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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000137_pilon:543096..552090- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15506.1.p1 ID=MSTRG.15506.1.p1|Name=MSTRG.15506.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8995bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000137_pilon:543096..552090- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTCGATTGCGACCACTATCTAGAAAAGAACGAACGTGTCAACATACTAT
TATTTTAGTGATAAATTTTGATCAAAATAAAGCGATATTTTTGCGGAGAA
TATGACTTCCTTGACATCAGTATTGGTTATTTTGATGATTTTGACTGCTG
CTGTTTTAAAGATGACAATGGCTCGATCTTGTCATGACGAGAGAGGAAAA
CCATTTTGCAATCGATCAAAATGTCCAAAATTATCTTGCAAAGGTAAGCT
TCTATAGATTTTTATGCGTTTTATTTGGGTGAGTTGAATTTAATCATTTC
TTGCGAATGAGTCTTTCCAAAGTCTGCAAAAAGTATACAATAAACAAAGT
AGACAAGACTAATTTTGATTATACAATTGACTATTACTGCTGTGACTAAA
TACAACATCGATGACTGGAGCTGTTTCTTCCAAAAAAAAGGTTGAGTCGG
TGATAAAAAATCGGTGATATCAAATGAAACACTTATTTCAAATGAACCTT
AACCTTTCATGTAAACCTTTGGTATCTATGTCATTAGACTTGTCCGGAAA
TTTCTTTTTCCTCCAAGAACATATCAATCATTTAGTGACAAAAGTCAGTG
TGTTTCTGTGTGTTAAAATCGGAATAAGACCATCATCCATCCATCCATCC
ATCCAATCTCCAAAATCAAATATCCTTCAAAAGGATGTGGTGGTGGACTT
CCTTCCTTTCGTAATATTATTGTGGCAGGAAATTTCTTCTTCCAATAAAT
TATAGAAAAAGAAAATACCAGACATCATTAATTTCAATAAGTCCTGTAGG
TTACATTTCAGACGGGAGGATTCCCCAAGAACCTTTATATTGATTCTCAA
CTTGACAAAATTGGAAACAAAATTCGTAATATTGTTTATTATTGAGATTG
AAGCTGATCTAAGTGGCGAGTGGTTTTCATCTGATTTCATATTCCATTAC
CAAACTTGCGAATAAAATTGATCGCTACAAATAATCACTATTTTTAAAGA
TTCAATTTTCTGGTGGTCGCAAATAAACTACTTGTGGTTACTTTGAAGTT
TTAGTCAATCGAAAATAGAAATCAAAAAACAACAATATGAAATTAAGTAG
GTAAAACAACCAAATTAAGTATAATTGGCGGGTCGAACAAATAGACCAGT
TTGTTTTCATATAATTGGCAGACAAATTAGAGATGTTCCGTGTTCCATCC
ACTCTTTTCACTATAAATAATAAAACAAAAGGTCGCACTGTTTCTTCACT
TTTTGACATCGCCAATTTCCAAAACGTTTTACTTGTGGTTGTAATAATTT
GCTTTTTGCGTCATTCAGTACACAAGGTCACCGCCCTTTTTATGACCAAA
TCATAAAGAGGTGCATTTATTTTATTAAAAGTATTTTATTACTAAGCTCG
TTAAATTACCTCTCATCATTTTCATCAAATCATAATTTTGTCTTTTCTTC
ACTTGTCTTTATTCGGACAATAGTAATCATTTTGCGAAAAGAGATTGTAT
CTTTCTTCTATCAGCGCCGCGTGTTAAATGCCGTTTTCCTCTTCACGTTC
ACAAGAATAAAGCGCGCGACTACAACTTTTTTCCTTTTATGGTAAGAAAT
ATGCGAAGAAAATACAAATTTATCAACTCTCACATTCAACCCGTACTGTA
CTGTCTTTTGCTCTAGTTCGAAATCATTTGTAATCGGAGCAAATTAGATT
TCCCGTGCATGTTTAGATTAGTGAAAGACCCTGCGATTTGCCGAAGATAT
TCTGAATTACTTCGTGACAAACTATCAACCCCATAAATAGCGGAAGCCAT
AAGAAAATGAAATGTACAAACCTTTTTGAGTTAATCACCCATTTTTTTCG
GAAAATTGAAAATCATTAATGGTAGCGACCTGTTTGTTTTTTCGAATTTT
TAATAATTACTTTTCATGAGACATCGTTAAGAAAACAAAATCGAGACTGA
CAGGGTCATCTCATAACCAAGCATCTCACCGTATATAATTATATAAAACT
AAATTATTTTGAAACCTCAAAAGTCGGGCATACTGGAGAAGTGGGACGTG
GGACGGTGGGACGCTCAGGTGGGACGCTCGAGTGGGACGCTCAGGTGGGA
CGCTCAGGTGGGACGGTAGTGGGAACGTAGGGGACGGGTGGGACGCTAAG
GTGGGACGGTAGTGGGACGCTAAGGTGGGACGTAGTGGGACGCTAAGGTG
GGACGGTAGTGGGACGCTAAGGTGGGACGGTAGTGGGACGGTAGTGGGAC
GCTAAGGTGGGACGGTAGTGGGACGCTAAGGTGGGACGGTAGTGGGACGC
TAAAGTGTGGGACGGTAGTGGGACGCTTTAGGTGGGACGGTAGTGGGACG
CTAAGGTGGGACGGTAGTGGGACGCTAAAGTGGGACGGTAGTGGGACGCT
AAGGTGGGACGGTAGTGGGACGCTAAGGTGGGACGGTAGTGGGACGCTAA
AGTGGGACGGTAGTGGGACGCTAAGGTGGGACGGTAGTGGGACGCTAAGG
TGGGACGGTAGTGGGACGTAAGGGGGACGGTAGTGGGACGCTAAGGTGGG
ACGTAGTGGGACGCTAAGGTGGGACGGTAGTGGGACGCTCAGGTGGGACT
GTAGTGGGACGCTAAGGTGGGACGGTAGTGGGACGCTCTCTCGTAAGGCT
TTTGTATTTTTGCTTCTCTGATAATTATTTACGAGTAAAAAAGAACTCAA
TATGAGTAAATGAATACTTTCAGTATTAGTTGTTATTCTGATCGGAATAC
TCTCAAATGATTACGCCAGTATCGACAAAATAACAATGAAAATCCTGCCT
ATTGTTTGTATGCGCGAATGAAAATGTTTTACGCAATTACATTACGTCAT
TTTTTATTACTTTTTATGGTAATATAAAGACATTTGCTCTCACCGAAGAA
GCATGACTAGATAGCTCAGTCGGTAGAGCATCAGATTCAAGGTCAGGTGG
TCCAGGGTTCGATTCCCTCTCACGTATTTTTTTTTCTTTTCTAAACTAAT
CTATCCACAGGGATCAAAAATATTTCAGACCTAATCAAAAATATTGATTT
TTCAAGCACGGAGGACGAGAAATTTATGTTTTTAAATAGCAGATCTTGTT
GTTGTCCTTTAATCTTTTGATACTTTTGATACAATTTTCATCCAAAATCT
GTCTTTGAATCATACAAAGTTCCAATACACTTTCCTCGAGATATACATGG
GGGGGATATTGGCAAAAAGGGGTACGGATGCTCCGGGGGGGGTACTAGGT
TTGCGAGGTGACAGGTATGTCCGAGGCAAAAATCGAAAATCGCCCCTTTG
AGAGACAAAATTTTGATGATTTTGGGACCCTTTGAGAGATTTTTTCCCTA
AATTTAGTTTAAAAGTCTGTACTAGAAGTGTTAAAAATTGGTTGGCTAGT
CAGACAGGCTAATAACGTTTTTTCTGAAACAAATATTCTTTTGACACTTT
TTGCCGGACAAAATCGGTTCGGAAAAACTGGAGCAACCTTCGATTGCCTT
ATCGGACTTTTTAGCTGTTGGACTAGATGATGTCGGATGCATGACTTTTG
AAGACTCCTCCCCCAGTTTGTGAAATCATCATTATGAGCAGTTTTCCAAG
AGAAAAATAAATAAAATCTGTATTTCCAATTAAATAAGACAGGCTATGAA
TTTTCGCATAGGAAATTGATTTTCTGTGGTTTCTCAAGGGAATAATAATC
TTCTTCTTCAAAAAGAAAAATTCAACTAATGATTGCTCAAGGAATTTCAG
TTATTTTGTATTTTTTGCAAGGGAAATACCTTTTCTTTCAAAAGAAAATC
AATAAAGTGCTGTGATTTTCCTTGGAAAATACGCAACAACTAATTTTCCT
CAGAAAATACGGACCAGTGATTTTCCTTGGAAAATACGCAACAACTAATT
TTCCTTGGAAAATACGCAACAACTAATTTTCCTTGGAAAATACGCAACAA
CTATTTTCCTCAGAAAAGACGGACCAGTAATTTTCCTTGGAAAATACGGT
CTAGTGATCTTCCTTGGAAAATACGCAATAACTAAATTTCTTTGGAAAAT
ACGCAACAACTAATTTTCCTTGGAAAATACGCAACAACTATTTTCCTCAG
AAAATACGGACCAGTGATTTTCCTTGGAAAAATACGGTCTAGTGATCTTC
CTTGGAAAATACGCAATAACTAAATTTCTTTGGAAAATACGCAACAACTA
ATTTTCCTTGGAAAATACGCAACAACTATTTTCCTCAGAAAATACGGACC
AGTGATTTTCCTTGGAAAATACGGTCTAGTGATCTTCCTTGGAAAATACG
CAATAACTAAATTTCCTTGGAAAATACGCAACAACTAATTTTCCTTGGAA
AATACGCAACAACTAATTTTCCTTGGAAAATACGCAACAACTATTTTCCT
CAGAAAATACGGACCAGTGATTTTCCTTGGAAAATATGGTCTAGTGATCT
TCCTTGGACAATACGCAATAACTAAATTTCTTTGGAAAATACGCAACAAC
TAATTTTCCTTGGAAAATACGCAACAACTATTTTCCTCAGAAAATACGGA
CCAGTGATTTTCCTTGGAAAATACGGTCTAGTGATCTTCCTTGGAAAATA
CGCAATAACTAAATTTCCTTGGAAAATACGCAATAACTAAATTTCCTTGG
AAAATACGCGATAACTAATTTTCCTTGGAAAATAAGGGACAACTAGTTTT
CCTTGAATTAATTATTTTAATCTTCTTATCTTCTAATCTTTCTTATCCTT
TCGGGCTGACCTTCCAGCACAGCTGGTTTATTTCCTTTAATCCTAGGAAG
CGTTTCTCTTTATAAAAATAATTTTACATAAAAATATAGCATAAAAAGAT
AATAAAGATAAGTTTTCGAGTGTTATATATATTTAGTGCAATCGGCTCTT
GCATGTTGGAAATAATCTAAAATCATTTCTTTAAGAAGTCAATACCTTGA
CAGGGTAAAATTATACAAGTCATGGCAAAATAAAGGTCTCATGATAATCA
TTGTTCACTTCTCTTGCACATCAGCTGCGTGGCCGAGTGGATAAGTCGAT
GAAACGGCAACTTAAGGGTAATGATTATAGAGAGTTTGAATCCTATACGG
GTGCGACGAAAATTGTGTTATTTTGTCTGTTTTGTCAACATTGATCAAAC
TTTTTCTGGTTTTATGAGCTCTTATTGATATTTTTGAAAATTTCCGTTAA
AATTTTAAGAAACAAAAATTGGGGGGGGGGGCAGTCAGGCAAATTGACCG
ACGCCGCGACGGGTATCTGCAGCGGTTTAGGCTATCTGATATTCCGATGG
CGTATTGGCGGCCGCCCACGCTAAAGCATACTGTCAATTGGTAACCTTAG
TAATGCTCTACCATGGGCATGCCCGGTGCAAACCCTTTAGTCTGTGGCTT
TCGACCGGTCATGAAAACGCCATATTCTATGTCAAGTGAGGTTAACTCTC
AAGCAAAGCTATCCATTTGGTCATTGAAAGATCCTCTATTGAATTTCACA
AAAAGAAACGTGTCTGTGTGGTCCTGGAATTTTTGCTGACGTCAGCAATT
ATGTCATTTTTGGTCATTTTTCAAACAACCTTCCCCAATAACTTTTATTG
GCTTCATTTTCAGATATGGGTTGTAATGTTTTTCTGAACGGGTATGAAAA
ATGCTTTCCAACGGTATGTAACATGACATACTTTGGAGAAAAGAATTTTC
ATTTTAGTCTGGAAACCTATTCTGGTCTGTAAAATACACAAACAGGTGTC
AATTTTTTGGGTCTGAGATTTAAATCCATTTTTGACCCCTAAACTACCAT
TGTGCAAAGTTTCATGCTTTTACGCCTTTGTGCACAATATTTGCACAACT
AGACCGTACTATTAGCGGGTGGAGAGTCAAGAGTCAAGAGTTATGACTTT
CCCTTGTCTTGAAAATCTAATGTTCCAAAACTTTCAACTAAAAAAATGCT
AAAAAATCGGCTTTCGTCTTTTTTTATTATATCTTATAAACACTTTTTTC
AGAACCACAATGAAAAGAAAAGCAAAACTGACTGAATATGCTGCCAAAAA
AGTGATTGACAGGTCTAGAAAATGATTGACAGGCCCGGGTTAGATATTTC
CGTGAGCAATCTCGTTATATTTATCAAAAAGTAATATACTTGTGGAAAGC
CCAATTATTCTACTTTTTCGAATGCTGTGTCATGGAATTTTTTTAACAAT
TAAATAGAACGGGGTTTCCTCTGATGTAAACAAACCTCGAGTCCTATCCT
GAAAATTGACATTGAGCGTAGAAAAAAAGACAAATGAAAGTATTTTCCTT
TTTAATTCATATTTCCAATAATTAAAGACTAACTTGAAAACACCAAGAGT
GAAATGTAGCTAAATGATTAGAACGCCTTGCGACTTAGAATTTTTTTTCA
AAACTGAAAATTTGACCCTGGCTCGAACTACCAAAGTCTCTTGTCAATGA
TTCTGAGTCCGGCACGTTAGCAATGTACTATCGAACCGATACGATACTAC
GCAATTCAAAAATCCTTATAAAAAACACTACTGCATATACGGGTGAACTG
ACCTTGGACCTCATGGGCTAGGTCTTTGTAGCTTCGATCAAATTGATTAT
GTTATTATTTTATAATCCATTCACTATGAAAAAAGTCAAAAACATTTCGA
TCGATCTGTGTATTGTTTATAAGTACTTGACCTGTCCCTCTTCACTGTAT
TATAAAAAGAAAAAGACAAAATACATATAAAAGAGCGTCCCACTTGAGCG
TCCCACTACCGTCCCACTTGAGCGTCCCACTACCGTCCCACCTTAGCGTC
CCACTACCGTCCCACCTTAGCGTCCCCACTACCGTCCCACCTTAGCGTCC
CACTACCGTCCCACCTTAGCGTCCCACGTACCGTCCCACTTAGCGTCCCA
CTACCGTCCCACCTTAGCGTCCCCACTACCGTCCCACCTTAGCGTCCCAC
TACCGTCCCACCTTAGCGTCCCACTACCGTCCCACTTTAGCGTCCCACTA
CCGTCCCACCTTAGCGTCCCACTACCGTCCCACTTGAGCGTCCCACCTGA
GCGTCCCACTCGAGCGTCCCACCTGAGCGTCCCACCGTCCCACGTCCCAC
TTCTCCAGTATGCCAAAAGTCGACAGGTGAATAGGTCACAAGGAGGTTGC
TAGACTTCAGTTTCCGTTTTACAAAAGGCGCTGTCGTCTGTGTTAGTTCA
TTACTTATGTTTTTTTCGGCCACAGTTTGTATTCTTTTTAGCGTCAACCA
CAAATTTATGAAAACCAAAACACTCATTACTTAACCGCTCGCTTCCGAAT
GCATCAACCACAGAAATCGGGAAAAAGATTATTGATTATTTTTGAGTCAA
ATTCGTGTTTCATAAAACAGAGAGCGGGTCAATCATTTTGGCTGCGAGTT
GGCAACTAGCCTAATACTAAAATGATTTTGTAAACGGTCTTCCATTACAA
GGCTATCTAACTGCGTGCGGTAAAACATTATCAAGAATAGATAAGTATTG
TAAATTGCCATAAGGCATATAGTGAGTGAAATTACAGATGATATTGTATG
TTTTCAAAAAGAGAAAAGCCGCCCGTTGATCATTTTAATTGTTTTTAATC
CGCCACTAATTGGGTGGTTTCCGTAAAACGGGGACCATCAAAACGTCTAA
CTGGACAAATACAATCATTTGTGATGGACACCAAAGTTGATTCAGCTCTC
CTTTCCTTCTTCCATCTTAGAAATTAATACTCCCCCTTTGATCCCTTATA
ATCGTTTTAATTTCCTCTCTGTGGCATTTGTTGCTAAGAAAGATTAAGAA
AGTTTCCACTAAAACGATCCACTACCATATTTTGACGTGTGCACAATATT
TCATGACTCATAATTCTGGATATAGAATCTACGCAAGTCATTTATTTTCT
CTATATATCTGCATTTTTTTCAACAGAGTGTAGATTGTTACTCTAACCAG
ACAAATTTCCGGCGAGCAATTGATGAGCTTTTGAGCGGTCTACTAAAAAT
AACCTTTTTTTTAACGTGCAATCTAAAGCAAGTATTTCGTAATGACATCA
GAAAGAACTGTCAAACGATACGATTTTAACACGTTGATCTGAACTTGACA
CGGATGGTTCCCAAAATAGATGAATCAGTAGTCTGCATGTCAAAAAGTGA
AAGACGCATAACTAGGGACGAAGAAAAATATACCTACGCTTTCGATCTTA
CGATCCCGGGAGGCGGCACTCAAGGTAAACGACGTGCGATCCTTAAGGGT
CCTTTTCCAAGCTTCCCAAAATGCACCGAAGGGTCAAAATGAACAAAGAT
GGGAAAAATTGCCAATTTTGAGCCGCACGTATGGTTCTTTTAGAACGACC
TTCAAACGACCCCAAGTCTTAAGAAATTGGACCATGGGTTATATTTCAAA
CATCTTTTAAAGTTTTCCCATTAAACATGAGAACTGGCAACCAGTTATGT
ATACAATCAAGAACTCTAGATTCTGTGACATATCAAGCATCTTTTCTAAT
TAAAATCTTTTTCATTATAGGAAACGTTGGTATAGACATGTGTGGATGTT
GTGATGTATGTCTGAAACAAGAAGGGGAAGTTTGCGGTGGCGAGAATTCC
CACTTTGGTGCATGTGAACATAAAGTGTCGCATTGTATCCAATTGGAAGG
TGAAAAACAAATGCATTGCCGATCATTGAAGACTGGTGAGTAATTTCATT
GATTGATTATTTCTCGGTCCATTGTCCAAAGTTCTTGGGTTGGTTATAGT
ACTGAAAACAGATTTACATAATGTTGGTCCCGATTTACTAACAGTGAGCA
CATATTTAACTTCGATGACATGCTACATCTTTGCTAAACGTTGAAAAAGC
TAACTCTTCGCAAATTAAAAACTTGAACAGCAGTACAAAAATGAATCTTT
ATTGTCTAATTTCTTTCTGCAGCAGTGGAAAATGGTGTACGAGAAGTTTT
GAACCAACTGGAATATTGCAACGCTACGAAGAGTACGAAGAGTAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000137_pilon:543096..552090- >MSTRG.15506.1.p1 ID=MSTRG.15506.1.p1|Name=MSTRG.15506.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1134bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000137_pilon:543096..552090- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGTGGAAAATGGTGTACGAGAAGTTTTGAACCAACTGGAATATTGCAAC
GCTACGAAGAGTACGAAGAGTGAAACGTTGGTATAGACATGTGTGGATGT
TGTGATGTATGTCTGAAACAAGAAGGGGAAGTTTGCGGTGGCGAGAATTC
CCACTTTGGTGCATGTGAACATAAAGTGTCGCATTGTATCCAATTGGAAG
GTGAAAAACAAATGCATTGCCGATCATTGAAGACTGATGACTTCCTTGAC
ATCAGTATTGGTTATTTTGATGATTTTGACTGCTGCTGTTTTAAAGATGA
CAATGGCTCGATCTTGTCATGACGAGAGAGGAAAACCATTTTGCAATCGA
TCAAAATGTCCAAAATTATCTTGCAAAGCAGTGGAAAATGGTGTACGAGA
AGTTTTGAACCAACTGGAATATTGCAACGCTACGAAGAGTACGAAGAGTG
AAACGTTGGTATAGACATGTGTGGATGTTGTGATGTATGTCTGAAACAAG
AAGGGGAAGTTTGCGGTGGCGAGAATTCCCACTTTGGTGCATGTGAACAT
AAAGTGTCGCATTGTATCCAATTGGAAGGTGAAAAACAAATGCATTGCCG
ATCATTGAAGACTGATGACTTCCTTGACATCAGTATTGGTTATTTTGATG
ATTTTGACTGCTGCTGTTTTAAAGATGACAATGGCTCGATCTTGTCATGA
CGAGAGAGGAAAACCATTTTGCAATCGATCAAAATGTCCAAAATTATCTT
GCAAAGCAGTGGAAAATGGTGTACGAGAAGTTTTGAACCAACTGGAATAT
TGCAACGCTACGAAGAGTACGAAGAGTGAAACGTTGGTATAGACATGTGT
GGATGTTGTGATGTATGTCTGAAACAAGAAGGGGAAGTTTGCGGTGGCGA
GAATTCCCACTTTGGTGCATGTGAACATAAAGTGTCGCATTGTATCCAAT
TGGAAGGTGAAAAACAAATGCATTGCCGATCATTGAAGACTGATGACTTC
CTTGACATCAGTATTGGTTATTTTGATGATTTTGACTGCTGCTGTTTTAA
AGATGACAATGGCTCGATCTTGTCATGACGAGAGAGGAAAACCATTTTGC
AATCGATCAAAATGTCCAAAATTATCTTGCAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000137_pilon | genome | sc0000137_pilon:543096..552090 - |
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