MSTRG.15652.2.p3 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15652.2.p3
Unique NameMSTRG.15652.2.p3
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000140_pilon:675225..692665+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15652.2.p3 ID=MSTRG.15652.2.p3|Name=MSTRG.15652.2.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17441bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:675225..692665+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAACCAACGACTGGATGAAGGTCAAACGTGTTATTGTTCTCATGTTCAGA TGGAGGAACAAGGAACCAAAAAGAGCATTGTTTTCAACAAAGGAGTTGGA GACAGCCGGCAAAAAGGTCATCAAAGCTGTTCAAGGTCTCACATTCGATC TTGAATCTATTTCGAAACGACCAAAAGGAGATTCACTACTACAACTTCAA CCTTTCAAAGATGACGAAGGAATCATACGTGTCGGTGGTCGTCTGAAGAA ATCAAGTCTTCAGATCGAATTGAAGCATCCAATCATTCTCCCCAAAGCTC ATCCACTTTCAAAGATGATACTGCGTTGGTGCCACATCAAAGCAGCGCAC AGCGGCAGAGGTTTGACAATCAACGAAGTAAGAACCTCTGGCTATTGGAT CATCGGAATCAGCTCGTTAACCAGAAGTTTCATCACAAGCTGTGTCCTCT GTCGTCGATTCAGAGGaaaaaaaTGCAACAAAAGATGGCAGACCTACCAG AAGACAGACTGGAACCAGAACCTCCATTCACCTACGCTGCAGTCGACATG TTTGGACCCTTTGCAATCAAAGTGCGAAGGGCAACTGTGAAGAACTACGT CGGTTTGTTCACCTGCATGTCTTCAAGAGCTGTCCATCTGGAGAGTACAA CATCCATGAATACTGACGCGTTCATTCTGATGCTGAGACGTGTCATCGCC AGACGAGGCAACATTCGATCACTGAGGTCAGACAATGGCACCAATTTCGT CGGTGCTGACAATGAGATGAAGAAAGCCATCCATGAACTCGATCACGAAC GGCCGATCGAATCAACGATTTCCTTCAAGGCAACGGAGGAGAATGGCTAC ATTGGAAGAAGAATCCACCAAAGGCCAGCCACATGGGTGGCGTCTGGGAA CGACAAATCAGGTCAGTACGTTCCATTCTTTCTTCCCTTCTTCACACTCA TGGCGAAAGTTTGAACGATGAGTCCTTTAGGACGTTGCTGGCTGAAGTTG AGGCAATCTTAAATTCGAAACCCCTGACTGTTGAAAGCTTGAATGACCCA AACAGTCCATTGCCTCTTTCCCCTGCAAATCTGCTTAccatgaaatcgaa agtaatcatGCCACCTCCTGGAGTTTTCCAGAAGGCTGATTTATATTGTA GGAAGCACTGGAGAAGAGTTCAACACATTGCCAACGAGTTTTGGACCCGC TGGAGGAAGGAATATCTCTCAACCCTACAATCCAGATCAAAATGGAATCA ACTACAAAGAAACATCAAAGTCGACGACATCGTCATCATCAACGATGAGA GCAGTCATCGAAACGACTGGAAACTTGGACGAGTTATTGATGTCAATCGA AGCGATGATGGCAACGTTCGAAGCTGCAAATTGAAGACTTCATCTGGTGA ATTCGTACGTCCGATTACGAAGTTGGTTTCTCTCGTCGATTGAGCGATGA CTGAGCTATCGAAACAGCGTCTACAAATACGTGTAGTGTATTATATGTTA TTGAAAGAATGAATTGAAGTCATTCTATATTATATTGTTGAAAGAATGAA TTGAAGTCATTCTATATTTCGTCGTCAAAAGAATGAATTGAAGTCATTCT ATGtgaaatgttattttttcgatttgatTGGTTTACTTGGATGATTTGCT AATTACGACAACATGCTTACCAGATTGATAATGATTGATTTCAGGACATA AGTATGAACTGATGCATACCTTCTTATACTTGTTATGGTGATGGCAATGA ATGTTGAATTTTTAGTAATCAATGATTAGAACTTGAAACGCTTATGGTAT CGATTCCCCATCGAGGGAGCCTTAtgaacattgaatttcaagatATGATT GGATATCTTGAGGGGAGCCAGATGTCGGTGCATATGGTTGCACCTTATGT TTTGGATTTGATGTTGGTCAATTTGGTTTTGTCTTGATACCGATGTCGGT ACTAATTAATAATAATTAGCTCTCTAATTTGTTCTCCAGCGTAGCGTCTC AACTCATTAGTGTTTCGCGTAGTCCCTTGAGACTTTTGATACTGTTTTTC TATTGTAGAATTTATTCTAGCCTTTTATATTATAATTAGGCAATTATGAC GTAGCATTTTGAAGGCGTTTGACAGTGTTGCCTTTCGTGTCTTTTTTGTG TTCAAACTCTCGTACTGTAGAGAGGGGAGAGAAGAGaattttgacgtatt ttaagaAGAGATTTTCGTGCTCGAAACTAAAAGCAATTTCTTGTTTGGAA AGAATTTTGTTACATTGAGGTGAAGTTTTTACCACTGTCACTCCAAAGTG TTTTTAGTAAGTATATTTTTTCACCTAGGCTTAGCTTTGTTATTGGACTT TAGCCTAGATTTCTTGATGTCTTGTAAGCAAATTTTTAGGCCTTGTCAAA CATTTTTCTAAGCAAAACTTTTGTACTTATTTTTAGCCTGCATATCGAAT GAATATATGCTGAGTCAAAACTTCAAACGTGAATCGTTTACATATATTTT ATATTGTAATgttctttttggttttttgaaaacacccctgtgtcccagac ccactggaaaatttagcgaAAATTACGTCCCGGtgggaatttcagcccca ctggggaatttactttgatttcatccccactcgaaattcaatgtctaaaa attgcGCTCCTAAGTCATCCTTACTGCGGGATTTGTTAAAGGggcattaa agtagtaaaatgtaaacactgtgcgaaccacgtgtcattaaagagaacaa ttaaaatcatgtgtccaaaacaaacttgtaaaacaattgaacaatcaaag ttagccatatttggtttgattttttattttggcatgtgacatttgttttg attttgtatccgctgcatacagtttgtttacaaatttcgcaagtactgtt atgtccctttaaccttggaataatagaatttctatccccattgggatttt aatCGAAATCTTTATCCCGATTGAGGAAAAGAGTTCGGCCGGGGCTGTGG GACAAGGGTGTTTGAAATTACCAAATCTGCTCTAAATCGGAGTTGAGAAG TTGAAAGTTTCACTCTAAGTGCTCTTATAAATCGGGTTCTTATAAATGAG GGTGGTTCTTGAAAATGAGTCAgattattttttgataagcaaTTACTAAG AATTTGTGTATGGCCATATATGGTGAATTTATTACGTAGTCTCTCCTTAT AGAGCTCGAAAAGCTTACAAATCAATTATTCTGCACTCGCATACTGTGAT ATTGATAAAAGTAAAAGGGGGATTtgtagtctagcatgctagacgactta actcagtaaaaaataggaagtagaaaacttgacaggagcatcaatatagt ttattttaaccatatctcgacataaaaatttcccgctttcaacaaaaatg ttataaacgactggattcccagtctaggggatttgtgaatattttataat tttatgttgtgaactttaaagccttgaaatgaacaacaaaaacatctaat attatttatctatttatttatttactttatattttataGAAACATATTTC ACTGGTCtataaaacaaaactgaaaGCAAATCTGATTTCGATATTATGTG CTGTTGGAGAAAAGTCACGAATCATAAGGGACGGAggatttgaataaatt ttttttgtaaaagaaaattATCGGTAAAAAATTCGTCACTATTTCTTTGA TAACATTTACAATATAAGTAAGGTGAAGATTAGATACTTTgatggattaa ttttcgcgggtattaaatttcgcggttgagctcatccgtgaaattttaag attttgcggGTACTTAACTTCGCGAATGGCAGCTttgggagacaatattt tcacgattttgcaCTTTTTCTGCTTGTCGAGCCGTTTGAAGTGAGGGGAC CAAAATTGTAGACCCATGTAGTAATTAAAATGTCATATCGTAGGCTGCCG TTACCTTATCGCTGAAAGACTCGTCGGCAAAAAATAACGATAAATGGCTT GATGACGCTTTTATTCCTTGGTATTCAATTCAGTCTTTTACAGTTTTTAC GCtgttttatgttttgaaaagattgCTCAACTTTCGGAtcaatttgattg gtcaaatTTTAGAAGTATAATGTAATTAAGTTAAATCAACCAACAAGTGC TGTTcgaaaaacttgaaagtttaGACAGAGTCTTTGaaataaagttaaaa taaaaagctTTATGCTTTTTAAGTCTCTATGACTTTTTTCttagaccacg ttcacacgctactgttccgtttcgcttcGAGACAAAaagaagccattcta ttggttgcattcaagtgttacgtcacttctaaccaatatataatggcttc atttcgtttcggagcgaaacggaaccgtcacgtgcgaacatggtcttagt tCTTTAAATTGCATGCTCGATAAGTTTAGTGCAATCTGTTGTTTCGTTAG AAGAGGGGCAACTTCCATAATCTGAAGGTTCACACCCTTACGGAAACTAA ATGCTcgtattccattgaaaacgaatatagaatgcattaaaaatagaata aaaatctaggttcaaaactttgatgaatttctaatTCATTGGGTATCAAA ATGTATTTAAATTCTAGACTTTAAATTACATATAAATGTATAATAAATGA TTACGTTGAACTTGAGcaaagaaaatacaattcaaatgtTGTTTCAATTA TATTCATTTTCCATTAACTTTTTCAAACGtagtaaaattatatttttaat gtgAACCACGGATTCACTAAAATAAAATGCAATTCAGATGCTCTCACaaa taaaatgcattttttattcgattttttaaacgcatttaaactaaatttta cgATATGCTgatgaattgacaaaaaaaatgcagttcaaatattttaaaaa ataaaatgcactttccattcgattttttaaacgcattgaaactaaatttt tcgataTGGTCATGAATTCGATAAAGTAAAATGCAGTTCAAatagtttta caaataaaatgcacTTTCCATTCGATATTTAAACGtattgaaactaaatt tttcgatatgttcacgaatttgataaaataaaatgcagttcaaatagttt tacaaataaaatgcactttccattccatgctgttttaatttttttgctga aattcatttttttctaactttttaaaaccaaaaaataagtaaaaagataa attagtaaagattaataccagagtaaataGTCACGAGACTAAATGCAACC TAATATATTTTAAGTAAAACTATAGCCAGTCTATTCGATATTCAGAAAAG AGATAGAATGATTAATGGTACAGGGATTaccaaaaatttccattttcacc TATTTGAATTCATTGCAGAATGGAGATTTTTCGcaagctttcaaaaaaaa tgttaccaaaattcttgaaacttaatagacgatatcgcgtttagataaat gcaatgcattctggtttctcggggaccctcaagggaattataatctattc cAGATCATTATATAATCGacattataattcctttgagagtccccgagaaa ccagaatgcattgcatttatctaaacgcgatatcgtctattgaaatCCCA TGTTCTTTCTTTCAGTGTAACACTCTATTTCAAGCTAACCTTTTCCGTGG TGAAGTGAAAGACCCAGCGTTTTTGTAATCTTAAAAGCATATTTACCaca aaagaatgcggctatcgcgaaatcgcacccttacaatGAAGATCGTAATC GTCAAAAATAAGGCACGCTGATGACAGTACAGTATTTCGCcatcaatttt aaatctttaatccATGTTTAtcatgttttgttaaatctCCTCCTTGATTA ACTCTCTTGCAGCTGTTCACAAGCTAGAGGAAACAGCCCCTAGAAACAGA CTCGGTGGGACCCCTCCTCACTGGAAAAAGCCGCCAAAAAATGGTCCCGG TGataaaaataccctgaaatttcatccccattgaaaaGCTACAAGAGCTC TCATTGCCGCTGGGAAAAAGACACTGAGGccatcctcactggatttttGA GATGTAAACATTAGAATTTGAGATCCCCACTCATTTAGAAACAAGCGGTT TTCAACTCCCATTGGCATAGCTCATTTTATCTTCACTGGCTAAATAACTT TAACAGGGTCACTAATATGCTATTTTTCATGAGTTAAAAATTACAGTTCA TTGTGGTAAggtttcaaaattaaatgatgTCAGAAAATAGACAAGTACTT TTCAGGAGTTCTGTCTTTTTGAGAGCACGACCAGTGCAcgagttttaaaa aaatcaaatacagCTTTTTGTGCACAATGCAGGGCGGATCGggaaatcat ttaaaattttgaatttttagtgACCCAGCCGCCCTCACGATTAATAacga aactttttttctctgaaCCAAATAAACTTTCGATAAGTTTTTTATCGGAC AAAAAGTGAATATTTGTCTAACAACAAATTAtttaaatattcgaaaaaac ttggaaaagcgaGCGCGTAGCAGCCATTTTAGAAGCTCTACGCGCAAGAT AACAGAATATGTTAGCTTTTAGTTGCAAGTAGCGCATGATCCTATGAAGT AGGATGAATTCTTCCGCAAATTatgaacaaaagtttttgatgttattatt atCACATATCATAGTATTTCACAATAATGGCgcaactttttttctgattc taatcataagttttttgtctgacaaaaaaaatgaaaatctatgGTTTAAT TTTCTGTCTTACTTGTAAAAACGAGACTAGCGCAGTATTTCCATGGATTT GTAAGTTGAGTTAGTTCACAATAATATAAGgacagaaattttgtttttat cacaaagaaaatatcgtttttgatgtttgatttattCCTCAATGCAGAAG AAACTtaatcaaaattgtaaaaatttgtgatattttttttacgCTCAAAA TTCTTAGATACgtttaaaatacatttatttttttcgaataatTTGGGTAA ATTGCTCTGCTCCATTGATAATTGTAGCAAATTAGTTAGCTAAATTGTTT TGTGTATTGGCGGTTTAGTTTGATTAAATTACGAGCAATTAGAACACAAa agatttgagaaaattgatgtttaaaagttttattttaacaagCCAAGTTG TCAGTTGTGTCAGTCACATGTCCGTCAGGCCATGAGCTATGTTTAGAAAT GCTGTTAAGGAAGAGTCTCTTCTTGGCTTAAATTTAACAACTCCAatgtt atttccaaaatttatctattaatatttattttctttctaacTTTCAGGTA AAACCATAATATACCGACGGAATACTGACACACAATTGAAGAATGATTAA AATCACGATACAAAACAAAAGACGAAGACGCcatcttatttttcaatttt tcaatttttaatcttttattagaattttcgttgtaaattttaactttaac ttctgtttattctactaaataaaaaattccatttGCAACTCAAACGGTTA GACTTGTATCCTGTATCTCAAAACGCAGTTAATCTGAGTGAATATTAGCC AATAACCCATCGAATGCAGCTCAACAATGTATACCCCTTACAAGCATCGA TAAACCTcggaaaataatcagaaaatccCCCGATAAAATCCCAATAAGGA CCCGAATACTGGTAGTGGTATTCTTACAAAGAAACGAAAAATAATGCATT ACAAATTCtcaattcttatgaaaaatctttcctataagaaatatttggat attgaaaagacattttaaatttggattttcaattaatttgaaatcttgTC CGCTATTTAAAGTGCATTTTAATTTTGACGCCGttcattaaaaatgtatt tataattttcctcaattctctttttcatgttaaaaatgtatttgtaattg tgaagtatcaaaaaattataaaattgttcaaaaaagtatatgcattttaa atgaaatccTAATGAATTATatttcctattttttcaaatgttatttCAAT GCAATTAAAGTGCATACTGTATGCTATTCCATAATGCATtttatttacaa agtttttactCTAGCAATGCGATTTAAATTCGTTTAACATTTTTGTCCAG GTCCAGGTTTCACTACATTTAAATTGCAATTAAActcaaatttcaatgaa aaattcgaTGCATTTAAAACGCGTGGAAGTTCCGTAAGGGCACATTTCGT TTTTATTCTCCTTATAAGGCGTCCCATCACCTGGATGCTTTTCATCTTCT CCTTGCGCTGTTCATGATTTCGTAGTCGGCGGGTTTTTTGAGTATCGGAT TTTTATCCAAGTCTGGGTACTCGTAACTGTGCTCGCCTTGGATGAGACCT TGGTAGGCAAGTTCGTCTCCTGAAGTGAACACGTCTGTGTTAAGTTCCGT GTAGCTCATGGTGGCAGTCTTTTGGTGCCctattgtcaaaaaaaattaaa tagttGTTTACTAGTTTAAGGGAACTTGATTTTAGCGGGAAACCAATTTC acgtttttgggtgtctaccgcgaaaattagttccgcgaaatgcgattttt actaaaaatcctTAGAACCTCCTAGAAATATGAAAGAATTTCCGCAAAAA GTGGGTGTCAACCGCAAAATGCGCCAATTTAGTACCCTACTCTTCATACT CTGAAAGAGAAGATCaaatggtttgagatttttcgcCTGTTGATAGATTC CATCTCAAACCTCTAAATGACTTTGTCTAACTATTATCTTAAGATATTCA AGTAGTGTTCACTttggtatgtgtacaccttttttccgattttttgtcaa aaaaaattttttcagtcaaagtggaagaaaagttactggatttcattttg gtaaaatcgcgatcttaaaatctttttttgatccagagttataaccattt aaatttcaaaacaaagttcgtcttatgatggattatttactcaaataatt gtctctttcggaaacaacaaagacaaaagagagaattcagctgatgttta ttctcacctctattgaattgtaatatttttgacacatttcactgattact caaatcaaagagatagaaaatagagGAGGTTGCACGCAACTGCTTTAAAG CCGGGCGACTCttgttttctattcaatttcctttgttttgcaacaaagaa aaatcgcCTTTGACGCGAGCTGTGTTATGCCGCCAATCGAGAAGGAAGCA AACATGGCGGGTCGAAGCGGTGATTTTTCTGCTGTTATTTTTGTTATGTC TATTCGAGTTATGACTAAAACAACGTCTACAGCAAGTACTACATTGTTTA AAACATCTCAAATGCTTTTggatatatttatttcaaccaatcaaatgatT TGTTTACGTTTTGACTAAGGATACAGTGAAATTATCATCGAAGAAAGAAA ACCTGTCTTGTTTAGTAGCTAACAGCACCTACTGATGGAATTCACTCGAA ATCGAAAAGatggacaatttttttcaaatagggAACAATTTTCCTTGGTA GAGGATGCCTTGAGGTATGTATATCTGAAGTTTCTAGTGTGGTCTGGCTC TTTTCACTGTGGTCTGGCTCTTTGAGTTCAGcccatttttaaatttcatg taCTCAACCATCGACTAGGTAGTTCTTTCAGTTCTTGTTGTCTTTCACTT TGTTTACGTGATCAGCTAAAAGTTGGCGGTTAATTTCGAAAAGTTTGCTT CTTGGTAATAATGAAGGAAGAGATGGAAGAAGAATTTGAATTTCGTCGCA AACAAACAGCTGCCTTAGTAAAGTAGTGTAGATTATTATGCGGTTATGCG TCCGGTGCGTGATATGATAAGCCGattcatcataaaaagtaagacTGTAG AAAACTTAAAGAGACAGCTTCTTTTAAAGATGCTTTCAATGCTTTGGGAG TTGATATTACTAATGATGCTGTTGATGTTCATCCTGAGAGAAAATCTGTG AAAAGTGTAGAGTTGTTTGTACGAGTTTGAATCAGCATTGAAAGGCACCC AGAGGCACCCAAGCTGAAAGTAGGAAAAAAGAGAAAGCTAGGCATAAATC AACACAGTGTATATAAAACAACAACAGCATCAGCTATTGATACCAGTGGT TTCGCAGATTGTGTTGATGGGagagaaaatttcagaaattaaagAGACTA TGGCTTTGTCTAATTATTGATGCTGAAGATTTTATATTTgttattgattg tttttttttgaattgggtGAAATAAATGAGGAAATCAATAAGTTGGAAAG GCAATGCGATGAGGAGGGCCAAAAAGCAAGACAATCAGCCTCGCATGTTT TAGCTTTCATTGTACGAGCTATCTACACTGgattacttttgtttttgttt tttccctaCTGCCATCTGCTTCAAGTGATGAGTTATTTCCTGTTGTCTGG GAGCTGTTGAAGTGTTGgaatatttgagtttgaaagtCAGGTGTTTGGTA TCTGATGGAGCCTCTACAAACCGTTCATTTTATAAACTCAAAGAATAAGG AAGATACTGTAATTTCTTCAGCATTAATCTATGTGCTTTGGATAGAAATA AGCTCTGCATATTTCATTTGTCTATTATTTCCAGAGGAAATACCTTAAAT GATATCAATGATgatttgtttgaaatatttatcacTACCAGgtgttgaaa ttcaaaaaaaattattgaaattatatGGTCTAATTCCTTTCCTTTTAGCT GGACAAACACTCAATCAATTGGAACCATGTGGTACAACTCTGGGAGTTCA AGAATACTAAAATCCCAGGGCTTTATACATGATCAAATTAACAAGAGAAC ACATTGACTAAATATGATGAACGTTTAAACTTGCAGCTCAGGTAACTTAG ATGATTACCATATTAACTCaaaaaaaGTGCCTATATGTTATCTAATCAGG CTAGGTAAAGTCTGAGAATTATATTTGTCTGAAATAAAATGGCCTTTTTA TGACAATAAAAATCCCATGATATGTATTCAGGTATTCAGTTGTTgtcaat gacattgaaatgACTATAGCTACAAGTCTGGTCTCaataattttagtttg atgacTAGCTTGATATAAacagaaattttgaataatttttctggGCTCAA CATCAAAACTTCTTGAGTGGCTTTTTCAGCTGTGTAAACACAAATATTGA ATGTTTGGATGGTGACAAAGACTCTagcttattttcattatttgtcCTGG AGGattccttttgaaaaagttacttcatttttattttagtgtCTCAGTAC TAGAGCATGCTCTTCAGTATCAAAGGCAAGCCCAAAACTAGAGGTACACA AAAGTTTGTCAGGATCTgcaacaaaatttttgattgcCTAAATGGACAGT ATCCTAACCAAGATATGGCAACAAGAAAACCGGCAAAACCTGCTCTCAGA CAGTACACAGAAACAAAAGACAAATGttttgaggtaatttttatccTATA TTTTTCGATGGGATTAGTTGTTGTAGGTATTCTCACTAGCTGCTAGTTCC CTTCAAGGGTTATGTAGGTGTTACTATATCCAGATAATTCTACTCCATAC AATATgtgaattgaaataaaatacatctcATGATTTTAAAGgagcatttt tatttattagagATGACGTGACGAGATGACATGACGGTTCACTTGTGTGT TGTGACCAAAttataactttttatcattttagtgGCTGACggatacattt ttgaaaagtgggaAAACAGAGGCACCTACACCTGGCTTGCAAAGGAGGAA AGAAAAAAGGAGACTGTACCTGGCTATTCAAATTGTTGAAAGGCTGCATG CAAACTACAGGTTTGTAATGATTTTGCATTCAAAGGTCTTTTAGTATGAA AtagtacaatgttaattttaagCAATCAATGTTTCTGCGAGTGCTCCTGG CCTTGCATGTTTtaaaggtggttttttttttcaatatagaAAACCGACAT TTTCTCAGTCTTTTATTCTTTCAATCAgacctttttcactttttatcttG CAGGAGCTGCTTGTTGAATATCATGGATTTTACATTTTGGATCATGGTCG TCTTAGTCAGCCAACCTCAACTTATGTGGGCAGGTCGTTCTGAtggtttt ttctattgtttaaattattgttatttaaaaaattgttttttcagatttta gctgaatttgATTTGGATAAATTCCAAATACTTTTTGTGGAATTTCGAAC AAAAATTCATTAAgcagaaaaagtaaataaacagaAAGGATACCTTTTAC CTTTACACTTGTGACAGTCTTTGACAtgagatgaaaaatttgaagttata GTCTTAAAGTTTTTGATCATCTTATATCTGTATATCTTCTCTCTTTTCTC TCCAAACTGATCTAAAATTATATGATCTCAATACATTTGTTAGTAGATAT TTATCTTTTGATGATAGTTCATTATGATCAAAAtatattatgatttttgt tgaaaaatatacatttttagCTGATAGAAAAAGCTAAAATTGACAACTGG TGCTAGATTTCTCCCTATACATACTTACCTTACCTTATTGGCAGCTATAT AGACTTTCATTGAAGTAAACCTTTCTTTAGAACGTGAGAAAGTGAACGGT ATATTTCAAGAGAGCTAATAtctaagaataaatttccaaaagactCGAGC TGTCAAGGAAAACAGCAGCCtccatttttttcatatttgtctCTCTGCCC gttctactttcgttttcaagcactttttttACGGCATAGATTATATCTTT TTGAATAAAACACCGATTGTTTCAATTTAGTCGGTTCCGTAAAACTTTCC CTCtttttttCTTCCCTAATTAATTATTCATGATCATAACTAACATAGTA TAATAGAAAGAGAATCGTGCAACCTCctctattttctatctctttgctca aattgatgtagaaaaaaacgaaattttaccacaccatactactcttaacg aagttaaagtcacccatagcatttagatatcgacttcattctttttttac gagattcccaaaagatcaaacttaaaaagtgtcttaggattttatttcta accgagttgtttttcctcaatttacagataactgaaaaaaatcacattta aatttacttttttatcgatatttttacagaatttaggatttaaagagtta aagtcaattccaaaaaaaatcccaagacacttttttagttcaatctattg ggaacatggcatcgaaattattttttcaaaattcaaaagctatgggtgac tttaacttctttgaagtaggtaaggttaagtttcttaagattttaattat atcctgcccagtttacattcagctgaaacttttaccattagaaagagaat attattggctttcagaaaatatatacttttgatgtataaaaatttgttgt tctaaagatatgatcaattaaagagaatgtgtcaagaaaggtgaacacat accttaagcaaaaaaacaatacaaTTCTGCTCTGCTCTGCTCGCaatatt tctaattatttttatcaaattacctaccttaaaggaagaaattttggcgg gaatttaatttggcggatgcacgaaaaaactaaatttggcgggaatttaa tttggcggtcgcttaaaaatttaaccttaaccctattcggactagggggg ggggctctttctgttcggaggtcaaactattggtaatagctcctgaaata atagagcttttgccgtgaaattttctgtaaattcctaacttttatttagc ttcaatataaaaaaaaatttgacacctaaaaattttcacaccttgagcat gatgacatttctgacagtaaggtgtcaaaaaaattgacacttttcgaata caaattgattttttaatgtcaaatatatcgtttaaaccgtaatttattga atatttaggataaaataagcattttaaactcaggcaatttttttctaaag cttttgttagaatacaatagctatttataagaacaaaggaaattttcggt ttttgctcactttgggcatgatgagtgacgtcatcaaaataaatttttgt caaaagttaccttatgtgtcaaggatcttgtgtgccaaatttcatccaaa aaggcCCACTAAATCAAaggttaaggggtggtacaggaaaagcccccccc cccctagttctgaaccgcccctaaaagcctaggttgaatagggttaagac ggcgtcaaaacagcgaaaaaatagcaaaaacaccttaaaagagatcatat tttcaaaatgtttaatttggcgggaatttaatttggcggatggcggaaaa aagaaattttggcgggaacttaatttggcggatttcagtcaaatccgcca aatccgccaaattttctttccgccaaaatttcttcctttaaggtattctA GCCGTAGATTCATTTATATCTTACATTAACATAGGtacttatttttataa aaatttctgtGTACAGTATTTCTTGTAACTTAACAATTTTGCGaccacct ccttagtttagattttttttctatgagtgtggtcgctagTCTTATTATag acaaataaataaacactaCATAAAAACTCTCCCTCAGCtttagtcgaccc accacgctactgattCAAGCGCAAGAACCGTTTCAGAGCCCAATTTTCAG ACATATTATAATTTTTCGACTTGGAAAGAAATTACAGGCCAAAGATCTCG AACCATCTGAATGATTATCtatttgaaagtttaaaaaaaaatccgttttt taatcACAGTTTGAATCAcgacttaagggctctgaccacagtcgaaaaat tgattttattatttgaacataaaagttccacttttaacaaatttcaaaag ttatggccgTTATTTTTCTATGacaaattgggatgaaaaattggtcaaaa agcactattttcaagattttgagacaaataagcttttagaaaaattttcc gaaaatctattttaagtTCGGTTAAGATAcaaccatctaccgcaaaaaat tattcaaaatgttttttcttcgccgaaaataagctcttcaaagttgaagt ACTCTTCGCAAAAgacttcattttcttcttcatcaatctttttcattgcg attctcaaattttcagactcaaggataattgacctaacagaaaatgtata acatgccacagttttgtgtgctacatcaagtagaaatttatatttaaaaa atccactatggtcagagcccttaaaggaaCTTCATATGTTTTTTGGTCGA GAGTTCGCTTCAGTtggaaaacaactttttttaccttcattttctcttgc atttttctttcctaaaaaaattaagaaagaaTTGGTAAACTTTTTCGCTG GCAGCTTGTAATTCAATAAAGGAAAGTTCAATCCTAGACATATAAAGGTT CTCTTACTCACTCATGCTTAAAAACTCGCTTCAAATCGCTGAATCGAACC tatattattcaaatctttctataattcggaCTTATTCTCAGTTCCCGTAA GGGAGAAACCCTCACAAAGTACTCTCTATAACTCGAgtctctctgttatt cgaacaaataagattccctgtttgagttcgaattaatGAGAGTCGACTGT AGTCCAATCTATTCGAGAACAATGGAAAATTCGAATCGCGACTCGAGTTA TAAGAACCGTTATTCAAGGATTTCTTCTTGATGGACACTGAGAATAAATT Cgaataaaccttttcataaattacgtcacgaacatcacttgcctcgtatt caaacaattactatagtgattatgtctcttgagacattaaatgatttttt tatgaataggaagtagttttaataaaatccgctaggagttaatcaccatg gcaataatttcaaaacgaggcaagtgatgtttgtaacgtaatttatgaaa aggtctattatagtAAGATTCGAGTAGCAGTTAGTTCGAATTAGCAAGCG TCTACTGTATCACGGTCAcgttcaaagaaacaaaaaatctcaTGTTAAGT TTTCTCGAAATAAGTCAATAAGCACAGTTAGCATATTTAGAAGATTTAGA AAATAGAAATAGTTAAAAAACCTGCAAATTACAGCCGgacctttagaaaa aaaattagcattGTGTTTTAAGTAGCGTTTGGTTTTCTAATCAGACCGCC AATGCTTTTATATGCTCCTCAAAAACTGCCGTAACTTACCGTGACAATTT TTGGAAACCAAAATGGCGGTCAAAGTTATGACAACAAGTAATGCTCCCAT GGCAACGAGGATTATTATAACTGTGTGCGAAAATAGAGGTTTTTTGATCT TCGTCGCCTTTGTTTCTTTGGGTTTTGGTGGTTCTGCCACTGCAAAcaag attaaaaaaattcattgtaTTGTTGATAAACACTGGGGGTCTGGAGGTAT TCTCAATCCCAACCAACTAAGATCTTTGAtcgatttatttttcaaaaggg GAACCCCTAATCGGAGAGAGCGTTAGATCTATTTTCTCTTCGACGAAGAC GCAATTTCTTTTCCAAATTTCACACCTTcacacaattttcaaaattcaca cTATTTCTGTTCACGCAACATTTTCCAATTCACGACTTTACGcagctttt ttttaattttcacgcattttCGCAaatgaaaaagcccattcacgcattcc cGTTAGAGGTCGATGCATTCACGCAAATAACTgggggggggCTCTGATAC TTATGATGTAGCACTGTATTgccttctttgcgggtacctttcaaaaaaaa actccgatcaaagacgGCCGGTAAACCTACTCAATGGTTTTATTAGACTA TAGTCTACTTCTTGctgatttttgctttttgataatttttcatgatgctg agtccagtgaagtatttgaagcatttgacgaggtcgccattttataagaa caaactatataagaccATAAGGttttgatgaccaaaatatcaagaacaaa ttaagaacattttagggcttcgcgaactctaaaacacccaatttctgaag aaaattgacaaaaatactcaaaaatgaagaaaataaaaacatgttaagaa catttaaaggcttaatactcaaaaacttaagaacatccgacggcttcaaa aattttggatgttcttataaaaaaacagtgTATCTATCGAAGTCTTAAAA CTACCTTGTCTTTCGTCTGTTGTTTGAAAGAATTGAGACATCTCACCAAG CTGGCCATCCCAACTAACTGCTTGTATCCTTGCAAATTTGATCCGTGTAA ACAAGGCCTTGTCATTACAATTTGTCAGTTGATTCTCCTCATGATACAGC TTTGTCATGATTAAGGTTTTATTGACATCGTATGCGAAAATGCTAAAGGT CTGTTTACACTGTGTTTCAGGTGCTGGTAATTTGAAGATGGTACAACAGG TGCCGGAAAATGTCGATAATTTGACAATGGTGAaatttttc

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000140_pilon:675225..692665+

>MSTRG.15652.2.p3 ID=MSTRG.15652.2.p3|Name=MSTRG.15652.2.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=492bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:675225..692665+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGCAACAAAAGATGGCAGACCTACCAGAAGACAGACTGGAACCAGAACC
TCCATTCACCTACGCTGCAGTCGACATGTTTGGACCCTTTGCAATCAAAG
TGCGAAGGGCAACTGTGAAGAACTACGTCGGTTTGTTCACCTGCATGTCT
TCAAGAGCTGTCCATCTGGAGAGTACAACATCCATGAATACTGACGCGTT
CATTCTGATGCTGAGACGTGTCATCGCCAGACGAGGCAACATTCGATCAC
TGAGGTCAGACAATGGCACCAATTTCGTCGGTGCTGACAATGAGATGAAG
AAAGCCATCCATGAACTCGATCACGAACGGCCGATCGAATCAACGATTTC
CTTCAAGGCAACGGAGGAGAATGGCTACATTGGAAGAAGAATCCACCAAA
GGCCAGCCACATGGGTGGCGTCTGGGAACGACAAATCAGGTCAGTACGTT
CCATTCTTTCTTCCCTTCTTCACACTCATGGCGAAAGTTTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15652MSTRG.15652Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15652.2.p3MSTRG.15652.2.p3-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15652.2.p3.exon1MSTRG.15652.2.p3.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15652.2.p3.exon2MSTRG.15652.2.p3.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000140_pilongenomesc0000140_pilon:675225..692665 +