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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000135_pilon:116703..120455+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15358.1.p1 ID=MSTRG.15358.1.p1|Name=MSTRG.15358.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3753bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:116703..120455+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TAAGAGCATAGATatgagagagaaaaaaaggatTTGCTATCTTTGCAAAT
ATATACATCATTGTAAAAACTATATAATATTGATTGATTAGCTCAGTTAT
TTAGTGTGTTAGAATTGATCATTTTAATCTGACTTCAGTagtctaaattt
tcaaaacagttGTTATACAGAGGAAAGTTTCGGTAAATCAAATATTTGAA
GCAATCATGGGAGGAGTATGTGTCAAGTACTCATtgcttattttcaattt
tatattcTGGGTAAGTTTAGTGATCAGGTCAACAtttaggggccgtccac
atagtacgtacgcactaaaatgtcgaaaatcaaGTATTTCCTCCCCCAta
tacgcaagcgtacgcaaatggctataccccctggtaagtacataattttt
cattcaccccctcCCTCTACcatgaaaagcacaggtcgaaatcatatatc
gacgctgtgccgaccaatccagattctattcagcgcgcaatcaacgcaga
gaaaagtaaccatgacgactatccaagatcttggatgaagttcaaagttg
atatttttattcccgtcgttaaAAACACAACTGAAAAATATCAtcgatgc
tttttaaaaagagtcagtgatagagaatcataacataaagtctgtctatt
atttcgattcaattaaagtgacatttccacaATTAAGagtttattttata
gtaattactgttatacatttggggatcatgtaaaagataatttttctctg
cgtacgtacattttcctttgacccctcccctccccctgtacgcaagtaTA
CCTTTTTtagaaaccccccccccttagtgcgtacatACTATGTGGACGAC
CccttacgacatttactttctccattttttgggcaaattttgcaTCTCAT
CTTACAGGGTCTAAATTTCGTTTGTTCAACTGTCAAGATCCAATCTTTGC
TCCCTGTATATAAGTGGATCTAACAgaggattttcaaaattgtagtGAAC
AAGGTTCTTTCAGGGgacttctcttttttttttacctcaGGGTCAGTTTT
CGGTAAAGAAGGGGTGATCCGCCtggtctgtgatacagggaAGTCATTCC
AAAACTATTTCGAACCTAATAAATATTCATGTCATTGACTTTCCAAAGAC
TCAAGACCGAAATATGGTTACGGTACTCTTAAAAACAGCAACTCCGGCCA
TTTTTTAGCATGAAATCAACAGAACTTCAGCGAATTTGCTAAAATTAGTT
CTGGTTTGATGCAATCTAAATATTCAAGTTGTCACTTTTAACACATATAC
TTCTCGACGACTAGTGGACGCCTGTCCTAGGACAAGGACTTTGAAAGTAG
TCATTGTTCGAAAGATATTCAAGCTCTTCCGTTCATTACTTTCAGATTAT
TGGGATCGCACTCATCAGCCTTGGAGCGtatctaaaatcgaaatatggaG
ATTACTTATCTTATAACGAGAGTGACAAATTTATATCAATGTCAATGTTT
CTTATCATTCTTGgtctgtttatttttttaattgctttCCTCGGATGTTT
TGGTGTTTTCAGAGAGAACCAATTTCTGATTACATGTTTTGCTGTTTGCA
TGGCTGTCATTATGATCCTTGAGATTACTGCTGGAATTCTTGGTTATGTT
TATAGAGGAAAGGTATGTGTTCCTCATCTGGTTTTAGACCATCCAAAAGc
gtttgatgatttttttcaatctctGCCTAAAACTTTTGCCTAATCAAGTC
gaatgtgaaaatgaaaatcggtCTTGCAATAATTCGTCAATAAAACGTGG
CCGTATTGAACTATTTTCTAATGCCCCTAAACTTCTAACTCTTAAAAGGA
GACCACTAAAAACAGAGATTTGGGTGTGAGTTTGCTTCTCAAAAATTCAA
CTTTCCATAATATACAGGTTGAAACAATAGTTGACAACACTTTAAATCAA
GCTGTCAGTAAGTATTTTGACCAAAACCAACCAGGAGCTAAAACACTCTT
AGATTGGGCTCAACAACAGTTTGACTGCTGTGGTATCGAAGGTTTTAATG
ATTATCAACAACCATCGAAGAATTCAACTGATTTTTGTTACCAATCGGGT
GGAGTAGCTTCATGTTATTCTGATAACAAGTGTGATTCCGGAGAGCAATA
CAAAGAAGGCTGTAAACAGAATGTAATTGACCTTGCTGAAAATAATATGT
TGCTATGTGGAGCTGTTGCATTAGCATTCGCTGGAATCCAAGTTAGTATG
ATTTGATAATTACAATAATTTGTTAGTGAAGTTATTTTTTCCCCCAGAAA
AGAAAACATCCCGAGTATCTACTTCTAACTTACAAGATAATAATTTTTAT
CTAGATTTAGGTCTTAGCTGTATCAGTTCATGAACACGGTCAACTACCAT
CTTACGatcttaatttatttttattcgaTTTTCATTTTAGATACTTGGAC
TGATTCTTGCTTGCTGTCTAATAAGagtaataaaatataattacatgTAT
GTTTAAAGACGATATATATTGAAACAAGAGAATTCCTTGgattaatctca
tggttgattgaaattcgattgacgtttttgcttacgttaatttgaaattt
cctgcgaacttgtaatttccctcctagcttttgtaaattccctcctagat
tttgtaatttcccgcaaaagtgaaatttccatcgtttggaaattcatcac
ctttttcgaaTTCTTACTAACTTTGAAGGCTTAcgtaaatggaatactat
ccaattaaaactcgattcgcatttctatgactttttgagacctcttttta
aagtttcagattaatttccagtgttaaattgacgtcttccagaattgtta
gaatttcaatccaaattCACGTCAAATCCAAGCAAAACTTACCTTCAAAA
CTAATTAAGCCACCGAAAATACCATTGCTGGTTAACTTTCATTTCCTGGA
ATAAGATTTCACTGTTTTTTCCAGAATATTTCCATTGTGTGGGCttgttt
ttaaatcttcatGTCGAACTTTGGGCgaattaatatattttttgaacttg
tcgaacaaatgtTGCAatctaatagaccttatcggagttttttatttttc
taaaaaagcggtgtatcgtgggattgtttcgagtgcgtattacaatagaa
atctcttaggaattcctcgagggaattctattgtaatacactcgaaacaa
tcccacaatgcatcacttttttagaaaaataaaaaactccgataaggtct
actTTGTTGAACTCGAAACGACGATCAATTGAGCCAATAAAATCCTCAAT
TTCCATGATTTCAAAGAATTCGATTaacaaatttgatcaaaattttgtca
tttgATTTTCAACGATGTTCGTTTAAATTAGGCCTGTCCAAAGGTCGATT
TGAATTCGACTGAGTGATTGCGACTAACATCCTCCAAGCGCATTTATCGA
TTAATTGGAGTCTGCTCGTTAGAAAATAGCCTGTGTTAGGTCTTGACAGA
ATCCAAATTAACGGTACAACAATTAGGgtcattttttttacaatttcgaA
GCTATATTTAATTGTTCACGATATCTGCActtatgaattatttttcaatt
atctTACTAGAAAATAGATGCAGTTGGCTTATTATGACTATTATTGATGG
GCTCATTTATAGTATGCACTATGAtataaattatgaatttattttttgat
accGTACTGACAATTTATTACAAATGAGATTCTGCTGataaatttttgat
taa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000135_pilon:116703..120455+ >MSTRG.15358.1.p1 ID=MSTRG.15358.1.p1|Name=MSTRG.15358.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2844bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:116703..120455+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGAGGAGTATGTGTCAAGTACTCATtgcttattttcaattttatatt
cTGGATTATTGGGATCGCACTCATCAGCCTTGGAGCGtatctaaaatcga
aatatggaGATTACTTATCTTATAACGAGAGTGACAAATTTATATCAATG
TCAATGTTTCTTATCATTCTTGgtctgtttatttttttaattgctttCCT
CGGATGTTTTGGTGTTTTCAGAGAGAACCAATTTCTGATTACATGTTTTG
CTGTTTGCATGGCTGTCATTATGATCCTTGAGATTACTGCTGGAATTCTT
GGTTATGTTTATAGAGGAAAGGTTGAAACAATAGTTGACAACACTTTAAA
TCAAGCTGTCAGTAAGTATTTTGACCAAAACCAACCAGGAGCTAAAACAC
TCTTAGATTGGGCTCAACAACAGTTTGACTGCTGTGGTATCGAAGGTTTT
AATGATTATCAACAACCATCGAAGAATTCAACTGATTTTTGTTACCAATC
GGGTGGAGTAGCTTCATGTTATTCTGATAACAAGTGTGATTCCGGAGAGC
AATACAAAGAAGGCTGTAAACAGAATGTAATTGACCTTGCTGAAAATAAT
ATGTTGCTATGTGGAGCTGTTGCATTAGCATTCGCTGGAATCCAAATACT
TGGACTGATTCTTGCTTGCTGTCTAATAAGagtaataaaatataattaca
tgTATGTTTAAATGGGAGGAGTATGTGTCAAGTACTCATtgcttattttc
aattttatattcTGGATTATTGGGATCGCACTCATCAGCCTTGGAGCGta
tctaaaatcgaaatatggaGATTACTTATCTTATAACGAGAGTGACAAAT
TTATATCAATGTCAATGTTTCTTATCATTCTTGgtctgtttattttttta
attgctttCCTCGGATGTTTTGGTGTTTTCAGAGAGAACCAATTTCTGAT
TACATGTTTTGCTGTTTGCATGGCTGTCATTATGATCCTTGAGATTACTG
CTGGAATTCTTGGTTATGTTTATAGAGGAAAGGTTGAAACAATAGTTGAC
AACACTTTAAATCAAGCTGTCAGTAAGTATTTTGACCAAAACCAACCAGG
AGCTAAAACACTCTTAGATTGGGCTCAACAACAGTTTGACTGCTGTGGTA
TCGAAGGTTTTAATGATTATCAACAACCATCGAAGAATTCAACTGATTTT
TGTTACCAATCGGGTGGAGTAGCTTCATGTTATTCTGATAACAAGTGTGA
TTCCGGAGAGCAATACAAAGAAGGCTGTAAACAGAATGTAATTGACCTTG
CTGAAAATAATATGTTGCTATGTGGAGCTGTTGCATTAGCATTCGCTGGA
ATCCAAATACTTGGACTGATTCTTGCTTGCTGTCTAATAAGagtaataaa
atataattacatgTATGTTTAAATGGGAGGAGTATGTGTCAAGTACTCAT
tgcttattttcaattttatattcTGGATTATTGGGATCGCACTCATCAGC
CTTGGAGCGtatctaaaatcgaaatatggaGATTACTTATCTTATAACGA
GAGTGACAAATTTATATCAATGTCAATGTTTCTTATCATTCTTGgtctgt
ttatttttttaattgctttCCTCGGATGTTTTGGTGTTTTCAGAGAGAAC
CAATTTCTGATTACATGTTTTGCTGTTTGCATGGCTGTCATTATGATCCT
TGAGATTACTGCTGGAATTCTTGGTTATGTTTATAGAGGAAAGGTTGAAA
CAATAGTTGACAACACTTTAAATCAAGCTGTCAGTAAGTATTTTGACCAA
AACCAACCAGGAGCTAAAACACTCTTAGATTGGGCTCAACAACAGTTTGA
CTGCTGTGGTATCGAAGGTTTTAATGATTATCAACAACCATCGAAGAATT
CAACTGATTTTTGTTACCAATCGGGTGGAGTAGCTTCATGTTATTCTGAT
AACAAGTGTGATTCCGGAGAGCAATACAAAGAAGGCTGTAAACAGAATGT
AATTGACCTTGCTGAAAATAATATGTTGCTATGTGGAGCTGTTGCATTAG
CATTCGCTGGAATCCAAATACTTGGACTGATTCTTGCTTGCTGTCTAATA
AGagtaataaaatataattacatgTATGTTTAAATGGGAGGAGTATGTGT
CAAGTACTCATtgcttattttcaattttatattcTGGATTATTGGGATCG
CACTCATCAGCCTTGGAGCGtatctaaaatcgaaatatggaGATTACTTA
TCTTATAACGAGAGTGACAAATTTATATCAATGTCAATGTTTCTTATCAT
TCTTGgtctgtttatttttttaattgctttCCTCGGATGTTTTGGTGTTT
TCAGAGAGAACCAATTTCTGATTACATGTTTTGCTGTTTGCATGGCTGTC
ATTATGATCCTTGAGATTACTGCTGGAATTCTTGGTTATGTTTATAGAGG
AAAGGTTGAAACAATAGTTGACAACACTTTAAATCAAGCTGTCAGTAAGT
ATTTTGACCAAAACCAACCAGGAGCTAAAACACTCTTAGATTGGGCTCAA
CAACAGTTTGACTGCTGTGGTATCGAAGGTTTTAATGATTATCAACAACC
ATCGAAGAATTCAACTGATTTTTGTTACCAATCGGGTGGAGTAGCTTCAT
GTTATTCTGATAACAAGTGTGATTCCGGAGAGCAATACAAAGAAGGCTGT
AAACAGAATGTAATTGACCTTGCTGAAAATAATATGTTGCTATGTGGAGC
TGTTGCATTAGCATTCGCTGGAATCCAAATACTTGGACTGATTCTTGCTT
GCTGTCTAATAAGagtaataaaatataattacatgTATGTTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000135_pilon | genome | sc0000135_pilon:116703..120455 + |
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