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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000132_pilon:349430..362759+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15168.3.p1 ID=MSTRG.15168.3.p1|Name=MSTRG.15168.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13330bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:349430..362759+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGTTTAAAATGACAAATATATCACCAAATGAAAAAACTCCAATGCTAGAT
AAGTCAAGTGCcttgaaattacaaaatctggACAGTGATGGAAAAAAGGA
TGATGGCCTTTTTCCAAATAACCCATTCAGCGAGAAATTTGACAAACAAT
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aaaaaaCATTCGGAATTTTCATTGTGGAATAACCTTAGAGGTAGTTCAGC
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TCTTCATCGTGTCCATGACTTGTGCTTTCTTCTTGAAAGGTACGGCTCAA
AGAATCAGTTATTTTCCATTGAAGTATTTTTGCGCGgggttttaaaacaa
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ATTAAGttcttttggaaaataaattttgtcctTTATGTTGACGTCAATTT
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GTATTGCAATTTATGGAAACTCCTGGAAAGTCGCAGGAAACTTACTTGAA
GTAAGTAGACGTGAAAAGCAATTGTTCCTCAATTTAATATTAAACACTTT
TAAGTGTCCTCGAACTAAGGATTTAGTTACCTTCGATTTAGAACTTATAA
ATCAcggagacacagatagaacatcTATTGACAACGAAAACAATAGCGTC
ATAGTTCCAGCCACTTCTAATACTAATTGATTCATTAGGGAGAAGATGAA
TTATCTGACATTCACCAACCTTGCAGATTTCATTGGTATAAGCCTGGTTA
TTTCACTTCTACCCATCAAATTTGGCACCGTTCATCTGTTATCAAAAAAG
AACCCAAGTGAACTTGAATGCTATGTAGCAGCTGCAACTTATTTCATTAA
CGTTCTTCgaatcttcaaatatttcccTGTCATCAGGTATGTGTTATATT
CGGTTCACGATAAATGCGTAATATGGAAATGTTACACTAACATGTGTTGT
CACATGAACATTTTAACGCAATTCTTTGTCATTTTATAGTAGAAACGGTC
CATGTATGCTACTCCATTTTCTTGTTATTACCCTTCCTCTTTCTGAACCA
TATTTGTAACTCGAAACTGCTTGAATAAATAAAGTTCGAGTACCTTTCTT
TGCTCAAGTCACAAAGTTCGAGTTATCTTCCGAGTAAGATAGTCGGGTAG
AATCGATTCGAATAAAAGACGTAACTTGACAATAGTGTTTTTTGTTTCTC
TCAAATTGTAGCCTTTTGCTAAGAAATCGCACTTAACTTATTCTTCTTCT
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GTGATATTCCACAGTTCTTGATCGTTTACATCGTTGTCGCTGCTGCTTTT
CTTGGAAGTGTCATCCTTGCGTTGACTGCTACTAAAGAAGGATTTGACAA
TGCAGAGTACGAAACCTTTTTGTTATGAAACTTCTTCCATTTGGGACCTT
TCGATTTCCAGGCCTTCGATTAGCAAATTTCACCAATATTATGTCTTTTG
AATTTCTTAGAGAGAGAAATTCGCAAAAGATTGTGCCCGTGAGAAATTCG
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TCAAAGACTTGTTGCTACGATACTTCAACGTTGTTAGAAATAATAAATGG
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ACATATTGCATGTGAGGATGTCGTTTGAAGTAATTATTTCGTTTGAAAAC
GAGGTCCGTAGGTGTTGATTTATCTCGAGAAGTGTGTATTTTAGTCCTTT
AAGAATTTAATTAAGTCAAAGAACAACCTATCCAATTTTTATCACTAAAA
ATATCTATTGATAACATCTTTGGTATTATAGTTATGTGAATTGTATTTTC
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CTTTCATCGTCTACGTTCGTTTGTTCAGCGATCGGCACTCTTATCACTTT
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AAGATGAGATTTCCACTTCGCCAAAATGTAGGTTCAAAGTTCTTACCCCG
CTGTAAAGATTTTCCTTCCAAATTGCAAGATGGACTTATACTACATTCCG
ATCCCAAAACAAAATTAATATCCGTGgaaaattttcgtattttttaaatt
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TAAATAGGCCTCGATTAGTCTCGATGACCCAAAACAAtatattacaataa
aaatatcaCACTCCCACGCACGAGGGGAGGTCACGTTCGTcgatgaattt
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TTTTTGTTTACAACGACGAGTTCGGCTCCGCGAACTTTACCATCTCTTCC
TCGTAACAATTTACTCACTCTACCTTTCCTCCAATCATTACGTTTAACAT
TTTCCTCATTGATTAAAACGATATCATTCTCGTTGATCATTTCGCTTGAG
TTCTTTCGTGCAAGTTTCTTGTGTGTTTCTCTCAACTCGAGTAAGTATTC
TGTTTTCCAACGTTTCCAAAAGTGTTCAATTGCTTGCTTCGTGTTTTCTG
ACAACTCAAAACTGTCACTGTTGTCGTTTTTTGTATTTGTGTTACGTCCG
AGACGTTTACCGTATAATAAATGATTCGGGGTTAGAGGTTCTTCTGTCAA
TTCGTCATAGATGAAGGTTAAAGGACGGTTGTTGATTGTTcgttcaattt
caatcaataacGAAAGGAATTCATCGTACTTCAGCGTTTTGTTGTTCAAA
GCTTTATTCAAACACGTTTTCACGGATTTCACAAGTCTCTCTGTAAACCC
ATTAAACCAAGGTGCTTTCTCGAGGCTAAACTTCCATCGAATTTGACAAT
TTGTAACAAAGTTTTGTACGTTTTCTGCAGTGAACGTTGAACCTTTGTCT
GAAAAGATTTCTTCTGGGATTCCTCTGCGATTCATAAATCTCCTTAATAC
TTCAATGCACGACTCTCCACTGTAGTCTGTAGCAATGTCTAAATATACAG
CCCGACTGGCTTGACATGTGATCAATGAAATCCATACCTTGaacttttct
ttcgttttgtCGAATACATTATACACCAAATATGGACCGCAATAATCGAT
TCCAATGTTCTGGAAAGCGGCACCAACTTGTAGTCTAGACTTTGGTAAAT
CGTAAGATTCTGGATAACGATAAGCTTTACCACCATGTTTCTTGCAAATC
GTACATTTGTAGATAAAATGACGGACGCGTTGACGCAATCTTGGAATTTG
AAATTGGGATCGTAGTTCGTTCAAAGTTTCACGTTGGCCATTATGCATTA
CCTTGTCGTGGGCTTGCTTGATCAACAAATCAACAAGTGGACTGTTCGTA
GGTAACCATATTGGATGCTTTGCGTCAAAGGGAATTGGAGCATTGTTCAA
TCTTCCCTTCCATCTGTACACTTCCCCTCCaaggaaaagatttttcttca
tttcgtcTGGAATACCTCTTTGGGCATCCAATAACCATTTCTTCTTGGCT
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atttatttgtttgttgtttttatttttccaacaaCGTATGTTCTCCACAA
ATTTGAAGACATACCCAGTAACACGTAACAATTGTTCAAAAGACCGAAAT
CTTTGAACGTCAATAATTTCACCAAGGTTGGACTGAGCTTCAGGTATAGT
TATCCACTCAGTCCCATCACTAATATTGAATGAAAGGGTATCCTTCTCCT
CAGGTATATTTAGAAGATTAGGACCCTTGTTGACACCATCACTAAAAGGT
TTGAGGTTTGTTCCCGTCTTCTCAGGTATAGTTAGAGGATCAGGGACCTC
AGAAAATTTGTCACCGACTTTCAAACGAGGCCACTGAGATTCAGGCATAA
TTAGAAACTCAGGACCATAAAACCATAATTTACAACCAGCTAGACGTGCT
GGCTTAGACCCCCGGGACGCAATGTCCGAAGGATTTTGCTTTGTAGCAAC
TAATTTCAGTTCAATCGAGAGAGATTCAAAATTTCGTCTAATCTCATcag
aaatattcttaatataTCTGTCTTGTTTTCTCGAAGTTTCAATGTTCTTG
ACCCAACAGTAAGCAACACTACTGTCAGTCCATacagtaaatttttcaaa
ttcaaagttcatTTCTAAGTGTCTCTTAACAACATTCATGAGACGTGATA
CAATAAGTATAGCTACCAACTCCATTCTGGGTGTCGTCAACTTCTGGTCA
TCAGGTTTGGTTTTTGATTTCGTCTTGATTGGATTCACGTGTGACTTTGA
TGTGACGAGGCTTGTCTTGATATCACCATCCTTTGATACGATTCGTGTGT
AGATACAGCAACCATGTGCGTCGTCAGAAGCATCTGAGAAGCCATGTAAC
TGAATTTCCTTGACATTTTGTTTAACACTCGAATAAGCTCTTTCGACTCT
GATCTCTTGTGTATACTCAAAgtctttcaccaaattttgccattcacaAA
GCAAATCACCGTCGATGGGCGTGTCCCAATCAATTTTACTTAGACACAAT
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TCAAACTCGCTAAGCTTTTGAGTTGGAAACAAAGTTCGTCAGATTCTTTG
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GGTTTCTCCGTATTTCGATTGGAGTTTGGATTCAAGTTCCTTCGAGTTGG
ATTGGAATTTTCTCAGGTTAAACGATGCTTTCGATAAATGCTCTTTCGTT
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TTGCTGTTCTGATATGATGTTGTAGGGTGGCATTCAAAACGAAGGGCGAT
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ATCTAGTAAGGTCTCTCTGTTCGTTGTTTAGTTTTATGTGTAGAAAAGCC
TTTTCAATATCACCGACAATGGCGACTTTGTCTGTTCGAAAAcgtaacaa
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ttaaagaaaataactcATTGTTATTTGCCTTTGCACTCGCGTCATAAACA
ATGCGTAcctttgttgttgatttttctgGTTTGATAACAGCGTGGTGCGG
AATGTAATGTGTTTTTCCAACCTCTTGATCATTTGGCGCTTTTTCGATAA
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tgttgattgttttcgaagctttttgataaacattgaagTCTTTTTCTACA
CAGTTCATAATTATCTCCTAGCAACCAATCCTCCTCTTTGACTGGATATG
TTGCTTCATACATTTTCTCTTTCTCGTTAAATTTTAATGAGTTCTCAAAC
TCCTTCACAAATTCACGTTTTTCGGTATCAAAGTTTTCACATTTTATTCC
AAGACTCTCCAAGTCCCAGAACTTATCAACGGTTTCAGATAATCGATCAT
TTTCACTAATGACGGCTTTCAAAAcatgtgagaaaaaaattccggacgaa
atcttttcttttaaatcagCAGGACCACTCAAAACGTATCCCAACGACGA
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GTATAAAATCCCAATAAAAGTTtgagccaatcaaaatatcaatatcGATG
GCTTTTTCATGATTTGGATCTGCCAGTTTTAAACCTTTCAAATGTTCAAA
ACGTTTTTGACATTCGACTGTGTTCTGTCTCGAAACGGGTTGACTGATTT
CGGATACGTAGGCTTGCACAGGAACCTGTCCTTTCGAAGTTTTCACGTTA
AATTCGACCAAGGGTAAGGTTTTGACggttttgttgtttccgaaCGATTG
GATACAAAGTTCCTTTTTTCCAATTTGCTTTAGATTCAGCTTTCGACTCA
ATGTGGGTGTAACATAACTCAACTGACTACCAGGGTCAAAGAAAATTCTA
CTTTCGGACGAACGATTTTTCTCGACATTTTCGATTTTGGCTTTGGCTGT
TTGTAGCAAAACGGTACACGAACTGCTTGCTAAATTCGACTGAGTATCTT
CTGGCGTATCTTCCTCTTTCTTGAAGGTTTTACAAATACTGCTATGATGA
TTTTTTCGACAATGATAACAACTGCGCATCGATCTACAACTTTTACTATC
ATGTCCTATTTTCAAGCACTTGAAACATCGTTTCTGTTTGATGAGAAAAT
CCTTTCGACTTTCTGGTTTCGATATCTTGGAACATTGATAGGCTTTGTGT
GAAGCGTTTCCACAGTAAACGCATGGAAAGGTACGGAACGGTTGTCTTCT
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CACCTTCATTCTCTGTAAGAAGGACCTTTTCTCGAGCTTCGACTTCTTGT
TGTAAGGCTTCGAGTAACTTATCGATTGCCCATACATCCTTTCCGAACTT
TCTAGTCaacaacaattttatttcttgTGGCAATTTCGACATAATAACTG
GTGCGAGCATAGGGCCGTAACGTTTCTCCTCCAGTCCGATTCCACGAAGA
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ATCGATAAAGTTTGATGTTGTTTCTAAGTTTAACAATTTATTCATATGCG
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GCAATATCGTAATTTTCGTTAGATAATGTTATACCTTGGATGCAAGATTC
CGCTTCTCCTTCAAGTAAACTGGTGAGGTATGTCATTTTTTCGACGTTGG
TCATATCATCTCTCTGATGAACGGCACAATCAAATGtatcgaaaaatgtt
ttccatTTCAACGGATCTCCATCGTAGGGTTTCAAACTCAATTTGGGTAG
ACGAATATCAGCTTTCCGCTGTTTCTCTCGGGTACTTGTGACACTACTAT
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TATTCCCATTTGCTCTTCATCGTCTAATTCATCCACGATGTTATCCGTAA
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CTCAACATCAaccatttttcaacttttattatgtattttcttgtttcgac
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ATTCATCTCTCTTCCACCTCGTTGAGACAGAGTTGTTTTAATTCCTTTCT
CATAGAATTGGTGTTATTATTCTGTTACAATTCAACATGTTAGCTTGTAT
CCTAATTCTTGCCAATGTTTTGATCGCCCACTTGTCGAACGTCTACACGG
ACCAACACGCACGTGCTAAAGTCCAATGTGATGTCGATCGGGCCGTTCTT
ATAACTAAGGTTGAGAATAGCTGGTTCAAATCTATGGTGAGTTTTGTTTA
TTTCGAGTCTATGACAACGTGAAATCGGgaattcaaataaaagaaaactt
taaattcttttcatagaattcaagttaaattttttggtttaaaGCAATGC
TGTCTTGAGTCTTGAAGTGGTTTTATCTTTTAATAATAGAGGAATATTTT
GCCTTTAAAATTCTTCGCTATTCTAAATAATGCTTATTTTGAGTATGTCT
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AAAAgatataaaagatatattttctttattttctttttagagtGCACGAT
TGAAATTTTACGCCGATGGCGACTATTACAGTAATTACAACGAAATCGCA
GGTTTGTAGCTAAGGAAATCACTAaggaaagaaaatcaaattcaaaaaaa
tgttactCTTTTACCGAAAGGTGCTGTGTGAAGTGATACTATAACAAATT
AGATTAGGATAACATCACTAAGTAGGTCCATTCGGATTAACTTTTACAAG
ATTAAATTTCAcgtgccaaaaaaaaattccagatttaattttgtaaattA
GCCTTTTGGAAAGTTCTCTACTGATTCAATTTTGTCTTTGGGCCTGATGT
CAACCCTGGTTTTTATTTCATGAGTCAGCTATCACATGTAATTTCACGAG
ATTTATTTCTgtgaaaaaggcAaaaaaaattgcgaaatttaatctcttGA
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AATATATAGAATGCATAGCTCAATGGAAGAGTGATCATCCATGTAAAGAT
GACGTCAAAGAAAGCAGCACAGAAAAGCTCGATAAAATCATAGGTATAAA
ATCTAGTTTTAGTGAAGTTCGGTAAGACTCGTACAAGGAAATTGTGTAAA
ACAAGCTCAGAGATATCTGGAAATCAAATCCAATCTCCAAAACTAGTTCA
AGCAgatctttcAaaacttttcattcAGTGGACTCTCTTCAAGGAACCAA
GAATCCTCTTCCAATTAGACAAAGATTCGGATTGCAGATATTATTTAACG
CCCCTGTGTCACAGACCCGTTAGGACCCCAGCCCCAATGGAAAAttcggc
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AATTGACTTGGATTTCATCCcctatcAaaattcaaaatAaaaaaaagcac
tCCAAAACCATCCCCACTTACGATTtttccccattgggatttcgatagAa
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gtgttATTTAGTACTACTTTcaagctgaggggaccaatgttctggttcga
ataacagaaagattcgaattatggaggTATGAAATAGAGAGAGAGTTAAC
TGTCTATTGATTTTGTGATTATCACTACAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000132_pilon:349430..362759+ >MSTRG.15168.3.p1 ID=MSTRG.15168.3.p1|Name=MSTRG.15168.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=10560bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:349430..362759+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCAAGAAATAATTGAACACCCTGCTGTAAGATTACTAACCCAACGGAA
ATGGAGGCTATACGGAAGACGTCTTGTCGGgctttatatTGGATTTTATT
TGTTCTTCATCGTGTCCATGACTTGTGCTTTCTTCTTGAAAGGTGAAAGC
GGTGATAGATCGATATACAAGACAACCAAAGACAAAATTCGTGGTGTATT
CGAAGTTATCACTTTTATTATAGCCTGTATCTATTTTATCATTGAAATCG
TGGAGCTGATCAAGGAGAAGATGAATTATCTGACATTCACCAACCTTGCA
GATTTCATTGGTATAAGCCTGGTTATTTCACTTCTACCCATCAAATTTGG
CACCGTTCATCTGTTATCAAAAAAGAACCCAAGTGAACTTGAATGCTATG
TAGCAGCTGCAACTTATTTCATTAACGTTCTTCgaatcttcaaatatttc
ccTGTCATCAGATATGTTGGTGTTCATGCGAAGTTGATTTCACGATTGTT
GCGACGTGATATTCCACAGTTCTTGATCGTTTACATCGTTGTCGCTGCTG
CTTTTCTTGGAAGTGTCATCCTTGCGTTGACTGCTACTAAAGAAGGATTT
GACAATGCAGATATTTCAACATGGGGAGCTTTGTTATCGGAAGTCAGAGC
CCTGACTGAGACCAACGGTTTCGCTGATGACTACATTGGAAAATTCAAAA
TTGGTGTTATTATTCTGTTACAATTCAACATGTTAGCTTGTATCCTAATT
CTTGCCAATGTTTTGATCGCCCACTTGTCGAACGTCTACACGGACCAACA
CGCACGTGCTAAAGTCCAATGTGATGTCGATCGGGCCGTTCTTATAACTA
AGGTTGAGAATAGCTGGTTCAAATCTATGagtGCACGATTGAAATTTTAC
GCCGATGGCGACTATTACAGTAATTACAACGAAATCGCAGAATGCATAGC
TCAATGGAAGAGTGATCATCCATGTAAAGATGACGTCAAAGAAAGCAGCA
CAGAAAAGCTCGATAAAATCATAGGTATAAAATCTAGTTTTAGTGAAGTT
CGGTAAATGCAAGAAATAATTGAACACCCTGCTGTAAGATTACTAACCCA
ACGGAAATGGAGGCTATACGGAAGACGTCTTGTCGGgctttatatTGGAT
TTTATTTGTTCTTCATCGTGTCCATGACTTGTGCTTTCTTCTTGAAAGGT
GAAAGCGGTGATAGATCGATATACAAGACAACCAAAGACAAAATTCGTGG
TGTATTCGAAGTTATCACTTTTATTATAGCCTGTATCTATTTTATCATTG
AAATCGTGGAGCTGATCAAGGAGAAGATGAATTATCTGACATTCACCAAC
CTTGCAGATTTCATTGGTATAAGCCTGGTTATTTCACTTCTACCCATCAA
ATTTGGCACCGTTCATCTGTTATCAAAAAAGAACCCAAGTGAACTTGAAT
GCTATGTAGCAGCTGCAACTTATTTCATTAACGTTCTTCgaatcttcaaa
tatttcccTGTCATCAGATATGTTGGTGTTCATGCGAAGTTGATTTCACG
ATTGTTGCGACGTGATATTCCACAGTTCTTGATCGTTTACATCGTTGTCG
CTGCTGCTTTTCTTGGAAGTGTCATCCTTGCGTTGACTGCTACTAAAGAA
GGATTTGACAATGCAGATATTTCAACATGGGGAGCTTTGTTATCGGAAGT
CAGAGCCCTGACTGAGACCAACGGTTTCGCTGATGACTACATTGGAAAAT
TCAAAATTGGTGTTATTATTCTGTTACAATTCAACATGTTAGCTTGTATC
CTAATTCTTGCCAATGTTTTGATCGCCCACTTGTCGAACGTCTACACGGA
CCAACACGCACGTGCTAAAGTCCAATGTGATGTCGATCGGGCCGTTCTTA
TAACTAAGGTTGAGAATAGCTGGTTCAAATCTATGagtGCACGATTGAAA
TTTTACGCCGATGGCGACTATTACAGTAATTACAACGAAATCGCAGAATG
CATAGCTCAATGGAAGAGTGATCATCCATGTAAAGATGACGTCAAAGAAA
GCAGCACAGAAAAGCTCGATAAAATCATAGGTATAAAATCTAGTTTTAGT
GAAGTTCGGTAAATGCAAGAAATAATTGAACACCCTGCTGTAAGATTACT
AACCCAACGGAAATGGAGGCTATACGGAAGACGTCTTGTCGGgctttata
tTGGATTTTATTTGTTCTTCATCGTGTCCATGACTTGTGCTTTCTTCTTG
AAAGGTGAAAGCGGTGATAGATCGATATACAAGACAACCAAAGACAAAAT
TCGTGGTGTATTCGAAGTTATCACTTTTATTATAGCCTGTATCTATTTTA
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ttcaaatatttcccTGTCATCAGATATGTTGGTGTTCATGCGAAGTTGAT
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TTGTCGCTGCTGCTTTTCTTGGAAGTGTCATCCTTGCGTTGACTGCTACT
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TGTATCCTAATTCTTGCCAATGTTTTGATCGCCCACTTGTCGAACGTCTA
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TTCTTATAACTAAGGTTGAGAATAGCTGGTTCAAATCTATGagtGCACGA
TTGAAATTTTACGCCGATGGCGACTATTACAGTAATTACAACGAAATCGC
AGAATGCATAGCTCAATGGAAGAGTGATCATCCATGTAAAGATGACGTCA
AAGAAAGCAGCACAGAAAAGCTCGATAAAATCATAGGTATAAAATCTAGT
TTTAGTGAAGTTCGGTAAATGCAAGAAATAATTGAACACCCTGCTGTAAG
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tttatatTGGATTTTATTTGTTCTTCATCGTGTCCATGACTTGTGCTTTC
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TTACGCCGATGGCGACTATTACAGTAATTACAACGAAATCGCAGAATGCA
TAGCTCAATGGAAGAGTGATCATCCATGTAAAGATGACGTCAAAGAAAGC
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AGTTCGGTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000132_pilon | genome | sc0000132_pilon:349430..362759 + |
|
