAGACTCTGATGTATACATGCCCTTAATTTTTGGGGTG
TAGAGACAAGCGAGAAATTAGTCCTTAAGCTCTTCTACTGATATTTCTTT
CTTTCTTTTGTGAAAAAGTTTTTTATCATTATATACTTTTCTAAACCAGC
AAATTTAAAATATTAGTAGAGAATGATAAACTGCAATAAACAATATACCT
GGTATAAAAATCCCTACAATACACTTTTCTAGAATCGTTTTCTCCTCAAA
CTGATAGCATTTGAACAAAACTATTCCATATAGAAGCAGAACAGAAAAAT
ATTCCAAATTGAATGTCTTTAATATTGTTGTCAGCATATTGGTCTTGGGG
CGCAGTTAGATTTTCATTTAATAATGCTATATTGTACACAAAAAACTTCT
AAATTAGCTAGATTGCAAAGAAGTTACCAATGAACTGTATTGCGAGCGAA
GCGATCGAAAAAAATTGCAAGAAAGGAACAAGATTACTCCCCCTCAAGTA
AAGGGCTTCCATTTGACCCTTGAGACCAAGTCCCCCCTTATTTCTCAGTT
TTTAACATTTTTGCCCCTTGTGTTTTTCTCTAAATTTTAAATCACCCCTT
ATTTTAAGGGGGGGCTGAAACCATGGGGGCTAAAGATGTTTCAAATATTT
GGGGGGACCTAATGGGGGAGCTGAAATCTCATCATTCAACGTGGGGGCTG
AATATTTCATCTTATCGGAGCCAAGAGAGTTGATTTAATCAAGGATAGCG
AATTTTGTGGGAGTGGCTGAAATACATGTGTTTTGGGAAGAATAATTTAT
AATTTTAATAAAGATCACTTAACCCTCACAAATTCGAGCTCGAAAGAAAT
GTTTAATTTATTCGAATTACAGAGAGATTTGAATGATAGAAAGTTTACAG
TATGTAAAACAAACAGTATTAAGGGGTTCGAATTCTGATACGTGACCAGA
TATGGTCCAGTCCCTAGGATCGCATAATGAAAAATCTTTCGCTAAATTTT
TCGATTCTCAGAGCTAGACAATTTGACACCATTTGTAACATAGGGATTAC
AAAAAATGACCCGAACCGTTTGATGTGTGTTTTCATCGTTTTACGTGAAA
TCGTATAAATTCATAATTTTGATTTTTTTCTCCATATTTATGATAAACAT
GAAGTTTCATGTTTCAAACGAAGATTTATATATTAAAAAGAAATGGAAAC
CAGATTTTAGTTTTGAGAAAGTGTATTCAATGTGTCTAATCTTAAAGTAA
ATCCTGCTTGCTTCACAGAGTTTCGCACAGAAGGGTCTCCCACAATTCAA
TAGAGATAATAGATAATAGAAAATAGCCACGTTAAGTTATAACGGGAAAA
AAACTTGGCTGTGTTATTTTTAATTTGTGGTCAATCTGCGGTGCCATTGT
TTTACTTTTAGCCAATCAAAGTGCTTTTAATGATCCTTACAGTGCAAAAA
AGATTTTTAAGGTGGTATAAACTCTCAAATCAAATCTCCAGCATCTGTGG
CGATGGGAGGATGGATGTGATAAGATTGATTACAACACAGTTGACTTTCG
CTAACTCGAATTCGAACAGGGGATCACATTCGTTCGAATTACAGAGAGAT
TCGAATTATAGAAGGTATTTCAAGAGGGTTTCTCCTTGACGGGAAATGGA
GAAAAGTTCGAATTATAGAAAGATTCGAATAATAGAAGTTAGAAATAGGG
TGAGAGGTTACTGTATTATTTCTTATTTTCTACTTCTGCAGGTAAAATCA
ACAACAAAAAAAAATTAATCAAAAATAATATTAGCACAACCAAGATGGGA
GGTCTAGATGAAACATTCGCTGAAGCGATGGTGGTTGTAATGTCATTAAT
GAGTGCAATCATTATCATTATAAATGCTGGATGTATTTACATCATCCAAT
GGTCTTCAGTTCTCCGTCAAAAAACGGCTAGTATCTTTGTCTACAGTATA
TTGACGCTACATTTACTGCAAGGTAAATAAAGGGCCTTTCCTCACTTTCA
TCTATATTTTTGTGGAAACAGTCAAAGTGTGCCAAATGAAAAACAGCCAA
AATGATTACAAATGATTATGTCAATAGATTAGTCAAATTACGAAAGAAAT
AAAGTACAATAGAAATTACAGTTAACTTTCTCTAGTTCGATATTGGATTA
AGGGCCTTCAATTATAGAATTATAGAAGGAGATTACAGATTAGAACAAAA
AGTTTTACGATTTCAAGGTTGAGCGGATCAATCTTTTAGTTCGAATTAAA
GAGATATTCAAATGATAGAGGTTCAAAATGATAGAGTCAGGGGTTTTGCT
TTGTTTTTGGTAGGCTGGCGAATGAAAAATTAATTCTAGCGATTTCTAGA
TTCTAGGCCGGCGAATTCTTAGCAAGCAGTGTATTGATTAGCGTAAATAT
TTGCAAATCTGACTTGCGAATCAAGAAAGTGCTCTATACGATATATCAGT
CAAGAATAGAGACAAATTTATTTTCCGATACTCGGAGTTTCGTGGAGCAG
ACTGTACTCATGATTTTTAGGGGTTAAACTATCGTTATTCGAATTTATCT
CATGCTTGAGTTAGCATGTCTGTCTGTGTTTTTTAATTTTATTTAGTCTT
CAAAAAATTAACCTCCGTACTATATAACTATCCCTCTTTAACCCTTTTCG
CCCTACAGCTCCGCTGGGGCAGTCCCCAGATAGGCCTATCACTGACGGTC
TACATCTTCTAAATGAAGGAGTCTCTTGAGCTTTCGTATCTTCTCTTGGA
AGGAGCAAGAAAGAAGCCGGCCCGTTTTGAGCTGGCCCGTTTTGAGCTGG
CCCGTTTTGAGCTGGCCCGTTTTGAGCTGGCCCTTCCCCTTCAGCGATGT
CTCGTAAAGCAAGAGAAATTCTGAATGTGCAAAGCTCTTGGACTGAAAGG
GTTAAACTATGGTACTTTAATGTTTTAGGCTGTTTTGTTATCCCTTTCTA
CGCTGCCAAGAAATCAAAAATCGACAGCATTGAATCTAAGAAATTCATTT
GCGATGGTTTCCGATTCAGTTATATGATCACTTTCTATGGAGCATGTATC
AACGTCCTTCTCATCGGTGGAGATCGTTTGCTGGCTATCAGGCTAATGAC
GTCGTACAAGCTAGTAGTGACTAGACGGCGTGCCATAATAGCTACCATTA
GCCTGTGGACTTATGTGTTGGTTTTATGTTTAATACCGTTCGTACCACCA
GAGTCTGAAAAGTTTTGCCGTTACAATCAACAGGATGAGTGGACGACGTT
CATGTTGTTTTTCAATACACTGTTACCGTACATATTTGTGATTGTCAGCT
ATATGTATATTACTGTCAAACTGGATGAGATACAACAGAAAACGCAAGCG
TA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000142_pilon:523142..530993- >MSTRG.15756.2.p1 ID=MSTRG.15756.2.p1|Name=MSTRG.15756.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=900bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:523142..530993- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCTGTTTTGTTATCCCTTTCTACGCTGCCAAGAAATCAAAAATCGACAGC
ATTGAATCTAAGAAATTCATTTGCGATGGTTTCCGATTCAGTTATATGAT
CACTTTCTATGGAGCATGTATCAACGTCCTTCTCATCGGTGGAGATCGTT
TGCTGGCTATCAGGCTAATGACGTCGTACAAGCTAGTAGTGACTAGACGG
CGTGCCATAATAGCTACCATTAGCCTGTGGACTTATGTGTTGGTTTTATG
TTTAATACCGTTCGTACCACCAGAGTCTGAAAAGTTTTGCCGTTACAATC
AACAGGATGAGTGGACGACGTTCATGTTGTTTTTCAATACACTGTTACCG
TACATATTTGTGATTGTCAGCTATATGTATATTACTGTCAAACTGGATGA
GATACAACAGAAAACGCAAGCGGTTTACGGGTGGAGAGATGAACCATATG
GCTGTTTTGTTATCCCTTTCTACGCTGCCAAGAAATCAAAAATCGACAGC
ATTGAATCTAAGAAATTCATTTGCGATGGTTTCCGATTCAGTTATATGAT
CACTTTCTATGGAGCATGTATCAACGTCCTTCTCATCGGTGGAGATCGTT
TGCTGGCTATCAGGCTAATGACGTCGTACAAGCTAGTAGTGACTAGACGG
CGTGCCATAATAGCTACCATTAGCCTGTGGACTTATGTGTTGGTTTTATG
TTTAATACCGTTCGTACCACCAGAGTCTGAAAAGTTTTGCCGTTACAATC
AACAGGATGAGTGGACGACGTTCATGTTGTTTTTCAATACACTGTTACCG
TACATATTTGTGATTGTCAGCTATATGTATATTACTGTCAAACTGGATGA
GATACAACAGAAAACGCAAGCGGTTTACGGGTGGAGAGATGAACCATATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000142_pilon | genome | sc0000142_pilon:523142..530993 - |
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