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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000135_pilon:234108..243740- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15367.1.p1 ID=MSTRG.15367.1.p1|Name=MSTRG.15367.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9633bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:234108..243740- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAAAATGGGCGAGAAGAATAAGTTCGGAACACTCCGCAATAAATACAGT
CATGTGAAAAAAATTTCGTCAAAAAATCCAAGAGTGAGTATAAGAGTGAA
AGTTCTTGGCTTTCCAGTTCTTTCACTTCTAAATTGTTAAAGCTGATTTA
ATTTTTTCTAAAATATTTGGGCTGTTTGTTTTATCTTCACGTCAACCATT
AAATTTGTTGTGCTTTGATCGTTCACTTGAAAATTGTTTGGTTCAGAGAA
GGACTTTTTTCAAATTTTAATACGTACAGTAGCTAGCTATAAAAAATGGA
TTAAATTTTGTGTGAAAAAACTTTTGCGCATGGAATGGAGGATCAAAATT
CTTCGCGTAGACAAATTCTTGCCAATCAGCCTCTTTTTCACCCAATTTCT
TTTGTTTTCCTAAGAGGTTTCTGTTTTATAAATATTTTGTGCAAATTAAA
ATAGGACCCTCCCGACGCGGTGCCTCGGAAACTTCTGGAGTTTTCGGAGC
AGCTAAAAAAACACTATTTTTCTCTCCGGAAATTCCAGAGCTCTTCCGGT
GCTTCCGGAGCAAGTGATTTTTAACACTTTCTAAAAAACCGTTTAAACAT
GGTTACAAGCAAAAAATATTCAAAATATTGATATTATGGTTCAGCCATGG
ATGTATAAAGAAACAGGAGAAGTATGCTATTGTAACCATGCTCGCCCTAC
GATTAAAAATATTACGAGGTATGCATGCTCATAATCTCATATATCGTGCA
TTTTTAATGAGCTCTTTTGTTGATAGGTAAAATCTTGCTTATTGGCTAAC
TTAATTGTTGGAAATAATATAAGATGGGACGAGATTCATTGTTTCTGACA
TTGGTGTAAGAAAATATTTGGATTAAAAAAGGGCCTGTAAACTTTGCAAT
CCTTCATCAAATGACAAGATTTTTCGGTCAACATTTTCTTCAAGGTGAAC
TCTATTGCTTAATACTTTCCTCCAAAATTCTCCAGTGACTTTTTGTCTAC
AAATTGGGTCTGAAATTGTGTGTGCTTATAAAGAACTTTTCATTTTCTGG
CTTGAGAAAATATCTTTTCAAAACAAAATTTAATGGATGACAAAATTGAA
CGCAAACTTATTTCGTGGAGCTAAATTTTATTTTATTCTCGTATATTAGA
AGGCTGGAAATCTTCGATGCTGATAGTAAGAATGTTCAGAGCAAACACTT
GAGTTCTACTAAAAAGTCGTATTTCATCGGGCGAGCCTAGAATTTCTTTT
GATTTATTACATAAAAGAAATCAAAAGACTTTAACGACCAATTACCGACA
AATTCATCTCCTGTCTTTCTTTATACCTCTATGGTTCAGCCATTAATGAA
ATTGAATTTGTCACATTATATTTAGAAGCATCACTTTGGTCGAAATATCG
AAAAAATTAAAAAACGTGAGGGTTCACATGAGTCGGCTGATTTTTTTTAA
ATACGTGCGTGCGCAGTTAGCTTTCACATGATTAGCACAGCGAGCGATAT
CGTAATTATATCACAGACATCTTCTCCGGAACCTTCAGGAGTTCCGGTGC
AGACCAATCACCGAAAATCTAACTCCGGAACACCGGAAGTCCTCCGGAAT
CTTCCGGTGTTCCAGAGCATGAAAAAAAACAGCACTTTTTGCTCTGGACA
TTTCCGGAGCGCCGGGAGGGTCCTATAATAAAATCCTCTTGAAATTTAAT
CCACTTTAGGCAGGCAGCAGAGCCACAAATAACTTGTGTTCGCGTCGTCC
GACCAACTCAGAGTTTTTCTTACTTTTCCAAATCTTTTGAGTCGGAAAGT
CCTGCCTAACTCAAATTTGAAAAAATTTCATATTTCCAACAATTCCGATT
GCCGACCTTATCTACCATACCAACTCACTTTTTGGAGCTGAACACAAGTT
ATTTGTGACCGCGGCCTTAAGAATGTACATAAGGTAAGACGTGTCAAAAG
AAATGGATTAACATTTGATTCATATTTTGTTTTTTCACAAAAGCTAATGG
AGTTGGATGTTCTTGCTTTTTTAGACAGTTTAGCCAGAATCATGTTTTTT
CTTCAATGACACTAAGCAAGCATTCAATAAAAGAAAACAAAGATTTTAAA
AAGAAAAACCCAAATAAAGGACTAAAAATGATTGTTGACCAATGTTGGGG
ATATGTAAAACTCAAAATCATCCTTTGATATATATAACCAAGGGGCCTGA
AGGGGCACTTGAGTCTCAACCCAAACATACACAGGATCAGGGAAATCCCT
CAATTGCGGTAGTAATTTCTTACTGCAATTGCGGTATAAACGTCACTTTT
AAATTTTTCATATAGCGCAATTGCAGTATATTCAAGAAACAGAATTCAAG
ATTCAAGGAGAAAACAGGCAATTTTTGTACATAATTGGTCATATCTTTTT
AACGCACAGACAAAATATTTTTTCCGTAGATCAGATTATTTTAATAAAGA
AAAGCTATCTTCTCGTACAATTTTTTACAGTCGATGTTTGTTTATCTTTG
TCGACCAGCACTATATGTAACTGTTATAAGACTTTGTAGGCTAATCACGA
ATGAAAACTACTGCAATTGCAGTATACAGCAATTGAGGGATTTCCCTGAC
TGATACACGAAACTTTTGCGATCATGTTCGGGCCAAAATAAAAAAAGCAT
GCAATGTTCAGGACGTGATATGATATTGGGCCACAAAAATTGGGATTTTA
ACCTTCAAAAACCTGGCCCGAATATGGTCCTTGAAGGGAAAATATGTTAT
ATGGCGGAATTGTTTTATTTTGTTCAAATGTGCCAAATGTTTTTAAAAAT
CCAATCACAGCGATATCCAATTGTTTTGTTTTGTTTTGTTCAATCACATT
CAATTGTGTTAAAAGTATAAACATCAAATCAAATGAAAGTGCTTTCATCC
AATCAGGCGAACCCTAAAAATATTTTTGTTTCCGGTCCACCGGGTGACGA
AAAAAACACTCACCCGGCCGGCCGCAAAAAAATTTTTTTTGGCTAAATTT
CGATCCCAAAACACGATTTTTTAAAGCACTCGTAGAAGTTAAAATGCTGG
TCTTCTTTACCTTAAATCTGTAGTAACTTGACACCGCTACAGGCTTTGGC
ATAAGAAAAATTCACGTGTGATCATCGCACGCCTAGATTTTTATTTATAG
TGGTCTAGGCGTGCGATTATTCAAATACAATTGAATATTCAATATCTCTA
AGAACACTCTCTTTCATTTTGAATATTTATCTTCAATTGCTAAAGGCTCC
AAACTGTGATTACAAAGTGAACTTTTTTGAGAAAAAAGTAGAGTGAGAGA
AACATTTCCCCAATTTTTTAAATCCTCACTTTATGAATGTTTCTTTTTAT
CTTACTCACAAGTCAGCATGATTCCTTTTATAAAAACAAAGCTGTTTACT
TACTGAAAAGTCCCCACATTGTGAATGCTTCTATTTATTTTACTCACAAA
TCAGCATGATTCTTTTATAAAAACCAAGTTGTATATAAAAAAAACATTCT
TAAAAGTTGAGTTGTAAGCAAGAATTAACAAAAACAATGCAGGGTTTAGT
TTGAGATTAATAAAATTTCATTTCTATAACAATGATCAGGATAAAACCTT
CATTCCAAGTGATTTCTAGGCGTGCATTTTACAGTAGAATATAAAATATC
ACGTGCGATAAATCACACGCCTCAAAAACTGATTCACGAAAGTTTTCCAA
ACAAACAAACTAACCCTAACCCTAACGATGATGTACGAAAAAAAATGCGG
CCGGGTGACGATGAAATAAATTTTCACCCGGCCGGTGGACCGGAAACAAA
AATTTTTTTCGGGTTCGCCTCAGAAAGGATTTTTGACAATCTTAACTCTG
GCATCAAATTCCAGCTTTTGACTTTTGACAACTATACAAGGATCCTGTTA
GCCTGGATATCCAAGCTCAAAATTTTAGAAAAACAAAAATTAGTCCGGCG
GCGATCCAGGATCACCCTTACAATTAGTAAATATGGGTTTTTATTTTATT
TTCCCATCATATGGTCCCTTGGGACCCCAAAACCAGTTTTTGCCAGGCTG
GCAAAGCTGGGGAAAGTTTTTTGTGGGGGCTTGAAGGGGGTAGGGTCATT
TTAGCCTGGGGGTCCTTAGAAAGTCGATTTTTGAAGTTCTCATTTAGCTA
AAACTGATTGTGCCATCAGATAGAGCTTGAAGAGTAGATCTCCAAAATAG
GGTCATTTGTCACATTTGGCGGACTTAGTCTCCCGGAATTGGCTGATACG
TCTTCAAAAATGCAATATTTTATGCTGACGTCAGCATTTTTGAGAGAATT
TCCAGCGAAAGAAACCACTTTTAACCGATGCGTCTCGAAGAGTACTATCG
ATTAGAGGGGTCATTTATAGGGTTTCCTAGGCTAGATTATGAGATATTTG
AGTTTGAAATTTTGCTGACTCAGCGTTTTTCAACGTTTTTTGCCCTTTTC
TGCTGAGTCAGCAAAATTTCAAACTCTAATATCTCATGATCTAGCCTAGG
AAACCCTATAAATGACCCCTCTAATCGATAGTACTCTTCGAGACGCATCG
GTTAAAAGTGGTTTCTTTCGCTGGAAATTCTCTCAAAAATGCTGACGTCA
GCATAAAATATTGCATTTTTGAAGACGTATCAGCCAATTCCGGGAGACTA
AGTCCGCCAAATGTGACAAATGACCCTATTTTGGAGATCTACTCTTCAAG
CTCTATCTGATGGCACAATCAGTTTTAGCTAAATGAGAACTTCAAAAATC
GACTTTCTAAGGACCCCCAGGCTAAAATGACCCTACCCCCTTCAATCCCC
CATAAAAAATTTTCCCCAGCTTTGCCAGCCTGGCAAAAACCGGTTTTGGG
GTCCCAAGGGACCATATAATGAGAAAATAAAATAAAAACCCATATTTACT
ACTTGTAAGGGTTGATGCAAAAAAGCCCTTTTCGCCGCCGGACTAAATTA
CCTCAACATACAAAGTTCTAAAATTATAGAGCTTGGTCTCACTAGAGAAA
GAAAGTGCAAACCCATGTTTCCTAGTCAACCCAGGGCAGCAAAACAGAAA
TTAATAAAAAGCAGTCTTACAAGATCTAAAACTATCTAAAACATCCAAAG
ATTACACCAAAGTCCATAAAAAAGTTTGCATGCATTATCATGACCAACCA
TGTTTTCTTGGAAAATGAACTTGCCTCTGTTTTCTTCTTTTTCATGTTTT
CATGTAACAGAAAGCCCTATCTTCACTAGCAACTGGAGGACTATCCTATT
TTTCCTTAAGAATTGCTCCGCGCTGTGTAGATTGGCCCTTACGGCTTTAG
CGAAGTGAGCGCAAGCAAGCGGACTGCATTCTCTTAAAGAGAATGCAAAT
CGCTCTAGGGAGACCAGGCTGTAAACCAGAACATAAAATATCAAAAACTA
GACTGTGAAATAGTTTACAGCCTGGATATCCAGGCTAGGATCCTGTTGAT
GGATTCTAATTCTATCTTTAAGGGGAATTAGAGTGTGTTTCGTCAGTAAG
TTTGAAGGGATTTGAATTTAATTGACAATGGGAAATTATCAAACAGTAAA
AGGTCAAATTGGAGAGCATCAGCTGTATATTATCACATTTGAATGGAAAA
GAATAGTAAAAAGTCTTGCTCATCTTTACAAATTTGCAGTTGGCACGCCT
CAAAAAAAAAAAAATAAATACTTTGATTACAAAACGATCATAGGCTTATC
GCCAACTTACAGGACTTGTATGCCCTTCTCACACAGAAGACCTGCGTTGA
CTTTAAAAACTAATCTTAAGTTAGCTATTTTGTTGAAGGTGTACCCCTTC
TTAAATTTGAAAATTTGTATCGGCGTCTCATATAATCTATATATCTGTAT
ATATTAATACGCTTAAACGTGTGTGTTTACAACATTTTGTAAAAAGTTTT
CGAAAATCTAACAAAGGTCTACAAAGCCTCCTCTTCATGGCGTTGAACCA
TCATCTTTTTGCACCTTAAGCAGATTTCCTACCACTAGACTAACTTTGAG
ACCCCAAAATACTATTTTCTATTCACCAAATTTTTGGAGCTTGATGGGTT
AAAATCAACCATCTTCCCAATTTTTTTTGTCATTTTAAAAAATTCTTATT
CTTAAAAATTTCTGTTTACAATAGCAGCTCCCTATCACTTTCAAAACTTT
TCAAAACTTTTCAAAGTCCTTCAAAGTCTTTCAAAATCTTTCAAAGTCTT
TCAAAGTCACCCTCGAATGTCCAACCACGATGGCTACTGTAGCCACGATA
GCTAAAAGGATCTAAAATATACTTTTGTTAAGCCATTTATTTAATTGTGG
TTAAAAATTACAATGCAATGTTATCTTCTTTCTCTTTTATTTCCTAAAAT
CAAAATCAAATCATCAATCGGCAGCTATCTTTCTGCCGTTATAATTTTTT
AGATGTGTAGTGATTCACTGGAATGGGACACGCAGCGTGCGACGCTGCGC
ATACGGCTAGTATTCTTTTATAATAATATTCTTCAATTAGAACGTCAAAT
CTTTTATTGGATAGGTTTTTTTTTTCAAATAATAGTGTTAAATTTCCTGC
TCAACCAAAGCTTGTCTACCTTCCTCTCGAGTCTTGCCTGGAAAGATATA
AAAAGATGGAAGTAAAATGGGGACAGGTTTTTTTTAGGGTTAATCAAAAA
GAAATATCTAAGAGACCCCTTTGCATATAATTATGTCTGTTATTATAATT
ATGTCAGGCCATGTCTGTGATGTGCACGTCAAAATTTTATACTACACGGT
ACCACATAGTTTTTTTGTTTTAACATGAAATGTACACTTTAATCGTAGAA
ATTTTAGCGAGACTAATTTTAGCGTTTTAGCAAGTTTTCCCTATTTTCGC
TAAAATAAATCTCGCTAAAACGCACCGAATTGACAGATTGCTAAAATTTA
TCCGCGCGAAATTTTTCGAAAAGCTGATTGCTAAAATAAATCCAGTATGT
TTTTTCATCATTTTGTTATCATTTTCATATTTTTTTCAAAAACTAGTAAT
ATGGGCGTAAATTTCCAAGTTTTTCTGTTCTTAGTCAAGAATTGTGTTAC
AAAGACATGTGACTATATTGATTTTTGTATTAAAACACATTATTTTTTCC
TCAAAATCATTGCCCTCGCTAAAATTAATCCACGCGAAATTTTTGTCAGA
CAAGTATTCGCTAAAATTTATCCACGCGAAATTTTTTGAAATCGTGATTC
GCTAAAATAAATCCAAAAAAAATCAAGATTTTCCTGACTCGCTAATATGC
GCTAAAATTAATCTCGCTAAAATTTCTACGATTAAAGTATATGATTAAAT
CAATATATTGCTGGATTTAGTTTTGAGCGACAGAAGAATGATTATTCTAT
GCTGAGAGTATTTAGAACATGTCATGTTTTAATGTTGTAGTAATTGTTTT
TTTCAACTTTGCAATTAGCAAAGAAAGTTTCCAATAAGTTATAACAAAAA
AAGGTGCCCATTCCATTGATTAAAACCAAAGAGGGCTACAGTATTCACAT
TATCAATATTTGAGTGAGTTAATGCACCAACTTAGAGTGCTCCTAATGAG
TATTTTATTATATTGGACTGGCTATTTTCTAAGAACATTATATTATACAA
TGTTTTTAAGATATAGTAATTACTTAACAAACTGCTATTAAATCTGTTAA
TGAGTTACTGACGTATGTACCTCAAAGCTGTTTACAATGCACTAATGTGA
AAGATGAAAATTGATGATTAAAAAACAAAAAACTGATTTCTTACATCATA
GTAGATCACATGTATACTACACTCATCCTAATTGCGTTTCTTTAATGTTG
AGTATCTATTTGGAAAGTAAAGTTTGTTTATAATATTTAAAGTTTTACTA
GTTATTATGTCAAATGTAATTAATCATGTTGGTTGAAGTTTACATAAAAT
TTTCATTTTTCAGATAGTAAAATATAAAAAAGATGCAACCACCACCAGCC
TATAGTGAAAAATCACAAGATCCATATGCGCCACCACCAGGCCAACCGTA
TCCTCCACAACAACCAGGATACCCACCCACCAGCCAACCTGGTTATCCAC
CAACTAGTCAACCTGGTTATGCACCACCACCAGGAGCCTACCCACCCCCT
GGTGCCTACCCACCACCACAACAAGCAGGATATCAACAACAATATGCTCC
ACCACCTGGTCCACCACCAATGGCTACCAACCAGGCCGTCCACCAGCAAA
CCACAGTAATCACCACACAGCCAACAACACAAGTCCTAGCTGTTAGTTTT
GGTGAAATGCCTACTTCATGCACATGTCCTCATTGTCAAGCACAAATTGT
GACCGCTGTTCATTATGAAGCTGGTTCCCTTGCATGGATCATTTGTTGTG
TCCTTTTGTTTGTGTAAGTAAACAACTTCTTTTACCTTCACTGCTCAGTG
TGAATTATTGAGTGATGTTTGTCCTACAAATTACTGATGCACAATTGCAT
CGTATTGAATATTAGTTAGGAAGGTGGATGTTTAATACTTTTTTTCTTAA
GGTTATCAACCACACTTTGAATTTAGCAGTTTTACGGTTACAATGTTCAC
GGGGTCAATCATATACTTTTGGGGTTTAATGCGACATATACTTTTTAACA
CTATCACTTTAGGTATCCTTTGTTTCAGTAGAAGCTTTTCATACGATATC
AAACATTATATAATGATGTAAATTACTATGTTAAATTACATTCTTCTTGT
TATTTTCAGCTTCTGGCCTTTGATGTGTCTGCCGTTCTGTTTGACTTCAT
TGCAAGATGCTGTTCACACATGTCCTAATTGTAAGAGACAAGTTGGTGCT
TTCAGACGTTAAGGGGGATTGTGGGGTCTGGGCCCTATTTCTTTGTGGTA
GTGTGAGAAGAAGGAGAGAGAAAAATTCTTTTATATTTTAAATATGTTTA
TTGATAATATTATGTGTTTTGTCGGTTTTATGTTTTAGGGTGATAGTTAT
GTATCCCTTTTATTATATATCAGTTTTTAAGTTGAAACTTTGTTTTTGAT
AACTACTCCCATTTGACTTATAAGTCTGGAGGATAACTCGTTTTATTTTA
AGGTTGAGTCACTAGAAATTTATAATTCTCTTTATAAAGAATTCAGTTCT
CAAATCGTTCTATTATATTCAGGTAAAAGGATAAGGTACTAAATAACATA
ATTATAAGTACACTTTTCCATTCCTTAGGCTATTATAGTCGTATCCTTAG
TGATCAAAATTTCATTTAGAAAGGCTAAGACTTTCAATTTTCTTTGTATA
TTGTATGTTTTATTCCAACTGCAGTCAAACACCATTGACTTAATTGACTG
ACACTCTACATTTCACAATCACTTTTTAGTTTGTGGAAGTTTTGTTTCAA
CAGTGGATCACCTTTCAACCTCAAAAATCACTCTTTCTCGAAAGGGAAAT
TCCTGTACTTGCTCTCAAATCAAAAGTCTAATCACCCAATCAGTAGAATT
AACTCCCTTCATATTTTATAGTTCAATAAAGCTTTTATTAATTTGTGTAT
TATTACTGAAATGATTTCCACTTGTTTTTTTTTTCAATTTTGGAGTTTTC
TATAATTTTTGTTTGCATTTTTATTTGTAAAATGATAAGAATGAAATATA
TCTGCACGTACGTCTACACTCTTTTAAAATGAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000135_pilon:234108..243740- >MSTRG.15367.1.p1 ID=MSTRG.15367.1.p1|Name=MSTRG.15367.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1068bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:234108..243740- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTCTGGCCTTTGATGTGTCTGCCGTTCTGTTTGACTTCATTGCAAGATG
CTGTTCACACATGTCCTAATTGTAAGAGACAAGTTGGTGCTTTCAGACGT
TAAATGCAACCACCACCAGCCTATAGTGAAAAATCACAAGATCCATATGC
GCCACCACCAGGCCAACCGTATCCTCCACAACAACCAGGATACCCACCCA
CCAGCCAACCTGGTTATCCACCAACTAGTCAACCTGGTTATGCACCACCA
CCAGGAGCCTACCCACCCCCTGGTGCCTACCCACCACCACAACAAGCAGG
ATATCAACAACAATATGCTCCACCACCTGGTCCACCACCAATGGCTACCA
ACCAGGCCGTCCACCAGCAAACCACAGTAATCACCACACAGCCAACAACA
CAAGTCCTAGCTGTTAGTTTTGGTGAAATGCCTACTTCATGCACATGTCC
TCATTGTCAAGCACAAATTGTGACCGCTGTTCATTATGAAGCTGGTTCCC
TTGCATGGATCATTTGTTGTGTCCTTTTGTTTGTCTTCTGGCCTTTGATG
TGTCTGCCGTTCTGTTTGACTTCATTGCAAGATGCTGTTCACACATGTCC
TAATTGTAAGAGACAAGTTGGTGCTTTCAGACGTTAAATGCAACCACCAC
CAGCCTATAGTGAAAAATCACAAGATCCATATGCGCCACCACCAGGCCAA
CCGTATCCTCCACAACAACCAGGATACCCACCCACCAGCCAACCTGGTTA
TCCACCAACTAGTCAACCTGGTTATGCACCACCACCAGGAGCCTACCCAC
CCCCTGGTGCCTACCCACCACCACAACAAGCAGGATATCAACAACAATAT
GCTCCACCACCTGGTCCACCACCAATGGCTACCAACCAGGCCGTCCACCA
GCAAACCACAGTAATCACCACACAGCCAACAACACAAGTCCTAGCTGTTA
GTTTTGGTGAAATGCCTACTTCATGCACATGTCCTCATTGTCAAGCACAA
ATTGTGACCGCTGTTCATTATGAAGCTGGTTCCCTTGCATGGATCATTTG
TTGTGTCCTTTTGTTTGT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000135_pilon | genome | sc0000135_pilon:234108..243740 - |
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