MSTRG.15393.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15393.1.p1
Unique NameMSTRG.15393.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000135_pilon:670699..708538-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15393.1.p1 ID=MSTRG.15393.1.p1|Name=MSTRG.15393.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=37840bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:670699..708538- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGACACAAATACAATTCATGGTTCACTGTGAACTTTTGACGACGGCTGAA
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CTACTTCACCGAGGTCAATAGATCTCAACTCTGTGAGTAGTCCTCCATCC
TCTAATACTGTTTCTCAACCGCCAGAGACCTCTTCAACGATAGAAGCTCC
GAAAGAGAAATCATAGGAATTGGCTGCCAATGTTTTGAGTGAAGTCGAAT
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CGTCGACGTCCTCCACGAAAGACGAGAAAATGTCTTCTCACTCTAAAAAC
CCTTCTTCGAAACACGATAAAAGTTCCATTTCCTCAAATGAGGGATCTGA
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CCGAGCGGACATAATCACCAAAACGTACACAATACAAATGTCAATAGTAA
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CAATGACAACTGGTATGTCACCTTTGAATGCGAAGATGACGCAAAGAAAG
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ATGGCTAGAATCAAAGCTAAAACGCTACTCAGCCGGACAGTCTATCTACC
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CTCAATGGATCAGTACAACCACACGATTCATTCCTCCAGAGAATCACCAT
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GACTCCGGTCCTAATCACCAAAAACATAGAAATAGGGAATGAGCGCTGGA
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TTCACTCAACAAAACGCCCTCGTACGCCCTGATATAATAACTCAAGTTTC
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GAATATTACTTCTCACGGGAGAATTTGGCGAACGATCAATACTTGAACTC
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ATCACCAACGAAGTTTCTCAACCACTTCACCAACCAACGGGTCACTCTGC
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ACCACAGTGGTGAGCACAGATAACGGTATACCAAAAATGCTGAGCTATGC
ACAAATGGCGCAAAAACCGAACAGTAATAAGGAAAATTTTGTAAACGATA
TCGACACGGCGAAGGACATTTCAGATGCGGTCGCCGCCAGTGACCCTAAA
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CCATCAACGAATAATAAAAATAATAGCGGCCTACCAGCGCTGCGGCCTTT
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CTGCTTCCTCTCTCAAGAATTGAATGGACAACGCCCTTACTTCCCTGGCT
CTAAGCCACGTTTCCGTAACAACTATAACAACCCCAACAAAGTACCGTTC
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TTTGAATGCGAAGATGACGCAAAGAAAGCTTACAGATATCTCCGCGAAGA
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ATTCTCCACCACCGGTGGTGTTCCGGCGTTCACTGTGAGCCACCCGCAAC
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ATAGATCTGCTTCCTCTCTCAAGAATTGAATGGACAACGCCCTTACTTCC
CTGGCTCTAAGCCACGTTTCCGTAACAACTATAACAACCCCAACAAAGTA
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CACGGCGAAGGACATTTCAGATGCGGTCGCCGCCAGTGACCCTAAAAAAT
CTTCAAATAATAAGACGGAAAACGGCAAAAACGGACAATCGGCAAATGGA
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GAAATCCAACGGACAAGACAAATCGGCGGAAGTCGAACAGATGAGCGTTT
CTTCGAACTTAACAAATACGGTGATGAAGGAAACTTACGCATCTAAATTT
GGTTCGTCCAGTGACTCGTCAAGAACTGGCAACTCTCCGTCAAGACCCAA
AACCCAACCAACGACTAACACAAACTCTATAAATAAGCAAAACCCACCAT
CAACGAATAATAAAAATAATAGCGGCCTACCAGCGCTGCGGCCTTTGATG
AGCCAAGTCATCAATCCACCTGTCAGTAAAATGGACGAAATCAACGGACT
AGAGTTACAACAACAGCAACCGATTTCGTTCAGTGATACTGTTAAAAAAC
AATCTTCAATTGAACCTTCCACTCCTACTTCACCGAGGTCAATAGATCTC
AACTCTGTGAGTAGTCCTCCATCCTCTAATACTGTTTCTCAACCGCCAGA
GACCTCTTCAACGATAGAAGCTCCGAAAGAGAAATCATAGGAATTGGCTG
CCAATGTTTTGAGTGAAGTCGAATCAAATAAAGAAAAACCAATGACAACA
TCTCCTGCAGACATGAGACGTCACAGTGGACCGCGCAAAGACTGGAATCG
AAACAGTTCTGAAGAAGGACCGCGCTTCCAGCGGCTCCGTGAACGACGCG
GCAAAGACGACACAGGAGGGTCTTCGTCGACGTCCTCCACGAAAGACGAG
AAAATGTCTTCTCACTCTAAAAACCCTTCTTCGAAACACGATAAAAGTTC
CATTTCCTCAAATGAGGGATCTGAAGATTCATCCAATGCTCCTCAAATTA
ATGGTGATTTGAACTTGGATCTGGCTTTGGATTTCCCAGCTCTACCAAGC
CCGAACTCACCAAACGAAACTGGTAGTAATGGATCAGCAAATAGATCTGC
TTCCTCTCTCAAGAATTGAATGGACAACGCCCTTACTTCCCTGGCTCTAA
GCCACGTTTCCGTAACAACTATAACAACCCCAACAAAGTACCGTTCCACG
AAAGAAACGGGAACGTTGACTACAATTCTGAAGACCGCCCGTCCAACGTC
CCTACTAACAGGCGTAACAACAACCCGAGCGGACATAATCACCAAAACGT
ACACAATACAAATGTCAATAGTAATTATCGTGGTAGAAATAGTGAAGACC
CACGCTTCGTATCCGACCGAAAAATAACTACAACAAATACAACAACTACC
AAGGGAATAAACGATGTTAAAGCGTTGTTCGCAAGTCCAAACTGTCCTAA
ATGGACGAGTTTCGAGTACGCATACAATGACAACTGGTATGTCACCTTTG
AATGCGAAGATGACGCAAAGAAAGCTTACAGATATCTCCGCGAAGAAGTC
CAATCATTTCAAGGTCGGCCTCTGATGGCTAGAATCAAAGCTAAAACGCT
ACTCAGCCGGACAGTCTATCTACCAAAGAATGCGGCAAGCGCCACCGGTT
CGACCACAACTAACACGTCACCGCCCGCCGATAATGTGACGTCACAATTC
TCCACCACCGGTGGTGTTCCGGCGTTCACTGTGAGCCACCCGCAACAAAT
CTTTTCACCCAATTTTCAACCGTTTTACAACACAGCACCTGTGAACGGGA
ATCCCGGCATTCTTCCGGCCGGTGCTCAATGGATCAGTACAACCACACGA
TTCATTCCTCCAGAGAATCACCATACGTGCAGTTGGACGAAACCGAACAG
AAAGTGCGTGCAAACATGAAAAGATGTATTGTCATTTTGAGAGAAATCCC
AGAAGTCACACCCATCGAGGTTCGAAAATTAACTTCAGATATTGATCTCA
TAGTGGACGCACTTCGAGCTCAATGACTCCGGTCCTAATCACCAAAAACA
TAGAAATAGGGAATGAGCGCTGGAAACCCACGGCAACCATAGTCGAAGAA
AACATTAATTCGGTCCCGATTCACGACCTACCGCAACCGTACATTGCACC
GGACGGTTTATATTACTGGCCGGCCGACATGATCAACGGATTCCCTCCCC
AACCTGTGCTGATCGAAAGCCTGCCAAACGGTACGGCAACGGTCATCCAA
GCAGACCACGACAGCCAGCAAGCTTTCACTCAACAAAACGCCCTCGTACG
CCCTGATATAATAACTCAAGTTTCAGCACCGCCGCCTACACCGCCCATTA
ACAACGTTGTCATCCCGCCCTCCACTAAAGACTTGACACCAGATGAGCTG
AAACGCTCCATACAAAATCAGTTTGAATATTACTTCTCACGGGAGAATTT
GGCGAACGATCAATACTTGAACTCACAGATGGACAGCGATCAGTATGTAC
CGATCTCTACCGTTGCTAAATTCAATCAAGATGGGGATACATCGACGGAA
GGTTCCATTTCACCTGATCTATTGATCACCAACGAAGTTTCTCAACCACT
TCACCAACCAACGGGTCACTCTGCAGCTGCTGTTGCCTCCTTGAATGCTA
ACGCCCCTGCCTTCACCTCAATAAGATGACTTCTGGTGTGATTGAATCAC
TTTCGACCTTGAGTTTGGAAACAAACACAGAAGATACAGAGACATCGTTA
GCTGACACAAATACAATTCATGGTTCACTGTGAACTTTTGACGACGGCTG
AAGTTTTCGAACCAGCAGCTACCGAACCCGCCCAAACCACTACAACGAAC
GCCAACGAAAACGCCCCCTTAATCACCACAGTGGTGAGCACAGATAACGG
TATACCAAAAATGCTGAGCTATGCACAAATGGCGCAAAAACCGAACAGTA
ATAAGGAAAATTTTGTAAACGATATCGACACGGCGAAGGACATTTCAGAT
GCGGTCGCCGCCAGTGACCCTAAAAAATCTTCAAATAATAAGACGGAAAA
CGGCAAAAACGGACAATCGGCAAATGGAAAACAAAATAGAAAACCTGGAA
GTAAGAACTCTCCTAGAAGTCAACGTCGGAAATCCAACGGACAAGACAAA
TCGGCGGAAGTCGAACAGATGAGCGTTTCTTCGAACTTAACAAATACGGT
GATGAAGGAAACTTACGCATCTAAATTTGGTTCGTCCAGTGACTCGTCAA
GAACTGGCAACTCTCCGTCAAGACCCAAAACCCAACCAACGACTAACACA
AACTCTATAAATAAGCAAAACCCACCATCAACGAATAATAAAAATAATAG
CGGCCTACCAGCGCTGCGGCCTTTGATGAGCCAAGTCATCAATCCACCTG
TCAGTAAAATGGACGAAATCAACGGACTAGAGTTACAACAACAGCAACCG
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TCCTACTTCACCGAGGTCAATAGATCTCAACTCTGTGAGTAGTCCTCCAT
CCTCTAATACTGTTTCTCAACCGCCAGAGACCTCTTCAACGATAGAAGCT
CCGAAAGAGAAATCATAGGAATTGGCTGCCAATGTTTTGAGTGAAGTCGA
ATCAAATAAAGAAAAACCAATGACAACATCTCCTGCAGACATGAGACGTC
ACAGTGGACCGCGCAAAGACTGGAATCGAAACAGTTCTGAAGAAGGACCG
CGCTTCCAGCGGCTCCGTGAACGACGCGGCAAAGACGACACAGGAGGGTC
TTCGTCGACGTCCTCCACGAAAGACGAGAAAATGTCTTCTCACTCTAAAA
ACCCTTCTTCGAAACACGATAAAAGTTCCATTTCCTCAAATGAGGGATCT
GAAGATTCATCCAATGCTCCTCAAATTAATGGTGATTTGAACTTGGATCT
GGCTTTGGATTTCCCAGCTCTACCAAGCCCGAACTCACCAAACGAAACTG
GTAGTAATGGATCAGCAAATAGATCTGCTTCCTCTCTCAAGAATTGAATG
GACAACGCCCTTACTTCCCTGGCTCTAAGCCACGTTTCCGTAACAACTAT
AACAACCCCAACAAAGTACCGTTCCACGAAAGAAACGGGAACGTTGACTA
CAATTCTGAAGACCGCCCGTCCAACGTCCCTACTAACAGGCGTAACAACA
ACCCGAGCGGACATAATCACCAAAACGTACACAATACAAATGTCAATAGT
AATTATCGTGGTAGAAATAGTGAAGACCCACGCTTCGTATCCGACCGAAA
AATAACTACAACAAATACAACAACTACCAAGGGAATAAACGATGTTAAAG
CGTTGTTCGCAAGTCCAAACTGTCCTAAATGGACGAGTTTCGAGTACGCA
TACAATGACAACTGGTATGTCACCTTTGAATGCGAAGATGACGCAAAGAA
AGCTTACAGATATCTCCGCGAAGAAGTCCAATCATTTCAAGGTCGGCCTC
TGATGGCTAGAATCAAAGCTAAAACGCTACTCAGCCGGACAGTCTATCTA
CCAAAGAATGCGGCAAGCGCCACCGGTTCGACCACAACTAACACGTCACC
GCCCGCCGATAATGTGACGTCACAATTCTCCACCACCGGTGGTGTTCCGG
CGTTCACTGTGAGCCACCCGCAACAAATCTTTTCACCCAATTTTCAACCG
TTTTACAACACAGCACCTGTGAACGGGAATCCCGGCATTCTTCCGGCCGG
TGCTCAATGGATCAGTACAACCACACGATTCATTCCTCCAGAGAATCACC
ATACGTGCAGTTGGACGAAACCGAACAGAAAGTGCGTGCAAACATGAAAA
GATGTATTGTCATTTTGAGAGAAATCCCAGAAGTCACACCCATCGAGGTT
CGAAAATTAACTTCAGATATTGATCTCATAGTGGACGCACTTCGAGCTCA
ATGACTCCGGTCCTAATCACCAAAAACATAGAAATAGGGAATGAGCGCTG
GAAACCCACGGCAACCATAGTCGAAGAAAACATTAATTCGGTCCCGATTC
ACGACCTACCGCAACCGTACATTGCACCGGACGGTTTATATTACTGGCCG
GCCGACATGATCAACGGATTCCCTCCCCAACCTGTGCTGATCGAAAGCCT
GCCAAACGGTACGGCAACGGTCATCCAAGCAGACCACGACAGCCAGCAAG
CTTTCACTCAACAAAACGCCCTCGTACGCCCTGATATAATAACTCAAGTT
TCAGCACCGCCGCCTACACCGCCCATTAACAACGTTGTCATCCCGCCCTC
CACTAAAGACTTGACACCAGATGAGCTGAAACGCTCCATACAAAATCAGT
TTGAATATTACTTCTCACGGGAGAATTTGGCGAACGATCAATACTTGAAC
TCACAGATGGACAGCGATCAGTATGTACCGATCTCTACCGTTGCTAAATT
CAATCAAGATGGGGATACATCGACGGAAGGTTCCATTTCACCTGATCTAT
TGATCACCAACGAAGTTTCTCAACCACTTCACCAACCAACGGGTCACTCT
GCAGCTGCTGTTGCCTCCTTGAATGCTAACGCCCCTGCCTTCACCTCAAT
AAGATGACTTCTGGTGTGATTGAATCACTTTCGACCTTGAGTTTGGAAAC
AAACACAGAAGATACAGAGACATCGTTAGCTGACACAAATACAATTCATG
GTTCACTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15393MSTRG.15393Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15393.1.p1.exon11MSTRG.15393.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15393.1.p1.exon10MSTRG.15393.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15393.1.p1.exon9MSTRG.15393.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15393.1.p1.exon8MSTRG.15393.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15393.1.p1.exon7MSTRG.15393.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15393.1.p1.exon6MSTRG.15393.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15393.1.p1.exon5MSTRG.15393.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15393.1.p1.exon4MSTRG.15393.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15393.1.p1.exon3MSTRG.15393.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15393.1.p1.exon2MSTRG.15393.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15393.1.p1.exon1MSTRG.15393.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15393.1.p1MSTRG.15393.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000135_pilongenomesc0000135_pilon:670699..708538 -