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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000142_pilon:459579..474107+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15752.1.p2 ID=MSTRG.15752.1.p2|Name=MSTRG.15752.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14529bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:459579..474107+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aggtcgtggcttcttcgtaaagacgaaagacagatctcgacttatttcgt
actttccagcctcttgttcgtagtttttctgactttctggttctatgtga
gttattttctatgttttctaacttactgaatgacttaccgacaaaTCGCc
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acccaaccctaccaggtcgcctgcaggtcctgacactattcccgcatgcc
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GTCTGGAACTGGTCTGGtccatagaccttttcgcctttccatccgccata
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tgccttgaagttcatttttgtaaattcttcctcattccgcgcaaaaaatc
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ATTATAGATCACTGAGAAGGAGACCTTTTTCATCTCAGTTCACTTTATTT
TACTTTATAGTTTTTATGAAGACACCACAATGGAGTGTTTAAATCTTCTT
TTTAAATTCTCTATTAGACGACTATTTAATTCTGAAACAATGACTTTAGT
TCATAGGGATTAAAACAAAGATGCATagtttttttgcctttttgccTCTT
TGGCATTATTAAACATTTTAGAcagtctagacttaaactcctatatcagg
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TGCTGCATTTCAcatggcccttctttttggcacccgtggcctttcagtgT
CTTGCCCTGCTGACGGTtgtaaaatctcacccttcataaggcgacaatca
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GCGGGtcggtcgtaaaaattttcgggtttccattttttccatccattttt
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gggacccacctccttaatttggtatcgataccaacatgactttttgaatt
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gaagctattagtatttgtaagaattaaatttgaataataatttagaaaat
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ccctccccctattttggtatcaataccaactgaggataactctttttttc
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atttccacatgaaaacaggtttcagatttcaaaagtttaggcaaaaagag
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taatatttttgaacgaaagaaaggtcattgacagaaaaagtccgacaaat
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gacgcgaaacgaagatatttgtgattgccgcctaacacctcttttatttg
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TACTTCCCACCCCACCCTAGCTAGATGGTGGGGTAAACGATTTtcctaaa
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TGCATAGACTTTGTGAAATAACGCTTAGAAAATATTCTagaaatcatttt
tgtataTAGACTTTTTTGCTCCATTTTCTCTAGGAGTTCAATCTCTTGAA
ATAATTCTGCAAgataatgaaaaattcaaacgtttttgttattttagtat
aaatataaaaactggACTTACTATGGCCTATCTGAGAACAAGTTCTAAGA
GTCTGGAAAcacgtggaaatttttgtttttttgaaggGTGGGGTATGAAT
ATTTTGGTGGTCAAGGGCAGGCTTGTTACTAGATTTAAGGTGGGGTTGGT
TGCAAAGGGtgggggggggcttttttagAGGGTGGAATATCAAcccttga
aatcgaaaatgaaactactgaaaacaaaagtaaaatcggcccgtactcCA
AATCCTCCAATTTTGTAATCTTGATATAAGAGTTTAAGTCTATatgcttt
ttttaaaaaacatagCTTACTGGAAAAAGCGCTAAAAATTACACCAGATA
TGatgctaaaattattttttttgatacaGTAAAAATTACAATTGAAAAAC
AAGCTGTTATAATGTACCCTTAATAAAGCTCTAAAAGAGCATCTAGTGGC
ATGAAAAACAGAATATGAATCTTCAAACCAGAATCAAATCTATAAATCTC
ACTAACAAACTTAAACTTGTAAAGATGGAACAAAATTGATAACGGTCTGT
CATCATTTGACCAACGAAAAACatcaaacaaaagattttctgtctGGAAT
GTtgcaaacatttcaaacaactTCCAACGAACTGATCCCCCATAGCTAAG
TGCCaccatttaaaatttttttaaaacaacagACGCAGGTAGAGGAAGGA
GAAATTCCTGTAAGGGCGAGGTAAATAAATATTAATATTTTATCTATCTG
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gttatttttgttattaaaaaGAATATTACAGGTTGTAGGCACTCAGTGGG
CCCCTAAACTgatctcaattaaaaaattttgtgtATCGAATTTCTTTGGA
TGGTTTTTCCATGCTCctttcaacttttctttgaagCTTTTGATGGACAG
CAATTTATTCCAGGAAAAAATTTTACCGGGTGTCTCAGAAAAAAGTtccc
ctctttgaagtgaattttctcgagttccaTAAACGGTTAAAGAATCAACC
CTTTTGCATTTGAAGGAGGAAggttaaacttaaattttgaggggttgttt
gtcaaatttattcacctaaatcaaaagttatagtctaaatattaaaaaac
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TCATATTTACAAAGTactattgttttttattcatcaggaaatgtatttaa
attttcaccaaaatcaCTTACTTACACAATTAACCATTCCTGCAAATTCG
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CTTTCAATTGATCAAGGGCCTGGGATTGCAAATTTCTGAGTTGTTCCCAG
ATTTCTTGTTTCGTGTAACcccacaaaaagaaaaaacatactGTGAGATC
AGGCGATCTTAGGGGCACTCAACAGCTTGATTGTTGGCCAtttttttGGA
AACTGGCCACAAAGAAGACACAGCGACTTTGATCGTTAATATATTAGTAa
aagaagaatttctttttgatgaTTAAATCAGATTTAATACCCTCGTACTT
ggcttttttaaaacttttttgaaaagtaatgttttagcatttaggccatg
gctttttaTCTAGTTAAGaccaaatttaacaaatgacccctgaAAATCTG
ACTTTATCTTCCGTCTTTCCAATGTCAATGGATTGATTCTTTTTAACCAG
TTCATAGAATgcaagaaaattcacttcaaataAGTTTTATATTTACAATT
AATTTAAAGTGTTTGAAGTGTTTCCTGTTTAAAacctttattattattat
caggTTTCAAGTCTGTTTTTGTTTCtgtaaagggctacatacactacaca
aaatattgtcaggcaatatatcgATAATATATGCTGAGTGTcggaaatat
attgaaaaggtgtccgcaatatattgtcagctcgatttacaatattccaa
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CTATTTGATTTCAATGCTGACATGCTTGGAGGCCGTTTTGAGTTCTTCTG
GGATCGTGGAAGTCTTGTGGCAATGGAAAAAGAAGATCAGCAAAAGTATG
TTGATTTCATGGCTGGCTTATTGCATACAGGAGGATTAGGTCTTCTGGAG
GTTATGGAGTATGATTCTGGTACTGAGCCTCGTCAACCATTTCCATTATA
TAAAGATGATGTTTCAAAGTTGTTTAAAAAGGACTTtgtacaaaaagaaa
ttgatcGACATACGGCAACTCTTAATTATGTAATGACATTTGTTATTtat
gaaattcagaaaatttgttCCAACAGTAAACATTAAAGCAAATAAGAATC
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TGTACTGCTTTTGTGTAATCATTACTATAtgcttatttttcaaattttgg
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ttaaaaaagtaaaatcatttaatttattttagtaatttaTATCATTTTGC
TGTTATTATTGATTTTGGGCCTTGTTATATAAGCAGGAGAAAGTTTTGGT
ACATAAATTCTCCCACTTTTCCCATCaaaaacccaaaggtttggtctaaa
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CcaaactttcctagccaacAACAGTAATCATTTGGATTTGCAAAGTTTTG
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TCGGCCGAAAATTATGCGTATCATCCTCCAATAGCAATTGAATAaagaac
tttcactttcgatttcatgaAAGAATAGATTATAGCGCCATAAATTACGA
TTTTCCAAGGTCacctttacttgaaaaaaactatggaaatattttttatt
tcatgctACTATGTTGCAACCATGGGAAATCCCCCATTTTTACAAACATT
TACAAAGTCTTGGTTAGGAAAGTTGTAAAAGTGTGAAAGATTGGAAAAGT
GGTAAACtttttttcccaaaactttCTCCTGAAGTTTGAGTAGTGAAGTT
TGTAGGGCTTGtattgcttttgatttcaaattatttattattgcttttcg
tatattttagtattttatAGCACAACACCATTTTGTATGATTTgtttatt
aaataaaaattagattctatcacaaacaaaattataaaattttgcaactg
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AATTAGGTGCATTTGTGTATTCTCTAAATTGATATTATACTGTATCACAA
CATTCGTTTTTTGTAATGATTTACCCTGTTTTACTAAAGGGATTTAAACG
GAAAATAATTATGTCTAATGGAAATAAGTTAAATCCTGTTTGGCAAGAAT
CTTGGGACACAAATGACACTATTTGGCAATTACCTGAGGTTAACGTGTCT
TTACAAAAGCACTTCTCAGTATTTGAGTCTGCATCCTTTGAATCAAAAAG
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ATAAAGGTTTTATAGTGGTTGGTGTAGAGGCCATTGGGAAGGCAATAGTG
gaattctttgaagaaaaaaaaatggagTATTCAGTTCAACAAATGGAAGG
GTACAAGGTATATTCTTCAAAAGATTCCAAATTGAAGGTCTTCCAaggaa
atctttttgatttcaaTGCTGACATGCTTGGAGGCCGTTTTGAGTTTTTC
TGGGATCGTGGAAGTCTTGTGGCAATGGAAAAAGAAGATCAGCAAAAGTA
TGTTGATTTCATGGCTGGCGTACTGTGTACTGGTGCCATCGGTCTTCTTG
AAGTCATGGAGTATGAGTCTATTGAGCCTCAACAGCCATTCCCGTTAAAT
CAAAAAGACCTTAACAAGTTATTTAGAAAGGACTTTGTCCAAAAAGAAAT
TGACCGATATGAGGCAACTTTTGATTTTGTCATGACTTTGGTCATTTATA
AAGTTCAGAAAATGTGTTTCAAAGGTAAACAATGAAATAGTAATAATTCA
TTATTACCTAATTATTTGGTTTGTGTAACTCAAAGAAAATGATCTTTAGT
ATTAACGTCGCTTTAGTATCACCCATTGACGTAATTTATCTACTTATCTA
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ATTAACTGCTCAAAGCACTggttttgattaaaaattagATTATAATTTAA
ATATTAATTATTGCAAACTCCATGCATCATAATTATAGGGACATCTGGAT
AGATTTTTTAGCGTTTCTGAAAACTTTATTACAAAGAGataaaaatactt
caaaagttcaagaatacATCAGAAATGTGCATGGCTTTAAAGgggaatta
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aaaaatggaatttaaagaaaaaagaactaATTAAAATTCTTGTATATTTT
ACTAAATTATTTTGCtctttttcaggcaaaaaaatacACCCTCCCATTTT
GTGACGTAGGTTACGCGGATGAGTATACAAAATGTTTTAAGTCTGCAGTA
GTAAAACAAGAAGAATCTTGAATAAATGGTATATTTTACAATATTAAAAC
ATATTGACTCAAGGGCTATCCTTTAACATGGCTACCCTTTAACATGGCTA
CCCTTTAACATGGCTATATTATCTTATCTTCAAAGCTTTTATTTTACGAG
ACAATGAAGAAAAACCTTCAAATTTGAGCCctcgagccttagcaacctgg
ttgccTTTAAAAATCGTTTATTCTCTTTcatttctctctcttttttataa
gttttgaaaATCCCTCCTGGCCTAcatcatgtgccgcgcttaagggtggg
gtttttctacatcccaaaatgcactgtaagggtgtgtatCTGTGAGATtg
caaattcaaaataaaaagaaaggtttttacttctcgtttgtttgaaaaag
tttctattgtctgataattacagctgacaagaataattttctcagttttt
ctttgaaacagaaaatatcTGAAGCTCCTTCTCTTCATGCAGATTTatag
ctgagaaatatagtgcactataagggttgggtaaatcaagagaaaatgca
ctgaaagggtaccttttcagccatattgaactgcactgtaagggtaccat
tttgaaaagcagattttgcgcggcacataccgtcgtttcaaAATCAAATG
GcccccccGGGAATGTAACACCCAGCATTTCTAGACCATGATTTTTGAtg
tagttgaccaaatttgacaaatgaccttttataattttaagtttatcttc
CCTCTTCCCAATGCATTAAGATTGATTGTTTAACAGTAATAGAACTCgac
aaaattcactttaaagagggggacttttttctgggcCACTGGTAtgattt
gtaaattaaatttaaatctaATATATATTACCCTATTAAGTCTCTATTAC
TACACTATCACGTTTATACAACATGGcagtatttttatttaaaaaaaatg
gacaTCCTTATTTTTGAGGTGATTGAATCTACTAATCTACTTTATATCCT
TGAACCTTGTTCAGAAAATCATTAggatttgtttctttttttctctagGT
GCTAATAagaatacattttataaagaaTACGCAATGGGTGACCAGCCAGC
AGTGAATGAAAGATGGCAAGGAAAATGGGACCGTGATGAAATTCGTTGGC
ATATGGATTATGTCAATGCTAATCTTCAAAAGTTTATGCCTGATTTGATA
GAAGAAGGAGCCAGAGTCTTTGTACCATTGTGTGGTAAAACATTGGATAT
GAAATGGTTCTATGATAAAGGCTGTACTGTGGTTGGAGTAGAGGCTGTAG
AAAAAGCTGTTGTTGAATATTTTGCAGAACAGCAAATAGAGTATGAAACA
ACCAATATTGAAGGGTTTCAGGTGTATACATCCAAAGACTCGAGAATGCA
AATCTTCAAAggcaatttgttcaattttaatGAGATCATTGCCGGTGGAA
AATTTGATCACTTTTGGGACAAAAGTAGTTTAGTTGCTATTGATAAAGAT
ACACGTGAGAAGTATGTTGATTTGTTTTCAAGAGTTATGAAATCGGGTTG
CACTGGACTCCTTGAAGTATTTGAGTACGATACATCCTTTCATTCAGAGC
AaccttttccaatttttcctgAAGATATGAATACAATGTATTCTGATTTG
TTTACTTATAAGGAAATTTCTCGATTAGAAGATACCACTTGGGCGTATCC
TAGAAGCACAGTGGCTTACACTGTCACTAGAAAGTGAATTGAACAATAAT
Aattgtcattttttgttttgtttgagttttattttgtttaggttaccttt
ctcatagagagaatattttttttgctttataccTGTTTATACTAGTTATT
TTGTAAAGAACTGAAATGTCATAAAATGACCTTTATATCTATAATTTTGA
TATTGCTGATTTAATATAAAAACATCAATAAATGGATTTGAATTTGCCTT
ATATAAAATGTAAttgcgaaaatattttttgtcacaCTTACAACTCTTTG
AAGGATAAGAATCATCCCTTTAAGCTAACTTTTACAATGCTTTGCTGTTA
TGTTAACGTACCATTTGatacactttttatttttagatgaaGTTCTTTAA
GATAATTTCAGCAGTAACAGTGGCATCTGCAGCAGTGGGTTACCAATGGT
TCAAGCTACCACAACAAGACATTACAAAAGTACGAAAAATGCTTTTCAAA
AATGGAAAACCTGTGGTATTTGCCCACAGAGCTGGACAATTCGAGGCACC
TGAAAACACATTGATTGCTATTGAAACTGCTCACAAGAATGGGGCAACTG
CTGTTGAAATTGATCTTGACTTCACAAAAGATGACATTCCAGTCATCATA
CATGATGATACAGTGGATCGAACAACAAATGGTACTGGGCCACTTAATAT
gtttaattttgaagaattgcgTAGTTTGAATGCTGCTCAAGACCACCCAT
TTATTATTGTTCCAAACAAAAAGATTCCACACCAATACGAACAGATTCCA
ACTTTAGAGGAAGCAGTTAAATCATGTATTGACAAAGGCTTAACCATTGA
CCTTGACGTCAAATCCAGTCCACAAAAAGTTGCAAAAGCTTTGAAAGATG
TGTTACAGAAGTATCCGAATgctcatgaaaatatttttgttacgTCTTTT
TATCCACAATACTTGTACACATTGCGTAGAGAATGTCCTGACTTTGCTTT
TGGTATTATCTGGCGACCCCATTATTTGGCGAAAACAATATCAGGGGAAC
CAAGATATTCACCTTTCCATATGTTTTACATGTCGTTTTTAGATGCTGTT
TTACAGTATTTGGTCCATAATTGGGCTTCACGTTTTCTTGGAATTTCAAT
GGCTGTCACtaacaaaaatgttttatctGAATATTATTTGAAATGCTGGA
GGGATCAGAATGTCGAGTTAATTGTTTGGACTGTTAATAGCCCAACACAa
aaggaatattttttaaatcaccTTGGAGTGCCTATCATCACTGATTCTGT
TCTGGATGATGCTAAATGCAAAGAACAAACAACTTGATTTGGCAAGAATT
GTTAGAAAATAGAATTTTAGAATGCACAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000142_pilon:459579..474107+ >MSTRG.15752.1.p2 ID=MSTRG.15752.1.p2|Name=MSTRG.15752.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=654bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:459579..474107+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGTGACCAGCCAGCAGTGAATGAAAGATGGCAAGGAAAATGGGACCG
TGATGAAATTCGTTGGCATATGGATTATGTCAATGCTAATCTTCAAAAGT
TTATGCCTGATTTGATAGAAGAAGGAGCCAGAGTCTTTGTACCATTGTGT
GGTAAAACATTGGATATGAAATGGTTCTATGATAAAGGCTGTACTGTGGT
TGGAGTAGAGGCTGTAGAAAAAGCTGTTGTTGAATATTTTGCAGAACAGC
AAATAGAGTATGAAACAACCAATATTGAAGGGTTTCAGGTGTATACATCC
AAAGACTCGAGAATGCAAATCTTCAAAggcaatttgttcaattttaatGA
GATCATTGCCGGTGGAAAATTTGATCACTTTTGGGACAAAAGTAGTTTAG
TTGCTATTGATAAAGATACACGTGAGAAGTATGTTGATTTGTTTTCAAGA
GTTATGAAATCGGGTTGCACTGGACTCCTTGAAGTATTTGAGTACGATAC
ATCCTTTCATTCAGAGCAaccttttccaatttttcctgAAGATATGAATA
CAATGTATTCTGATTTGTTTACTTATAAGGAAATTTCTCGATTAGAAGAT
ACCACTTGGGCGTATCCTAGAAGCACAGTGGCTTACACTGTCACTAGAAA
GTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000142_pilon | genome | sc0000142_pilon:459579..474107 + |
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