MSTRG.15301.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15301.2.p1
Unique NameMSTRG.15301.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000134_pilon:350181..371771-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15301.2.p1 ID=MSTRG.15301.2.p1|Name=MSTRG.15301.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21591bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134_pilon:350181..371771- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000134_pilon:350181..371771-

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GATTGCTAAGTGGAGTCATACTTAGTGGAGCTCCAATTACCGGTGACTGG
GAGCATTTCCGATATGGTATCTATCGCCAAAACACACCGGAAGCGCCAGT
AAGAGAATCAGAAGAAGAAAATCACAGGTTGGGTGGATTTGCCGCCCACC
GCCCGTTTGATGAACAAGCACTAGTCATAGTGAATTCCTTTACAGAGCAT
ATACCCAAAGTGCAGAAATTATTTACAAGCACGCAAGTACAAGATGGTTG
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AGGACTTGCTTCTCTGAAGCCATCCAAGACGTTCGAAAGGTGGTTCAAAC
AGAAATTTTATGAATGGTGGAAGTTACATTGCCAACGAATATCTTCCCAT
AACCACAAGTTATGATTTTGACGCTCCATTGTCAGAAGCTGGTGATCCTA
CAGAAAAATATTGGCAAATTCAAAAAGTCATTTCCAAATATGAGAGACTT
CCATCTGGACCGCAACCAGAACCAACAAAGAAGTTAGCGTATAGAAAGTT
GAGAATTTATTCTGTAAATTCGGAATACTATACTGGTTGGTTTGATAACT
GGGGTGAAGGACATCATGTTGAACGACCTGAATACATAGCACATTATTTG
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AGGTTGAAAATGAATATGGTAGTTATGGTTGTGATGAAAAATACATGTTA
GCAATGGAACAAATGTTAAGAAAATATCTCGGTCAAAAAGTTTTCCTATA
CACCACAGACCCTATCATTGATCAAGCCTTACAGTGTGGTTCAATTTCAT
CTTTGTATAGAACAGTCGATTTCGGAGCAGGTCATGATGTGAATAAGTCG
TTTGCACTGCAAAGAAAATATCAGCCGAAAGGACCGTATATATGTCGCAT
GGAACATGCACGAAATGTTCGAAGATGTCTACCATTTTGAAAATGATCTT
GACATCGTTTCGTATATTAAATTGGCTCAACAGTACGATCTCATGATTTT
GTTGAGGCCTGGACCCTACATTGATTCTGAATGGGAATATGGCGGTTTTC
CTTATTGGATGAACAACAAAGTTGGGAAATTGATCCGAACTTCAGACCAA
GGATATCTCAATCTTGTTGACAAATGGTTTTCTGTTTTGCTACCGAAAGT
TAAACCACTATTATATGAAAATGGAGGACCTATCATTGGTGTTCAATTGC
ATTCTCTAACCGGATATCCACTGAACAACGAGAGATCTTTTACAATCGAT
TATGAGCACAACACATTCTTGAAAGATGGAAAACCATTTCGTTACATCTC
TGGTAGTATGCATTATTTCCGTACACCGCATCAACTTTGGGAAGATCGAT
TCTATAAAGCGAAGATGGCTGGATTAAATGTCATTCAAACATGGTTGATG
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ACAAGTTCAATTCCACAAAAGACCATCTTTATACCCAAAACAAACCTTAA
AGTTGGTAACAATACAATCGTACTGACGGAATTTGAACGTGCACCTTCAA
GTATGGATGAAGCCTATATTGAACTTGTTGAAAAGCCAGTTTTCGTGTGA
GGATTGCTAAGTGGAGTCATACTTAGTGGAGCTCCAATTACCGGTGACTG
GGAGCATTTCCGATATGGTATCTATCGCCAAAACACACCGGAAGCGCCAG
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CGCCCGTTTGATGAACAAGCACTAGTCATAGTGAATTCCTTTACAGAGCA
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GGGTTGGACCTCCAGCGTTGTATGGAATTACCTTCGTATTGGAGGAGGTT
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AAGGACTTGCTTCTCTGAAGCCATCCAAGACGTTCGAAAGGTGGTTCAAA
CAGAAATTTTATGAATGGTGGAAGTTACATTGCCAACGAATATCTTCCCA
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TGAGAATTTATTCTGTAAATTCGGAATACTATACTGGTTGGTTTGATAAC
TGGGGTGAAGGACATCATGTTGAACGACCTGAATACATAGCACATTATTT
GGATCAAATACTGAGCTTTGAAAATGCTTCCGTCAATTTGTATCTGTTTG
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TGGAACATGCACGAAATGTTCGAAGATGTCTACCATTTTGAAAATGATCT
TGACATCGTTTCGTATATTAAATTGGCTCAACAGTACGATCTCATGATTT
TGTTGAGGCCTGGACCCTACATTGATTCTGAATGGGAATATGGCGGTTTT
CCTTATTGGATGAACAACAAAGTTGGGAAATTGATCCGAACTTCAGACCA
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CTGGTAGTATGCATTATTTCCGTACACCGCATCAACTTTGGGAAGATCGA
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GCCTCAAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15301MSTRG.15301Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15301.2.p1MSTRG.15301.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15301.2.p1.exon9MSTRG.15301.2.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15301.2.p1.exon8MSTRG.15301.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15301.2.p1.exon7MSTRG.15301.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15301.2.p1.exon6MSTRG.15301.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15301.2.p1.exon5MSTRG.15301.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15301.2.p1.exon4MSTRG.15301.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15301.2.p1.exon3MSTRG.15301.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15301.2.p1.exon2MSTRG.15301.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15301.2.p1.exon1MSTRG.15301.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000134_pilongenomesc0000134_pilon:350181..371771 -