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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000007_pilon:1283765..1301831+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.1525.2.p3 ID=MSTRG.1525.2.p3|Name=MSTRG.1525.2.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18067bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:1283765..1301831+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCTCCTCAGAACTTACTAAAATCAATTAATTGTATTATTAGGAATGTgat
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GGGcaaaggcatggtttaacgggcaatccatttttacggaatcttcttct
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GCCGTTTCACGCATGTCTAAGTTTAGTTCATATCCCGTTTCTTACCCCAC
TAGGCAGAAAACAACGAGGGGTAAATACGGGACGCGTCCCGTGTTTTAAA
CCATTAAGAGGGTTGATAGATGACCATTAGAGGGAGTTGCTGGCCAAAAA
TCATGATTGTAGCTTTTGAAGTTCCTGAGATATGGGAAGGTTCGTCAATT
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ttgagccaaaatcctgcaaaggcgggacaaaaatcagttttttgaagttt
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GGGGTTGGATCATTGTTCTAAATTCCATTTTTTAATagaaacaacaataa
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ATCTCATATCTTTAAATGGGCATCGaaacaaatttcaagaaaaccTTTCA
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TACAGATTTAGCACAAATAATATAATGTTTTTTAATCGGAAAATCCCAAG
AATTACTAAGCTATCAAAACGCAATGTTGTGGGCTATAGCTCTCAAATAT
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GTTGTTGGACAATCTCAACACGGACCAAGTTTTCCTCATCCTTTAGAAGG
TCGATAAATTTCCAAAGGGTCGGGTGGCATGATAAAACTTGTAGAGAGAA
TCTTTGATGCCACCCTTCAAGATTGTTGTTGGTTCGTGGCAATTCTTCGT
TTGTTCTGTTGAACATGTTCCATACCATATGTTGATGGGGAACAGGGGGC
GACCACAACGATTTCGGCGAACACGACCAATGTAGGTGTCTTCAAAGTAG
TCTAGTGAATTATCCAgatcattttcaaaactttcgtGAATGGCATCCGT
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AACAATGGAGAGCAAACTCTTTGTCATTTGCATATCTTTGTTGGAAACCC
AACTCCCTTAGCGTGCGTGTGAAGATTGACTTGCTCAACAAATTCATCAT
CCTCATCTATTTGAAGAAAGCATTGCACCGACTTTCCTTTCGCCgtaaaa
tacattcaaatgttCAATCCACTTGCCAACTCCTTTTTAAACATATAAAT
GTATCCGTCTTTAATAATTTTAGGTTTTCCTTTTTCCGTTTCAGTAAACT
CCATGATTTCACTTTGGTCGTAAATTGCATTTAAGTAGAGTAGCATATAG
ATTTATAACGATTCTTTGTTtgcgtttttttctttttcaaaaaggtaaaa
acctgtttttctggattttgtTGTAATGTATGTAGACACTCAATTAagtt
tcaaatcaattttgtaagGGCCGCAAAAGATAATTGTTAACAAGACCTTT
TTTCGCAATTCTGTATATGGCACATATTGATTTAATTGTATACAATATAA
ATGTTACCAGTAGTTTGAATACCATGACGCAAACGAGAATTTCTGCCTCT
TTCGGGGCTTAagtatttataaaaaatgaatatcaaTTTCCATTCATGTA
CGAAATCGATATGTCAACATCTTTTTTATTACATTCTCTATTGATTCTTT
AGGAAATTTAGAAgatgttatttttataaaaatatctgagtgggaattca
ccagggggaatttgccggggggaatttgccggggggaatttgccaggggg
aattcaccaggggggaattttcCGGACAccgtttacaaggctcttgacag
aatattgtttgtcTTATTgccaatgatgacagtgccgttatcaattttgt
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attgaagaatattctggttttcatgttattagatgctgttttagagcttg
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tcccatgttttgtccaatcgttccaagttagagcagttgacggtataccg
accgtgagattgggtaacttgcatcagtggaggctaacatgcatgtagcc
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ACTATTCGTaaaaaaaTTGTCTGTTaccagttttttatttttctgacacc
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ATTTCCTTGATGCTGTTGGAGTCAGCTTGCCTAAGGTTGAAATAGTGGGC
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GGAAACGTCGATAGTTGGCAGATTTGGTGGAGAgggggggAGTGTGAAAT
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CTGATTTTCTAagcatgtttgtttacattaacccattttcgttctatttt
gtctagtattctttttgcagcaaaattttgtgtttgtgtcaggttgaaat
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ggggggggaataagaggggggagatttaaaaaaatcaagaatttggtggg
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AAACTCTAAATCCTTTTTATGAAAAGGAATTTTTCAGTGCATTAAGATTG
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ACATATAAAAGTCAATCtaggtttttttttatctgGCTACCTTCGTTAAC
CTATTCACAGTTCAAGAAACAATTTAACAATACCCCTTTGATCAGTTAAA
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GAATACCCCCCATTTGATAAGTTTTAGAATAATATTTCCTTATTAGTAAG
TTTAATTTATCCAGAATGTCAAGGCAAGCATCAATTAGAAAAAATAGTTC
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TTCATGATTCCAGCTAATTTAAAGAGAGACGGTGTCGTCTTGATAGATTG
GAGCATATTTCATGCAGGgcagaaatttttctttattctatCCTGCAAAT
CAACCTGGTACTATAATGTATTTTTATGGCTTATGTGGAAGAACTTATTC
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GTTTAGACTTTGCGTGGAAAGTTTGATTTGGAACACTTATTACCAAACAG
AGACCCACTAGCAAAAGAACTCACATCTGGAAAGTTCACAGTATCAGTAA
GATGTTTTTTCCCTTTTCATATGATGTTATAGAGTGGGTAATCCTGAGAA
GAAATACTATTACCATTAACACTTTATTACGGAAGTATGGCAACTTAAAG
TCCTCAatgaaaaagagtttttttaagaaaacagtCTCAGGTCGAAAAAG
TGACGTTACCGATCTGGTGACATTTTAACAAATCACGTCACGAGCAATGC
TTACCtctctttcaaaatatttcattggTAATTGATGTCTAGAGGGGCTC
ATAAGAAGTCTGTACTGTCCaaaaaaaTAACACCTCTCTGGGACAGGCTT
TTTGATCATGTGTGTGCCAATTTCTATTGTCAaagttgtattttcatttt
cttccacTGTCCTCCGTACCACTTTCTGTTTAGTTTACTGCTCATTGAAT
GACAAATAACTCTGTTTTTCTTGCAGTGTAAGCAAGGTCCAGAAGGTGAT
ACACTATGTATATTTTATGCAAGGAAGCACTTGCCAAAACAAGTGGAACA
CGCAACTGTTTTGCAATCTATTGTTTTTCAATTGGACAGTATAATGAAAA
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TGATAAAGTCTGACTAAGctgtttttagtttttaatattAGGCATGCAGC
ACTTTCTCTCCGAAATGCAATGTGCTGAATAGACACTTCAGtatctaatt
tttttcattaaggATATTACAGAAATTGTTTGGATAAATAGCACTAGAAA
TAGctgaactttttattttagacCCGATGCACAAAGACATGGGTTATCAT
TTGTCTATGATATGACGGCGTCTGGATAtgtgaattttgattttgacctt
GCTATGAAGGTTCTTCACCTCTTAAAGGTTTGTCTTATAATTATCATTTA
CTTATCACCCCAGGTAGAAGGTAAAGTCAGTTTAACGCGATTACTTCAAT
TTAGTTGACTCTCTAATAGGGACTGTGAAAGTCAGGGGTTAATCGATCGG
AATCGACCTGCAGCAAAAATGTTGATCTCAGGAAATAGCCTGACTTGTTT
GTGGGCATGTAACTTCTTTTGATAAGACTGGTTGATGGGATTGGCCTTTT
CTGAcatcatggatttatcatagaactctggatacacaacgagctggttt
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tgttcaccctcctccattcactaataatttctcgtaaatttttttattgc
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gtgccaccgcgtgcctccaaaagattttcatatcactatgaagccaagat
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AAGTTTAAACAAAGAAGAATGAAAGTTAGAAATTGTCTCAGTAACTTTCG
TGCCAAATTTCAATGTTATAGCATGAATAGaagtaaaaatatataaatgt
gTTTTTGACACAACTATGATTTTTGAAATCTGGAAAATTACGAATGGATA
TTTTCCAATTAGATGATGCCTCCAGAGAACCCACATTAGTTAGTTCGGCC
AcgtggaaaaaaaattctagattcctttttctcttattttctctTAATTC
TTAATATTTGTTTCAGCTTAGACAGCTTAAAAACTATTTAGCACTGGCTG
GATGAGGCACACTAAATCGTTTTTTCTTCTCTACCAAGGGTGGTTATCCA
GCCAGATTGAAACACGTTTACATTGTGTCAGCACCGTTCTGGTTCCGAGC
ATCCATGACTGTTCTTTCGAGCTTTTTGAAAGATAAAATCAAAGACAGGG
TAAGTTCTAGGTGAAACAcgagttttgaaaaaacatatttAACACATAGT
ACAGAGTTGCTCCGTCTCTACTTTTTcgtcttcaaattcaaaaaaattct
gcaaaattagAAGAATTTgagccttattttttgttttaaagttcataTCC
TTCTTTCCTTTGACCACTGTTAACAggttataatttgaaaacattttcca
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CAAGGTTGAAGTGGTGAAGAGCATTCCTGATTTATACCAACATTTACCAC
CGGAATATTTACCCAAGAGATTGGGTGGTACCGTTGATCACAGTCATCGA
GAATGGCTTCAACACTGCATGAAACATTATCACGAGAGGTAAGAAGATAT
TCTTGTACTAGACACACGACATACAATCGCAGCTAGTATTTGAATGAACT
CACtgtatttgattgttttttttagatACACAAAACATCACTTTAATTCA
CATTCATTTCAGCCTTTCATCTTTGGACATCCAATCCTCGGATACTTCAG
CACACGCTTCTATAGCTTCTACTCTACCATCAAATAACTCACTGGAGACT
TTAGAATCCAAGGACAGTCGATCCATctttgaaaatgctgaaaatcatGA
ACCTTCAGACGACTCCATTTCAATCAAATCGTCAGATCCAGAAATAAAAC
CATCAGTCCACTCTATACCAAGTATTGTCAGAGAACCGCCCACCCAAACA
ATAACCGAGGTTGCACCACCTCAACTTCCACCTCGACCGCCTCCACATCG
CTCGCCTCAGCCTTCGCCCAAAGTTGATCAAATACATAACCGCGCATTGC
CAGCAGAGCCTGTTCCAGCCATCGACAATATTTCAGATACAGAGAGTTTA
TCAGAACAAACTTCACAAGGACGTCAAGCTTTCAGCATAGAGGATTTCAT
GGTAAACATGAATCGTGCTGGTAAAAAAGGCGTACATAAAGAATATGAAG
AATTGAGAAGTTTGCCACCCTCTGGTAATTTTGAATCTACACTGTAAGGA
ATTTCATTCGTATGTAACATATTTCTCCCCCATTGAATGCACCTAAATCT
TGAGTTTTGGAATAACCGTCCCTTCTAATAAGCGCCGCGCCTCCAAAGAC
GACACAAATCCATTAATTCTCCCTCGTACGCTACAAACACCGATAGAGAT
AAATTTCACAGTGACATCGCCTCTCTAAGAATATAATATGAACCCATGAA
TTAACCAAATTTGTGAAATAAGTAATAACTTTAGAAACTTGGAGACTCCA
ATTTTAAATAAATGCTTCCCGTCAATAGGCGGTGCTCCCAAAATCACGTA
ATTCATTTCATACACCTTGGTAAAAGCTCTTCAGTCTCAGACGCATTTCC
GTCTCACTTGtgttagtaaaaaaaaaagataagtttTCGTCAAAAGAATT
AGTTGCGTAAAGATCCTTCAATTTCGTtagaaaaactttatttgctTTGG
CCGCTGCATGCAAACCTCTAGCATAAGAAGTACATTGTAATGAACAACAA
CAATCATTAATGTCCATTAGATACCCCGTCAATACGAAAAAGAATCGATA
CAACAACATTCTAACGTTTGAAGAAACAAGAGTTCGGCTGGAAAGAAGAA
ATGACGATCCGGTAAGGTTTTGACCTCATAAAAAATCTTATCCCCATGTT
AAAAGGATAATCACTAAAAACAAAGCTGGTAGAATTATTTCCTTCAACAA
GTCAACATTACGAATAATGatattccttcaaaaatacaaagagtgatact
ttttcaaaaatccatttAATGCTTTCACCTAAAGGttctaatttttttgc
tttacaGTTTTCCGATTACATCAACGCAAACTTCGTGAATGGGTATGATG
CTGACAAGAAGTTCATCTGCACACAAGGTCAGGACTTAGAATCACTTTCC
AGCTCAAATTAAATGCTAAACTGACTATAGgttgataaatttttataaat
taatgTAAAACGCAACGTTGTCCGCAGGGCTCATAAAATTTAACCCATGA
TAAGTATGATTTATATACTACATACAAGTTTTCGAAGAAGCTGGCAACTt
cgtagcgagcacctcactaaaaaccgggatttttcacctcgtttcttagt
gagttccactttgacgattttcgaaaaatagaagcctttcaagtgctttg
acgcaaattcgattattttgatactgcaggagcttcgaaagttaaaagtg
acgtcaaaaaatcgaatgtttagagcccgaaaacctgggctcaaaacatt
cgaaaaagtcgcaaagtggaatagacgttaattgcgtaaaaaacgcgggt
gacgtctagtataggctaacaACTTCGTAGAAGTTTGCGACTCCCATGTT
TACTGCCTTGAACTCCCTAGAcgtgtatgatttttttttcacctttgcgA
AAGGTGGTTTTACCAATCTACTGGATTTTACGATGTCGTTATTAATAaag
tttctttgaattttttccgcCTAGCTTCGTTTCTAATACGGGAAATGGCT
CTTAATTTCATCGGAAAATGTTTTCTTAGGTTGTTATTCATTTCTTTTGA
CATCTTGATGGAAGTTTTTTCGACGTCTTTGACGACCATAATCGatctgt
ttcatttttatttttgccgttataatgttttccagggttttatttttttg
ttcctttaACTACTGCTTGATATCCGCTATAACTCGTGGTACCTTTACAt
ttttttGGCCTgtaaagtaagtctgcgactgcagtcggaggcgacccgaa
ggctcctctttcgatagctatctacccgaaggtaggggagggcgccacta
tttctccctggattgctccacccacccttgatccttctcttaattgctga
gcatcaagcagagaggcatcaagtaccattttggaaatctttggtatgac
ccgctgggggttgaacccacaaccttacgaaccgtagccggatgctctac
cactgcactacggtcgctctTTTGGCCTGTACTACAtttttatgcttttt
ctttttgttaaaaatagGCCGGTAAGCCTTTACATCCATAATGAAGCAAT
CTTGATTCTCAAGCTATCATCGACCGTCACTTTTGCACTGTATCTCAGTA
CAATTATCTCTTCTGTTTGCTCGAACAATGTCAGTCCGGTTTTTTCCCGT
TCTTTGATACCATCTGGTTTCATTCGACGATTTTTGGATTAAAACGTTTA
CTTACTCTCCTTCAATTCTCCGTACTTTTTGTCGCTTCAGGACCAACACC
GTTCACTTTTAACGATTTCTGGCGTATGATATGGGAGCAGAAAGTAGGAG
TCATTGTAATGGTCACCAGGTATGTAACTAGTAAGTCTGTAGTAACCACA
AAGAATCCTCCCTCTTTCCAGACAAATGTTATAATGGGTAGaaaaaaaGC
CCTCGCAGAAATTTGTAAGTAACCTAGATTCCTCATTATTCTATTTTAAA
GATAGCCCTGGCtttttttGGTTAGATTGTTTTTATAGTTTATTGATTTT
CATTGTCTAGGTGTGTTGAGCGCAATCGTATCAAGTGTGGAACTTATTGG
CCACAGATGCCCAAAGAATCGACTGTCTTTGGAGAAATCTTCGTTGAGAA
TATCGATCAGAATGTGGGCGAGGATTTCACCATCAACCAATTCGTACTTA
AACATAATAACGTAAGTGCGTTCACTCCTTCTTATCTGGTACAAAAATGT
ATAGATCCCTTTGATCATCTCACTCTCCTATTACTAAGAAAACTTTTCCC
AAGAAAACAGTAACATAGGGCAAAGATAGGTTAACACCGCTTTaagttta
aaaattcaaaatttagttcATTTTACGCCACTTTGAGATAAACGATTTCA
CTCTTAAACTTTTGCACACTATAGGGTGAAGCATTAAGAAAGTTGTACCA
CATTCAGTTTACCACGTGGCCTGATTTTGGAGTTCTTTCGTCAGCTGCAC
CCATTCTTGAAGCTATTGAATTCATTGAGGAGCGCCAGCCAGAGTTGACG
GAACAATTACAAGAAGAAGCCAAAATGAATAGAGCAGGTGGCGGCTTGGA
AGGATCTGGAGAATACGATACACCAGAAAAACCTGCAGTTATTGTTCCAC
CAGTTGTTATTCATTGTTCAGCCGGTGTTGGAAGGACGGGCACCTTCTGT
TGTCTCAGTAATAGCGTGGAGCGGCTACGCAAGACAGGACTCATAGATAT
TTATTCCACTGTCAAAAGCATTCGTGAACAACGAGCTTTTAGCGTGCAAA
CTCCCGAACAATACCAGTTTTGTTATACGGGTATTTTAGAATATGTTTTA
AAGAGACGTTATTTGAAAGGTGAAGATACGGGTAGTGTTGAAGCAGGCTT
GACGGATTTCCTACACCGTGATTCAAGCGATGAAAGTGAGTAGAGAcaat
tttctgttttatttcTTAGTAGTTCTTCTGAATTATTGACATGATTCATG
TTTGCCATTGGTTAATTGACAGGTAAAGATGATATAGACTTTCTCTGATA
TCGTCACAACAACAAACACAAAAAGGCTGactttttatttacaaagttcc
ctttcaaattgtttttcttttagtcgAGGCCAAACTTAGTTGTTGTTTCA
TGGGCTATACTACACGCTACTCGGAAATTAGggtcttttaaaagaaaaat
gagacTGATGGTTtgaatttaaagggacataacagtacttacgaaatttg
taaacaaactttatgcaacgggatacaaaatcaagaaaaatgtcgcatgt
caaaataaaaaatcaaaccaaatatggctaattttgattgttcaattgtt
ttacaagtttgttttggacacgtggtttttattgttctctttaatgacac
gtggttcgcgcaatgtttacattttactactttaatgtccctttaactcG
AACGATATTTGCTTATTAAAGAACAGGAAACTTCGGTTTGAGCCCtcaaa
ataaaaactattttttaaattcactGATCTCAAAGTCCAAATCGATTAAC
GGGAAGAAGCATCTATTAATATAGTTAGCAATTTTGTGCTCACTGGAGAT
AATCCGAATGGTGAATCACATATTATCAAACCGCACCCTTTTGGCAAAAT
CTGGGAACTGAAGATTACTAATCGCCGTATTTTTATGGACCAGCAAAATA
TTTTCTGGATCTTAGGGTCGATTGTACCCTCGAAATAACGAATCGAATTG
TTCTCGTATTATTGAGCTTTAGCTGCATTTTCTAGCCTTTATTCGAATTC
CAAAACTATTCGAATTCCAAAACTATTCGAATTTTCCCATTTTGCAATAA
ATTGATataattttaggaattttatttAAGAATATTAATTATGCTATTGC
AGTGTATATTGTCACTTCTGgttatatttttgtaacaaaTATTTTGTAGG
CTTTCATTCAAACTTTATATAGGACAGTTCTGATGTTTTGGTTTCGTTAG
TTCATTATTTTGATGTAGCTGGTTTGAGGTTTTATTGCAACTCTTTTGGA
CAAATTTAAAGTATCACCGTCCCTTGTATTGTTTTACACGATTCTCTTCG
ATAGACCTTTGGGAGAACGCGACAGTCTTAACTAATTACTACAGCATAAA
TTACTTTACTCCAAGCAGCAAATATGagataaattttttgtttctagGCA
AAAGCTGTCTTGAAGAAGACAAATCAATTAGATGACGTTATTATTAAAAA
ACACTATGTTGTAGTAGTTGGATTAAATAGACCGTCGCGATCTCCTAAAC
AACTATCCGTGCAATGGTTCTTCTCTCACACTTttgaaaattcatctttt
taaagtagcacaatgtttttttgcaatttagttCCCAGACTGTACAAGGA
CGATGCAGTACTATTTTCACATCCGAATGTTCAAACATTTTATTCACTGT
TATCaccttattttttttctatttttgtattATAAAAACCAAACACCTTT
cacgtcatcattttttattgttatgaAGATTAACCATTGATTTATTTTCC
TTCCAACTACTAAAATTATTGATAGTGAATAAAAGTTAATAAATTCGACT
AATGGAATATCATGTGC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:1283765..1301831+ >MSTRG.1525.2.p3 ID=MSTRG.1525.2.p3|Name=MSTRG.1525.2.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=369bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:1283765..1301831+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATAGAGCAGGTGGCGGCTTGGAAGGATCTGGAGAATACGATACACC
AGAAAAACCTGCAGTTATTGTTCCACCAGTTGTTATTCATTGTTCAGCCG
GTGTTGGAAGGACGGGCACCTTCTGTTGTCTCAGTAATAGCGTGGAGCGG
CTACGCAAGACAGGACTCATAGATATTTATTCCACTGTCAAAAGCATTCG
TGAACAACGAGCTTTTAGCGTGCAAACTCCCGAACAATACCAGTTTTGTT
ATACGGGTATTTTAGAATATGTTTTAAAGAGACGTTATTTGAAAGGTGAA
GATACGGGTAGTGTTGAAGCAGGCTTGACGGATTTCCTACACCGTGATTC
AAGCGATGAAAGTGAGTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000007_pilon | genome | sc0000007_pilon:1283765..1301831 + |
|
