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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000135_pilon:91245..95083- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15356.1.p1 ID=MSTRG.15356.1.p1|Name=MSTRG.15356.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3839bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:91245..95083- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATTTTTGAATTTTCATTTTAGTATTTCTGTCAAAAAATTATCATTTAAAA
AGTAAAAGAAAAAACATTATCAAAAGATGAGAGGAGTGATGAGAATCTTG
CTCAATTTCCTGAGCTGTCGTTGGAAGTTGTCTTCAAAATCAATTATCAT
TGGTATGATTATTTTCTTTGGTGGAAATTATATTATTCTACGATCAATGT
TTGCCCGGAATTATACTAATGAAACAAAGGTTGGTCACAGTACTGAAGAT
GATGGTGTTATTGTTAAGCAGAATGTCTATCATAATAATAGAAAAGACAA
TACAAATGAATTTATTGAATCTTTAGTTGATAAAAGTCAAAATGTTGGGA
ATGGGAAAAGTCCACATAAATTTAACCGTGAAACTGAGGCACCTGTTGGA
AATGAAAATCATATTGATGTTAAGAATGTTGATCATGAAAATAAAAAAGA
TGGTAAATTTAAAATTGCTTTATTGATAATTTCTTGTAATCGAGTCGAAG
TACGGCGTTGTTTGGATAAGATTTTTGAACACAAACCTAAAGATTATCCG
ATTGAAATAATTGTCAGTCAAGATTGTGGTCACAAGGCAACAGCAGATGT
TATACGGTCGTATGGTGATCGAATCAAGTTTATTCAACAGCCTGATTTAG
GCCCAGTTCATGGAGTACCTAACAACATGCATCGTTTTATGGGTTATTAT
AAGATTTCTCGACATTTTCAGTTTGCACTTGGTAAAGTTTTTGAAATGAC
GGATAGTGATAGTGTAATTATTGTGGAAGATGATATAGAAATAGGTATGT
TTTTATTTACTTTTTACATATATTTTCGAAATCTTTCTAGTTGAGAATTA
TTAATGCTTCACAACCCTTTAACTGTCGATGTCGGCATATCCCGACATGA
GCACTTTCAATTTCTTTGCGGATGTCGGGATTTGCCGACATGGGCACTTT
CCATTTCTTTGCCGCAAAATTTAACACTTCTACAAAGATTTTGTATTAGA
TGGTTTGAAATGAAAAAAGATAATAGTTAAAAGCTTTTCTATGTTGAAAA
AAATAACTATTCAACAATGTTCAACTCAAAATTATAGTCCTTGGCTGATA
CTTCATATATTATTCAGAAAATGAAGTCAAAATCGCTACCTTTTGCCTAT
GTCGGCATATGCCGACATCTGGCAAATAGGTCGAACCTTCTTTTTTTCCC
GTGGCAAATAGGTCGAACCTTAAAAAATACGAACGGCAGTTTAAAGGGAT
AAAGAGACTAGTTTGAGTAAAGAAAACGATTTAACACAATTCACTGAATA
TTGCCATCCTGGATGGCATGAAACTTTGAGTATGAAATTAACTTAAATAG
TTTTCTTTACTTAAACTATAAAGCTCTGTTATCATTAACATTGAGCACTG
CTATTGGTTTTGGCTTACACAAAGCAGTGCTTCACAAGAGATGTATTTTC
ATGGGTTTTTGTTACAATTTGAGAGAATTTACTCTTTCCTGTTGGGTTGG
GTGGAGGATATATAATTTTTGAAGTGATCTACCAGTAAATATTTTGATTT
TTCATCGCCTGGACACGTGCCTTACCTTTGGACAAGCATCGACCTCTGAG
ACACTAAAATGAAATCCATGGAGCATTAATTCATCTAATCGATAAGGCAA
TTTCATAAATTTGTTCTATGCTATATCTTCCATCACCTAATGACGATCCA
TTTTGGTTTTTAAAATGTGGATTTTCAAGATGTGTAACTGTTTGTCCAAA
ATAAATTGTTCATATTTATATAAAATCTATCATTTTTTTTCTTCTTATAG
CTTCTGATTTCTTTGATTATTTCTTGGCAACTCGGAAACTTTTAGAAGTT
GATAACACTTTGTTTTGTGTGTCTGCTTGGAATGATAATGGGAAAGAAGA
CTCCGTTGATCCATCTGCTATTGATGTTTTGTACAGGTCTGACTTCTTTC
CTGGACTTGGCTGGATGATGACTCGTAAACTTTGGAATGAGATTGGGCCT
AACTGGCCTAAAGGTTTTTGGGATGATTGGATGAGAGATCCTAAACAACG
TAAAGATAGATCATGTATAAGACCAGAGATATCACGTACAAAAACCTTTG
GACGTATTGGAGTCAGTCAAGGGCAGTTTTATGATCAATATTTAAAATAT
ATCAGACTGAATAATCAAGCTTTTCCATTTCGTGATTACGATTTGAGTTA
TTTAATGAAATCAAAATATGATGAAGAATTTTTAGAGAAGGTTTATACAA
CACCTGAAGTGGACTCCCAACAAGCTACATCAAAAGGAGCATCAGATGTT
CGTATTACTTACAACAATCACTATGAATTCGAAAACTTTGCAAGACGATT
TGGATTAATGTCAGATTTCAAAGCTGGAGTACCTAGAACAGCATATCATG
GTGTAGTCACTTTCTTTCGTGGTGGGCATCGCATCTATATAGCTCCACCC
AAAAATTGGAAAGGCTACAAAGAGCATTAATTACTTCTATTTTAATCTAG
AATTTTTTCAGTTATTTTTTTCAGTTTTAATTTGTCTTCAATTTTATACT
AGTAAGTAACTACAATTTTCCACTTGATTATTTTTATACTTCTATACTCA
GCTCTATGATAAAGGGGGAGTGGGGTTTGAATAAAGGGGGGGGGGGTGGA
TGATGTAAAAATCTTTAAGTTTTAATGAACCTCTAGATACCCCCATAATT
ACCTTATAATTAGAGATTGAGTTTATTTGATTAAGGCTATTTAAAGCAAA
GTAAAGGACTCTTCTTTTTTTGACTACTGAAAATATTTTCAAAAATTAAT
AAGGGGGTCCTAATAAAAGTCAAAAAATTAAAATCTGAAGATTTCGGAAC
CTTATCATAAGTGATTACCAAAGTCAGCTTATTTCCAAATTAAGAAAATG
TTATCTTAGTACCCTGGATAACTAGAATGAGTTACCAAAGAAAGTAAATT
ATTTTAATACTATATTTTACTGCATTTTTTTTATCTTCGATTTTTTATCA
AGTTATACACAGAGCTATGAGTTAGGAGTTGATTTTTAAAGTTATCAATT
GAAATGAAAATATTTTTCTGACTCGTGAAATCAAAAGTTATGAGCCAAGT
TTTTATACGTCATTTTGTGTGTATAACCTTTATTTGGAATTGCTAAATAA
AAAATAAATTAGCCATTTTCTTTACAATAAAATTTTAAATTATTTGGGCA
ATAATTATTTCAGTAGATTTGCAAATCCGCCAAATACTAAAGTAAATCTA
TTCTCTTATATTAATTCGAAAATTAAAATGCCTATTAAATAAATTTCATT
TGATTCTAATGTTTAGTAGTAGTATATTGGGCCATTCCATTTTATATTCA
TACAGGATGCGGTGGACGGTAATTTCCACTGGGTAATACAATAAGAATTT
CCAGGGATCGAAAATAGTGTTTTATTCATTTTCCAGGAGGTAAAGACTTA
AATTCTTTTTATGATTTTAGATCGTCCACCCTCACTTTAAGGCATGAAAA
TTTTTTTTTCCAAGGTTTTTTTTCAAACTTTGCCATTTTCCAAGGGGTAT
CCACATTTCCAAAAAGTTTGTCTTGACTTAAAAAGGTTCGTCCACCCCCC
TGTATGGAAATTTTATGGAACAGCCCATTTGTTTCATCGGATTTCCAAAT
AGATAAAAATAAGATTAATATAGAACATTGTATTTTTATTGAATTTAACT
TTTATAATTATTGTTAGAACGCTAGAAGCTAGAACGACCAAGATTAGATA
AATTGACTATCAGTACTGCATTTTATTCTTGTTATGGCCTTTAAATCTTG
ACTGTTGTATTGCAGATGATGGCCACGTGTCTTTGACTG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000135_pilon:91245..95083- >MSTRG.15356.1.p1 ID=MSTRG.15356.1.p1|Name=MSTRG.15356.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2796bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000135_pilon:91245..95083- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTCTGATTTCTTTGATTATTTCTTGGCAACTCGGAAACTTTTAGAAGTT
GATAACACTTTGTTTTGTGTGTCTGCTTGGAATGATAATGGGAAAGAAGA
CTCCGTTGATCCATCTGCTATTGATGTTTTGTACAGGTCTGACTTCTTTC
CTGGACTTGGCTGGATGATGACTCGTAAACTTTGGAATGAGATTGGGCCT
AACTGGCCTAAAGGTTTTTGGGATGATTGGATGAGAGATCCTAAACAACG
TAAAGATAGATCATGTATAAGACCAGAGATATCACGTACAAAAACCTTTG
GACGTATTGGAGTCAGTCAAGGGCAGTTTTATGATCAATATTTAAAATAT
ATCAGACTGAATAATCAAGCTTTTCCATTTCGTGATTACGATTTGAGTTA
TTTAATGAAATCAAAATATGATGAAGAATTTTTAGAGAAGGTTTATACAA
CACCTGAAGTGGACTCCCAACAAGCTACATCAAAAGGAGCATCAGATGTT
CGTATTACTTACAACAATCACTATGAATTCGAAAACTTTGCAAGACGATT
TGGATTAATGTCAGATTTCAAAGCTGGAGTACCTAGAACAGCATATCATG
GTGTAGTCACTTTCTTTCGTGGTGGGCATCGCATCTATATAGCTCCACCC
AAAAATTGGAAAGGCTACAAAGAGCATTAAATGAGAGGAGTGATGAGAAT
CTTGCTCAATTTCCTGAGCTGTCGTTGGAAGTTGTCTTCAAAATCAATTA
TCATTGGTATGATTATTTTCTTTGGTGGAAATTATATTATTCTACGATCA
ATGTTTGCCCGGAATTATACTAATGAAACAAAGGTTGGTCACAGTACTGA
AGATGATGGTGTTATTGTTAAGCAGAATGTCTATCATAATAATAGAAAAG
ACAATACAAATGAATTTATTGAATCTTTAGTTGATAAAAGTCAAAATGTT
GGGAATGGGAAAAGTCCACATAAATTTAACCGTGAAACTGAGGCACCTGT
TGGAAATGAAAATCATATTGATGTTAAGAATGTTGATCATGAAAATAAAA
AAGATGGTAAATTTAAAATTGCTTTATTGATAATTTCTTGTAATCGAGTC
GAAGTACGGCGTTGTTTGGATAAGATTTTTGAACACAAACCTAAAGATTA
TCCGATTGAAATAATTGTCAGTCAAGATTGTGGTCACAAGGCAACAGCAG
ATGTTATACGGTCGTATGGTGATCGAATCAAGTTTATTCAACAGCCTGAT
TTAGGCCCAGTTCATGGAGTACCTAACAACATGCATCGTTTTATGGGTTA
TTATAAGATTTCTCGACATTTTCAGTTTGCACTTGGTAAAGTTTTTGAAA
TGACGGATAGTGATAGTGTAATTATTGTGGAAGATGATATAGAAATAGCT
TCTGATTTCTTTGATTATTTCTTGGCAACTCGGAAACTTTTAGAAGTTGA
TAACACTTTGTTTTGTGTGTCTGCTTGGAATGATAATGGGAAAGAAGACT
CCGTTGATCCATCTGCTATTGATGTTTTGTACAGGTCTGACTTCTTTCCT
GGACTTGGCTGGATGATGACTCGTAAACTTTGGAATGAGATTGGGCCTAA
CTGGCCTAAAGGTTTTTGGGATGATTGGATGAGAGATCCTAAACAACGTA
AAGATAGATCATGTATAAGACCAGAGATATCACGTACAAAAACCTTTGGA
CGTATTGGAGTCAGTCAAGGGCAGTTTTATGATCAATATTTAAAATATAT
CAGACTGAATAATCAAGCTTTTCCATTTCGTGATTACGATTTGAGTTATT
TAATGAAATCAAAATATGATGAAGAATTTTTAGAGAAGGTTTATACAACA
CCTGAAGTGGACTCCCAACAAGCTACATCAAAAGGAGCATCAGATGTTCG
TATTACTTACAACAATCACTATGAATTCGAAAACTTTGCAAGACGATTTG
GATTAATGTCAGATTTCAAAGCTGGAGTACCTAGAACAGCATATCATGGT
GTAGTCACTTTCTTTCGTGGTGGGCATCGCATCTATATAGCTCCACCCAA
AAATTGGAAAGGCTACAAAGAGCATTAAATGAGAGGAGTGATGAGAATCT
TGCTCAATTTCCTGAGCTGTCGTTGGAAGTTGTCTTCAAAATCAATTATC
ATTGGTATGATTATTTTCTTTGGTGGAAATTATATTATTCTACGATCAAT
GTTTGCCCGGAATTATACTAATGAAACAAAGGTTGGTCACAGTACTGAAG
ATGATGGTGTTATTGTTAAGCAGAATGTCTATCATAATAATAGAAAAGAC
AATACAAATGAATTTATTGAATCTTTAGTTGATAAAAGTCAAAATGTTGG
GAATGGGAAAAGTCCACATAAATTTAACCGTGAAACTGAGGCACCTGTTG
GAAATGAAAATCATATTGATGTTAAGAATGTTGATCATGAAAATAAAAAA
GATGGTAAATTTAAAATTGCTTTATTGATAATTTCTTGTAATCGAGTCGA
AGTACGGCGTTGTTTGGATAAGATTTTTGAACACAAACCTAAAGATTATC
CGATTGAAATAATTGTCAGTCAAGATTGTGGTCACAAGGCAACAGCAGAT
GTTATACGGTCGTATGGTGATCGAATCAAGTTTATTCAACAGCCTGATTT
AGGCCCAGTTCATGGAGTACCTAACAACATGCATCGTTTTATGGGTTATT
ATAAGATTTCTCGACATTTTCAGTTTGCACTTGGTAAAGTTTTTGAAATG
ACGGATAGTGATAGTGTAATTATTGTGGAAGATGATATAGAAATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000135_pilon | genome | sc0000135_pilon:91245..95083 - |
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