MSTRG.15321.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15321.1.p1
Unique NameMSTRG.15321.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000134_pilon:638244..656910+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15321.1.p1 ID=MSTRG.15321.1.p1|Name=MSTRG.15321.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18667bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134_pilon:638244..656910+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000134_pilon:638244..656910+

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CATTGGTTTGATGCTTGTGTTGATTTACCTTCAAGTGGAAAATTCCAGAT
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TGACTTCCACGTTCAAGCCAATCGACATAATATTAAACAAATTAAACTTA
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CACACGAAACCATTGCGTTGCCATGACATTCGGTGAAATCCGATTGGATG
AAGGAGTTTGCCCTGGAGAACAATAAATGGGACGTGTCACTGTATTTTCG
ATTTTGGTGCTGGTTGTCTGCGTTTATACTGGTTATGACGCCGCCAGTAT
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AGTCACTCACAAATGAATTAAAAGATGAAGTGAACCATGTGAAATATGAT
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TCTTGGTCAATCAAGAGGTTCACTTGGTGTCGATGACTTTAAAGTGACTT
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GGATCATTAAGTATTGCTGTCATTGAAAATGGCAAAGAAAATGAATTGTT
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GTGAAAGTTTGGGCATCAGATATTTTCCATGAGGCTGGAGGCGTCATCAT
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CTGTTTGTAATAAGCCTCTCAGTGATCAGGATTTCGATGTTTTCTTTGAC
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TGTCCCAGCTGTCTTTATTTATAGTAATGACTACAGAATGCATATCACAG
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CAAGACGAATGGGTTAAACTTGTCATCCAACAAAAAAGAGACGCTTTCGG
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ACCTATGAGACATGTAAAGATCGAGAATATCAACTATCTGTCCAACCAAC
CAGATTGTTCACGCGTTATGGCTGTCTTCACATCTCATACAAAATGGCTG
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ATGGTACGAAGAGAAATTCTCTATCCATAACTATTGGAGAAGATTTGGAC
GTCCAATTATTGGAATTCGTGGTGCGTACACACGAAACCATTGCGTTGCC
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AGTACAAGGATCATCCAACGACCAATGTATCGAATTCTCCTACCTCATGT
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TGTGGTGACAAAACTACAGAATTGTTTAGAGCCAGCACTACGCCTTCTTA
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GTGAGGTTTTGTTTCATGTTGCTAGAGGTCTTGGTCAATCAAGAGGTTCA
CTTGGTGTCGATGACTTTAAAGTGACTTTCGGCTCCAAATGTTCCGACTC
GTCTATTGCCGCCGATGCTAAGGACAATGTACCAGAGGATATGAAATGTG
ATTTTGAGCATTACCAGGATGAATGTCTATGGAAAATGCGAGGAAATCTT
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TGCTTATTTTGGTCACCATCTTTACCGAGTTAGCGGTGGTGGATATCGAT
ACATTGATGCCAGAAAGGACGATAAAATGGATAAGCGAGGCAAAAATGCG
TATTACATTAGTCCAGAATTGACTGGGAATGGAGACAAACGCATGAAGAT
GGCATATTCAATGTATGGTGTTGATATGGGATCATTAAGTATTGCTGTCA
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AAAGGAAAAATCAAAGACTTAAAGCATTGGTTTGATGCTTGTGTTGATTT
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GCCGTTGACATCGAGGCTGGCAAATGTAACCAACAACAACCGTTAGCTTC
TTGTTCCCATGGCAAGGGTGAATCATGCCCTTACGTCACAGAAGATAGTT
GTGGAGCTGAAGAAAcCGAAGAATTCAGGCTCGATGATGAATTTGAAGCC
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CATCTCACTGAAAGTGAAAGTTGAGAAGAAAACTTCTGATTGGCGAAACA
TCATCAAGTTCACTGAATCTGGCCGTGATTGTTGTTGGAGAGGTGATCGT
GTACCTACATTGTTGATTCTTCCAAATCAACTCAATGTTGAAGTCGCCAC
ACAGATTGGTTGGAATGGCAACTGGCATAATAAAGGCATTAATCTGCAGG
AGAATAAGTGGCACACTATCAAAATGGAACAGAAAAAAGAAGCGGACGGA
AAATACTATTTTTACATCCACTTCGATGGCCAACAAATGGCCAAACAACA
CCAAGATATACCTCGTGAAAAACACAATGTGAAAGTTTGGGCATCAGATA
TTTTCCATGAGGCTGGAGGCGTCATCATCAAGGACTTGTTGTTTCAAAAC
AAGAAGGGAAGCTTTGATGAATGTAAAGCTGTTTGTAATAAGCCTCTCAG
TGATCAGGATTTCGATGTTTTCTTTGACAGAACGCAAAAGCAAGAAActg
TGATTTATGAAAATGCTGCTGTTATGACACCAACAAAGAACAGTTTGGTT
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GTGCAAATTGTTGTGACAAAGGCATGCGTGTCCCAGCTGTCTTTATTTAT
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CCATGCGTATAATGATGGAAGATTGAAACAAGACGAATGGGTTAAACTTG
TCATCCAACAAAAAAGAGACGCTTTCGGACATTTGCTTTATTCAATCTTG
ATCGACGACAAAGAAGAGCATAGATATATAAATAGTGATCCACAAAgtta
tcaaaacatgaaaatgtaTCTGTCAGATAATTGGCATAATGCACCCGGTG
TTGAAATCAGGAATGTcgtcttcaaaagttttggtgGTTCAGCTGGCACT
TATCCCTGTCCAGAGATGTGTAAAGCTATCCCTCAAGAAGAAGATATCAA
CGGAACTACTGTCAAAACGCTCACTTACACCTATGAGACATGTAAAGATC
GAGAATATCAACTATCTGTCCAACCAACCAGATTGTTCACGCGTTATGGC
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GCATTGTGACTTCCACGTTCAAGCCAATCGACATAATATTAAACAAATTA
AACTTAGAGGTGATGGAGAGGTTGGCAAATGGTACGAAGAGAAATTCTCT
ATCCATAACTATTGGAGAAGATTTGGACGTCCAATTATTGGAATTCGTGG
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TGGATGAAGGAGTTTGCCCTGGAGAACAATAAATGGGACGTGTCACTGTA
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CCTTAAAGTCACTCACAAATGAATTAAAAGATGAAGTGAACCATGTGAAA
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AATTCACAACATTAAGTGCACCATTCGAAGTACAAGGATCATCCAACGAC
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TCGATGGCCAACAAATGGCCAAACAACACCAAGATATACCTCGTGAAAAA
CACAATGTGAAAGTTTGGGCATCAGATATTTTCCATGAGGCTGGAGGCGT
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TTTGACAGAACGCAAAAGCAAGAAActgTGATTTATGAAAATGCTGCTGT
TATGACACCAACAAAGAACAGTTTGGTTAAGGACAATTTTGAAGTCGGCC
AAGAATACGAACTCTCAATGGAAATCAAAGCTAAAGAAAAGAAAGGTGGC
TGGACCAATATTGTTCATGTTACTAATGGTGCAAATTGTTGTGACAAAGG
CATGCGTGTCCCAGCTGTCTTTATTTATAGTAATGACTACAGAATGCATA
TCACAGCACCAGTCAACCATAATGGTAACCATGCGTATAATGATGGAAGA
TTGAAACAAGACGAATGGGTTAAACTTGTCATCCAACAAAAAAGAGACGC
TTTCGGACATTTGCTTTATTCAATCTTGATCGACGACAAAGAAGAGCATA
GATATATAAATAGTGATCCACAAAgttatcaaaacatgaaaatgtaTCTG
TCAGATAATTGGCATAATGCACCCGGTGTTGAAATCAGGAATGTcgtctt
caaaagttttggtgGTTCAGCTGGCACTTATCCCTGTCCAGAGATGTGTA
AAGCTATCCCTCAAGAAGAAGATATCAACGGAACTACTGTCAAAACGCTC
ACTTACACCTATGAGACATGTAAAGATCGAGAATATCAACTATCTGTCCA
ACCAACCAGATTGTTCACGCGTTATGGCTGTCTTCACATCTCATACAAAA
TGGCTGCCAAATCTATCCAGGGAACATCGCATTGTGACTTCCACGTTCAA
GCCAATCGACATAATATTAAACAAATTAAACTTAGAGGTGATGGAGAGGT
TGGCAAATGGTACGAAGAGAAATTCTCTATCCATAACTATTGGAGAAGAT
TTGGACGTCCAATTATTGGAATTCGTGGTGCGTACACACGAAACCATTGC
GTTGCCATGACATTCGGTGAAATCCGATTGGATGAAGGAGTTTGCCCTGG
AGAACAATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15321MSTRG.15321Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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MSTRG.15321.1.p1.exon20MSTRG.15321.1.p1.exon20Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15321.1.p1MSTRG.15321.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000134_pilongenomesc0000134_pilon:638244..656910 +