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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000132_pilon:406768..413755+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15176.1.p1 ID=MSTRG.15176.1.p1|Name=MSTRG.15176.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6988bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:406768..413755+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACTCCATATAGTCATTTGTATTTGACAAATAATTTGGAGATATGTCCAGG
CTAGCTAGCACTACTTTGTATAGTGATCTGAAGtatgcaaaaaaattaag
atggaGGAGGAAAACTGGTATATTCATATTgaaagtttatcgtggcttgg
atcgcGAGATTTACgtgagattcttctcccatcatcgggcaaggTGGAGG
ATATGTTTTCTACTCTATTTGTACTAAGACCTTCTGACTACCCATAATTA
CCAAGTGTAGCTGACACATTTaccagattttaaaattttaaaagcttaTT
AAGTTTTCTAGAATCAATAATTTTTGGTAAGAATCGGGTTTTTTATTTCT
AAGTTAGATTAGATTTAGAGTCTTATAGTTCGCatctgtcaagtcgcagt
gcCTGTCtgcgccgtgattcctactccttcgggAGTAGAACCCATTCTGA
AagcattcggagggctcatatctataTCTATAATTGCTCTAGTTAAAAAA
TAGTGTAAAATGTTCCATGTTGAGTCGAGAAATAATTGTTTGGTTATTAT
TTAGCATAAAATAATGAAGAGAGCTGAAATATAATATCACCTGTCCTTca
tatcaactttttttgtttcGTGACTCTTATACTGCTCAGAATGTCTATTT
ATTTTGCTGGTATATTGGTACAATGATATTGGAGAAGAATATGAAAAATC
ACTCCATAGAATTTGAATCATTTGTTGATTGTTTGTTTTGGAGTTCAGGT
TGAAAATCAAACGAACAGGAAGCCAAGATTGAGAAGCTAgggttttttac
ttttttaaacctCATTACTGGATTGGTCATTAGCATAGAACCATAGCTAT
ACTGTGATCGGCCTGCTATATTGTGATCAGAGTAAATACTTCACTTGAAT
gcgcgtttttttataagaacaaactaaataagaacataagccttcgatag
ccaaaatcttataaacaagttaagaacattttaaggtttatGATCAATGT
TTGCCATattgataaaaagtaaaaaacaacaacatttaaaattagcaaaa
gcttttcggtctttccatcatcagtgctatagaatagtaaaattgaaaat
caaaaaagttacaaatttattcgtctaaaatcattaaaaagtgataaaag
aaagctattaaaaatgaaaagaggCATTCTCACGGGATATGTGAATGTCT
CTTGTCTATTAAAATCTATGTTACACCATTTCTAAAAAGAATTAAACGAG
CAGAGTCGAGTTGGTCATTTAGACGTGGTCTCTTAAGGGCAATTAATGCG
GCttccagattttttcttaaTCGGGTATTCGTGGGAGCGTTTAAGATTAT
TTTCCATAAGAATTCGTGGTCAGGGTGGTTTTTGAGATGCTTTGCAGGTT
CAGAGTTGTGCTCAAAGTTATTATGTTCTGACCACCTGGTTTCAACATTA
CGTTGGGTTTCGCCGATATAATTCAATCCACAAGAACACGTGCCTTCGTA
AATTTTACACGCTGGGTGTGGATTTTTATCCTTCGAGTTAAATAACTGTT
TTACTTTCTTTGTTGCCCATTTTAtagcaaaatcaattttgtcgttggta
aaaaacttcaatttttcaatgaatCGCTTTACAAGTTGTTCATTGGTGTC
TGAAAATGGAACCTCAATGAGTATGAATTtgcgtttttctttgaaaagga
aATCAGGTATGATGCAATCATTAGTTAATTTcgtttcaaaatctttgatg
aCGCTTTCGGTGAATCGAATTGGGTAACCTGCTTCTCTAAACTTTTCTCT
GATAATTTCCTTTTCTTTATTATAATTGTTACTGATTCTATATGATCGAT
TTAGGTCACCATTGATCGTATTACGTTTTATACCTTTTAGGTATCTTAGA
AGACCAGTGTGTGGGATGCTTGTTCTGTTTCCTGTGTACAGATGTTATAA
CTTGGCCATTTATCAGTATTATATCAGTGTCCAGAAACTTAGTTGGTTGG
GTCTCGATTGTAAATCGAATATTTCGGTGGTAATTGTTCATTGATTGCAA
TAAGTAATCTGGTTCGTTAATCTTTCTACGTGTGATAATGTCGTCAACAT
ATCTCTTGTAGAAAGGTGGTTTGATCGATTTGACAATTTCGGTCTCCATC
TTGGTGAGGAAGATGTTGGCAAGTGTTACCGATAGTGGTCCACCCATTGT
ACAACCGTCAGTTTGCTTGAAAAAACACGATTGGAAGATGAACGTACTAT
CAGCAgataacttaaaaaaagtcGTTTCATTACCAAACGAGTGCATAGTA
TTGGCAACTTTTTATGTACATATATTTGATCTAGGATATAATCAACTGTA
TCATTTATTGGAACGTTTGTAAATAAAGATTCTACATCGTACGAGACATA
TTCTTCGTCTAATGTGATCGGTGACTGATTTCGAATCATTTCTGGAAAAT
CTTGTGTGTTATTTATTATATAATCATTACATGCGTATAACGGTTTTAGG
TATTGTGAAATTACTTGTGCTGCATTATACATGCAAGTGCCCGTTTGAGC
GATAATCGGTCTAAACTTTATAGATTCGACGGTTATGTCAGAAATATTTG
TAAATTTATGAGTTTTTGCTGTACCATAGAGCTTAGCTGGAGCATTTGAA
GTTGGACGCATCTTTTCATAGTGCTCATACTTGCGGAAATTTCGATAcag
aaaatcttgaaaacgTTTCAAATCAATTAAGGTGTTATCGTCTGAGTGTT
TGTAAACTCCTTGATCAATACCTTCATTTATCATAGCCTGTAGTTTATTT
ACATAGTCGACTTTGTTCATAACCACAACGGACGAGTCTTTGTCTCCTGG
TATGATAACAATACTATCATTATTGATGAGTCTCTTTAAATTAGTGTAAG
TGTAATCTTTTGAATCATATATATTTTTCGTGAACATATCACAGTACGCT
CGTAAAAGTTCATGAAACTCTTCTTTTTGTTCGTTCGGTACGTCTTTATC
GGTCGATTGTGCTAAGGATTCGAGGTTTGCAGCTAAATTCTTTTTCACAT
GTTTATTTTTATCGATGAAACTCTGATCTAACCCATAACTTAACTGCATC
AGTTCTTTCTCAGTTAGTTCTATTGATGATAAATTTATCACAGGAATTTT
ATATGGTTTGAAATTGAACGGGTATTTTGGGCGCAATTCGGATATTTTCT
TTAGTTTGGTCGTGAAGGATGAAGAGCGGATATCTTTAGATGTGTGTAAG
ATTCTTCGGTACTTCAGTCACCGATCACATTAGACGAAGAATATGTCTCG
TACGATGTAGAATCTTTATTTACAAACGTTCCAATAAATGATACAGTTGA
TTATATCCTAGATCAAATATATGTACATAAAAAGTTGCCAATACTATGCA
CTCGTTTGGTAATGAAACgactttttttaagttatcTGCTGATAGTACGT
TCATCTTCCAATCGTGTTTTTTCAAGCAAACTGACGGTTGTACAATGGGT
GGACCACTATCGGTAACACTTGCCAACATCTTCCTCACCAAGATGGAGAC
CGAAATTGTCAAATCGATCAAACCACCTTTCTACAAGAGATATGTTGACG
ACATTATCACACGTAGAAAGATTAACGAACCAGATTACTTATTGCAATCA
ATGAACAATTACCACCGAAATATTCGATTTACAATCGAGACCCAACCAAC
TAAGTTTCTGGACACTGATATAATACTGATAAATGGCCAAGTTATAACAT
CTGTACACAGGAAACAGAACAAGCATCCCACACACTGGTCTTCTAAGATA
CCTAAAAGGTATAAAACGTAATACGATCAATGGTGACCTAAATCGATCAT
ATAGAATCagtaacaataataataaagaaaaggAAATTATCAGAGAAAAG
TTTAGAGAAGCAGGTTACCCAATTCGATTCACCGAAAGCGtcatcaaaga
ttttgaaacgAAATTAACTAATGATTGCATCATACCTGATttccttttca
aagaaaaacgcaAATTCATACTCATTGAGGTTCCATTTTCAGACACCAAT
GAACAACTTGCAAAGCGattcattgaaaaattgaagttttttaccaacga
caaaattgattttgctaTAAAATGGGCAACAAAGAAAGTAAAACAGTTAT
TTAACTCGAAGGATAAAAATCCACACCCAGCGTGTAAAATTTACGAAGGC
ACGTGTTCTTGTGGATTGAATTATATCGGCGAAACCCAACGTAATGTTGA
AACCAGGTGGTCAGAACATAATAACTTTGAGCACAACTCTGAACCTGCAA
AGCATCTCAAAAACCACCCTGACCACGAATTCTTATGGAAAATAATCTTA
AACGCTCCCACGAATACCCGAttaagaaaaaatctggaaGCCGCATTAAT
TGCCCTTAAGAGACCACGTCTAAATGACCAACTCGACTCTGCTCGTTTAA
TTCTTTTTAGAAATGGTGTAACATAGATTTTAATAGACAAGAGACATTCA
CATATCCCGTGAGAATGcctcttttcatttttaatagctttcttttatca
ctttttaatgattttagacgaataaatttgtaacttttttgattttcaat
tttactattctatagcactgatgatggaaagaccgaaaagcttttgctaa
ttttaaatgttgttgttttttactttttaacattttaaggctttgtggac
tctaaaacacccaatttcttaggaaaatggaccaaaatactcataaaatg
gtgtaattaagaacatgttaagaagatttttaggcttaaaactcaaaaag
ttaagaacatttgaaggcttcaaaaattttggatgttcttataaaaatcg
tgTACTTCGAGAAATGGACAAGCTTCGAGTTGATTAGAGTAAAATCTtcc
tacacccctgtctcggtgACCATTAGTATAGTAGGAAGTTTATAATTTAT
CAGTCTATGAAGGGTATTTTAAGTTGACAAAGTTCAACGGGGATTTTAAA
CCAAGATCAACCATAATTTGTCATTATTTATCATCATTCTTCAATTTATA
CTTTGTGTACGCCAAAACCAATAACAGTGCTCAATGTTAATGATAACAGA
GTTTTATACTTGTTTGAGTAAAGAGAacgatttaagttaatttcatactc
aaagtttcttGCTATCCACGcaggatggcaatcttcagtgaaaatcTTAA
ACCATTCTTCAATTTATTTTAGCTATAATGGGATATATAAAAGAATCAGC
AATGAACTGTACAGAAATTGTTTTCACGAAAACAGACACGTACCGCACCA
TACAAATCGTcgttttgacatttttcttgTCCATCGTCATGCTTaataac
attttggccatctatgcaacccaaaaatcaatatcaacgaaatattgtat
ttttgctcaactttacaatatttcatacATCAGTAACATCATGGCTGCTT
TTTCATTGTACGGTGGCAGTTTGTTTATAACCGATTACCATGGCGACGCA
TTCGGCTGCCGGCAATTACCACTTGATCGATATTTCTTTTTATGTTTTGG
AATGTCGAATAACGTTTTGGTTTTGTTGCTAAATACTTATTTAAGACGTA
AATCGTTGATGGATCCTCTCGCAAGTTGTGATGTGCCAAGAAGCAAGTGG
AAAGCTTTCCTAAAGTTCCTCGTCCCATTCTTCCTAGTCTCGTTAACGCT
GTCAGCGATGAATATTATATTCCAATATGAAGTCCAAATGAATTTCTACA
TTGGAGTTGCAGTTGGGTTTTACGTACCTCTCATGATAGTTGTTATCGTG
TTAAATATACACCTTACATACTTCTTAAACGAAAGTAAAAAGATTGCCGA
AAATATTAATCAACAATCGTGGCGTAACCTAATGAAAGCTCGTAAAATAT
TATTAATGATCGTTAAACTACAATCTTTTTATACCTTTTTATGGATTATC
TTGGTCATTTTGATGCATACCATTGGTATAAAGAACGAAatcaattttgt
tattcttGAATGGCTTATGCGTGTAGTATACGGACTAAGTTTTGTATTAG
AGGCTAAAATTTTAATCCGCCGTGACAAAGTCGTTCAAAAGGTACTTCTG
AAAGCATTTCATAAAATGTCGAAATTTTCGAGGGATGTTTCGTCAACGAT
TAGTCGTTCAGCCACAAGAAGCAGTCAAAGCAGTAAAAGTAAACAGAAAA
CTGAATCAAGCAGCATTGAAATTCATATGGACCCGGTGGTTTTAGGATCT
ACTTCTTCATAAAGAACCctaaaaactttgtaaactaCTTTTCAGACGAT
ACTATCGTTTGTTAGAGGGATAGCAAACGCGGGAAATATATATTCGcaaa
ttttcagccataatggcggtatacgggaacaaaacaaaaatagtgGTGGT
AGAGGTTGGAACGAACGCTTACAATGTAAACACCTCCGCAACTGCTTACT
CCGCCCCGGGCTAAACTCCACTTTCAAATGTATCCCCACCTCTTAAATTA
TTCTATTTTGAGTGACCTTGTGTAACAACTTATATATTGTATATACAATG
TAAGATGATTGCTATGTATGTTTCTGAGTCATACACGATTCTCGAGAATC
AAATTGTTGCgacccttattttcaaatataatatttACTATGTAGAGTGC
AAACCCATTAATCATTATCTAACGATACATCTTGGCAATACTATGGGTTA
GTTTAAGGAATAATTGAAAATGTGAACTAGATTTTATGACTCTATACTTA
TTACTATGATTTCTTAAGcaataaatgtttttattattttaaataagttt
tgaaattaaGAATGACTTTGAATATTCTTGAATGGATGTGCAtattatgg
cgcgccaaagcggaaataaatactatctttttaaaacaatactatcttcg
tttaaaacatactatctttgttgtaaacatactatcttcgtttaaaacat
actatcttttttaaaacatactattttttgcttaaaaa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000132_pilon:406768..413755+ >MSTRG.15176.1.p1 ID=MSTRG.15176.1.p1|Name=MSTRG.15176.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1035bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:406768..413755+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGATATATAAAAGAATCAGCAATGAACTGTACAGAAATTGTTTTCAC
GAAAACAGACACGTACCGCACCATACAAATCGTcgttttgacatttttct
tgTCCATCGTCATGCTTaataacattttggccatctatgcaacccaaaaa
tcaatatcaacgaaatattgtatttttgctcaactttacaatatttcata
cATCAGTAACATCATGGCTGCTTTTTCATTGTACGGTGGCAGTTTGTTTA
TAACCGATTACCATGGCGACGCATTCGGCTGCCGGCAATTACCACTTGAT
CGATATTTCTTTTTATGTTTTGGAATGTCGAATAACGTTTTGGTTTTGTT
GCTAAATACTTATTTAAGACGTAAATCGTTGATGGATCCTCTCGCAAGTT
GTGATGTGCCAAGAAGCAAGTGGAAAGCTTTCCTAAAGTTCCTCGTCCCA
TTCTTCCTAGTCTCGTTAACGCTGTCAGCGATGAATATTATATTCCAATA
TGAAGTCCAAATGAATTTCTACATTGGAGTTGCAGTTGGGTTTTACGTAC
CTCTCATGATAGTTGTTATCGTGTTAAATATACACCTTACATACTTCTTA
AACGAAAGTAAAAAGATTGCCGAAAATATTAATCAACAATCGTGGCGTAA
CCTAATGAAAGCTCGTAAAATATTATTAATGATCGTTAAACTACAATCTT
TTTATACCTTTTTATGGATTATCTTGGTCATTTTGATGCATACCATTGGT
ATAAAGAACGAAatcaattttgttattcttGAATGGCTTATGCGTGTAGT
ATACGGACTAAGTTTTGTATTAGAGGCTAAAATTTTAATCCGCCGTGACA
AAGTCGTTCAAAAGGTACTTCTGAAAGCATTTCATAAAATGTCGAAATTT
TCGAGGGATGTTTCGTCAACGATTAGTCGTTCAGCCACAAGAAGCAGTCA
AAGCAGTAAAAGTAAACAGAAAACTGAATCAAGCAGCATTGAAATTCATA
TGGACCCGGTGGTTTTAGGATCTACTTCTTCATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000132_pilon | genome | sc0000132_pilon:406768..413755 + |
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