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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000007_pilon:1880226..1933796+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1565.2.p1 ID=MSTRG.1565.2.p1|Name=MSTRG.1565.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=53571bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:1880226..1933796+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
agtAAAAGTTCAATAAAGTTATTTGACGTCTACTGGACATTTGCATATTA
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tttccaacggcatgataagggatctcatggacaaaattgtctacattaaa
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cttACTGTGTCAAATTACTATAATACAGGATCTGTATGTATTCTTTTTGG
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catagttttttttgtaaacatttgaaaacttcctttttttctttagttta
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ACTTGGAAGtaataaatgtaaattcaaatcaataaaataaaatttgtaca
aaatcataaagtatctcaaagtcacaaataatGAGTCTTGACTGCAGGAG
AGACTACTTGCAACTTGTTTTTAAATTCTTCCAGAAATTTCCACGCATCT
ACATCTTCTTCCTTTCCTGAATGTTAACAAATtggacaaattttatatat
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ataccTAACATTCACGGAAAAGACTAACTACGGATAGGCTTGCgcgacaa
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ttatgagtgcctcctcactCGCTGACGCTCGTTGCAGGGGCAattaaatt
atttaaatattataaagtattattattattttttcaaacgtCCTTTTCAA
TAGACGTCCTTTCCGCCAATAGATGTTATACTTTCAGCTAACTGAAAAAT
GTCTAATTTTATTATCAGGTAGGTCTATATAAGTATAGCTTGTTATTTTA
TAAAAGGGGTTTTTAgaattgcctccccagtttgctcAGATTGCCCGATT
TTGGTAAACCCACCACCCTACTTTTGACAAGGCCCGACAACAAAAAATTG
GTTCCTGACAGGGcccatttttcaaactccaagTAACTCTATCCTGGAtt
ttgactaaaatttactgTATAATATGTTGTTTTGGAGAAAACCTTTTGGC
CCATGTTGTATTAAACATTGAAGACTGAACAGGGCATGAATAAGGTTGTA
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CAAGAACGTAACAAACTAACAATAACATGGATTCGTGTAAATTGGATAGT
CATTTATGCTTTATATATTTGTCTGGCTGTTTTGTTATTCAAAGAAGTAG
GAGAATGTGTGAAATATGATGATTGTGGTCTGgagaaattttattcaatt
caTTCTCCCTTGGTTATATTCTTGGTCTTGTTCATCACCATTTGGGCTCT
TGACTACAACTTGCCTTTCATACATCCTAAATTCTTGAAAGGTAAGttct
tcaaatctttctttttctacGGTTAATAATAAAATGTGTGTAGAATAGGT
GTTTTCAATCGTTCGTATTCACCATAGTGGATCAGTTCTCCCAGGAAAAT
TTTATTGCCAGGTTTTAAAACCACCCCTTAACCACCACCACCTTTCGCCT
TAAAaagagatattaacccttgaaaaccgtgtttttcagccagaaacagc
tattttgtccagtttttgcgctttttgaagctcaatatttcgagttaggt
actgaaatcacctatacttgcaatatatctctaatcctaattttctGGGA
GCTTTTTAGAagtatacaacaggtctccctTTCTCGAgctaaattttcat
taatttttaaccctatgatttttgcctgagaccgtcatatttgtccgaaa
attacaccaaagtgtccgaaaaaaaaattggaaacatagtaatttcgatt
cccctactccttagctttccaaaaatgtataacaagtgcttctaacaaaa
cagtcgagcgattttacaaaatgccctttACTAAtgtataaaacataaaa
ttttatcaatttgttccaaaattacgaggattttaagttttgcctggaaa
gcaagaaactttcaatctccataacttttgatgggAACTTTTGATGATGC
TTTATACCTTAATTTCCATCTATTGgcatatttttgatgacgtcatctgg
caggtggccaggtggcaaaatttggtgttactgtactgtttgaaattaag
ttttagaccctctgaGGATCATCTGTGCCTAATTTCAAGCTtctatcacc
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gaggtcctataaattaacaaacaaattttcgtttgttagttagttagttt
tagttttttagttttttttgctcgcaaatttcagccaaaaaacagctaaa
aaaagggtattttggagattttctcaaaaaaaaattttcgtctTAAAAAG
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cagtccaacaATCCTTGCACCTGAAGTTATGAGTCAGCCCCGGTGACCTT
TCAAATCGGTTCCGCGAttttttttCCAGCAGCAGCGCATTtggacttgt
tttttaaatccgatttcggattattttcggaaaacaagtCATCGGTAAAA
atttggcgcgaaaaatattttctattggaagagaaaagaaacacgtcact
tcatttatttattattaagaTTTGCGCATGATATCAGaataaaaaaagag
aagaaagtagtgaaaatgaaaattttttgtttattcaataaattgaaaga
agctattgcattgtaaataaatagagagtataaaagaaagttttttatga
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TCATCATAACTTTCgattgagttatcgaaactggacggaattttcgacgc
agcttcctcaatataaaatgcccCTACTCATTCACATTATACTAGGGGCC
TACTTGGTTCAACACGtcatttaaatcaatctgaCAAATGTGACGAAAGC
TGCAGTGAACAGTGAACATCTAAAGCGACCGCGCCTCGAATATACTTTCT
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AATTTCCCGGGGGGtttatttaggcaaaatggatgcgaaccataagggta
cctttttgcgggcctcaaaagtctctcagagGGGTGCAAATTCATAAGTT
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aaggacacgatttccagaaattttgaccaaaatttggtgaaaatcaaacc
aaaatttggaaaaaatctaccaaaattttaggaaagtctctcaaagggtc
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CCCGTCACCTCGTAAACCTAGTAAAATGTGAAAGGTGAAATTCCAACATC
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gtctgaagtttcagccaaaatgagCTCTTCAACCTCTTTGACTTTAACAA
cgaattaggtttcttgattgtacttccttctaatcgttttaagcttattg
ggctgaccttccagcgcagctggtttattattttttcaaacgtCCTTTTC
AATAGACGTCCTTTTCAATAGACGTCCTTTCAGCCAATAGATGTTATACT
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GTATAGCTTGTTATTTTATAAAAGGGGTTTTTAgaattgcctccccagtt
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TGGAGAAAACCTTTTGGCCCATGTTGTATTAAACATTGAAGACTGAACAG
GACATGAATAAGGTTGTATTTCAATTTACTTTATAGAAAATGACGAATCA
AAGTCTCGGATATCCCTTCAAGAACGTAACAAACTAACAATAACATGGAT
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TGTTATTCAAAGAAGTAGGAGAATGTGTGAAATATGATGATTGTGGTCTG
GTTATATTCTTGGTCTTGTTCATCACCATTTGGGCTCTTGACTACAACTT
GCCTTTCATACATCCTAAATTCTTGAAAGGTAAGttcttcaaatctttct
ttttctacGGTTAATAATAAAATGTGTGTAGAATAGGTGTTTTCTGTCGT
TCGTATTCACCATAGTGGATCAGTTCTCCCAGGAAAATTTTATTGCCAGG
TTTTAAATCCACCCCTTAACCACTATCACCTTTCtgtaggaccccccccc
cctaatagTAACAATAAGTATTGCAATAGTAAAATTACCTAATCCCAAAG
TAAAAAGATATTACCCCTTTTCGAAAATTCTCCCCCCTCCCTCacataat
tttcattatttctttaCCACATACTCTTTgtcaaaaatttcacaaaaaat
tccccaacaaaagaggggaaaaattctgtaccaaagcacaaataaatAAG
TACACTTTCACGAATCTAGCTCCTTCAAATTTGTCATGGGTCTATTATGG
TTAGCTCTTATAAATTTTAGGGGTAGAAAAAGGAATATAAATGATAATAT
TGTAAAGCATTTGAACCAAAACAATTGAGAAATTGTTTGCATTAATGCAA
TGACTGTTTACTAACATCAGAATACAAAAATGACTTCAAACCGTCATAGT
AAACGAGTATGAAATTGAGCAATAGATCTTATTACAAAAACACTTCAAGG
AGGTATAGAGGTCTGGATATTGAATGATCTGGAtttttttCGTAAGATTC
GTGGCTATAAATACCAAATTCTTTAATTTATATGAGATACGATAAATATT
TTGTCTTAAATCTATATGCTATTAAAGTTAGATTTCCTCCTTTAAAAGGG
ACGGTTCACACAATGACACCAGCATTTTTGAAGAATATACAAACTTTGAT
TTGAAGTAAAATATTATACGTTTGTCGTTTTCTTATTTAGATAGAAGAGC
TTTGGACCAATACTTGCTAGTATATAGAACGGACGTTTCGAATCACAGTC
TTCACTGTGTTTACATCAGCTCAATTGTCGACCGCAATGGGGGGAAATAT
AATTGTATCAACAGCTGGGGAGATGACCAACGTTACCCGCAGATCCCAGT
GGAGCAAGAGGGAAACGAACTCTGGAGAGTCAAAGTTCATTATGTTAGCA
GTTCCTCTAAAGGTAAAACGTGAATTTCATCTTTCACCTGCTTAAAGAAT
TGTTGTTTTTGCCCATTTAGATCTCTTGTTGAAGAGAACATCTATAACAT
AGATTTAGATTGTTTTTCTAATTTCCTTCCTTTTGTTTTTCAGCCTATAA
ATTTGGGGATAAAGGAAACCAGAAAGAAAGGTATGAAATTTTCGATGAAA
TCTTTCcacaaattttctacttttattttctgAACGCTCCTAAAGCATAA
AGTCGTTTCGTTctaaaagtttgttttgctttCCATTTTCCAACAATTTC
TTTAATTCTAAAATATTATCGTTGAAAAGACAATTCAAAACACTataatt
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tgaaaaattttactTGTGAATTAAGTTTCAACATGTCTAGTTTCTTTCCC
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aaagttgaGTCACGGGTAGAACCCGAAGAACGGGTTTGAATGTTAATAAT
GAAAAATCCGAAAAATACACCATAATTGTGAAGTCATTGAGTTAAAAATT
CATACCAATCGTGCAAATTGTGATAAAAGcgtgaaatttggtacagaggT
CAATAGTGAtcatttaatcaaaattttaagggGAGACAAGCGTCAAATGT
CATGTGTCACTCCCTGTCAGCACTTATTGACAAACAAAAATGTCActcca
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tttttcgcttagataaactgcTGGATGTACTCAATAAGAGCAGAACCAAA
AAGaagttgcaaaaatgacgtcatcgtttgaaataaaattttgtcaaaac
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gaaaatatactcaataagagtaaaataaaaacaagctcaaaaatTGAAGT
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GTATCTACCTATAATAATAGGATAACTAACTTGTGTGTGTTTAGGTAGTG
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ATCTCTGACTTCAAATGTGtattcagattttgaaaatgtgtggacTGCCA
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GTGTTGTGAAAAAACGCAAAAGCTACATCTTAAAGTTCAAAAGAGAATAT
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CGGCTCCTTCAAATGGCTAGAATTACCCAAAAAGGCGTTAGAAAATGTCC
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CGTGCTTTGGTCTCTCATCTGAAGAAAAACGAAGACTTGGTTGTTGTTGA
ACTTGAATCCACAGGTAGGCTCTTGCAAAAATAATTTCGTTAAGgagatt
tttctactttttctgtaattttcaagttttattaattattcttgatgttt
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ATTCACAATAATCGCTAAGgcttttttccaccaaaatttcttcccttgct
TTGTGAAAGTACCGAGGGAATGAGTTTAAAGATGCCTAAAGGCAATTCTC
CGAATTCCAAAACTTATTTCTCGCCTAAAATACTTTGGCTAGATTATTGG
TCAGTCAAGCGCTGAGCTTTCCAACTTTCCAACTGGTGTTTTCCATGTGG
AGACGTTGGAAAATAGTTTCCCAGTTTACACTTTTTTGCACTAATGGTGA
ACACTATGTACGGAAGTTATCATATGAGTTTATTCCAAATGAGCTTTTAA
AACGTGCGAGACTTTTTCATCAAGGCTAGACTTCTTATCATTactaaact
aaaaatatttatggtTCAAAACTTTGGACTGACCTTGCAACATAACtggt
tattttattttactttacctattacttttcacttttcagaAATCGCGGTG
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caaagaaaggtttgtattttttgttacctttattttgaaagggacaattt
ttttaaagagacagACCATTGATTAAATCTTCTCGACTTAATCGCCATGT
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TGTACGGGGTAGTCTTAAgggtagttttttttaaagaaccacGAAATGCA
CTGATGGGTGTACTTTCGATGGAGTGCACTGCAAATAACGTATTCTTTTG
TCTGACCCAATATGTCATAGTGTCCTAGTAGGTTGGTtcccccccctaga
aaatggaaaaaaatccctctccccccccttttaaatccctctccccccct
tttaaatccccccctgagatttgaaaaaaaatttccccaccctagaaatt
ttttttttcaatttttgctctTGATGCTTCTATTCACGTTATCTCTGTTA
TATAtccaatgaaaaattgaaaaaaagtttccacagAGTGAAATGAGTAT
GAATTCAAGCATGTATATTTATTAGATGTTAGTTTAGACAAAGTTAGCTA
CAGAgagtagaaaaaatatttttccacagtagaaaaaaataatgtcccca
gattttttctcccccctagactttttggggccattttttctccccccccc
ttttgattaccccccctagatttttgaaaaccattttgccccccccTttc
ctattttctgaaaaaaaaatccctccccctttaaaaagggggggggggga
ggacactatgtatgTAGGTTGAATTTGAAAGCTCTCTCAAATCCGCagga
aaagatattttacaaaactttttctGCTTTTAAAACTTCAGCATCTCTAC
TGTTTTTCACAAAAGTTCTTTTCCCAAAGTTTCAACTtgaacaatatttt
tcagtCGCTTGAAGACAGATAGCtttttttCATGGCCCCCAATGTGTAGG
TCAGGAATTTTTGCAATCTCTCCAGATATATCTGAGGTACAAGTATCAAT
TTTTGACCACAGTCTTGAAGTATAATTTGAAAGATGATGAGTATAAATTT
GCTAGATAAAATGTTCACAGTATCCCTTGGTCGTTAAAATATAGGTTTGT
AGCCCCCAAAATGTAGGTCTACCTAAAATCAAACTGTATCGTCCAGTGAT
GTTAGAGTGAAAAACCTATAAATTTTCCAACTGACTGATGTaaaatttgg
taattttgaTAAAGGATTTCAGGATTTTCGATAATGCAAAGTCAAAAccg
aacattttgaaattttgataatgactgtttaaatgaaatgacgttttgat
tggatttttgaaaaccattttcttttggaaataatCGTTATTTGGGTATG
GATTACGCTGTAAAAAATTCAGAATTAAAACTTGGCTCAGTCCAAAGATA
TGAggctttaaagttatttttctctTATATTTTCGACGAAAACGATATTT
TTCCCGATTTTGCTGATTAAGCAAATATTATTGTATATGAAGttgatttt
ctgtttcaaaCTATGAAGTTAAGTTGGTAGCAAAAGAATTCCACAGGTTT
TAGCTATTACCCATCATTAGAATTTCGATTCTGTTTATGCTAATTCAAGG
GCCCCCACAATGTTGGTTGACTTAAAGATGCCATATCTTTTATTCAACAT
CTCAAGATATAAAAACATCTGGATTTTTGGATGGTTCTTGGGTGTAGAAA
GCATCCTATACTCCATCTTCATAATTTAAGTAATTTAGCTACACCAAATA
TGTTTTAGATCatcaaaacatgtttttcttgAAGAAGAAATACTAACCta
ccaaaataatcaaaaatcatttcattttgaCTAATCTACAGATCAGAATC
TTCATTAGAATTAAAACCTACATATTGGGGGCCACCTACAtattgggggc
catatactgtattcATTTACCTTTTTAATACTTCATTTTGCAAAGTTCAa
aaactgcactgtaagggaatCTTTCAATAACTCCTCCAGGCAATGCAAGC
TCAAGCTCCCTAGTGACAGCTACTTGCTTGTAAAATATCTATAGTGATTG
GACCTAATGATCCACCAACATCTGTTTATTTAGACTTTATGTGAAGAAGG
TTAACAAAGATCGTGTAGAAATCATACTGCCCTTGGACATAATTGAAttc
aacaaaattgaacggattgAACGTCTGCAACACGAATCAGATAAAGACGA
GGAGGAATGGAAACTTGTCACGTGTGCTAAAGAAAACTGGTTTCTTCTAG
CTGAAAACAGCATCGATGCTGAATTTAAAACCATCGTAGTAAATGGATTG
TCGAACAAAAGAACCTATTGTGTCCGCGTCATTGTATATCATGGCGGGCT
TGAGAACTGGATAGTATACAGTCAAAATGAGATAGACGCAAAAGGTAGGT
TTTGTATTTATTATTATCCAAGTTGATTGAATGAGCTTTTCTCCaaaaaa
aatgctttcaagGAACTAAAAATGTTCACAATTTTTGCCGTTAACCAAGA
CAGTTACCTGCTTATCGAAAAATCAGAAACTCAATGCAGTTTGTTGTAAG
ATGAATGTTAGTATCGCAGTGCCGTAGCCACCggggggctgggggggctg
cccccccccccaaataaaaaaaaagaagaagatgtAAATTTCGTCAACGT
TGTCTGTATAGTTACTTATTTGATTTCTTTGCTTAATCTCTTCCCTCCTT
TTACCACTTTTACGAGCCGACGCGTGCCACAGAACGAAATAACTAACTAA
CGCACTAATTATGTAAGAAGACAGtcttatgatttgaaaatatactaaTA
TGCACGCAATTTCTActtacttttttctgaaaattgactTTCGGAGAGGT
AGTTTTTGCCAATCTGGAGGGTATAAAGTCCAAAAATGTTCCTGGCCCCT
CGGCCCCAACCATTAGATACTAAACATATAGGGCCCCCCTAAAATATAAT
TTGTGTCTACGGCACTGTATCGAATGTAGGTGTAGGGACGGTACCGGACT
TTGATACCGTCTGCTTTAATCAGTTCGTCTTACTCGAACAAACACATCGT
CATTATGTTTCTGCCCAAAGTTTCACTTTGTTCTTGATACTTAGTTCGTT
TGCGATGAAGTGCAGAGCTGTTATTCCAATGAGGGCTGCCATCATCTGAC
ATCTCCTCATCCTTTGTCATCCAGCTTCCGgttttggttttctttaactt
ttttcgtttctataggtgcaactttatctttcgtttcACCGTTCGTCTAT
AAATTGTAGTTTGTATGCTTTCTTTGATGCGTCACAATCGACGTACCTGG
GAATTTCAATGCCTTGAAGTTTTTTGTTGTCAGTATCTTTGAATATCATC
ACCCAAAGTTTGTGTGTTATCATTTCAAGTTGGTGTAAGACTGAGGTGTT
TGTTTCTTGGTTGTGTTAATAGAGTTAACATATATCGAACTTATATCAAT
TGAGAGTTCCATTTCATTctatggcgttctaaatctacagGCCTAGTAAG
CGTGCAGCGACTTCGTTTTTGTGGGGGCTCAAATTTTCGAAGTCATTACA
TTGACGCTAGTCGCTAGTTCTACGAAATTTTAGTAGAAAATGGAATTATG
TTTAGTTTCTTTGACCTTTCTCGTACCTCTGCGTAAACCTAGACTTGAGT
GCCAGGcataaagttttttatttgacgtcaaatagtcAAGACGTGTTCTG
CAtcgctttcaaaaaaatggtggAAACTCAAAGAAGCATCGAAATTCgct
aaatatgaacaaaaatcgcgataaaaaCACCCAAGACCCACCAATTGAAG
CAGCAAACACAACATGCACCCTTGTTACGTGTATTGATGATGAAGATCAA
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AATATGTATGTCACAATTGTGTGCGAATAACGAGATCCTTAAGAAGTAAA
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
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