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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000140_pilon:675226..687034+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15652.3.p4 ID=MSTRG.15652.3.p4|Name=MSTRG.15652.3.p4|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11809bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:675226..687034+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AACCAACGACTGGATGAAGGTCAAACGTGTTATTGTTCTCATGTTCAGAT
GGAGGAACAAGGAACCAAAAAGAGCATTGTTTTCAACAAAGGAGTTGGAG
ACAGCCGGCAAAAAGGTCATCAAAGCTGTTCAAGGTCTCACATTCGATCT
TGAATCTATTTCGAAACGACCAAAAGGAGATTCACTACTACAACTTCAAC
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TCAAGTCTTCAGATCGAATTGAAGCATCCAATCATTCTCCCCAAAGCTCA
TCCACTTTCAAAGATGATACTGCGTTGGTGCCACATCAAAGCAGCGCACA
GCGGCAGAGGTTTGACAATCAACGAAGTAAGAACCTCTGGCTATTGGATC
ATCGGAATCAGCTCGTTAACCAGAAGTTTCATCACAAGCTGTGTCCTCTG
TCGTCGATTCAGAGGaaaaaaaTGCAACAAAAGATGGCAGACCTACCAGA
AGACAGACTGGAACCAGAACCTCCATTCACCTACGCTGCAGTCGACATGT
TTGGACCCTTTGCAATCAAAGTGCGAAGGGCAACTGTGAAGAACTACGTC
GGTTTGTTCACCTGCATGTCTTCAAGAGCTGTCCATCTGGAGAGTACAAC
ATCCATGAATACTGACGCGTTCATTCTGATGCTGAGACGTGTCATCGCCA
GACGAGGCAACATTCGATCACTGAGGTCAGACAATGGCACCAATTTCGTC
GGTGCTGACAATGAGATGAAGAAAGCCATCCATGAACTCGATCACGAACG
GCCGATCGAATCAACGATTTCCTTCAAGGCAACGGAGGAGAATGGCTACA
TTGGAAGAAGAATCCACCAAAGGCCAGCCACATGGGTGGCGTCTGGGAAC
GACAAATCAGGTCAGTACGTTCCATTCTTTCTTCCCTTCTTCACACTCAT
GGCGAAAGTTTGAACGATGAGTCCTTTAGGACGTTGCTGGCTGAAGTTGA
GGCAATCTTAAATTCGAAACCCCTGACTGTTGAAAGCTTGAATGACCCAA
ACAGTCCATTGCCTCTTTCCCCTGCAAATCTGCTTAccatgaaatcgaaa
gtaatcatGCCACCTCCTGGAGTTTTCCAGAAGGCTGATTTATATTGTAG
GAAGCACTGGAGAAGAGTTCAACACATTGCCAACGAGTTTTGGACCCGCT
GGAGGAAGGAATATCTCTCAACCCTACAATCCAGATCAAAATGGAATCAA
CTACAAAGAAACATCAAAGTCGACGACATCGTCATCATCAACGATGAGAG
CAGTCATCGAAACGACTGGAAACTTGGACGAGTTATTGATGTCAATCGAA
GCGATGATGGCAACGTTCGAAGCTGCAAATTGAAGACTTCATCTGGTGAA
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TGAGCTATCGAAACAGCGTCTACAAATACGTGTAGTGTATTATATGTTAT
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TGAAGTCATTCTATATTTCGTCGTCAAAAGAATGAATTGAAGTCATTCTA
TGtgaaatgttattttttcgatttgatTGGTTTACTTGGATGATTTGCTA
ATTACGACAACATGCTTACCAGATTGATAATGATTGATTTCAGGACATAA
GTATGAACTGATGCATACCTTCTTATACTTGTTATGGTGATGGCAATGAA
TGTTGAATTTTTAGTAATCAATGATTAGAACTTGAAACGCTTATGGTATC
GATTCCCCATCGAGGGAGCCTTAtgaacattgaatttcaagatATGATTG
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TTGGATTTGATGTTGGTCAATTTGGTTTTGTCTTGATACCGATGTCGGTA
CTAATTAATAATAATTAGCTCTCTAATTTGTTCTCCAGCGTAGCGTCTCA
ACTCATTAGTGTTTCGCGTAGTCCCTTGAGACTTTTGATACTGTTTTTCT
ATTGTAGAATTTATTCTAGCCTTTTATATTATAATTAGGCAATTATGACG
TAGCATTTTGAAGGCGTTTGACAGTGTTGCCTTTCGTGTCTTTTTTGTGT
TCAAACTCTCGTACTGTAGAGAGGGGAGAGAAGAGaattttgacgtattt
taagaAGAGATTTTCGTGCTCGAAACTAAAAGCAATTTCTTGTTTGGAAA
GAATTTTGTTACATTGAGGTGAAGTTTTTACCACTGTCACTCCAAAGTGT
TTTTAGTAAGTATATTTTTTCACCTAGGCTTAGCTTTGTTATTGGACTTT
AGCCTAGATTTCTTGATGTCTTGTAAGCAAATTTTTAGGCCTTGTCAAAC
ATTTTTCTAAGCAAAACTTTTGTACTTATTTTTAGCCTGCATATCGAATG
AATATATGCTGAGTCAAAACTTCAAACGTGAATCGTTTACATATATTTTA
TATTGTAATgttctttttggttttttgaaaacacccctgtgtcccagacc
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tggggaatttactttgatttcatccccactcgaaattcaatgtctaaaaa
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taaaatcatgtgtccaaaacaaacttgtaaaacaattgaacaatcaaagt
tagccatatttggtttgattttttattttggcatgtgacatttgttttga
ttttgtatccgctgcatacagtttgtttacaaatttcgcaagtactgtta
tgtccctttaaccttggaataatagaatttctatccccattgggatttta
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ACAAGGGTGTTTGAAATTACCAAATCTGCTCTAAATCGGAGTTGAGAAGT
TGAAAGTTTCACTCTAAGTGCTCTTATAAATCGGGTTCTTATAAATGAGG
GTGGTTCTTGAAAATGAGTCAgattattttttgataagcaaTTACTAAGA
ATTTGTGTATGGCCATATATGGTGAATTTATTACGTAGTCTCTCCTTATA
GAGCTCGAAAAGCTTACAAATCAATTATTCTGCACTCGCATACTGTGATA
TTGATAAAAGTAAAAGGGGGATTtgtagtctagcatgctagacgacttaa
ctcagtaaaaaataggaagtagaaaacttgacaggagcatcaatatagtt
tattttaaccatatctcgacataaaaatttcccgctttcaacaaaaatgt
tataaacgactggattcccagtctaggggatttgtgaatattttataatt
ttatgttgtgaactttaaagccttgaaatgaacaacaaaaacatctaata
ttatttatctatttatttatttactttatattttataGAAACATATTTCA
CTGGTCtataaaacaaaactgaaaGCAAATCTGATTTCGATATTATGTGC
TGTTGGAGAAAAGTCACGAATCATAAGGGACGGAggatttgaataaattt
tttttgtaaaagaaaattATCGGTAAAAAATTCGTCACTATTTCTTTGAT
AACATTTACAATATAAGTAAGGTGAAGATTAGATACTTTgatggattaat
tttcgcgggtattaaatttcgcggttgagctcatccgtgaaattttaaga
ttttgcggGTACTTAACTTCGCGAATGGCAGCTttgggagacaatatttt
cacgattttgcaCTTTTTCTGCTTGTCGAGCCGTTTGAAGTGAGGGGACC
AAAATTGTAGACCCATGTAGTAATTAAAATGTCATATCGTAGGCTGCCGT
TACCTTATCGCTGAAAGACTCGTCGGCAAAAAATAACGATAAATGGCTTG
ATGACGCTTTTATTCCTTGGTATTCAATTCAGTCTTTTACAGTTTTTACG
CtgttttatgttttgaaaagattgCTCAACTTTCGGAtcaatttgattgg
tcaaatTTTAGAAGTATAATGTAATTAAGTTAAATCAACCAACAAGTGCT
GTTcgaaaaacttgaaagtttaGACAGAGTCTTTGaaataaagttaaaat
aaaaagctTTATGCTTTTTAAGTCTCTATGACTTTTTTCttagaccacgt
tcacacgctactgttccgtttcgcttcGAGACAAAaagaagccattctat
tggttgcattcaagtgttacgtcacttctaaccaatatataatggcttca
tttcgtttcggagcgaaacggaaccgtcacgtgcgaacatggtcttagtt
CTTTAAATTGCATGCTCGATAAGTTTAGTGCAATCTGTTGTTTCGTTAGA
AGAGGGGCAACTTCCATAATCTGAAGGTTCACACCCTTACGGAAACTAAA
TGCTcgtattccattgaaaacgaatatagaatgcattaaaaatagaataa
aaatctaggttcaaaactttgatgaatttctaatTCATTGGGTATCAAAA
TGTATTTAAATTCTAGACTTTAAATTACATATAAATGTATAATAAATGAT
TACGTTGAACTTGAGcaaagaaaatacaattcaaatgtTGTTTCAATTAT
ATTCATTTTCCATTAACTTTTTCAAACGtagtaaaattatatttttaatg
tgAACCACGGATTCACTAAAATAAAATGCAATTCAGATGCTCTCACaaat
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gATATGCTgatgaattgacaaaaaaaatgcagttcaaatattttaaaaaa
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cgataTGGTCATGAATTCGATAAAGTAAAATGCAGTTCAAatagttttac
aaataaaatgcacTTTCCATTCGATATTTAAACGtattgaaactaaattt
ttcgatatgttcacgaatttgataaaataaaatgcagttcaaatagtttt
acaaataaaatgcactttccattccatgctgttttaatttttttgctgaa
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ttagtaaagattaataccagagtaaataGTCACGAGACTAAATGCAACCT
AATATATTTTAAGTAAAACTATAGCCAGTCTATTCGATATTCAGAAAAGA
GATAGAATGATTAATGGTACAGGGATTaccaaaaatttccattttcaccT
ATTTGAATTCATTGCAGAATGGAGATTTTTCGcaagctttcaaaaaaaat
gttaccaaaattcttgaaacttaatagacgatatcgcgtttagataaatg
caatgcattctggtttctcggggaccctcaagggaattataatctattcc
AGATCATTATATAATCGacattataattcctttgagagtccccgagaaac
cagaatgcattgcatttatctaaacgcgatatcgtctattgaaatCCCAT
GTTCTTTCTTTCAGTGTAACACTCTATTTCAAGCTAACCTTTTCCGTGGT
GAAGTGAAAGACCCAGCGTTTTTGTAATCTTAAAAGCATATTTACCacaa
aagaatgcggctatcgcgaaatcgcacccttacaatGAAGATCGTAATCG
TCAAAAATAAGGCACGCTGATGACAGTACAGTATTTCGCcatcaatttta
aatctttaatccATGTTTAtcatgttttgttaaatctCCTCCTTGATTAA
CTCTCTTGCAGCTGTTCACAAGCTAGAGGAAACAGCCCCTAGAAACAGAC
TCGGTGGGACCCCTCCTCACTGGAAAAAGCCGCCAAAAAATGGTCCCGGT
GataaaaataccctgaaatttcatccccattgaaaaGCTACAAGAGCTCT
CATTGCCGCTGGGAAAAAGACACTGAGGccatcctcactggatttttGAG
ATGTAAACATTAGAATTTGAGATCCCCACTCATTTAGAAACAAGCGGTTT
TCAACTCCCATTGGCATAGCTCATTTTATCTTCACTGGCTAAATAACTTT
AACAGGGTCACTAATATGCTATTTTTCATGAGTTAAAAATTACAGTTCAT
TGTGGTAAggtttcaaaattaaatgatgTCAGAAAATAGACAAGTACTTT
TCAGGAGTTCTGTCTTTTTGAGAGCACGACCAGTGCAcgagttttaaaaa
aatcaaatacagCTTTTTGTGCACAATGCAGGGCGGATCGggaaatcatt
taaaattttgaatttttagtgACCCAGCCGCCCTCACGATTAATAacgaa
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tggaaaagcgaGCGCGTAGCAGCCATTTTAGAAGCTCTACGCGCAAGATA
ACAGAATATGTTAGCTTTTAGTTGCAAGTAGCGCATGATCCTATGAAGTA
GGATGAATTCTTCCGCAAATTatgaacaaaagtttttgatgttattatta
tCACATATCATAGTATTTCACAATAATGGCgcaactttttttctgattct
aatcataagttttttgtctgacaaaaaaaatgaaaatctatgGTTTAATT
TTCTGTCTTACTTGTAAAAACGAGACTAGCGCAGTATTTCCATGGATTTG
TAAGTTGAGTTAGTTCACAATAATATAAGgacagaaattttgtttttatc
acaaagaaaatatcgtttttgatgtttgatttattCCTCAATGCAGAAGA
AACTtaatcaaaattgtaaaaatttgtgatattttttttacgCTCAAAAT
TCTTAGATACgtttaaaatacatttatttttttcgaataatTTGGGTAAA
TTGCTCTGCTCCATTGATAATTGTAGCAAATTAGTTAGCTAAATTGTTTT
GTGTATTGGCGGTTTAGTTTGATTAAATTACGAGCAATTAGAACACAAaa
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CAGTTGTGTCAGTCACATGTCCGTCAGGCCATGAGCTATGTTTAGAAATG
CTGTTAAGGAAGAGTCTCTTCTTGGCTTAAATTTAACAACTCCAatgtta
tttccaaaatttatctattaatatttattttctttctaacTTTCAGGTAA
AACCATAATATACCGACGGAATACTGACACACAATTGAAGAATGATTAAA
ATCACGATACAAAACAAAAGACGAAGACGCcatcttatttttcaattttt
caatttttaatcttttattagaattttcgttgtaaattttaactttaact
tctgtttattctactaaataaaaaattccatttGCAACTCAAACGGTTAG
ACTTGTATCCTGTATCTCAAAACGCAGTTAATCTGAGTGAATATTAGCCA
ATAACCCATCGAATGCAGCTCAACAATGTATACCCCTTACAAGCATCGAT
AAACCTcggaaaataatcagaaaatccCCCGATAAAATCCCAATAAGGAC
CCGAATACTGGTAGTGGTATTCTTACAAAGAAACGAAAAATAATGCATTA
CAAATTCtcaattcttatgaaaaatctttcctataagaaatatttggata
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GCTATTTAAAGTGCATTTTAATTTTGACGCCGttcattaaaaatgtattt
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gaagtatcaaaaaattataaaattgttcaaaaaagtatatgcattttaaa
tgaaatccTAATGAATTATatttcctattttttcaaatgttatttCAATG
CAATTAAAGTGCATACTGTATGCTATTCCATAATGCATtttatttacaaa
gtttttactCTAGCAATGCGATTTAAATTCGTTTAACATTTTTGTCCAGG
TCCAGGTTTCACTACATTTAAATTGCAATTAAActcaaatttcaatgaaa
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TTTATTCTCCTTATAAGGCGTCCCATCACCTGGATGCTTTTCATCTTCTC
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TTTATCCAAGTCTGGGTACTCGTAACTGTGCTCGCCTTGGATGAGACCTT
GGTAGGCAAGTTCGTCTCCTGAAGTGAACACGTCTGTGTTAAGTTCCGTG
TAGCTCATGGTGGCAGTCTTTTGGTGCCctattgtcaaaaaaaattaaat
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TGGGTGTCAACCGCAAAATGCGCCAATTTAGTACCCTACTCTTCATACTC
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ATCTCAAACCTCTAAATGACTTTGTCTAACTATTATCTTAAGATATTCAA
GTAGTGTTCACTttggtatgtgtacaccttttttccgattttttgtcaaa
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aaatcaaagagatagaaaatagagGAGGTTGCACGCAACTGCTTTAAAGC
CGGGCGACTCttgttttctattcaatttcctttgttttgcaacaaagaaa
aatcgcCTTTGACGCGAGCTGTGTTATGCCGCCAATCGAGAAGGAAGCAA
ACATGGCGGGTCGAAGCGGTGATTTTTCTGCTGTTATTTTTGTTATGTCT
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AACATCTCAAATGCTTTTggatatatttatttcaaccaatcaaatgatTT
GTTTACGTTTTGACTAAGGATACAGTGAAATTATCATCGAAGAAAGAAAA
CCTGTCTTGTTTAGTAGCTAACAGCACCTACTGATGGAATTCACTCGAAA
TCGAAAAGatggacaatttttttcaaatagggAACAATTTTCCTTGGTAG
AGGATGCCTTGAGGTATGTATATCTGAAGTTTCTAGTGTGGTCTGGCTCT
TTTCACTGTGGTCTGGCTCTTTGAGTTCAGcccatttttaaatttcatgt
aCTCAACCATCGACTAGGTAGTTCTTTCAGTTCTTGTTGTCTTTCACTTT
GTTTACGTGATCAGCTAAAAGTTGGCGGTTAATTTCGAAAAGTTTGCTTC
TTGGTAATAATGAAGGAAGAGATGGAAGAAGAATTTGAATTTCGTCGCAA
ACAAACAGCTGCCTTAGTAAAGTAGTGTAGATTATTATGCGGTTATGCGT
CCGGTGCGTGATATGATAAGCCGattcatcataaaaagtaagacTGTAGA
AAACTTAAAGAGACAGCTTCTTTTAAAGATGCTTTCAATGCTTTGGGAGT
TGATATTACTAATGATGCTGTTGATGTTCATCCTGAGAGAAAATCTGTGA
AAAGTGTAGAGTTGTTTGTACGAGTTTGAATCAGCATTGAAAGGCACCCA
GAGGCACCCAAGCTGAAAGTAGGAAAAAAGAGAAAGCTAGGCATAAATCA
ACACAGTGTATATAAAACAACAACAGCATCAGCTATTGATACCAGTGGTT
TCGCAGATTGTGTTGATGGGagagaaaatttcagaaattaaagAGACTAT
GGCTTTGTCTAATTATTGATGCTGAAGATTTTATATTTgttattgattgt
ttttttttgaattgggtGAAATAAATGAGGAAATCAATAAGTTGGAAAGG
CAATGCGATGAGGAGGGCCAAAAAGCAAGACAATCAGCCTCGCATGTTTT
AGCTTTCATTGTACGAGCTATCTACACTGgattacttttgtttttgtttt
ttccctaCTGCCATCTGCTTCAAGTGATGAGTTATTTCCTGTTGTCTGGG
AGCTGTTGAAGTGTTGgaatatttgagtttgaaagtCAGGTGTTTGGTAT
CTGATGGAGCCTCTACAAACCGTTCATTTTATAAACTCAAAGAATAAGGA
AGATACTGTAATTTCTTCAGCATTAATCTATGTGCTTTGGATAGAAATAA
GCTCTGCATATTTCATTTGTCTATTATTTCCAGAGGAAATACCTTAAATG
ATATCAATGATgatttgtttgaaatatttatcacTACCAGgtgttgaaat
tcaaaaaaaattattgaaattatatGGTCTAATTCCTTTCCTTTTAGCTG
GACAAACACTCAATCAATTGGAACCATGTGGTACAACTCTGGGAGTTCAA
GAATACTAAAATCCCAGGGCTTTATACATGATCAAATTAACAAGAGAACA
CATTGACTAAATATGATGAACGTTTAAACTTGCAGCTCAGGTAACTTAGA
TGATTACCATATTAACTCaaaaaaaGTGCCTATATGTTATCTAATCAGGC
TAGGTAAAGTCTGAGAATTATATTTGTCTGAAATAAAATGGCCTTTTTAT
GACAATAAAAATCCCATGATATGTATTCAGGTATTCAGTTGTTgtcaatg
acattgaaatgACTATAGCTACAAGTCTGGTCTCaataattttagtttga
tgacTAGCTTGATATAAacagaaattttgaataatttttctggGCTCAAC
ATCAAAACTTCTTGAGTGGCTTTTTCAGCTGTGTAAACACAAATATTGAA
TGTTTGGATGGTGACAAAGACTCTagcttattttcattatttgtcCTGGA
GGattccttttgaaaaagttacttcatttttattttagtgtCTCAGTACT
AGAGCATGCTCTTCAGTATCAAAGGCAAGCCCAAAACTAGAGGTACACAA
AAGTTTGTCAGGATCTgcaacaaaatttttgattgcCTAAATGGACAGTA
TCCTAACCAAGATATGGCAACAAGAAAACCGGCAAAACCTGCTCTCAGAC
AGTACACAGAAACAAAAGACAAATGttttgaggtaatttttatccTATAT
TTTTCGATGGGATTAGTTGTTGTAGGTATTCTCACTAGCTGCTAGTTCCC
TTCAAGGGTTATGTAGGTGTTACTATATCCAGATAATTCTACTCCATACA
ATATgtgaattgaaataaaatacatctcATGATTTTAAAGgagcattttt
atttattagagATGACGTGACGAGATGACATGACGGTTCACTTGTGTGTT
GTGACCAAAttataactttttatcattttagtgGCTGACggatacatttt
tgaaaagtgggaAAACAGAGGCACCTACACCTGGCTTGCAAAGGAGGAAA
GAAAAAAGGAGACTGTACCTGGCTATTCAAATTGTTGAAAGGCTGCATGC
AAACTACAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000140_pilon:675226..687034+ >MSTRG.15652.3.p4 ID=MSTRG.15652.3.p4|Name=MSTRG.15652.3.p4|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=606bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:675226..687034+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTCTTCAGTATCAAAGGCAAGCCCAAAACTAGAGGTACACAAAAGTT
TGTCAGGATCTgcaacaaaatttttgattgcCTAAATGGACAGTATCCTA
ACCAAGATATGGCAACAAGAAAACCGGCAAAACCTGCTCTCAGACAGTAC
ACAGAAACAAAAGACAAATGttttgagtgGCTGACggatacatttttgaa
aagtgggaAAACAGAGGCACCTACACCTGGCTTGCAAAGGAGGAAAGAAA
AAAGGAGACTGTACCTGGCTATTCAAATTGTTGAAAGGCTGCATGCAAAC
TACATGCTCTTCAGTATCAAAGGCAAGCCCAAAACTAGAGGTACACAAAA
GTTTGTCAGGATCTgcaacaaaatttttgattgcCTAAATGGACAGTATC
CTAACCAAGATATGGCAACAAGAAAACCGGCAAAACCTGCTCTCAGACAG
TACACAGAAACAAAAGACAAATGttttgagtgGCTGACggatacattttt
gaaaagtgggaAAACAGAGGCACCTACACCTGGCTTGCAAAGGAGGAAAG
AAAAAAGGAGACTGTACCTGGCTATTCAAATTGTTGAAAGGCTGCATGCA
AACTAC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000140_pilon | genome | sc0000140_pilon:675226..687034 + |
|
