MSTRG.15734.3.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15734.3.p1
Unique NameMSTRG.15734.3.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000142_pilon:22438..72679-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15734.3.p1 ID=MSTRG.15734.3.p1|Name=MSTRG.15734.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=50242bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:22438..72679- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGGAGACGTCCTATAAAGCTGCCCCGCTGACATTCTTATCAAAATGGTAG CCCGAGTAGTGATGTCCATAAAGTTAGGTAAGTTTGCTCAACTAGTCGCG CGGCTGAGGTCGAAAAACGTTTCATTTCGTGATACATCTTTTAGATTCCA AAAAAAACAACGGAAACTCGCGAATTAGTATGTGTAGATTACAAATCAAA AAAGTTTCCACAATATTATCGTGCAAGTAACGAGTAATTGGCGATTTTTT GCGTTTCCAGGCAAAATTGTAAGGCCTGGAAATTCATGATTTTTGGGGGG GGTCTTCAAATTAAAAAAAAACCTATACCACATGATAGAGCTCTTCAAAC TGAGCAAAAAAGTGTATTATACCAAAGTCCCAACTTCTCTAGATCAAAAT TTATTGGCCTATTTGTGGTCAAAAACTGATGGAAAACAGGGAATTTCCCC ACAATCTGCATTAATTTATGCAAAATTAAACACCTTTTTGACCACAAATA GGCCCATAACTTTTGATCTAGAGAAGTTGGGACTTTGGTGTAATACACTT TTTTGCTCAGTTTGAAGAGCTCTATCATGTGATATAGGTTTTTTTTTAAT TTGAAGACCCCCCAAAAATCATGAATTTCCAGGCCTTGCAATTTTGCAAA CATGTTCGGGCCTCTTGAGTAATACTTTTTAAAAATGGCCCGCACGGGCC CGCGCAGTTTCGGACCATGTTCGGGCCAGATTTTCGAAAACTTGCTACGT TACGATCGCGCGTGTAATTTCAGGACCCAATATTTATATTTTTAAATTTG TTATTTTAGCAAACAAATTTAAAAATCTTCATCTTTATTCAAATATATAT TGTTCAAATATAAAAGTTAATCATCTATCTTCCAAAGTTAAGAAAATTAT TAAAAAGAATGATTTGAATCTTACATAATATGGTCTTCTTTTTATTTTTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000142_pilon:22438..72679-

>MSTRG.15734.3.p1 ID=MSTRG.15734.3.p1|Name=MSTRG.15734.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=8337bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000142_pilon:22438..72679- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTTATGATGTAGATACTGGTCAAATGTCTTATGGAGTTACCTCAATGAAC
AACAGCATACATTCTAGTCAAGCAATATCCCACAATCCAACACTGCAAAG
GTAACTTCAAGTTACCCACAGATGGGATCCTTACCACACAATATGCCCTC
TCCCCATGACGATACTGGAAAAGATATGAGATCAACAACTCCTTTACAAA
GAGATGGTAGATTGTCTGCTAGCCCACACCCTCATGCACTTTGTCCTTAC
TCCAAGAACTGAAATGAAATACCAAAAGATTAACGAAGAATTTGAAATTA
TGATGAAAAAGTCCTCAAATGGGACAATTTCAAGAAAAGAAAACAAGAAT
TGTGGATCTCCAGATGATGACTCTGTCACCTTCACTAAAAGGAAATTTGG
TCTGATGAAGAAGGCTTATGAACTAAGCATCCTGTGTGATTGTGAAATTG
CCTTGATTATCTTCAACTCCAGTAACAAGTTATTCCAATATGCAAGCACA
GACATGGATAAGATTTTGCTGAAATATACAGAATACAATGAACCACACGA
AAGTAGAACAAATGCAGATATTCACGAGATGGGTCGAAAGAAAATCCAAA
TCTCTCGAATCAACGATGAAAGGAACCGTCAGGTCACACAGTTTGAACAA
CAACAAACCAAACATGAACATCAAAGTTGAGCCACCAGACCACATGAGGG
GGCCGTCCCCTTCTATTCACAACTTTCAATCTCCTAATCCATTTCATCAT
ACTGCGCCACCATCGCACCATAAAGACTTTAGTGACCAGAATAATATGAT
GTCACTTGGTGGTGGTGGGCCTATGTCTAAGAGACAGCGTATAGAAGGCC
ATAATGATGGATGGCAGTAGCGCTTCATCATGGATTAACATCACCGCCAC
CACAAAACTTATCTTTACCAAGTCGCAGTCCACACCCAATGAACCCACCA
CCTCTAGGAAACACGAATAACAATATCAGTCGAAGTGGAACACCAAACAT
GAAACAAGGAGGAATGCAAAATTCACGAGCTCAACAAAATCACACACCGA
ATCAACAACTGATGCATGGAAACATGGGAAACTCTGAGTCAATGCCAAAC
AATATGCCTAGTCAGACCTTTGGAGGTGGAGGAGGAGGTGGCTCAATGCA
ACCGCCAAGCTTGCCATCAAATTTCCCAACGAGTTATTCAAGTTATGATG
TAGATACTGGTCAAATGTCTTATGGAGTTACCTCAATGAACAACAGCATA
CATTCTAGTCAAGCAATATCCCACAATCCAACACTGCAAAGGTAACTTCA
AGTTACCCACAGATGGGATCCTTACCACACAATATGCCCTCTCCCCATGA
CGATACTGGAAAAGATATGAGATCAACAACTCCTTTACAAAGAGATGGTA
GATTGTCTGCTAGCCCACACCCTCATGCACTTTGTCCTTACTCCAAGAAC
TGAAATGAAATACCAAAAGATTAACGAAGAATTTGAAATTATGATGAAAA
AGTCCTCAAATGGGACAATTTCAAGAAAAGAAAACAAGAATTGTGGATCT
CCAGATGATGACTCTGTCACCTTCACTAAAAGGAAATTTGGTCTGATGAA
GAAGGCTTATGAACTAAGCATCCTGTGTGATTGTGAAATTGCCTTGATTA
TCTTCAACTCCAGTAACAAGTTATTCCAATATGCAAGCACAGACATGGAT
AAGATTTTGCTGAAATATACAGAATACAATGAACCACACGAAAGTAGAAC
AAATGCAGATATTCACGAGATGGGTCGAAAGAAAATCCAAATCTCTCGAA
TCAACGATGAAAGGAACCGTCAGGTCACACAGTTTGAACAACAACAAACC
AAACATGAACATCAAAGTTGAGCCACCAGACCACATGAGGGGGCCGTCCC
CTTCTATTCACAACTTTCAATCTCCTAATCCATTTCATCATACTGCGCCA
CCATCGCACCATAAAGACTTTAGTGACCAGAATAATATGATGTCACTTGG
TGGTGGTGGGCCTATGTCTAAGAGACAGCGTATAGAAGGCCATAATGATG
GATGGCAGTAGCGCTTCATCATGGATTAACATCACCGCCACCACAAAACT
TATCTTTACCAAGTCGCAGTCCACACCCAATGAACCCACCACCTCTAGGA
AACACGAATAACAATATCAGTCGAAGTGGAACACCAAACATGAAACAAGG
AGGAATGCAAAATTCACGAGCTCAACAAAATCACACACCGAATCAACAAC
TGATGCATGGAAACATGGGAAACTCTGAGTCAATGCCAAACAATATGCCT
AGTCAGACCTTTGGAGGTGGAGGAGGAGGTGGCTCAATGCAACCGCCAAG
CTTGCCATCAAATTTCCCAACGAGTTATTCAAGTTATGATGTAGATACTG
GTCAAATGTCTTATGGAGTTACCTCAATGAACAACAGCATACATTCTAGT
CAAGCAATATCCCACAATCCAACACTGCAAAGGTAACTTCAAGTTACCCA
CAGATGGGATCCTTACCACACAATATGCCCTCTCCCCATGACGATACTGG
AAAAGATATGAGATCAACAACTCCTTTACAAAGAGATGGTAGATTGTCTG
CTAGCCCACACCCTCATGCACTTTGTCCTTACTCCAAGAACTGAAATGAA
ATACCAAAAGATTAACGAAGAATTTGAAATTATGATGAAAAAGTCCTCAA
ATGGGACAATTTCAAGAAAAGAAAACAAGAATTGTGGATCTCCAGATGAT
GACTCTGTCACCTTCACTAAAAGGAAATTTGGTCTGATGAAGAAGGCTTA
TGAACTAAGCATCCTGTGTGATTGTGAAATTGCCTTGATTATCTTCAACT
CCAGTAACAAGTTATTCCAATATGCAAGCACAGACATGGATAAGATTTTG
CTGAAATATACAGAATACAATGAACCACACGAAAGTAGAACAAATGCAGA
TATTCACGAGATGGGTCGAAAGAAAATCCAAATCTCTCGAATCAACGATG
AAAGGAACCGTCAGGTCACACAGTTTGAACAACAACAAACCAAACATGAA
CATCAAAGTTGAGCCACCAGACCACATGAGGGGGCCGTCCCCTTCTATTC
ACAACTTTCAATCTCCTAATCCATTTCATCATACTGCGCCACCATCGCAC
CATAAAGACTTTAGTGACCAGAATAATATGATGTCACTTGGTGGTGGTGG
GCCTATGTCTAAGAGACAGCGTATAGAAGGCCATAATGATGGATGGCAGT
AGCGCTTCATCATGGATTAACATCACCGCCACCACAAAACTTATCTTTAC
CAAGTCGCAGTCCACACCCAATGAACCCACCACCTCTAGGAAACACGAAT
AACAATATCAGTCGAAGTGGAACACCAAACATGAAACAAGGAGGAATGCA
AAATTCACGAGCTCAACAAAATCACACACCGAATCAACAACTGATGCATG
GAAACATGGGAAACTCTGAGTCAATGCCAAACAATATGCCTAGTCAGACC
TTTGGAGGTGGAGGAGGAGGTGGCTCAATGCAACCGCCAAGCTTGCCATC
AAATTTCCCAACGAGTTATTCAAGTTATGATGTAGATACTGGTCAAATGT
CTTATGGAGTTACCTCAATGAACAACAGCATACATTCTAGTCAAGCAATA
TCCCACAATCCAACACTGCAAAGGTAACTTCAAGTTACCCACAGATGGGA
TCCTTACCACACAATATGCCCTCTCCCCATGACGATACTGGAAAAGATAT
GAGATCAACAACTCCTTTACAAAGAGATGGTAGATTGTCTGCTAGCCCAC
ACCCTCATGCACTTTGTCCTTACTCCAAGAACTGAAATGAAATACCAAAA
GATTAACGAAGAATTTGAAATTATGATGAAAAAGTCCTCAAATGGGACAA
TTTCAAGAAAAGAAAACAAGAATTGTGGATCTCCAGATGATGACTCTGTC
ACCTTCACTAAAAGGAAATTTGGTCTGATGAAGAAGGCTTATGAACTAAG
CATCCTGTGTGATTGTGAAATTGCCTTGATTATCTTCAACTCCAGTAACA
AGTTATTCCAATATGCAAGCACAGACATGGATAAGATTTTGCTGAAATAT
ACAGAATACAATGAACCACACGAAAGTAGAACAAATGCAGATATTCACGA
GATGGGTCGAAAGAAAATCCAAATCTCTCGAATCAACGATGAAAGGAACC
GTCAGGTCACACAGTTTGAACAACAACAAACCAAACATGAACATCAAAGT
TGAGCCACCAGACCACATGAGGGGGCCGTCCCCTTCTATTCACAACTTTC
AATCTCCTAATCCATTTCATCATACTGCGCCACCATCGCACCATAAAGAC
TTTAGTGACCAGAATAATATGATGTCACTTGGTGGTGGTGGGCCTATGTC
TAAGAGACAGCGTATAGAAGGCCATAATGATGGATGGCAGTAGCGCTTCA
TCATGGATTAACATCACCGCCACCACAAAACTTATCTTTACCAAGTCGCA
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GAAACTCTGAGTCAATGCCAAACAATATGCCTAGTCAGACCTTTGGAGGT
GGAGGAGGAGGTGGCTCAATGCAACCGCCAAGCTTGCCATCAAATTTCCC
AACGAGTTATTCAAGTTATGATGTAGATACTGGTCAAATGTCTTATGGAG
TTACCTCAATGAACAACAGCATACATTCTAGTCAAGCAATATCCCACAAT
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CACTTTGTCCTTACTCCAAGAACTGAAATGAAATACCAAAAGATTAACGA
AGAATTTGAAATTATGATGAAAAAGTCCTCAAATGGGACAATTTCAAGAA
AAGAAAACAAGAATTGTGGATCTCCAGATGATGACTCTGTCACCTTCACT
AAAAGGAAATTTGGTCTGATGAAGAAGGCTTATGAACTAAGCATCCTGTG
TGATTGTGAAATTGCCTTGATTATCTTCAACTCCAGTAACAAGTTATTCC
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GGAACACCAAACATGAAACAAGGAGGAATGCAAAATTCACGAGCTCAACA
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GGTGGCTCAATGCAACCGCCAAGCTTGCCATCAAATTTCCCAACGAGTTA
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TGAACAACAGCATACATTCTAGTCAAGCAATATCCCACAATCCAACACTG
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CCAAATCTCTCGAATCAACGATGAAAGGAACCGTCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15734MSTRG.15734Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15734.3.p1.exon19MSTRG.15734.3.p1.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon18MSTRG.15734.3.p1.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon17MSTRG.15734.3.p1.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon16MSTRG.15734.3.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon15MSTRG.15734.3.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon14MSTRG.15734.3.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon13MSTRG.15734.3.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon12MSTRG.15734.3.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon11MSTRG.15734.3.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon10MSTRG.15734.3.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon9MSTRG.15734.3.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon8MSTRG.15734.3.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon7MSTRG.15734.3.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon6MSTRG.15734.3.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon5MSTRG.15734.3.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon4MSTRG.15734.3.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon3MSTRG.15734.3.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon2MSTRG.15734.3.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15734.3.p1.exon1MSTRG.15734.3.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15734.3.p1MSTRG.15734.3.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000142_pilongenomesc0000142_pilon:22438..72679 -