MSTRG.15641.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15641.1.p1
Unique NameMSTRG.15641.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000140_pilon:473027..493601-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15641.1.p1 ID=MSTRG.15641.1.p1|Name=MSTRG.15641.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20575bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000140_pilon:473027..493601- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTGACTGCAGAAATCTTTAATGGTCATTACAGAAATTCGAATCAATAAT CTTCTAGTATTATTTTGTTATTACAGGTAAACAAAAATATTTTAATGAAA GATATAATATAGTAAAAACAGAAATATTTAATGGTTGTTACCAAGGAACA AGCAGCTAACTCAAGATAAACATTTTAAACACAAAAACAAATGAATTGAC AAACCATCAACAACAAGAAAAATTTGACGACCATTCAAAATGATAACACC AGTCTCAAGTTACATTCATTCAACTTTTCTCTATCTTGTAATGTAAAGAA AAATCAATGTTTATGGTTGGAATTTATGATTTGCATGTGTGTAGGATTTC ATATTCGCTCTGTTTGTTTGCAAGAGAAATGGTATGTTATTTATTATCTA GTTTGGATCAACTTGCCAATAAATCAATTCTTTATTCATTTATGTTTTTG TTTATTTAGATTTTTTTAGAATCTTAAGTAAATGTATACATAACTTCCAT AAATATACCTGCAAGAATAAATGGAGTAAAAGTCATTAAGATTTTCATTG CCAGTTGCGCACGCCTATGCTCAGAATACGCTCCTCTACGGGAGTTCCAG CAGGGCCCGCAGATTTCTGCGGGGTGAGAAAACAATCATATACAACAAAA TATATAAACAAATAAAAATTTCAGCCAATGAGAATTTCTAAGTGAAAGAA AAAAAAACAAACCAAAACAAACCAACAAGACCCCCTGAAAATGTTATCCA AAAACATGAAAAAAGAGAATTTTTATGAAAAGTTTGTTGTGCACAAAATA TTCTAGACGACTATATTGATGCTCCTGTCAAGTTTTTTACTTCCTATTTT TTACTGAGTTAAGCAGAGTTAAGTCGTGACAGGGGCGTGCCGCTTGAGTT TGAAAAGTGAACCCTGTTAGATAAGAATATTTGGTAAATCTTGGACCCTG 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GAGATCCGATTGATTCCGATTTACCATGGCCCGGATTCATGTTTGGACAA
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GTTATCTACCTGGACACATTAATGGCATTTGTAATGGTGGGAGGAGCTGC
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TCCTCAAGGAGTTCCAAGGGGGTCAACTCTTCATTTATATCCAAGCTGTT
TCAGCTTATCTATCACCTCCAATAGCTGCTGTCTATCTGTTGGCAATCTT
CTGGCAACGCAGTAATGAACAGGACTTCGTGGTATGATGCTTGCAGTCAT
GATGGCAGCCTTGATGAGTGATTTGACTTCCATCTTTAATTCTGCTTCCA
CTATTTTCACCATGGACGTGTACCGGAGTATACGGAAACAAGCCGGAACA
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CCGAAACTTGTCTTGGAAATTATGCCTTCGGGTCATTGTTCAGCGTGCTC
TGGCAGCCAAAAGTTTATCGCATGCACAGGGCGGGGCAGTTCTTGCGGGA
TACATCAAAATCTTACCGATGTTTATTATGGTCATGCCCGGAATGATATC
ACGTGTCCTATTCCCAAGTTTCAAAGAAATTGGTTGGTACTCAGGCCTCC
GCGCAAAATACCCAAATGCAATGGCGGATGAAGTGTTACTGGGAAACACA
ACCTGTGGTATTCCACGGCATGATTCATTCCGATTGTTAAGAGATCCGAT
TGATTCCGATTTACCATGGCCCGGATTCATGTTTGGACAAACATCTGCTT
CTATTTGGTATTGGTGCGCTGATCAGGTGGTTTGGCCACGGTTATCTACC
TGGACACATTAATGGCATTTGTAATGGTGGGAGGAGCTGCAATAATGACC
TTCATCGGTGAACATGTATTCCGGTGCTTTATTCATCCAACAATCAGTGG
GTTGGAATCTCTATCTTTCAATCTTTGGTCTCCTGGCGTTGACTGGTATA
TGCACCTTAACAGGTCTTCACTTTGCCAGAATACATCCACAAGCGATTTG
GTGGGAACAGAATTCGAATCTTTTTGGCTGTTCTATCTTTGCTTCTTTAC
ATATTCACTAAAATTTCGGCATTGATGTTTTTACAGCTTCTTGGATTTGT
TTTTCTCCCTGTGTACATCTCAAGCGGGGTTGGGATGTCATTATTTGCCA
GTAACATTGGTAGCGAGCATCTGATTGGTTTATCAGGGTCTGGTGCTGCT
GCTGGAATCAGTGTCGGTGCATTTGAATTCAATTCGATGTTTCAATCCAA
ACGTGGAACAGTCAGCGGATATTTCTTGGCTGGAAGATTCATGACATTTT
TACCGATGACGACCAGCCAGGGAAAACTTACGGTAGCCGATATTTCAGTG
ATTGCTGTGTATATTGTCAGTGTTATTGCTGTTGGAGTATGGCAGACGTT
ATAGTTCATCAGCCACGCCCATCATGTTGTAAACGTGCTTTATATTTCAT
CTGTGGCCTCTCGGAGGATCCCATCGAAGAGCGGAAATCAATGGACGAGC
AGAAAGACCATATCAGAGAAGTTATTTCCTTAAAACAAGATCCAACAGCC
AAGAAATTTCTCCACATCAATTGTATTCTGGTTCTGGTGGTCTGTATTTT
TCTTCTCGTGTTCTTTACAGTCCCAGATGGTGGACCCACGGGGCCGACGA
TCCCCTTACCGTATATGCCGTTCGTTTTAAATGGGACACGACCCTATGAA
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CGATGAACTCTCTGAACAAAATGACATGGAAGAAAACGACCAAAACGAAA
TCCGACGTCGTTTTACATCAACCGGATCTGAAACAGACGGCGCGACGTTG
GAAATGAAGGAACGGCAAACGACAACTAAAGATAGTGATGATAATAGTAG
GGTGCCATTAATGACGTCACATACAATCTATTCTTCGAATGAATCAATTA
CTAATCAAGGGTACTTTTTGGGCGATGATGGTTGGTTTTGCTGTTGGTAT
AACTCGCATGATATTGGATTTTACTTATCCAGCGCCCTCATGTTCAGATG
CCGCCCAAGATACACGCCCTCCTATCATCAAGAAATTGTTGTTCCATTAC
TTTTATGTTGCATTGTTGTTGTTTGTGTTGACTTTGATTGTTTGTGTTGT
GATAAGTTTGTTGACCGAACCCCCTGATGAAGAACTGGGTGTTCATTTTA
ATCTTATGCGTGATTGGTGTATTATGGGTACCAGTCCTCAAGGAGTTCCA
AGGGGGTCAACTCTTCATTTATATCCAAGCTGTTTCAGCTTATCTATCAC
CTCCAATAGCTGCTGTCTATCTGTTGGCAATCTTCTGGCAACGCAGTAAT
GAACAGGACTTCGTGGTATGATGCTTGCAGTCATGATGGCAGCCTTGATG
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CGTGTACCGGAGTATACGGAAACAAGCCGGAACAAGAGAACTTATGATTG
TTGGCCGATGAGGTGGGGTGTGTCGATCCGGACAAGTGTATGGCTATCTG
TGAAAGTCGGACAGGATGTACAAATATCGCTCTTCCGAAACTTGTCTTGG
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ATCGCATGCACAGGGCGGGGCAGTTCTTGCGGGATACATCAAAATCTTAC
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TGGCCCGGATTCATGTTTGGACAAACATCTGCTTCTATTTGGTATTGGTG
CGCTGATCAGGTGGTTTGGCCACGGTTATCTACCTGGACACATTAATGGC
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TATTCCGGTGCTTTATTCATCCAACAATCAGTGGGTTGGAATCTCTATCT
TTCAATCTTTGGTCTCCTGGCGTTGACTGGTATATGCACCTTAACAGGTC
TTCACTTTGCCAGAATACATCCACAAGCGATTTGGTGGGAACAGAATTCG
AATCTTTTTGGCTGTTCTATCTTTGCTTCTTTACATATTCACTAAAATTT
CGGCATTGATGTTTTTACAGCTTCTTGGATTTGTTTTTCTCCCTGTGTAC
ATCTCAAGCGGGGTTGGGATGTCATTATTTGCCAGTAACATTGGTAGCGA
GCATCTGATTGGTTTATCAGGGTCTGGTGCTGCTGCTGGAATCAGTGTCG
GTGCATTTGAATTCAATTCGATGTTTCAATCCAAACGTGGAACAGTCAGC
GGATATTTCTTGGCTGGAAGATTCATGACATTTTTACCGATGACGACCAG
CCAGGGAAAACTTACGGTAGCCGATATTTCAGTGATTGCTGTGTATATTG
TCAGTGTTATTGCTGTTGGAGTATGGCAGACGTTATAGTTCATCAGCCAC
GCCCATCATGTTGTAAACGTGCTTTATATTTCATCTGTGGCCTCTCGGAG
GATCCCATCGAAGAGCGGAAATCAATGGACGAGCAGAAAGACCATATCAG
AGAAGTTATTTCCTTAAAACAAGATCCAACAGCCAAGAAATTTCTCCACA
TCAATTGTATTCTGGTTCTGGTGGTCTGTATTTTTCTTCTCGTGTTCTTT
ACAGTCCCAGATGGTGGACCCACGGGGCCGACGATCCCCTTACCGTATAT
GCCGTTCGTTTTAAATGGGACACGACCCTATGAATGAATAATACGTACAA
CCGTATGGACAAAATACGATTCGCGCATTCGCTCCGATGAACTCTCTGAA
CAAAATGACATGGAAGAAAACGACCAAAACGAAATCCGACGTCGTTTTAC
ATCAACCGGATCTGAAACAGACGGCGCGACGTTGGAAATGAAGGAACGGC
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TCACATACAATCTATTCTTCGAATGAATCAATTACTAATCAAGGGTACTT
TTTGGGCGATGATGGTTGGTTTTGCTGTTGGTATAACTCGCATGATATTG
GATTTTACTTATCCAGCGCCCTCATGTTCAGATGCCGCCCAAGATACACG
CCCTCCTATCATCAAGAAATTGTTGTTCCATTACTTTTATGTTGCATTGT
TGTTGTTTGTGTTGACTTTGATTGTTTGTGTTGTGATAAGTTTGTTGACC
GAACCCCCTGATGAAGAACTGGGTGTTCATTTTAATCTTATGCGTGATTG
GTGTATTATGGGTACCAGTCCTCAAGGAGTTCCAAGGGGGTCAACTCTTC
ATTTATATCCAAGCTGTTTCAGCTTATCTATCACCTCCAATAGCTGCTGT
CTATCTGTTGGCAATCTTCTGGCAACGCAGTAATGAACAGGACTTCGTGG
TATGATGCTTGCAGTCATGATGGCAGCCTTGATGAGTGATTTGACTTCCA
TCTTTAATTCTGCTTCCACTATTTTCACCATGGACGTGTACCGGAGTATA
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GGTGTGTCGATCCGGACAAGTGTATGGCTATCTGTGAAAGTCGGACAGGA
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TCATTGTTCAGCGTGCTCTGGCAGCCAAAAGTTTATCGCATGCACAGGGC
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CATGCCCGGAATGATATCACGTGTCCTATTCCCAAGTTTCAAAGAAATTG
GTTGGTACTCAGGCCTCCGCGCAAAATACCCAAATGCAATGGCGGATGAA
GTGTTACTGGGAAACACAACCTGTGGTATTCCACGGCATGATTCATTCCG
ATTGTTAAGAGATCCGATTGATTCCGATTTACCATGGCCCGGATTCATGT
TTGGACAAACATCTGCTTCTATTTGGTATTGGTGCGCTGATCAGGTGGTT
TGGCCACGGTTATCTACCTGGACACATTAATGGCATTTGTAATGGTGGGA
GGAGCTGCAATAATGACCTTCATCGGTGAACATGTATTCCGGTGCTTTAT
TCATCCAACAATCAGTGGGTTGGAATCTCTATCTTTCAATCTTTGGTCTC
CTGGCGTTGACTGGTATATGCACCTTAACAGGTCTTCACTTTGCCAGAAT
ACATCCACAAGCGATTTGGTGGGAACAGAATTCGAATCTTTTTGGCTGTT
CTATCTTTGCTTCTTTACATATTCACTAAAATTTCGGCATTGATGTTTTT
ACAGCTTCTTGGATTTGTTTTTCTCCCTGTGTACATCTCAAGCGGGGTTG
GGATGTCATTATTTGCCAGTAACATTGGTAGCGAGCATCTGATTGGTTTA
TCAGGGTCTGGTGCTGCTGCTGGAATCAGTGTCGGTGCATTTGAATTCAA
TTCGATGTTTCAATCCAAACGTGGAACAGTCAGCGGATATTTCTTGGCTG
GAAGATTCATGACATTTTTACCGATGACGACCAGCCAGGGAAAACTTACG
GTAGCCGATATTTCAGTGATTGCTGTGTATATTGTCAGTGTTATTGCTGT
TGGAGTATGG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15641MSTRG.15641Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15641.1.p1MSTRG.15641.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15641.1.p1.exon16MSTRG.15641.1.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon15MSTRG.15641.1.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon14MSTRG.15641.1.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon13MSTRG.15641.1.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon12MSTRG.15641.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon11MSTRG.15641.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon10MSTRG.15641.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon9MSTRG.15641.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon8MSTRG.15641.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon7MSTRG.15641.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon6MSTRG.15641.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon5MSTRG.15641.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon4MSTRG.15641.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon3MSTRG.15641.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon2MSTRG.15641.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15641.1.p1.exon1MSTRG.15641.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000140_pilongenomesc0000140_pilon:473027..493601 -