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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000132_pilon:504206..511767- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15183.1.p1 ID=MSTRG.15183.1.p1|Name=MSTRG.15183.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7562bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:504206..511767- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GGAGTTCTTGTTTTGGCGCTCCATAAAGGGGCGCCGATTGCCACTATTTT
TATTTTACGTCTTCATTTCAAGATGGCGACAACTTTGCAAGGCAATTCTC
AAACTATGTCGACGTTCACAGTTTTAAGACACCTTTTTCTTGCCATATCC
TTTGGTATTTTTGGATATTACTATTACAACAACTATCTCAATATCGAAAG
ACAACGTGTGAATAATGTTTTACATGGACTCTTACTTGAGGAACGTAGTG
TGAATCTCTCAACTGAAAAGGCCGTTGCTGTTGGTTTTGGAGCTTGTGTT
GATCTTTTTGTTGATGGAATCCCTCTTGTCAATGCTCTTGGATTAAAGCC
ACCTAAAGAAGCAAAATATCACAATAATATTCAATCATTGGAAGATGTTG
CAGAAATGTTTGCTTTCTTCTTATCCAATGGTGCAGCTGCAGAGTAAGTC
AGTCAGGACCTCTTTGGTCTTTTTTAACATTAGTTCGGATAGAATAAAAA
CATACCTGATCAACACAACCAAACCTTCTGTCTTGCGTTTACTCTTTCCT
TCACAACAACTTTCGTTTTTGCTTATGTAGGTTTTAAAATCCACAAGTAA
TGAACCTCTTATAGCTTTATCTGAATAAATCTGGTTGAAAACCTGCTATC
AGGTTTCATTCCGTACGTTTTTTATCCACGTGGTGAACCGGTTTCCCCGA
TTTCCCGATAATTAAAAATTGGAACTTTCCCGTGGGCGCGATTGGGCGTA
CCGCCATCGCGAAATATTTTTCGTGAAAATTTACCGTATTCTAACGCTAA
TATAATCTAGATAGGAAACAAATATTAAATTTGACTCTTTTTTGCTCGTA
TTTCTAAATTTTACGATAAAAAGAACTATTTACAAATTATTTTCTTTAAC
GGGCGTTGAATCGATATTGACATATTTAATGATGTCATAATCAATGCCGT
GCATATTTTGTCAGTGTCGTGCATATTATGTCAACATCCTTTTCATTGGA
TAAATACCACTAAAATATACAAGAAAAGTAAAGATAAATTTATCGCCCGC
GAGCACGGCTTAGCTAAGCGCACCTCTCTTATTCATTATCTAAGAATTGG
AGCGGGCAAAGATTACCGCGCGGGCTGATAGCGGGCAAAGGTTATTTGAA
GATGTTTTCAGTTATAATCCAAGGTAGAACAAACTAAACATAGACAGGGG
GTATTTTTTAGTGCTCTATACGATGATCGGTATTTTTTTTGAATTCTATG
TTTAGATTTTTCTACCCAGCCCCGTTGCTATGTACGCGCGCCTTGTTGCT
AAGACCTTTGCTTGAAATCGAAAGTGAAACCAAAATAATTTAGCGCAAAC
TGCCGTTTGCGTAATATCGATAAAGTGAAATGAGGTCCTGACTGGAGTAA
GTACCTTAAGGGAAGAAATTTTCGCGAGAAGAAATCTTCGCGGAATTTAA
TTTCGCGAATCAGAGTCTCAAAATAGCAAATTTCGCGGAATTTAATTTCG
CGAATGAGCCGATTTCAAAAGTTTCACGGAATTTAATTTCGCGATTGAGA
AGAAGTTATCAACTTAGATTAACTTTTAAGCATCACGGAGTTGTTTATAT
TTGTTTATATTTGATAAAAAAAATACACGTTATAATGCTTAAAAATCAAT
TGTGTCCATCTTTTTTGGTAATACCTGGTCAAAAACAACAAAATAAAAGA
AGAAGAAAAAAAATCGAATTTCGCGGAATTTAATTTCGCGATTTAACAAT
TTTGGTGTGTTTCGTGGAATTTAATTTCGCGAATTACGCCCAAATTCGCG
AAATTAAATTCCGCGAAAATTTCTTCCGCGAAAATTTCTTCTCGCGAAAA
TTTCTTCCCTTAAGGTACTTTTTTTAATCCTTGGTTCTTATTATTCATGA
TATTCATGATTGGGCTCTTCCAGTCTGGGAAATCCTCTCAATTGCACGCT
TATGTTTCGAGGGCGTAAGCGCGCAATTGCATGGTTATAATTTACGCCCG
CTCCCGGCCTGGTTGAAATTGCTTAGGGATTTCAAGGGGTTCAGAATTCT
CTAATTCGGGGGCGAAGGCATGGTTTAACAGGCAATCCATTTTTACGGAA
TCTTCTTCTACAATAAATTTTGAGTAAAACTGCCCTAGGCTTTTGAAATT
CAACAGAGCTTTCGGAAGGAATTGCGTGTCAAAAATATAGGAAATTTTAA
AAAACGCTTTAAAATTTCCTATAATTTTTTCATATATATATCTATATTTT
GTGGAATTCCGAGGCAAAATTTTTTTTTGAAATTTATGGATTTCCAATAC
AAAAGCAATTGAAACGAAATCTGGAATTTCCGATACTTTTTTCAAAATTT
TGACGAATTACCGTCAATTGCTCTAACTTGGGACTATCTGACAAAACATT
GGACGGCAATTTGGCCACCATTTCACCGAACCTCCAAAGTCATTTGATTT
GAGTTAAGGAACAGCGTATTTAAAAATACACGATCTCTCTTTCGATTTTA
GGGGCCACTCACATATCGATTTTTCCTACGCTTATAGCGTCATTCCGACG
CTATAGGGTGGGTGGGTTAGATCGAGTGACGCTAAGAAAATCTACTAGAG
ATATCGGTTTTTGAGGCCAAAGAGATGTTCAAATTTCCAGAAAACTATAA
CTTCCATACTTATTATTTTCAATTAGCACCCTGTTCCCCTGTTCATATTC
GAGATTCAACAAAACATCCTCGCGCTTCTCTTTTTCACGACATCAAAAAT
AAGCCAGTATAGTAAAATACCGGAGATGCTATGTTTAAAAGTTTGGGACT
TCGCGTCATAACTTATGCGAACTTGTGCAAAAGTCATATACCGAAACCAC
TACTCGAAAAAAAAGCAAAATGTACCAAGCAGAAGAGGGAAGAAACTTCT
CTGTCAGTGGAACATCAATACTTGAAGTGAGAAAGGAAAAAAGGTTTTCA
TCGGTTTTCGGTATATTTTATAATATGACGCTAAGGGTAGGGGGGGTGAG
TGGGTTTTTTAATTAGCGTCGGAATGACGCTAAGCGTGGGAAAAATCGAT
ATGTGAGTGGCCTCTTACAGTAAGTGAAAATACAGACCAGATATGCAACA
GTCCCATGTTTCGACCAATCGTCCCAAGTTAGAGCAGTTGACGGTATGTG
GAATTTCCAATGGTTCAAATAAAAAAATTGATTTGAAAAATTGACTGGAT
TTCCGAGTGTTTTTTTTATCTGAAAATTCCTGTCGTCCAACCCCTATATC
AAATTTTTTCTGAAAGAGCCCATTAAAAATCTTTAGATATGAAACAATAG
AGAGAAGAAAAATCATGTAAACATTTGGCCGACATCTCTTTGTGGCCAAA
AATCAGATGAGCTAAGCTATTTTGTACCGTGAAGTCGGGTAACTTGCATC
AGTGGAGGGAAACTTGCATAGCCATCAAATGACTGACTAATCAAAGCAGC
AAAATTTCAAAACAAATGAATTACGCAGCTTTGCTTGCAGCTCTACTCTA
CCATTTTTGTTTTGATTTAACTTTGTATTTTAATGACCAGCCAGGTCATT
CATTTGAGGGCTATGCATGTTAGCCTCCACTGATGCAAATTACCCAATCT
CACGGTATAGACCAGACGGTCGTAATTGATAAAATCGATCATCGATTAAA
ATCGATAGCTAATCGATATTAATCGATGAACTATATCGATTAAAATCCAT
AATCGTTAGCTAATCGATATTCACAATTTTTTCGTCCTCGATTAGCTATC
CATTGCTATCAATCCAATCGATATTATCGATTATTAATTTATGGAGTTAG
TGAATACTGTATTTAAAAAAGAAGTATAATAAAAGAGGTTCTGGTTCATT
TAGTTTTGAAGTGTTGCTAATTAAATCAAACCAATTGAATCTGTTTATTC
AATCCATAATTCGAACCTCGAAAAAGAATCTATTCCTAAATACCTCAGAG
TAAAGCTAAATAAAAAGCTCAAATAGAACACACATACTGATGCTATCTGT
AAGAAAGCTAACAAAATACTTACAAAGAAATATACGTTTTATAAGGGTAT
ACTCTCCCATAGGTAGGTTTCAAAACCCGCAGAAATTAACGTTAAAAGTT
GCTACAGGTTTTTTGTCTTTCGACATCTTCAAAGCCTTGAATTGTAATTG
TTTATGATAAAAAATTGTTGTTTGTACCAAGCTAGTATCATACATACTGA
AGACTTATACAGTTAATTAGTGGACAAAAAGTATTGCCAGAGCCTTATTT
CGAGAACCAATGAAAACCCGGTGTTTTTTGGTGGAAAAGCTAGACTTTCC
TTTTTGACGTTTTACTGACGGTAGCTTCGTCAGCGAAGGGAAAAGATCAG
AATTAGCTTCAATGTGAATGCAAAAGTCTTCAAATGATTTTCCCGAGGTT
AGAAGTACCATAAAAGTCATTTGGAGGATAAACAAATGATTTTATAGCAA
ATTCCTTTTTGACAAAGATTTCGGATAAAGATTTTTGTTGTATATATTTG
AATGAACATAAACATTTACACTACTTTATTTATATTTAGTGATAATGAAC
ATTCATGTTTCATGACTACTTAAATATATAGATAGATTACCCCTTCTGTA
TTGACGATATTTAGAATATTTCCTGGGGGTCGTTGCTTGGAAAATACTGT
GCACACAAGTTTTTTTGCCACTGAAAATGGCTGCCAAATGTTTTGAATCG
ATGTGTCAATAAACGAATACATAACGTCATGAATATCACAAATAGACCTT
CTGCTAGTTTAGATGTCATGTTAAATAAAAACTCCAGCCTCAAAACAATA
GCACATTAATACATAATTAATATAAGTAGATGCATTAACTTTTTCTTGTC
ATTGTTTGGTGCTGGAGTTTTTAATTATTCATATGACATCCTAATTTAGC
AAAAGGTCTATTTCATCGTCCCCTCACTTTTTTTGAATGAAAAGTTTTCA
TACCATAAGATGGCTAGCTAAACTTTTTCATTCTCGGGGAAGCATTCTTA
TCGCCACTTTACTTTTACAATAGACTAACATAAAAAGCATCACACTGGGT
AGGTACAAAAGTAGCTTCAACTTGATAGCCCGTTGTTTGTTGTCTACTCA
TTTTATGCAGCGAAAAATCATCTTTGCTGGTATGTCCAGAAAAAAGCAAC
AACAGATCCCGGAAACGTGCCAGGAATGTTTCCCATGGAAGGAGAATGTT
TAGCCTGTGGGTATTTTTAAAAGCAAACTCAGTCGTAGATTACTTTCTCA
AATATTTAACAGAAAGTTGCTTTGATTTCGATATGGTACAATTATCTGAT
CAGTTGAAAAATGATTGACAACTTCAAACTTAGTCAGAAAAAAAAGACTA
AAAGACTATTGGCTTTACTTTCATAAGTCTTAAAATCATAACTGTTTCTA
ATCCTTGACTTACCTATGAGTCAGAAAGTCAAAATATAACTTGTTTGCAT
ACTATTCGTATATGTAATCACATGATAACGAGTGCTATTCGAATATAATT
GCACGAGTGATTTTTTTGTTATTAATTTTCCGAGTCCGAAAGGACGAGGA
AAATTCGAAACAAAAAAATCACGAGTGCAATTTTCGAATTGTACGAGTTA
TTATGTGATTACGAGCTAATCGCACAATGGCTTTCACTACTTTTTCCCAG
TTAGGAAAGTAAATTACAGAAATTACACTGAGAGTTTTATATTTTTCTCT
TCTCTTTATGTCTTTCTTTTATTGTTGTTTATTGATTTTCTTTCTCACAA
AATAAATTTCGAATGCAATTAAAACGTTCAATGCAAAAAAAATGTAAGAA
AAAACATTAAAATAAACATTGGCGCGGCATTGGAGAGTGTGATTAACGAT
TAATTGCTCTCTACCAAAAGAGCTACCGCAAAGAAAGTAAAGAAAGTACC
GTTGACGGTACTCAGGTTTAGTAAAGAATAGACGGTATATTTTATTATGT
GTCCTATTCCAATTCAATGTTTCCTAATTGTACAATTTCTTTTTCAAAGT
GATCAAATTGATATTAAAAAATTGAAACTGAAAATTACATGATTTTGATT
ATGAAGTACATTTAAGAAAATTCTCCATTATCTAGACTCTGGTCAATCTT
CTTAAAAATTGAAATATTTTTGTTTTGTTGTTATTGTTTTTTTGCTTTCT
TTCAAAGCTGTTCAAACTTGATTTTCCCCATGTGTTTTTCACATGTTAAG
GCAGTTTTTTCCTATAGTGGTTAAAAATGGTGCTTTCCATGTGTTCTAGC
TCAGAAACTGAACGAAACAACCAAGAACTTTTAAATTTATTTTCAGGCGA
TACGTTTCAAACGAGTTGCTGTCGGTCATGGTGGAAAAGGCCGCCCAATT
GGAAGGCGCTTATTTGGCGATGGGTGGAAATGCGCCTGTCATCAGCAAAC
GATTTGCAATCGAAGGATTTACCGTTCACGTTGGTGCCAAAGGATCAGAG
AAAATGCGCAAACAAGTTCATAAAAACATTCACTTTTCACAGGGGTTTGG
GGAGAATGATGATATTCATTTGATTTTGGAGTATAAAGTTGGAGAACAAT
GGGGTCCGTATGTTGTAAATCGGGCTAATCGGTTTATTTTACATTCCGAT
AAAAACAATCCGGAATTAAGATCTTTGGAAAGTTTTATGGAAGTTGTGGA
AAAAGTTCAACCACAAACTGTTTTGATTGGTGGCTTACAGATGCTTGATA
ATTTTAAATTCGAAGAAGGCGTCCGCGAGGAGAGAATGAATAAAATGAGA
GATTGGTTGCGTGGTTTACCAGCTTCCATCAAAATCCATTTCGAAATGGC
TTCATTTGGAGAAGTGGCTATGATGAAGTCACTGATTGAAAATATTGTTC
CTTATGTTGATTCTTTGGGAATGAATGAACAAGAACTTCCAAACATTGAA
AGTATGATTCGAGATGGAACCATCATTGAAGTCGCTGATTCCAATCCACG
AACGGCCACGGTTCTCGATAACCTACGCTCGCTAATTCAAAATGTCGAAC
TTGTTAGTCAGCGCGGTTTATCGCGCGTTCATGTTCACACGTTAGCGTAT
CAAGCCATCTGGACGAAGAAGGGTTCCATGTGGAAGAACACACGTGCTGG
GTGCGCTAAAGCCTCATTGGTAGCTCATCGTCACGTGTGTGGTGTCAAGG
AAATTAATGCTGACAATGCAAAATTATTGATGGATGATTCGTTCTCCTTG
ACCACCAAGAACACTGATAAACGAATCAGCTTCAACGAGCATGCGCCAAT
CTCGTGTTGGGAGGAACGCGAAAACGAGATTTGTATTGCACCTGTTCTCG
TGTGCACCAAGGTGAAACAAACAGCCGGCGGTGGCGATAACATAACACCA
GCAGGTTTGATGCCACAGTTGTAAGATACTTCTTTTTTTTTTGGTCTAAA
GAACATTGGACATTAAATGGTAGAAACTTTAATAAAACCGATTAGAATTT
TATTATTTTAAATAAACAACTTCAAGTTAGCTATCTGACAAGCGGAGATT
CTAATAAGAGAACCAGAGGAACTGAGTGCCAGATATTTATACACACGAGA
GAAGTCCCTTTT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000132_pilon:504206..511767- >MSTRG.15183.1.p1 ID=MSTRG.15183.1.p1|Name=MSTRG.15183.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2898bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:504206..511767- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCGATACGTTTCAAACGAGTTGCTGTCGGTCATGGTGGAAAAGGCCGCCC
AATTGGAAGGCGCTTATTTGGCGATGGGTGGAAATGCGCCTGTCATCAGC
AAACGATTTGCAATCGAAGGATTTACCGTTCACGTTGGTGCCAAAGGATC
AGAGAAAATGCGCAAACAAGTTCATAAAAACATTCACTTTTCACAGGGGT
TTGGGGAGAATGATGATATTCATTTGATTTTGGAGTATAAAGTTGGAGAA
CAATGGGGTCCGTATGTTGTAAATCGGGCTAATCGGTTTATTTTACATTC
CGATAAAAACAATCCGGAATTAAGATCTTTGGAAAGTTTTATGGAAGTTG
TGGAAAAAGTTCAACCACAAACTGTTTTGATTGGTGGCTTACAGATGCTT
GATAATTTTAAATTCGAAGAAGGCGTCCGCGAGGAGAGAATGAATAAAAT
GAGAGATTGGTTGCGTGGTTTACCAGCTTCCATCAAAATCCATTTCGAAA
TGGCTTCATTTGGAGAAGTGGCTATGATGAAGTCACTGATTGAAAATATT
GTTCCTTATGTTGATTCTTTGGGAATGAATGAACAAGAACTTCCAAACAT
TGAAAGTATGATTCGAGATGGAACCATCATTGAAGTCGCTGATTCCAATC
CACGAACGGCCACGGTTCTCGATAACCTACGCTCGCTAATTCAAAATGTC
GAACTTGTTAGTCAGCGCGGTTTATCGCGCGTTCATGTTCACACGTTAGC
GTATCAAGCCATCTGGACGAAGAAGGGTTCCATGTGGAAGAACACACGTG
CTGGGTGCGCTAAAGCCTCATTGGTAGCTCATCGTCACGTGTGTGGTGTC
AAGGAAATTAATGCTGACAATGCAAAATTATTGATGGATGATTCGTTCTC
CTTGACCACCAAGAACACTGATAAACGAATCAGCTTCAACGAGCATGCGC
CAATCTCGTGTTGGGAGGAACGCGAAAACGAGATTTGTATTGCACCTGTT
CTCGTGTGCACCAAGGTGAAACAAACAGCCGGCGGTGGCGATAACATAAC
ACCAGCAGGTTTGATGCCACAGTTGTAAATGGCGACAACTTTGCAAGGCA
ATTCTCAAACTATGTCGACGTTCACAGTTTTAAGACACCTTTTTCTTGCC
ATATCCTTTGGTATTTTTGGATATTACTATTACAACAACTATCTCAATAT
CGAAAGACAACGTGTGAATAATGTTTTACATGGACTCTTACTTGAGGAAC
GTAGTGTGAATCTCTCAACTGAAAAGGCCGTTGCTGTTGGTTTTGGAGCT
TGTGTTGATCTTTTTGTTGATGGAATCCCTCTTGTCAATGCTCTTGGATT
AAAGCCACCTAAAGAAGCAAAATATCACAATAATATTCAATCATTGGAAG
ATGTTGCAGAAATGTTTGCTTTCTTCTTATCCAATGGTGCAGCTGCAGAG
CGATACGTTTCAAACGAGTTGCTGTCGGTCATGGTGGAAAAGGCCGCCCA
ATTGGAAGGCGCTTATTTGGCGATGGGTGGAAATGCGCCTGTCATCAGCA
AACGATTTGCAATCGAAGGATTTACCGTTCACGTTGGTGCCAAAGGATCA
GAGAAAATGCGCAAACAAGTTCATAAAAACATTCACTTTTCACAGGGGTT
TGGGGAGAATGATGATATTCATTTGATTTTGGAGTATAAAGTTGGAGAAC
AATGGGGTCCGTATGTTGTAAATCGGGCTAATCGGTTTATTTTACATTCC
GATAAAAACAATCCGGAATTAAGATCTTTGGAAAGTTTTATGGAAGTTGT
GGAAAAAGTTCAACCACAAACTGTTTTGATTGGTGGCTTACAGATGCTTG
ATAATTTTAAATTCGAAGAAGGCGTCCGCGAGGAGAGAATGAATAAAATG
AGAGATTGGTTGCGTGGTTTACCAGCTTCCATCAAAATCCATTTCGAAAT
GGCTTCATTTGGAGAAGTGGCTATGATGAAGTCACTGATTGAAAATATTG
TTCCTTATGTTGATTCTTTGGGAATGAATGAACAAGAACTTCCAAACATT
GAAAGTATGATTCGAGATGGAACCATCATTGAAGTCGCTGATTCCAATCC
ACGAACGGCCACGGTTCTCGATAACCTACGCTCGCTAATTCAAAATGTCG
AACTTGTTAGTCAGCGCGGTTTATCGCGCGTTCATGTTCACACGTTAGCG
TATCAAGCCATCTGGACGAAGAAGGGTTCCATGTGGAAGAACACACGTGC
TGGGTGCGCTAAAGCCTCATTGGTAGCTCATCGTCACGTGTGTGGTGTCA
AGGAAATTAATGCTGACAATGCAAAATTATTGATGGATGATTCGTTCTCC
TTGACCACCAAGAACACTGATAAACGAATCAGCTTCAACGAGCATGCGCC
AATCTCGTGTTGGGAGGAACGCGAAAACGAGATTTGTATTGCACCTGTTC
TCGTGTGCACCAAGGTGAAACAAACAGCCGGCGGTGGCGATAACATAACA
CCAGCAGGTTTGATGCCACAGTTGTAAATGGCGACAACTTTGCAAGGCAA
TTCTCAAACTATGTCGACGTTCACAGTTTTAAGACACCTTTTTCTTGCCA
TATCCTTTGGTATTTTTGGATATTACTATTACAACAACTATCTCAATATC
GAAAGACAACGTGTGAATAATGTTTTACATGGACTCTTACTTGAGGAACG
TAGTGTGAATCTCTCAACTGAAAAGGCCGTTGCTGTTGGTTTTGGAGCTT
GTGTTGATCTTTTTGTTGATGGAATCCCTCTTGTCAATGCTCTTGGATTA
AAGCCACCTAAAGAAGCAAAATATCACAATAATATTCAATCATTGGAAGA
TGTTGCAGAAATGTTTGCTTTCTTCTTATCCAATGGTGCAGCTGCAGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000132_pilon | genome | sc0000132_pilon:504206..511767 - |
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