MSTRG.15249.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15249.2.p1
Unique NameMSTRG.15249.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000133_pilon:492921..499036+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15249.2.p1 ID=MSTRG.15249.2.p1|Name=MSTRG.15249.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6116bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000133_pilon:492921..499036+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTTCGCTTCCGGCTAAAATgatgtaaacaaagatggcgcGCTCTCAGGT GGTGATTTTATTGAGtggaatttttttacatattttataTCTTTCCTCAG TATTTTACATCTATTTCAAATCACCAATATTGCCTGGACTTCACAGCATC GATGTTGAAACAAATTCTCTTGCAAATAGATTGGTTTTATTTGTTGCTGA TGGACTGAGGGCAGACAAACTTTTTCACCGAAGCAATGCCAAACATTCTC AATTTCTAAGAGAAATCATCCAAACTTATGGAAGATGGGGTGTCTCACAC ACTAGAGTACCAACCGAATCAAGAGTAGGACATGTCTCCATGATGGCAGG GACATATGAAGATGTTTCTGCTATTACAAACGGTATTATTgatattgttt ttaattttagggGGCAGGCCAGCCTGGCGAAGGGGTACTACCAGACAGAC AGGGTGCGAATCGAACAAATCAAACGCCAAATCGATTGAACAcaatcaaa ctcaatcgaataattgcaattcaattgtcaaacacaatcaaattgtaatc aatcTGTCAATAccaccgtgagattgggtaacttgcatcagtggataatg aaaacaaaaatggtagagagtagagctgcgagcgcagctgcgtagttcat ttggtttgacattttgctgctttggttggttattcatttgagggctatgc atgttagcctccactgatgcaagttacccgatctcacggtattacCCGCC CAGTAGAATTTACCGTTCGATGCTTTGATTACGTTTGATATATTTGATTA TTATGTTTGATTATGTTTCAGATTGATTCAATTGCATTCGCTCGCTTTAA TTGCTCTTGTGTTGTACTTATACGCTCGCTCTTATCTGATTTCTGATGGT GTACCGGTATTTGAGGATCATTTATTTTACAGAAGAAATGAAGttgtctt 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000133_pilon:492921..499036+

>MSTRG.15249.2.p1 ID=MSTRG.15249.2.p1|Name=MSTRG.15249.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=12900bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000133_pilon:492921..499036+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggcgcGCTCTCAGGTGGTGATTTTATTGAGtggaatttttttacatat
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15249MSTRG.15249Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15249.2.p1MSTRG.15249.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15249.2.p1.exon1MSTRG.15249.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15249.2.p1.exon2MSTRG.15249.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15249.2.p1.exon3MSTRG.15249.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15249.2.p1.exon4MSTRG.15249.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15249.2.p1.exon5MSTRG.15249.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000133_pilongenomesc0000133_pilon:492921..499036 +