MSTRG.15248.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15248.1.p1
Unique NameMSTRG.15248.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000133_pilon:474996..486984-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15248.1.p1 ID=MSTRG.15248.1.p1|Name=MSTRG.15248.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11989bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000133_pilon:474996..486984- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATAGGAACCAAAGGGGTATTCAAAGGGGTTTCAAAAATTCTTAATAAAAA
ATCATATGTTAGATTTTCATATCAGTAAGATTTTATTCCTGGCAGAAGCA
AGATATTAAGAGAGAGCGAAATTGACATAGCAAAGCAACTCAGAGAAGTT
TTACTAAAATGTATATTATCTTGGTAATTATCGCAATTTCTTTCATCAAA
CCATCGCAATCGCAGGGTACTATTCATGGTGAGCAGGATATTTTTTAATT
TTTTCTTTACTGTGTTTAGATTTACTTCAACGGCGGGCTTGATAGGGGCT
CCCCCAGGGGCTGGCGTGACGCGTGAATGACCCTTTTTTTCTGTCGTGAA
TACGTGAATTGGACTTTTTCAACGCGTGAATACGTGAATTGAGATATCCG
CGTGAACGTGAAAATAAGATTTTACCAGCGTGAATTCGTGAATCGAGATT
TTGAGCGTGAACGTGAAAAGCAAATTATTGTTAAACAAAAATGAAAAACC
TAAATAGTAAATTTCTTGCTCGCTTCGCTCGCTAATCCTTTACATAAATT
ACCTTTAACATTGTAAGTTATTCAAAAATCAAAATTGAACGAAACAAATA
TTTTTTCGTATTTTCTAGGGCGCATTTTGTGATGCAATTTGCATCCAGCG
AGATGTTTTGACCAAAACAGAAAAGTTAAATGAGAACTTTTCTTCGTCGG
GGCTTATGATGTCGTCTTTCTGTAATCGCTTATTTGTTACTAAATCATAC
CAAATGATACCGCATGAACTTGGAAACGTGAAGGCTGTGATTCTTGCAAT
TTAAAAAGTAGGTAGATAGTTTAAAAATTTTTATATATGATCATCGAAAT
TCAGAAAAATACCTTGCGACGCCGCCCGTGTAAGAGTACGTCACGCGCCC
TACCAGATTGTACCAGTAAATGGTCAGTGTTGAAATAATCAAAGATTTGA
AATTTTTTTGACAACAAGGCATTTGGGTAACATAGTGTGTTAAGGCCGTT
TTCTCAGCAATGAAAGGTGAAAGTTGTCGAATTTTCGCGCTCGCTTCGCT
CGCTTTTTCCTTTCCACAGCTTTTCTTCAATGAGAGACAGGGTGTCAAAC
TTTGGAGTTTGCGTCCTCTGGTTGTACCACCTCTTTGAAGCTCGCGATTT
TCCAGACCATGAATTGGGTCAAACCGCGATTAAATTTATTTCAGAAGAAC
ATATTAGGGCCGCGAGGAGAAATTGGGGGAAACCTTAAAGCTAGGCTAAC
TTTGCCTTCCATCCCTAAAAGCAATTCAGGCAGGGTTTATACCACGTACG
CCGAGAGGTAGTTTTTTTAACTTTTGGCGTGATAGACGTATAGCAGACCT
TAACACATGCCCCTAGAAAGCCAAATAATTGTAAGAGGTCTTAAAACGGT
CGATAAATCTCAATAATTGTAAGAGGTCTTAAAAGGTCGATGCTGTCGAG
AATAAGGTCAAAAAACTGCAGCAAACTTTATGTTGGCCATAAAAGGTCAC
AATCGTTTAACAAAATAATTAAAAGCAAAATCAGCGCGTGAACGTGAAAA
TGTTTTTTTTCGCGCGTGAATACGTGAATTGGCAAAAAATTTTGCGTGAA
TACGTGAATTGAGGGTCGACTGGGGGGGCCTCTTGATATCAATACTCTTA
GGTGCCAAATAAACGGGGGGGGGGGGGGGGTTGGAAAAAATATTTCAAAT
TAAATAAACGGGGGGGACCTAATTACCGGGGGGGTTGGAAAATGGACCTT
AAAAAAACCCTTAAAAATGTCAAAATAGACTAAATTTAGGCTTTTTAGAG
TAAAACAAGGAGCTTTCCTTTTGGTAGCTGGGAATTTTTTCAAAAATTAA
TAAACGGGGGGGGGGGGTCCTAATAAGGTCCGGGGGGGTTGGAAAAAAAT
CAAAAAAATTAACAAGCGGGGGGGGGGCGTTTATTTGGCACCTAAGAGTA
TGTCTATATTCATCTACTTGTTTACTAAGGTAAGACGTTGGGCAGAAATT
GTTGGATTTCATTGTCGCAATACACAGACTGCAAAATTAAAGTCTGAAGA
CAAAATCACGCTTTTATTCGAAATTTTTATATGCTTGTCACATGAAATTT
ATTTCTGATTGGTTCGAAATTATTGACACGAATAAATTTATCAGCTTTAA
GTTGTAAAGCAAGTAACATGGGAATAAAATCACGTGAACTTTTTCGATCA
ATCACATGTTTTGACTGCATTGATGTACTTTTGCAACCCGTGTATTCGTG
GGAGGTTCTGTTGGTTTATTCCTCGGTTTACTTCACTTTGCTTTATTTAT
TTGAAAAAAATACAAAGTATCCATAACGTGAATTTTTTTCTTTTAAGTTT
TCATAGAGCTGATAGTGACTAGCGAGAAATGAGTCCTAGTATGAAAATTT
AATTTTTTTACGGATGCACTGTATGAAGAAAATATAGGGTTGCCTAACCG
TACCAAATAACCAACGATAATGTTTTGCCACTCTTTATCTAGACTTCAAT
GGTAAACGCTATATCTTGGAGAATGCTGCACTTACATGGTCAGGCGCTGA
AGCCGATTGCGTATCCAGAAGAGGACATCTTGCAAGCATCCAATCAGATG
CAGAAGCTAATTTCTTTAATTTTGTAGCTTCTAACCGGTAAAAAACTCAT
ATTTTGATTCATGTAATCTACTGACCGGAAATTTTGCAACGAAAACCCGT
CTGCTGAATCCGATTATTTTGATGGTGGAAACTCATAAAAAAGCACAAAC
TTGTAAATAAAAAAATCATTTTCTTTTAGTCAGATATGGTTGGGGGCAAC
AAAGACACTAAATTCTCCTCCTAGCGATGATTGGAAATGGTCAGACGATA
CGTGTTGGTCATATACGAATTGGAATGTCGGTGAGCCCAACAATGGTGGT
GGTAATGAAGATTGTATGGCAACGGCTGGTGGAAGTACTTCTGTCTGGAA
TGATTTAAATTGTGCTGCTTCTCTACCGTACTTATGTGAACTAGACGGTA
ATGAAATGAATAACATATACCCTAGACGTTTATTAATTTTTTTTCATTTT
TAAGGGCGTCGTTTAGTCGCAGGGGACGTTTAAGAGAAAGAGGCGTTTAT
TAAATCATATATAACCAAAGTTATTTTGATAAAATGAATTCATCATATGT
AACATTGCAATGTCTGCAATGTCTTCTGACATTACATCACAGACCCAACA
GCTGATTGGTTGTAAGTGACGTAAAATCGGTCAATACGACACTTCCAAAC
AATCAACTGTTGGGTCTGTGGAAGACATTGCAATGGTACATATCACGAAT
AGGAGCCTTATTTTGTCTTGAGTACAAATGTTTATCTAGAGGATGTAGAA
TTGGTTTTTTTCCCAAAGAACATTTATTCGAATTAATACGGTGTTCATTT
GAGAGTTACAGTTAGGGTTAGTAATAACACGCATGTATTCGACTCAAAGC
AAAGGTAAAGGTTATTGTAGGATTTACTGATTGACTGCAATTTGTAAGTT
ACGTATTGGAAGCTTAGGCGAGGCCAATTTAATTTGTTGTTTTACGGGCC
AAGCTACCAAAAAAAGAGAGTCGGTCGGTCGGCGAAAAAATAAAAATAAA
AGTAAAATTTCACTTATAAAATCTCCTAAAAAGGCAGCAAAAACTACTTC
CCCCAGGGGGGGCACGCAGTTACTACAAGACAGTATGACACTTACTACCG
TGGTGGTACTGTATTCAGAAGTTATTAAAACAGTTACTACACAGTGTAGT
AACTGCTGTTTGGGGGTGGTGCCAAACACTAAAACTAGCACTTTTGGTGT
AGTAAGTGCTTATATTTTGATTCTTTTTAAAGAACTTTCATAATTTTTCA
CAAAAAATGAATTTTTTTGTGAAAAAATTCTTTGTTAGAAAAAATAGTTT
TGTTATAAATGGACGAAAAAAAATTTAAAATTTTTCTCAGACCCAACTTT
GAAATTATGCTTTCCCTAATTATCATTAAAATGTTCTCAACAGCTGTTAA
CCAATTAAATTAAAAGAAAATCTAGCACAAAAATGGCTTTAGGTTGAAAA
ATAATCGTAATTTCGAGCATGTTTTTGATGATAGCACTCAAAAACAGGGG
TGGTACCTGGAAATCTTTTCTGAAAACAGTTACTACCAAGGTGTAGTAAC
TGCAAAGGGTGGTGGTCCTGAAAAAAAGTGTTGAAAAAGCACTTACTACA
CATCATGTCTTGTAGTAACTGCGTGCCCCCCCTGCTTCCCCTTGACAAAA
GTGCGAAATAGAAAATAAAAAGCACAAATCGCTCGAATTCATGGATAAAT
TGAAAAATTGAACATAAAATTCTCGAAACCTTGAAAAAACTACAAAAATT
TTGAAAATTTGTCAGTCTGTAAAGCAATGAAAATAAAAATGTACTGCCGA
AATCAATTTTATTTTTATTTCGATTTTTGGAATTTCAGGGTCGGTCGGGC
TCGTAAAACAATTAATCAAATTGGTCTCGTTCAATATTTCTTTATTCTAT
TCACCCTTTATGACCGTGTCGTCAGTTTCGATTCCTAATCGCACGATGAG
TTATTTTTTCTTCTTTCGCGCCCCTTCAAAGGGAGCAATTAATCGTTAAT
TGCATCCTGTAGAGAGCAATTAATCTTTAATCACACTCTTCAATGACGCG
CCAATGTTTACAAAATTGATTTTAATGTTTTTTCTTACATTTTTTTATCG
AACGTTTTAATTGCATTCGAAATTCATTTTTTGAGAAAAAAAATCTTTAA
GCAAACATCAATAAAAGAAAAACATAAAGAGAAGAGAAAAATGTAAAACT
TTCAGCGGGATTTACTTTCCTGACGGGGAAAAAGTAGTGAAAAATTGTGC
GATTAGCTCGTTACCATGTGATTACATATACTAATTATTACTAAGATAAT
AATTTTACTCTATTTTTTATTTCAATCAACAGATTGCGGCACAGCCAACT
GTCAAAGTAAGCTCTTTCAAAAGATTTTCAAAAGTTCCCGAAATAAGTTA
TCAGGCATAATTGCATGTCTAAATCGTGGGTTTGACGGTGACCAAATATA
TTTGGAGAAAAACGTGCCTTTAGAAAGATAATAAAGATAATTGGTGGATA
TAAATTTTGTACTAACAAAACAAATAATTTATGAAAACAAATAGGGTTTC
AGTCCAAGAAGTAAAGATAGTCACAATAGATTATCTAAGCCTCTGAGATT
TTTTGTGAGCTTGTTAAGATTGTACACGATTTCATTTTTTTAGTCGATGG
TGGCTGGTCATCCTGGTCTTGGGGAGCATGTGATGCACCATGTGGCCCTG
GAACTCAAATAGAAGAACGTTCGTGTACAAATCCATCTGTATCAAATGGT
GGTTTAAGCTGCTGCGGTTCAGCTACAGGGAACACACAATCGTGTGAGGT
TGTACCTTGTCCAGGTATATAGCAGCACTGATATCCAAATACCTACCTAT
CGATCGACTGCATTTTCATTTAATGCCCAAAAACACATTTTTCTATTAGC
AACTCCTCGGGTCAGCATTGCTTAGCATTCTGGCTCATTTTCTGAAAAAT
TGATTTTCAACCAGCCCCGACCTGATATTATCCCATATTTATATTGTTTG
CTTAGATTATCTAAAAAGCTTAAATTACTTTACCAAACAGTGAAAAAGAT
TCAGCTAATATCAGGTCTCGGAGCCTTAGCAACCAGGTTGCTTATATAAA
TAAAAAATGTGTAGCCCATTACAGACCCGGGGGGGGGCACTCGATCTGAA
AACGACCATACGTTCGGCCCAAAATTTGGCTTCTAAAATCAGACCCTTAC
AGTGCAGTGAATTTCCATGAAAAATCATACCCTTACAGTGCACTTTTTCA
AAATTTCTCGCCCGTAAGGGGGAAAATTTTTGCAATTTTCCAAGGAAATG
TGGAATTTTTCCTCCAAAATTGACCAATTTTGTTCCAATTTTACCAAAAA
ATTGGCCTTTTATCACAATTTCCTACCCTTACAGTGCAGTTCAGTGCAGT
TTTGTAATTTCCTACCCTTACAGTGCACTAGCTGAACTATGAACAACCTA
CCCTTAAGGGCCGAACGCCTGGTAAGACATTTACCTTGAGTGCCCCCCCC
CCCCGGGATTACAGACTTTCACAGTTAATTCGAACAACCTGCACAACTAA
TTTACGAAATATAATTATTTTATTTATAGTCAACGGTGGTTGGACTGCTT
GGGGAACTTGGGGTGCTTGCAGTGATCCATGCGGAACAGGATCACAGGAA
CGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGAGGAGACCCTTG
TGCTGGAGATACATCTGAATCACAAGATTGCAATACCAATCCTTGCCCAG
GTACTTAAGGGAGTGGTCAGAAACTATCTACTAGGGGGAGTGGAGGATAT
TTCAAAAAATCAAAAGAAAATTTTTTCACCCCAACCCCTAGACGATCTAT
CGTCTACCCAACCCCTGACCTGGAAAGATTTTTCGAGCCCCCCTCAAAGA
GGTTTAAAAATATTTCGCACTCCCCCCCCCCTTTGCTAAAATTTTTTTCT
CCCTACACTCTAAGTGACTGATTAATAAGGTGAGGGTTATACTTACTTAT
ATTTACCTTTGAATAAGGGTGACTTGTCAAATATAAATCAGGCTCAAACT
ACAGTAAATTTCCAGATTGTGAGTGATCCTATAAGCTTCGATATCCAAAT
GGCGTGCACTCATGCTGGGGAGGACTACATTTTTATTTAGAAGGCAGCTA
GTGGCTTGATTTCAAACGTGCAAACCATGGTTTGCACCGACAGGAGAAAT
TTTGATTTTAGACTCCTGATTTCCTTCAAACATAGCTCTTTTTCGGACCG
ATTCTGTCCAGAAATGAGGCTTTCAATGTCTGAATCATATGGATGTACAA
TATCGTTATATAACAAAAGTAATATTTTGAGTTGAGTTTAAAGGTAATAA
TGTTATCAGAGATTAAGAAGGCGCAACCATGGTTTGCGACGACAGGAGAA
AAAATTCAATTTTCAACTACTTTATTCGCTAAATAAACCACTGTATTTTC
AGCTTTTTTTAAAAAGGCTAGACTATGCTGAAATATGAAATTGTAAGAGG
GGAAATTCCTTAAAAAAAATTCTCTCTTAGTCCACTGAACCATTGTTTAC
ACAATGTCAAGACCTACAGAAACTGAAATGGTGAGGCTATCACGATGTAT
TTCATTAATACAGAATTAACAATTATACGAAATATGAATAATGTCGGCCG
TTAAGCCGGAAAATTTTCAAATCTTCAAATGTGAAACCATGAAATTTGAT
CTCCTGAGTTATATCTCTTGAGTTGTCCAAAAACATTTCACTCCCCCCTT
TTCTATTGAAATATTTTTGACCCCCCCTAAACCCTCAAAATAATTTTCGA
ATCCCCTCTGAAATCCTCCATCCCCTCGTAGTCCCTAGTAGATACTTTCT
GACCATTCCCTAATTATAACAGGGTATATTTTTTATTGTAAAAATTATTG
TTGTTTGGAAAATGTTCGTAGATTTATAAGCCATAATTACTTTCTGACCA
TTCCCTAATTATAATTTTTTATTGTAAAAATGATTGTTGTTTTGGACACT
GCTCGTAGATTTGTAAGCCATAATAACCTCTGAAATATGTCGGAAAAGGA
TAAAGTCTCAATATCTCTAGACTAAATTGCCTTTTTCTTAGTCAACGGTG
GTTGGACTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCACTGCTACATGCGGAACA
GGATCACAGGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGG
AGGAGACCCTTGTGCTGGAGATACATCTGAATCACAAGATTGTAATACCG
ATCCTTGCCCAGGTAACTATAACAGGATATATTTTTTATTGTAAAAATGA
TTGTTGTTTTGGACACTGCTCGTAGATTTGTAAGCCATAATTACCTCTGA
AATATGTCGGAAAAGGATAAAGTCTCAATATCTCTAGACTAAATTGCCTT
TTTCTTAGTCAACGGTGGTTGGACTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCA
CTGCTACATGCGGAACAGGATCACAGAGAACGGTCAAGAACTTGTACAAA
TCCAACACCTGCCCACGGAGGAGACCCTTGTGCTGGAGATACATCTGAAT
CACAAGATTGCAACACCAATCCTTGCCCAGGTAACTATAACAGGATATAT
TTTTTATTGTAAAAATGATTGTTGTTTTGGACACTGCTCGTAGATTTGTA
AGCCATAATTACCTCTGAAATATGTCGGAAAAGGATAAAGTCTCAATATC
TCTAGACTAAATTGCCTTTTTCTTTTAGTCAACGGTGGTTGGACTGCTTG
GGGAACTTGGGGTGCTTGCACTGCTACTTGCGGAACAGGATCACAGGAAC
GGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGAGGAGACCCTTGT
GCTGGAGATACATCTGAATCACAAGATTGCAACACCAATCCTTGCCCAGG
TAACTATAACAGGATATATTTTTTATTGTAAAAATGATTGTTGTTTTGGA
CACTGCTCGTAGATTTGTAAGCCATTAATTACCTCTGAAATATGTCGGAA
AAGGATAAAGTCTCAATATCTCTAGACTAAATTGCCTTTTTCTTTTAGTC
AACGGTGGTTGGACTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCACTGCTACATG
CGGAACAGGATCACAGGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTG
CCCACGGAGGAGACCCTTGTGCTGGAGATACATCTGAACCACAAGATTGC
AATACCAATCCTTGCCCAAGTAACTATTTTACATTTTAAAACAAGTGTGG
TAAATCAATGCCATAAGAGTGCTCGAATAGTTAAGAGCTAGTTTCCAAAT
GTTGCCATAAGAACTAATTCATTCTAAAGAACTTTAAATCCTCCCCCCCC
CCAGGACAAATCATAAATTTTATTTTCAATACTTCTTAATGCTTTCGTTA
TTGTTTTTTTTTGCACAAATTATCCAGTTTTTTAGCTTTTTACGTCGAAT
TTTAAAATTTTCAGTCATTACTATACATATGATTAGTGCCTCTCCAAATA
AACGCCCCCCCCCTGTTTTTCAATTTTTCCAAAATTTTCCAATCCCCCGG
ACTAGAACCCCCCCCCCCCGTTTAATAATTTTTAAGAATATTTTCAGCTG
GCAAAGAGAAGGCCCCTACTTTGCTTTATAAATAGCCTGTTTTTAGCCTA
TATCTACCTTATTTTTGGTTTATCACAAGTACAATTTCCAATCCCCCCGG
TAATTAGGTGCCTCCTCCATTTATTAAAATTTCTTCGAAAATCTTCCAAC
CCCCCCCCGTACTTATGTACTTTTTAGTCTTTTAATGGAAGATAACTTTT
AAAATATTGTTATTTTACATTTTAAATGTTTTACATTCAAACGCTGTGCT
TTAATACTCTTTGTTTCAGAGTTTTTATAGGGCACTTGTGATTTACAATG
TTACGTTTAACACATGTACTAAAAGAATTCAAATCCATTTTCGTCTGATT
TATTTAGTTCATGGTGTTTGGACTTCATGGGGAAGTTGGGAGACATGTAG
CTTAACATGTGGTACAGGATCTCAAAATCGAACAAGAACATGTACAGATC
CTGCACCTCAACACGGAGGAGATAATTGTGCTGGAGATGCATCAGAACCA
CAAGATTGCAACACCAATCCTTGTCCTGGTATGTTTGAATGTACATAGAA
GCGCTTAGCTGATATTTTTCGTGTGTTTTATTTTCGCAAGTGTAGCTACC
GTCAACTGCTCTAACTTGGGACTATCTGGCAAAACATGGGACTGCAATTC
GGCCACCATTTCACCGAACCTCCAAAGTCATTTGATTTGAGTTTCTCTTT
CGATTGTACAGTAAGTGAAAATACAGACCAGATATGCAACAGTCCCATGT
TTCGACCAATCGTCCCAAGTTAGAGCAGTTGACGGTACTCAGTTATTAGT
AAAGTTTCACGAACGAAATTTCAAGCACATCAATAATCTAAGCATTCTCT
TTTTCAGTCAATGGAAATTGGGGACAATGGAGCAATTGGACAGAATGCGA
TAAACCGTGCGGTGTTGGATTCCAAAACAGGTCACGTGTCTGTGATGATC
CTGCTCCCGCTCATGGTGGAAATGATTGTAATGGAACGCACACTAATGAA
ACACAAATGTGCAACTTCAACTATTGCCCAGGTAAGTAATTAAATAAATT
GAGGGTAAACTAGTAACCTAAAAACATCGATCTAAGTAGCTGACGTAATG
AACATTTTTATTTGGATGTTGCATCCACTGTTGAAATAATCAAGTTTCTT
CTCTTTCCAAGATTTGCAAAACCGGTAAAACTAAAGTGACGTTTATACTT
CAGATATGTGTAATCAATATTTCAAGATGTGTGGTTGTGAAGATATACCG
GTGATTTACGACATGACACTCCTCACGACAAACGCAACATATTATGGTAT
CGACGAAACAGATGTCAATGTTACCCTCAACTCATTGGGTACATGGGACT
CCGAAGCTATCAAACTGCTTTGCAAAAGTAAGAAGACTTGTTTCATTTTG
AATCTATAGGCACTTTTTCATAGAACAATTTCATAAGAGCACGGGCCTGA
TAATCGAAACCTAAGAACAAATTAAGAACAATCCTGAGCCTTAGATTTCA
GAAGTTATTTAAGAAAGTATTGAAAGAAAGCGTATTAAGAACGTCGTAAG
AACATTTTAGCGTTAACATTTCAGCAAATTATGAACAAACCTATCCTAAA
ACCAGAATTTACTAGTTCTCATTCATGTTTTATTCCTTAACTGAAACATT
TTCTAGATTATAAAAAAATACTCTTTTATCAATCATTTGATTTAAATCTT
TCAGATTCTCAATGCAGCGACACAAGTCTTCAGAGTGCAATCAACGATAT
TCAAGCAGAGATAGATAGAATTCAAATATCTTTAAATACTGTTAGTTTGT
CAAAAAAACTCATTCGAAAGATGATTGACTGCAAGGCAAATGTCTGGGGA
AGGCGAGGCGAATTATATGACCATTATGAGGCTCTTTGCAAACGTAAAGT
AATTGTTCGACAAGTTCATGAGGATTTGAAGATAAAGAAAAATATCTTGG
AAAAAGAGAAAAAGAGATGTGCGGATAGGAGTAAGTTAAAAATTATTTTT
TTAAGCTGTATATTTGTTCAAAAAGTCATTGTATAACAATCATAATAATC
GTATAATAATCAGATTGCAGAGCTTTATCTGTCAAAACAATATGATGGAT
TACCGAATGTTGGTTATTCATGGTAATGAGGCTTTTTCTATTATTCTGTC
TTTTTCTCCAGGTTGGTTACGACAAGTTTTGGAAAATTCATGGTCAAAAA
TGTAATGATTTATTTATTATTCGATAATATTTTCAAGACATATTTTTAAG
TTTAATTCTATTTAAGTTTATGAATAATGAACTAGCACTAAAGTGTAAAG
AAGACTGTTGAAAAGCTACCAATACACCCCTGTGTCACAGACCCGCTCGG
ACCCTAGCCCCACTGGAAAATTTGGCAAAAATTTTGTCCCCGGTGAGAAG
ATACACTGGAATTTCAGCCCCTTGACTCTTCTTTTGACGAAATAGATGTA
TATACATTGGATTATAAAAATAATGGCTTGAAATTACTGTCAACAACTCC
TGTCTGCAGTGTCCTTGTATCATAAATCTTGAATTTGCAATTTATTGGTT
AATAATTTTTTTCATTTCATATTAAAGTATGTACTTCTTATATTTCTATA
TTTTAAAATCTAAAATTGTTAAAATTGTTAAAAAAAAATTTAATCTTAAT
AATTCAAATGATTAGAAAACTTGTAAAACTTAGAACAGACCCAAACAAGA
GTCGTAAAGATGCGGATAAAAATTTCCCCTGCAATACCGAAAAAGTCTAG
ATAACGAAAAAAGATTGAATGCTAGAAAATGCATAAAAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000133_pilon:474996..486984-

>MSTRG.15248.1.p1 ID=MSTRG.15248.1.p1|Name=MSTRG.15248.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6573bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000133_pilon:474996..486984- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCAACGGTGGTTGGACTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCACTGCTACA
TGCGGAACAGGATCACAGAGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACAC
CTGCCCACGGAGGAGACCCTTGTGCTGGAGATACATCTGATCAACGGTGG
TTGGACTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCAGTGATCCATGCGGAACAG
GATCACAGGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGA
GGAGACCCTTGTGCTGGAGATACATCTGAATCACAAGATTGCAATACCAA
TCCTTGCCCAGTCGATGGTGGCTGGTCATCCTGGTCTTGGGGAGCATGTG
ATGCACCATGTGGCCCTGGAACTCAAATAGAAGAACGTTCGTGTACAAAT
CCATCTGTATCAAATGGTGGTTTAAGCTGCTGCGGTTCAGCTACAGGGAA
CACACAATCGTGTGAGGTTGTACCTTGTCCAGATTGCGGCACAGCCAACT
GTCAAATCAGATATGGTTGGGGGCAACAAAGACACTAAATTCTCCTCCTA
GCGATGATTGGAAATGGTCAGACGATACGTGTTGGTCATATACGAATTGG
AATGTCGGTGAGCCCAACAATGGTGGTGGTAATGAAGATTGTATGGCAAC
GGCTGGTGGAAGTACTTCTGTCTGGAATGATTTAAATTGTGCTGCTTCTC
TACCGTACTTATGTGAACTAGACGACTTCAATGGTAAACGCTATATCTTG
GAGAATGCTGCACTTACATGGTCAGGCGCTGAAGCCGATTGCGTATCCAG
AAGAGGACATCTTGCAAGCATCCAATCAGATGCAGAAGCTAATTTCTTTA
ATTTTGTAGCTTCTAACCGATGTATATTATCTTGGTAATTATCGCAATTT
CTTTCATCAAACCATCGCAATCGCAGGGTACTATTCATGTCAACGGTGGT
TGGACTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCACTGCTACATGCGGAACAGG
ATCACAGAGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGA
GGAGACCCTTGTGCTGGAGATACATCTGATCAACGGTGGTTGGACTGCTT
GGGGAACTTGGGGTGCTTGCAGTGATCCATGCGGAACAGGATCACAGGAA
CGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGAGGAGACCCTTG
TGCTGGAGATACATCTGAATCACAAGATTGCAATACCAATCCTTGCCCAG
TCGATGGTGGCTGGTCATCCTGGTCTTGGGGAGCATGTGATGCACCATGT
GGCCCTGGAACTCAAATAGAAGAACGTTCGTGTACAAATCCATCTGTATC
AAATGGTGGTTTAAGCTGCTGCGGTTCAGCTACAGGGAACACACAATCGT
GTGAGGTTGTACCTTGTCCAGATTGCGGCACAGCCAACTGTCAAATCAGA
TATGGTTGGGGGCAACAAAGACACTAAATTCTCCTCCTAGCGATGATTGG
AAATGGTCAGACGATACGTGTTGGTCATATACGAATTGGAATGTCGGTGA
GCCCAACAATGGTGGTGGTAATGAAGATTGTATGGCAACGGCTGGTGGAA
GTACTTCTGTCTGGAATGATTTAAATTGTGCTGCTTCTCTACCGTACTTA
TGTGAACTAGACGACTTCAATGGTAAACGCTATATCTTGGAGAATGCTGC
ACTTACATGGTCAGGCGCTGAAGCCGATTGCGTATCCAGAAGAGGACATC
TTGCAAGCATCCAATCAGATGCAGAAGCTAATTTCTTTAATTTTGTAGCT
TCTAACCGATGTATATTATCTTGGTAATTATCGCAATTTCTTTCATCAAA
CCATCGCAATCGCAGGGTACTATTCATGTCAACGGTGGTTGGACTGCTTG
GGGAACTTGGGGTGCTTGCACTGCTACATGCGGAACAGGATCACAGAGAA
CGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGAGGAGACCCTTG
TGCTGGAGATACATCTGATCAACGGTGGTTGGACTGCTTGGGGAACTTGG
GGTGCTTGCAGTGATCCATGCGGAACAGGATCACAGGAACGGTCAAGAAC
TTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGAGGAGACCCTTGTGCTGGAGATA
CATCTGAATCACAAGATTGCAATACCAATCCTTGCCCAGTCGATGGTGGC
TGGTCATCCTGGTCTTGGGGAGCATGTGATGCACCATGTGGCCCTGGAAC
TCAAATAGAAGAACGTTCGTGTACAAATCCATCTGTATCAAATGGTGGTT
TAAGCTGCTGCGGTTCAGCTACAGGGAACACACAATCGTGTGAGGTTGTA
CCTTGTCCAGATTGCGGCACAGCCAACTGTCAAATCAGATATGGTTGGGG
GCAACAAAGACACTAAATTCTCCTCCTAGCGATGATTGGAAATGGTCAGA
CGATACGTGTTGGTCATATACGAATTGGAATGTCGGTGAGCCCAACAATG
GTGGTGGTAATGAAGATTGTATGGCAACGGCTGGTGGAAGTACTTCTGTC
TGGAATGATTTAAATTGTGCTGCTTCTCTACCGTACTTATGTGAACTAGA
CGACTTCAATGGTAAACGCTATATCTTGGAGAATGCTGCACTTACATGGT
CAGGCGCTGAAGCCGATTGCGTATCCAGAAGAGGACATCTTGCAAGCATC
CAATCAGATGCAGAAGCTAATTTCTTTAATTTTGTAGCTTCTAACCGATG
TATATTATCTTGGTAATTATCGCAATTTCTTTCATCAAACCATCGCAATC
GCAGGGTACTATTCATGTCAACGGTGGTTGGACTGCTTGGGGAACTTGGG
GTGCTTGCACTGCTACATGCGGAACAGGATCACAGAGAACGGTCAAGAAC
TTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGAGGAGACCCTTGTGCTGGAGATA
CATCTGATCAACGGTGGTTGGACTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCAG
TGATCCATGCGGAACAGGATCACAGGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATC
CAACACCTGCCCACGGAGGAGACCCTTGTGCTGGAGATACATCTGAATCA
CAAGATTGCAATACCAATCCTTGCCCAGTCGATGGTGGCTGGTCATCCTG
GTCTTGGGGAGCATGTGATGCACCATGTGGCCCTGGAACTCAAATAGAAG
AACGTTCGTGTACAAATCCATCTGTATCAAATGGTGGTTTAAGCTGCTGC
GGTTCAGCTACAGGGAACACACAATCGTGTGAGGTTGTACCTTGTCCAGA
TTGCGGCACAGCCAACTGTCAAATCAGATATGGTTGGGGGCAACAAAGAC
ACTAAATTCTCCTCCTAGCGATGATTGGAAATGGTCAGACGATACGTGTT
GGTCATATACGAATTGGAATGTCGGTGAGCCCAACAATGGTGGTGGTAAT
GAAGATTGTATGGCAACGGCTGGTGGAAGTACTTCTGTCTGGAATGATTT
AAATTGTGCTGCTTCTCTACCGTACTTATGTGAACTAGACGACTTCAATG
GTAAACGCTATATCTTGGAGAATGCTGCACTTACATGGTCAGGCGCTGAA
GCCGATTGCGTATCCAGAAGAGGACATCTTGCAAGCATCCAATCAGATGC
AGAAGCTAATTTCTTTAATTTTGTAGCTTCTAACCGATGTATATTATCTT
GGTAATTATCGCAATTTCTTTCATCAAACCATCGCAATCGCAGGGTACTA
TTCATGTCAACGGTGGTTGGACTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCACT
GCTACATGCGGAACAGGATCACAGAGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATC
CAACACCTGCCCACGGAGGAGACCCTTGTGCTGGAGATACATCTGATCAA
CGGTGGTTGGACTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCAGTGATCCATGCG
GAACAGGATCACAGGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCC
CACGGAGGAGACCCTTGTGCTGGAGATACATCTGAATCACAAGATTGCAA
TACCAATCCTTGCCCAGTCGATGGTGGCTGGTCATCCTGGTCTTGGGGAG
CATGTGATGCACCATGTGGCCCTGGAACTCAAATAGAAGAACGTTCGTGT
ACAAATCCATCTGTATCAAATGGTGGTTTAAGCTGCTGCGGTTCAGCTAC
AGGGAACACACAATCGTGTGAGGTTGTACCTTGTCCAGATTGCGGCACAG
CCAACTGTCAAATCAGATATGGTTGGGGGCAACAAAGACACTAAATTCTC
CTCCTAGCGATGATTGGAAATGGTCAGACGATACGTGTTGGTCATATACG
AATTGGAATGTCGGTGAGCCCAACAATGGTGGTGGTAATGAAGATTGTAT
GGCAACGGCTGGTGGAAGTACTTCTGTCTGGAATGATTTAAATTGTGCTG
CTTCTCTACCGTACTTATGTGAACTAGACGACTTCAATGGTAAACGCTAT
ATCTTGGAGAATGCTGCACTTACATGGTCAGGCGCTGAAGCCGATTGCGT
ATCCAGAAGAGGACATCTTGCAAGCATCCAATCAGATGCAGAAGCTAATT
TCTTTAATTTTGTAGCTTCTAACCGATGTATATTATCTTGGTAATTATCG
CAATTTCTTTCATCAAACCATCGCAATCGCAGGGTACTATTCATGTCAAC
GGTGGTTGGACTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCACTGCTACATGCGG
AACAGGATCACAGAGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCC
CACGGAGGAGACCCTTGTGCTGGAGATACATCTGATCAACGGTGGTTGGA
CTGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCAGTGATCCATGCGGAACAGGATCA
CAGGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGAGGAGA
CCCTTGTGCTGGAGATACATCTGAATCACAAGATTGCAATACCAATCCTT
GCCCAGTCGATGGTGGCTGGTCATCCTGGTCTTGGGGAGCATGTGATGCA
CCATGTGGCCCTGGAACTCAAATAGAAGAACGTTCGTGTACAAATCCATC
TGTATCAAATGGTGGTTTAAGCTGCTGCGGTTCAGCTACAGGGAACACAC
AATCGTGTGAGGTTGTACCTTGTCCAGATTGCGGCACAGCCAACTGTCAA
ATCAGATATGGTTGGGGGCAACAAAGACACTAAATTCTCCTCCTAGCGAT
GATTGGAAATGGTCAGACGATACGTGTTGGTCATATACGAATTGGAATGT
CGGTGAGCCCAACAATGGTGGTGGTAATGAAGATTGTATGGCAACGGCTG
GTGGAAGTACTTCTGTCTGGAATGATTTAAATTGTGCTGCTTCTCTACCG
TACTTATGTGAACTAGACGACTTCAATGGTAAACGCTATATCTTGGAGAA
TGCTGCACTTACATGGTCAGGCGCTGAAGCCGATTGCGTATCCAGAAGAG
GACATCTTGCAAGCATCCAATCAGATGCAGAAGCTAATTTCTTTAATTTT
GTAGCTTCTAACCGATGTATATTATCTTGGTAATTATCGCAATTTCTTTC
ATCAAACCATCGCAATCGCAGGGTACTATTCATGTCAACGGTGGTTGGAC
TGCTTGGGGAACTTGGGGTGCTTGCACTGCTACATGCGGAACAGGATCAC
AGAGAACGGTCAAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGAGGAGA
CCCTTGTGCTGGAGATACATCTGATCAACGGTGGTTGGACTGCTTGGGGA
ACTTGGGGTGCTTGCAGTGATCCATGCGGAACAGGATCACAGGAACGGTC
AAGAACTTGTACAAATCCAACACCTGCCCACGGAGGAGACCCTTGTGCTG
GAGATACATCTGAATCACAAGATTGCAATACCAATCCTTGCCCAGTCGAT
GGTGGCTGGTCATCCTGGTCTTGGGGAGCATGTGATGCACCATGTGGCCC
TGGAACTCAAATAGAAGAACGTTCGTGTACAAATCCATCTGTATCAAATG
GTGGTTTAAGCTGCTGCGGTTCAGCTACAGGGAACACACAATCGTGTGAG
GTTGTACCTTGTCCAGATTGCGGCACAGCCAACTGTCAAATCAGATATGG
TTGGGGGCAACAAAGACACTAAATTCTCCTCCTAGCGATGATTGGAAATG
GTCAGACGATACGTGTTGGTCATATACGAATTGGAATGTCGGTGAGCCCA
ACAATGGTGGTGGTAATGAAGATTGTATGGCAACGGCTGGTGGAAGTACT
TCTGTCTGGAATGATTTAAATTGTGCTGCTTCTCTACCGTACTTATGTGA
ACTAGACGACTTCAATGGTAAACGCTATATCTTGGAGAATGCTGCACTTA
CATGGTCAGGCGCTGAAGCCGATTGCGTATCCAGAAGAGGACATCTTGCA
AGCATCCAATCAGATGCAGAAGCTAATTTCTTTAATTTTGTAGCTTCTAA
CCGATGTATATTATCTTGGTAATTATCGCAATTTCTTTCATCAAACCATC
GCAATCGCAGGGTACTATTCATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15248MSTRG.15248Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15248.1.p1.exon13MSTRG.15248.1.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon12MSTRG.15248.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon11MSTRG.15248.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon10MSTRG.15248.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon9MSTRG.15248.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon8MSTRG.15248.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon7MSTRG.15248.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon6MSTRG.15248.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon5MSTRG.15248.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon4MSTRG.15248.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon3MSTRG.15248.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon2MSTRG.15248.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15248.1.p1.exon1MSTRG.15248.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15248.1.p1MSTRG.15248.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000133_pilongenomesc0000133_pilon:474996..486984 -