MSTRG.15445.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15445.1.p2
Unique NameMSTRG.15445.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000136_pilon:442657..476488-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15445.1.p2 ID=MSTRG.15445.1.p2|Name=MSTRG.15445.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=33832bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000136_pilon:442657..476488- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAGAGAAGTGACACAAAGGCACGTAATCAAGTTTTTAACCTTCTTAAAGA CAAAAAACAATAACAAACCAATCCGGAAACAAAACTAGATCAATAAAAAT GAACAAACTACCATCTTCAACAGTGAAATTGATTTCTTCCAGTCAAGTCA TCAAAAGTGTGTGGAATGTTGTTAAGGAGCTTGTGGAAAATTCACTAGAT GCTGGCAGTGATTGTATTGATGTTAGATTGGTAAGTCTTTCAGTCAGTTT CAGTTCTCTTTAATGTAATTGTAGATTTTTTTATTATTTGATGTCAGTTG AAGTTATTATTTACAGAAGTTGGTTCAAGTGAACTGTCATACCATACATA AAACAGAATTTTCATTTCAGATTTGCCATTCAATTTTGCATTATACTAAT AGATTTTTAACATCTTTGTTTTTTTTTTCATTTATCACTACAGAAGTAAC ATAAATGAAGAAAAATAAAGTCAAATAATCCAAGGCATCTGTCTTTTTCA TGTTTTGTACTAATAATTGCTGGTCTCCTGAGGTGACCCTTCAAGCAAAC CTAAATCCCCAAAGAAAAAAATGGCCAAATCATCCTTTTTTATCAGAATG TTGATGATGTTTTGATGTATTGATGATGAAATTGACTTTAATTTCATCCC CACTCGAAATTCAATGTTTAAAAATTGCAATTGCTATCCCAATAGGAGTT TTTATCCCCACTGAGGAAAAACGTACCATCGGGGCTGTGAAACAGGGGTG TAATGATTGTGACAATGATTATGTTTCAGGAGCAAAGTGGTTTGCAGAAA ATCGAGGTCAATGACAATGGTCCTGGAATACCAAAAGAACAAATTGAACA TCTTTGCAAGCCATATTTCACATCAAAGCTTTCCAGCTTCGAAGATTTAG AAACACTTCAAACATGTGGTTTTCGTGGGGAAGCTCTACATTCTATTTGT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000136_pilon:442657..476488-

>MSTRG.15445.1.p2 ID=MSTRG.15445.1.p2|Name=MSTRG.15445.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1197bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000136_pilon:442657..476488- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ATTCAATCTTTCCGAAGACTGTTTTGTCCGAACCGACAACGAGCTAAAGA
GGCATTAGTTAAGACTTTGATACCGATCGGACTGTTGAAAGATCCTCATA
TTCAAATTGATGATCGACTGAAGAATAAACGTTTTTCTATGTTTTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15445MSTRG.15445Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15445.1.p2MSTRG.15445.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15445.1.p2.exon17MSTRG.15445.1.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon16MSTRG.15445.1.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon15MSTRG.15445.1.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon14MSTRG.15445.1.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon13MSTRG.15445.1.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon12MSTRG.15445.1.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon11MSTRG.15445.1.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon10MSTRG.15445.1.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon9MSTRG.15445.1.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon8MSTRG.15445.1.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon7MSTRG.15445.1.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon6MSTRG.15445.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon5MSTRG.15445.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon4MSTRG.15445.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon3MSTRG.15445.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon2MSTRG.15445.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15445.1.p2.exon1MSTRG.15445.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000136_pilongenomesc0000136_pilon:442657..476488 -