MSTRG.15590.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15590.1.p1
Unique NameMSTRG.15590.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000139_pilon:435918..517058-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15590.1.p1 ID=MSTRG.15590.1.p1|Name=MSTRG.15590.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=81141bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000139_pilon:435918..517058- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTCTTTCCTGCATTCAGTCACTGAAAGACATCTTATCCAGCGATGAATT CAATCTTGTGGCTGCTAGATATTATTGCCAACTTCACCACGAGAACACAA CATATCAATCAGAATGGGAAGTTTTCATCCAAGTGTCCATCAAACTACTT GGTTTCCCTGAATCTTCTATTAAAAACATCAAAGTAAGTCTTGAATTTTC AATATGTTTCGTTAGGGGTTGCTTTGAAACTGTCAGTTTCCTAAAGGGGT GTAGTCATTTGAAGAAGGTGTTAGGTGCAATGGGTTTCGTACCAATACAG TTTAACTGGCAGGTCATAAATTTAGCACAACAATCAGCGCCGAAAAATAT TGGCAATTACGTTTTTCAGATTTTAAGGCTCGGGCGAGAATTACAATTTC AGTACATGCACTTTGTTCGAGTAGATCTTTTCGATGTTCTCAGCCATATT GAAATAATTTTGAGCTTTTAGATCCTGAGAGGCTAAGATCGTAAGTGTTG AGTCTAATGTTAAAACTCAGAGTTAAAACTCTATTTTCTAACCGTACTTT AAAGCAATTAAAAATCAATTGCGGTTTTAAAGTTTTGAGGAAATTCCCCT TTTGTGCCAAATATTTCGATGGCGATTGTGATAACATCCTAGGCTGTAGA GGGGAGGTTAGAAATAGCGTACGTCTATTGCTTTAATGATATCATTTCTA TTGTGCACTGTAGTACAAGGGGCGTTGGGTGGTTGAATATTTGGAATCTT TTTGAGTATGTACCGTGGATGAACCCATATCTCTGAGCTATGCCGCATAT CTAATTTTAATGATAAATTGTTCGATTTTCAGGAGAATGTATCAAGTCCT GCTCCACCAGAGCCGAAGAAAGCAAAGAAAAGTGATTCTTATACTGGTTA CGAAGTAAGTTGAATTCCTTCTCATCAAATTTCATGAATTTCTAAGTTCA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000139_pilon:435918..517058-

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TCTTGGACTGGGATGTTTTCAACTTACTGTATAATTACATCAACCGTGGA
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TTCGCTCTGACAGTACCGAAGAAAAACAAGTAAGAGACTTTGAACTATCC
TGAATCGAGAGTGAAGATGTTATCACCCTGTTTCATCCCTGAATCAAAAT
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GCTACACACCTATTGAAGTTACTCTAAAAATATACCCTAAAGACAGATGA
TATTGCGATTGCTTCATTGCTATGTGCTGTCTATCCAAAATGGCCAATTA
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CATGATTGGTATCACAACCCTGGGTCCTCGATATTTATCCTTCGCTCTGA
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CGTCTTTTTGTAACACGGGATGTGGATAACAAGAACATCTGCTACACACC
TATTGAAGTTACTCTAAAAATATACCCTAAAGACAGATGATATTGCGATT
GCTTCATTGCTATGTGCTGTCTATCCAAAATGGCCAATTAGTTCTAAAGA
TAACAGTTGATGGCAGGTTCGGGTAATATTACTATATTAAAGATGGCGCG
TCAGTTACGTAAGCGAACAAACGATGTATCCTATGGCAACCATATGGCGA
TTCATATGGCGATCGGCTTTCTTTTCCTTGGTGGTGGAAGGCTGGTGGAA
AAGTCATACTTGAGCAATGCTTAAACACAGTTTTAGTATCTTTGTCGCTC
TTACCTTGGTTGAAGATAATTCGAAAGTTGCGCGAATCATCTTATTCAGA
AGAAGTATTACAGAATTTGCGCAATCAGTGGATCCTTCTTGGCACTGTCT
CTGAAGTTTGCAGCCAGTTGTAATGCTCATGCATTTAACATGATGTACGC
TGAATTACTGGAATCTTTGCAAAGTGAATCATTTCTAATGATTGGCTGGA
CACAAGAGTTATGCTATCGTTCAACTTGATCATGTGGGATACTCTCGTAC
CTACCTTAGATTGGATGGAAGAAATTGTACCAGGGCATGGTAGCCAACTC
CGTTAAGGTGATTGTATCGGAAGCTACAATGGATTCATTGAAGCCTGACC
ACGTGCTGTATAGGGAGGGAGATACAGTAAATACTGACGTCACTGCTCCA
GCTGCCATTATGGCATTGTCTTTGTTGTACCTCAAGACAAATAATCTATA
CCTGGTTACAATGATTCATCTCAACATCAAGGGAGCTTTCAAATCTTTCA
AGGGACAGACAACATGAAAATCTTGGACTGGGATGTTTTCAACTTACTGT
ATAATTACATCAACCGTGGAAAGAAAAATGAACTGATGATCATGATTGGT
ATCACAACCCTGGGTCCTCGATATTTATCCTTCGCTCTGACAGTACCGAA
GAAAAACAAGTAAGAGACTTTGAACTATCCTGAATCGAGAGTGAAGATGT
TATCACCCTGTTTCATCCCTGAATCAAAATATATCAAAAAGATTCCACCT
GCAAGCGTTACGCCATTTATACGTGTTAGCCTGTGAACCGCGTCTTTTTG
TAACACGGGATGTGGATAACAAGAACATCTGCTACACACCTATTGAAGTT
ACTCTAAAAATATACCCTAAAGACAGATGATATTGCGATTGCTTCATTGC
TATGTGCTGTCTATCCAAAATGGCCAATTAGTTCTAAAGATAACAGTTGA
TGGCAGGTTCGGGTAATATTACTATATTAAAGATGGCGCGTCAGTTACGT
AAGCGAACAAACGATGTATCCTATGGCAACCATATGGCGATTCATATGGC
GATCGGCTTTCTTTTCCTTGGTGGTGGAAGGCTGGTGGAAAAGTCATACT
TGAGCAATGCTTAAACACAGTTTTAGTATCTTTGTCGCTCTTACCTTGGT
TGAAGATAATTCGAAAGTTGCGCGAATCATCTTATTCAGAAGAAGTATTA
CAGAATTTGCGCAATCAGTGGATCCTTCTTGGCACTGTCTCTGAAGTTTG
CAGCCAGTTGTAATGCTCATGCATTTAACATGATGTACGCTGAATTACTG
GAATCTTTGCAAAGTGAATCATTTCTAATGATTGGCTGGACACAAGAGTT
ATGCTATCGTTCAACTTGATCATGTGGGATACTCTCGTACCTACCTTAGA
TTGGATGGAAGAAATTGTACCAGGGCATGGTAGCCAACTCCGTTAAGGTG
ATTGTATCGGAAGCTACAATGGATTCATTGAAGCCTGACCACGTGCTGTA
TAGGGAGGGAGATACAGTAAATACTGACGTCACTGCTCCAGCTGCCATTA
TGGCATTGTCTTTGTTGTACCTCAAGACAAATAATCTATACCTGGTTACA
ATGATTCATCTCAACATCAAGGGAGCTTTCAAATCTTTCAAGGGACAGAC
AACATGAAAATCTTGGACTGGGATGTTTTCAACTTACTGTATAATTACAT
CAACCGTGGAAAGAAAAATGAACTGATGATCATGATTGGTATCACAACCC
TGGGTCCTCGATATTTATCCTTCGCTCTGACAGTACCGAAGAAAAACAAG
TAAGAGACTTTGAACTATCCTGAATCGAGAGTGAAGATGTTATCACCCTG
TTTCATCCCTGAATCAAAATATATCAAAAAGATTCCACCTGCAAGCGTTA
CGCCATTTATACGTGTTAGCCTGTGAACCGCGTCTTTTTGTAACACGGGA
TGTGGATAACAAGAACATCTGCTACACACCTATTGAAGTTACTCTAAAAA
TATACCCTAAAGACAGATGATATTGCGATTGCTTCATTGCTATGTGCTGT
CTATCCAAAATGGCCAATTAGTTCTAAAGATAACAGTTGATGGCAGGTTC
GGGTAATATTACTATATTAAAGATGGCGCGTCAGTTACGTAAGCGAACAA
ACGATGTATCCTATGGCAACCATATGGCGATTCATATGGCGATCGGCTTT
CTTTTCCTTGGTGGTGGAAGGCTGGTGGAAAAGTCATACTTGAGCAATGC
TTAAACACAGTTTTAGTATCTTTGTCGCTCTTACCTTGGTTGAAGATAAT
TCGAAAGTTGCGCGAATCATCTTATTCAGAAGAAGTATTACAGAATTTGC
GCAATCAGTGGATCCTTCTTGGCACTGTCTCTGAAGTTTGCAGCCAGTTG
TAATGCTCATGCATTTAACATGATGTACGCTGAATTACTGGAATCTTTGC
AAAGTGAATCATTTCTAATGATTGGCTGGACACAAGAGTTATGCTATCGT
TCAACTTGATCATGTGGGATACTCTCGTACCTACCTTAGATTGGATGGAA
GAAATTGTACCAGGGCATGGTAGCCAACTCCGTTAAGGTGATTGTATCGG
AAGCTACAATGGATTCATTGAAGCCTGACCACGTGCTGTATAGGGAGGGA
GATACAGTAAATACTGACGTCACTGCTCCAGCTGCCATTATGGCATTGTC
TTTGTTGTACCTCAAGACAAATAATCTATACCTGGTTACAATGATTCATC
TCAACATCAAGGGAGCTTTCAAATCTTTCAAGGGACAGACAACATGAAAA
TCTTGGACTGGGATGTTTTCAACTTACTGTATAATTACATCAACCGTGGA
AAGAAAAATGAACTGATGATCATGATTGGTATCACAACCCTGGGTCCTCG
ATATTTATCCTTCGCTCTGACAGTACCGAAGAAAAACAAGTAAGAGACTT
TGAACTATCCTGAATCGAGAGTGAAGATGTTATCACCCTGTTTCATCCCT
GAATCAAAATATATCAAAAAGATTCCACCTGCAAGCGTTACGCCATTTAT
ACGTGTTAGCCTGTGAACCGCGTCTTTTTGTAACACGGGATGTGGATAAC
AAGAACATCTGCTACACACCTATTGAAGTTACTCTAAAAATATACCCTAA
AGACAGATGATATTGCGATTGCTTCATTGCTATGTGCTGTCTATCCAAAA
TGGCCAATTAGTTCTAAAGATAACAGTTGATGGCAGGTTCGGGTAATATT
ACTATATTAAAGATGGCGCGTCAGTTACGTAAGCGAACAAACGATGTATC
CTATGGCAACCATATGGCGATTCATATGGCGATCGGCTTTCTTTTCCTTG
GTGGTGGAAGGCTGGTGGAAAAGTCATACTTGAGCAATGCTTAAACACAG
TTTTAGTATCTTTGTCGCTCTTACCTTGGTTGAAGATAATTCGAAAGTTG
CGCGAATCATCTTATTCAGAAGAAGTATTACAGAATTTGCGCAATCAGTG
GATCCTTCTTGGCACTGTCTCTGAAGTTTGCAGCCAGTTGTAATGCTCAT
GCATTTAACATGATGTACGCTGAATTACTGGAATCTTTGCAAAGTGAATC
ATTTCTAATGATTGGCTGGACACAAGAGTTATGCTATCGTTCAACTTGAT
CATGTGGGATACTCTCGTACCTACCTTAGATTGGATGGAAGAAATTGTAC
CAGGGCATGGTAGCCAACTCCGTTAAGGTGATTGTATCGGAAGCTACAAT
GGATTCATTGAAGCCTGACCACGTGCTGTATAGGGAGGGAGATACAGTAA
ATACTGACGTCACTGCTCCAGCTGCCATTATGGCATTGTCTTTGTTGTAC
CTCAAGACAAATAATCTATACCTGGTTACAATGATTCATCTCAACATCAA
GGGAGCTTTCAAATCTTTCAAGGGACAGACAACATGAAAATCTTGGACTG
GGATGTTTTCAACTTACTGTATAATTACATCAACCGTGGAAAGAAAAATG
AACTGATGATCATGATTGGTATCACAACCCTGGGTCCTCGATATTTATCC
TTCGCTCTGACAGTACCGAAGAAAAACAAGTAAGAGACTTTGAACTATCC
TGAATCGAGAGTGAAGATGTTATCACCCTGTTTCATCCCTGAATCAAAAT
ATATCAAAAAGATTCCACCTGCAAGCGTTACGCCATTTATACGTGTTAGC
CTGTGAACCGCGTCTTTTTGTAACACGGGATGTGGATAACAAGAACATCT
GCTACACACCTATTGAAGTTACTCTAAAAATATACCCTAAAGACAGATGA
TATTGCGATTGCTTCATTGCTATGTGCTGTCTATCCAAAATGGCCAATTA
GTTCTAAAGATAACAGTTGATGGCAGGTTCGGGTAATATTACTATATTAA
AGATGGCGCGTCAGTTACGTAAGCGAACAAACGATGTATCCTATGGCAAC
CATATGGCGATTCATATGGCGATCGGCTTTCTTTTCCTTGGTGGTGGAAG
GCTGGTGGAAAAGTCATACTTGAGCAATGCTTAAACACAGTTTTAGTATC
TTTGTCGCTCTTACCTTGGTTGAAGATAATTCGAAAGTTGCGCGAATCAT
CTTATTCAGAAGAAGTATTACAGAATTTGCGCAATCAGTGGATCCTTCTT
GGCACTGTCTCTGAAGTTTGCAGCCAGTTGTAATGCTCATGCATTTAACA
TGATGTACGCTGAATTACTGGAATCTTTGCAAAGTGAATCATTTCTAATG
ATTGGCTGGACACAAGAGTTATGCTATCGTTCAACTTGATCATGTGGGAT
ACTCTCGTACCTACCTTAGATTGGATGGAAGAAATTGTACCAGGGCATGG
TAGCCAACTCCGTTAAGGTGATTGTATCGGAAGCTACAATGGATTCATTG
AAGCCTGACCACGTGCTGTATAGGGAGGGAGATACAGTAAATACTGACGT
CACTGCTCCAGCTGCCATTATGGCATTGTCTTTGTTGTACCTCAAGACAA
ATAATCTATACCTGGTTACAATGATTCATCTCAACATCAAGGGAGCTTTC
AAATCTTTCAAGGGACAGACAACATGAAAATCTTGGACTGGGATGTTTTC
AACTTACTGTATAATTACATCAACCGTGGAAAGAAAAATGAACTGATGAT
CATGATTGGTATCACAACCCTGGGTCCTCGATATTTATCCTTCGCTCTGA
CAGTACCGAAGAAAAACAAGTAAGAGACTTTGAACTATCCTGAATCGAGA
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GATTCCACCTGCAAGCGTTACGCCATTTATACGTGTTAGCCTGTGAACCG
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AGGGACAGACAACATGAAAATCTTGGACTGGGATGTTTTCAACTTACTGT
ATAATTACATCAACCGTGGAAAGAAAAATGAACTGATGATCATGATTGGT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15590MSTRG.15590Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.15590.1.p1.exon21MSTRG.15590.1.p1.exon21Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.15590.1.p1.exon7MSTRG.15590.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15590.1.p1.exon6MSTRG.15590.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15590.1.p1.exon5MSTRG.15590.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15590.1.p1.exon4MSTRG.15590.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15590.1.p1.exon3MSTRG.15590.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15590.1.p1.exon2MSTRG.15590.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15590.1.p1.exon1MSTRG.15590.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15590.1.p1MSTRG.15590.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000139_pilongenomesc0000139_pilon:435918..517058 -