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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000141_pilon:396906..401976- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15700.3.p1 ID=MSTRG.15700.3.p1|Name=MSTRG.15700.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5071bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000141_pilon:396906..401976- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTAAAAAAGTTCAGACTGTCAACAAAGTGTTGAAAAACTTTATACTGTAA
AACTTCGTGGATAATTTAGTTTGTATTTCTCTTTCTCTTTCAGAAAAATA
TTTATGTGGTTTGTTTAGTTGTTTGTGGAGTAGCTTATTGTGTAGTGTAA
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TTAATAACATTTTTATTAACATTGTAAATGTTGAAATGATGAATGTCTTC
TTTTTTATCTAGGTTGTTCATTCATCAAATATGCAAACAGATTACAAGCA
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TCTTCATTGACTCACTAATTCCAACTTTTGCAATAAGTTGATATACTAAA
TCTAGCTTTATCTTACATTTTGGTATTGAAGAAATTAGATTTTGACTGTA
GGTATTTTACTTTACCCTTTGATCAAATATGTATACATTATTACAATCTT
TTCAGGGATGCTCTTCACCTCTTGTTGTTAAAATTGCTGATACAGAAAAG
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ATGGCAATGCCAAATACACCTGTTCCAGCTCAGCTTGTTAGTAATCCTGG
ATTCGCTAATATGAACAATAACACTTTACCAAATGGTGTCAGTGCTGCTC
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CAAACACAACAAGCAAACTCTTCACTATTCAGTTCTAGTATTGGTCAACA
GTTACCTACAAGTAGTTTCACCACGTCACAAAGCGCAACAAATCCATTAG
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TGATGCTCAGTAACTAAAGAGAAGGGTCAAGAGTAAGTAAATAAATCCTG
GGAAAAGAGCGGTATCGCCCTGTGGTTGCAACTTTCTTTCTACTATTAAT
AAACCTGAATAAACAATTAACTTAGTTAAACAGGGAATGTAAGCAAGCTC
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AATTCTATTGCTAACCTTGGTGGACTAAACAATATGGCTAATCTTGCAAG
TATGACAGGTTTAAGTTCTACTCAAGTTGCAGCAAACCCAGCGGTAGTTG
CTGCTGCAGCAGCAGCCTCGGGGCCACTTCAAAGCCTCCCAAATATTCCT
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AACTGCTTACTCAGGAGTCGAGCAATTTGTTGGTAAGACTGTCAAACAAA
CAGTCTTATCAAGTGCATAGGAAATGTGTCAAAAACTTCTTGTTTATTTT
GAAGATTTATCATCTTTGTGTTGTTGCTTTTCATTTCTTTCTGTTTTGTC
ATGTTGTTTTTATTGTATGTTATAAATTATGTGTGCACAAGAAGTTGGGA
GTTGCGTGCAAGAAGTGTGGAAATTTTAAAATATTGATTTTGCATTCAAG
CTACTTTTCACATTTTTGTTCAGCAACTTTCATAATGTATGTCATTGTCT
TATGCATTTGATAAGTGTTTGTCTTTGTCCTGTTTTTGTCTAATTGTATT
GATGACCTTCAATGACCATTTAAAAAAAAGGAGGGATGTGTAAATGATTT
CCCTGTATATTTAAAGTAGATATTATTCATAGTTCTAGATGAGGGTTGAT
ATGTATCATTTCCATTATATTTCTGCTACTTCAACTAGCAATTCTTATTT
GATCATGTGAGAATTATGCAAACCTATACTTTCTAATGTTGACTCTTCGT
AGAGCTTTATTCTTTAGATTTTTATGTGCTTACTTTGAATTCGGTATTTC
TAAATCTTGTTTATTTTTAATTAAAGCTGCACTTCCACAAGCGTATCAAA
ATTTACAAAGGCAGAATGTCGCACAACCCCAAAAAGAAGGTTAATTGTTA
TTTTGTCTGTTTTATTTTGAATGACTTTATTTTTCTATTTAAAGTTAATT
GTTATTACTGGCAAGAACCTTATTGATCATGTTGATTTTTATTTGCTTTC
AGGTCCTGATGGTTCAAATCTGTTCATTTACCACCTTCCACCTGAATTTA
CCGATGCTGATCTGATGCAGACCTTTATGCCATTTGGAAATGTTCTCTCT
GCTAAAGTCTTCATTGACAAACCTACGTTGTTGAGCAAATGTTTTGGTAA
TTGTTATTTTATAAACACTTTATTTTTTTGTTGATCAGATGAAATTAATA
GTTTGTGAATAGCACTCATATTTTTTCATTGTGTTACTTGTAAATTATCC
TTTTTAAACTTTAGCACATGTATCATTTTGTAACTTGCAATGTTTTGTAA
TGTTTACTTTTTTTCAGGTTTTGTCAGTTTTGACAACCAACACAGTGCCA
GGCAAGCTATTGAAGCAATGAATGGATTTAGTGTTGGTTCCAAGCGGTTA
AAGGTTCAGTTGAAGCGACCAAAAGACCAAAACAAACCATATTAAAAAAA
CATGCATGGTAAATTGAAAAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000141_pilon:396906..401976- >MSTRG.15700.3.p1 ID=MSTRG.15700.3.p1|Name=MSTRG.15700.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=10776bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000141_pilon:396906..401976- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTTTTGTCAGTTTTGACAACCAACACAGTGCCAGGCAAGCTATTGAAGCA ATGAATGGATTTAGTGTTGGTTCCAAGCGGTTAAAGGTTCAGTTGAAGCG ACCAAAAGACCAAAACAAACCATATTAAGTCCTGATGGTTCAAATCTGTT CATTTACCACCTTCCACCTGAATTTACCGATGCTGATCTGATGCAGACCT TTATGCCATTTGGAAATGTTCTCTCTGCTAAAGTCTTCATTGACAAACCT ACGTTGTTGAGCAAATGTTTTGCTGCACTTCCACAAGCGTATCAAAATTT ACAAAGGCAGAATGTCGCACAACCCCAAAAAGAAGGGATGCTCTTCACCT CTTGTTGTTAAAATTGCTGATACAGAAAAGGACAAATTGCAAAAACGTAT GCAAGCTATGGCAACTAATTTAGTCGGACTTGGTATGACAATGAGCCAAT TTGGAATGCCTGGAGGCTTAATAAACAATGCATATCCTAATGTAGGACAA AATAATGCATATCAACAACTTTTAACACAAATGGCAATGCCAAATACACC TGTTCCAGCTCAGCTTGTTAGTAATCCTGGATTCGCTAATATGAACAATA ACACTTTACCAAATGGTGTCAGTGCTGCTCTCGTGGCTGCAATGGCAAAC CAGCAACAACAACAATTACAAGGACTTACTCAAACACAACAAGCAAACTC TTCACTATTCAGTTCTAGTATTGGTCAACAGTTACCTACAAGTAGTTTCA CCACGTCACAAAGCGCAACAAATCCATTAGCTAATAATGGTTTGTCTGCT CTTCAAACTAACATATCAGGTTGTTCATTCATCAAATATGCAAACAGATT ACAAGCACAAAATGCTATTAGAAAGTTGCACGGCTCTCAGACTATGGAGT GTGGCCATGCAATGCAAGTCAAACCTGCAGTATCAGAGACGAAAACTGAA GATAGAAAATTATTCATTGGAATGTTATCCAAGAAATTAAATGAAGAAGA CCTAAGAGTTATGTTTTCCCCCTTTGGAACGATAGAAGAACTGACAGTTT TGAAAAATCCTGATGGAACTAGTAAAGGATGTGCATTTTTAACATACTAT GAGAAAGAATCAGCCCAGCAAGCACAAAATGAACTTCATGAAAAAAAGAC ACTTCCAGGGATGACTATTGATATGACAGCATCAACAAATAATATTGGTA TGGCCAAAGAGCCAGAAGCTTGTAAACTGTTTATTGGACAAGTACCCAGA ACATGGACTGAAAAAGAACTGAAACCTATATTCGATCAATATGGTGAAAT ACATGACCTTACTGTGCTTCATGATAAATACACTGGTCAACATAAAGGTT TTGTCAGTTTTGACAACCAACACAGTGCCAGGCAAGCTATTGAAGCAATG AATGGATTTAGTGTTGGTTCCAAGCGGTTAAAGGTTCAGTTGAAGCGACC AAAAGACCAAAACAAACCATATTAAGTCCTGATGGTTCAAATCTGTTCAT TTACCACCTTCCACCTGAATTTACCGATGCTGATCTGATGCAGACCTTTA TGCCATTTGGAAATGTTCTCTCTGCTAAAGTCTTCATTGACAAACCTACG TTGTTGAGCAAATGTTTTGCTGCACTTCCACAAGCGTATCAAAATTTACA AAGGCAGAATGTCGCACAACCCCAAAAAGAAGGGATGCTCTTCACCTCTT GTTGTTAAAATTGCTGATACAGAAAAGGACAAATTGCAAAAACGTATGCA AGCTATGGCAACTAATTTAGTCGGACTTGGTATGACAATGAGCCAATTTG GAATGCCTGGAGGCTTAATAAACAATGCATATCCTAATGTAGGACAAAAT AATGCATATCAACAACTTTTAACACAAATGGCAATGCCAAATACACCTGT TCCAGCTCAGCTTGTTAGTAATCCTGGATTCGCTAATATGAACAATAACA CTTTACCAAATGGTGTCAGTGCTGCTCTCGTGGCTGCAATGGCAAACCAG CAACAACAACAATTACAAGGACTTACTCAAACACAACAAGCAAACTCTTC ACTATTCAGTTCTAGTATTGGTCAACAGTTACCTACAAGTAGTTTCACCA CGTCACAAAGCGCAACAAATCCATTAGCTAATAATGGTTTGTCTGCTCTT CAAACTAACATATCAGGTTGTTCATTCATCAAATATGCAAACAGATTACA AGCACAAAATGCTATTAGAAAGTTGCACGGCTCTCAGACTATGGAGTGTG GCCATGCAATGCAAGTCAAACCTGCAGTATCAGAGACGAAAACTGAAGAT AGAAAATTATTCATTGGAATGTTATCCAAGAAATTAAATGAAGAAGACCT AAGAGTTATGTTTTCCCCCTTTGGAACGATAGAAGAACTGACAGTTTTGA AAAATCCTGATGGAACTAGTAAAGGATGTGCATTTTTAACATACTATGAG AAAGAATCAGCCCAGCAAGCACAAAATGAACTTCATGAAAAAAAGACACT TCCAGGGATGACTATTGATATGACAGCATCAACAAATAATATTGGTATGG CCAAAGAGCCAGAAGCTTGTAAACTGTTTATTGGACAAGTACCCAGAACA TGGACTGAAAAAGAACTGAAACCTATATTCGATCAATATGGTGAAATACA TGACCTTACTGTGCTTCATGATAAATACACTGGTCAACATAAAGGTTTTG TCAGTTTTGACAACCAACACAGTGCCAGGCAAGCTATTGAAGCAATGAAT GGATTTAGTGTTGGTTCCAAGCGGTTAAAGGTTCAGTTGAAGCGACCAAA AGACCAAAACAAACCATATTAAGTCCTGATGGTTCAAATCTGTTCATTTA CCACCTTCCACCTGAATTTACCGATGCTGATCTGATGCAGACCTTTATGC CATTTGGAAATGTTCTCTCTGCTAAAGTCTTCATTGACAAACCTACGTTG TTGAGCAAATGTTTTGCTGCACTTCCACAAGCGTATCAAAATTTACAAAG GCAGAATGTCGCACAACCCCAAAAAGAAGGGATGCTCTTCACCTCTTGTT GTTAAAATTGCTGATACAGAAAAGGACAAATTGCAAAAACGTATGCAAGC TATGGCAACTAATTTAGTCGGACTTGGTATGACAATGAGCCAATTTGGAA TGCCTGGAGGCTTAATAAACAATGCATATCCTAATGTAGGACAAAATAAT GCATATCAACAACTTTTAACACAAATGGCAATGCCAAATACACCTGTTCC AGCTCAGCTTGTTAGTAATCCTGGATTCGCTAATATGAACAATAACACTT TACCAAATGGTGTCAGTGCTGCTCTCGTGGCTGCAATGGCAAACCAGCAA CAACAACAATTACAAGGACTTACTCAAACACAACAAGCAAACTCTTCACT ATTCAGTTCTAGTATTGGTCAACAGTTACCTACAAGTAGTTTCACCACGT CACAAAGCGCAACAAATCCATTAGCTAATAATGGTTTGTCTGCTCTTCAA 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TTCATTGGAATGTTATCCAAGAAATTAAATGAAGAAGACCTAAGAGTTAT GTTTTCCCCCTTTGGAACGATAGAAGAACTGACAGTTTTGAAAAATCCTG ATGGAACTAGTAAAGGATGTGCATTTTTAACATACTATGAGAAAGAATCA GCCCAGCAAGCACAAAATGAACTTCATGAAAAAAAGACACTTCCAGGGAT GACTATTGATATGACAGCATCAACAAATAATATTGGTATGGCCAAAGAGC CAGAAGCTTGTAAACTGTTTATTGGACAAGTACCCAGAACATGGACTGAA AAAGAACTGAAACCTATATTCGATCAATATGGTGAAATACATGACCTTAC TGTGCTTCATGATAAATACACTGGTCAACATAAAGGTTTTGTCAGTTTTG ACAACCAACACAGTGCCAGGCAAGCTATTGAAGCAATGAATGGATTTAGT GTTGGTTCCAAGCGGTTAAAGGTTCAGTTGAAGCGACCAAAAGACCAAAA CAAACCATATTAAGTCCTGATGGTTCAAATCTGTTCATTTACCACCTTCC ACCTGAATTTACCGATGCTGATCTGATGCAGACCTTTATGCCATTTGGAA ATGTTCTCTCTGCTAAAGTCTTCATTGACAAACCTACGTTGTTGAGCAAA TGTTTTGCTGCACTTCCACAAGCGTATCAAAATTTACAAAGGCAGAATGT CGCACAACCCCAAAAAGAAGGGATGCTCTTCACCTCTTGTTGTTAAAATT GCTGATACAGAAAAGGACAAATTGCAAAAACGTATGCAAGCTATGGCAAC TAATTTAGTCGGACTTGGTATGACAATGAGCCAATTTGGAATGCCTGGAG GCTTAATAAACAATGCATATCCTAATGTAGGACAAAATAATGCATATCAA CAACTTTTAACACAAATGGCAATGCCAAATACACCTGTTCCAGCTCAGCT 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000141_pilon | genome | sc0000141_pilon:396906..401976 - |
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