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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000132_pilon:306944..312530+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15165.6.p2 ID=MSTRG.15165.6.p2|Name=MSTRG.15165.6.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5587bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:306944..312530+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGcaatttattgcaaaaattcgTATTTCTCTGAtgtctgctgacgtcag
caaaatttgaaaaaaaagattatgcACACCAAATGGCATAGCGAAAATGC
TATTTAAATCAACCCCAAgtgacaaaaaaatattgacgTCATCACATAAT
ATGAGGTGTGTACTACAAtttacataaaatattttttcatgctcaatagg
atgtTGACGGTGCaggtggatatagattgacatgttttgaaaacaatatg
tgtcatcacaagcgatttgaagtacaaatAAAACGGAGcgttcttgagac
gttcctgAACGTTCATGAACGCTCCATAGCGTTCCTAGAACGTTCCAGAA
CGTCCTCGATCGTTCTAAAACGTTCAGGGACGTTTCTGATCGTTCCAGAA
CGTTCAGAGACGTTCCAGAACGCTCGAGAACGTTGTAGAACGTCCCGGAA
CGCTCGCGAACGATCTTTTGAGTCCAAAGGTTAATATTGACTCAATAAGA
ACGTTATGGAACGTTTGAGAACGTTCGAGAACGTTATGGAACGTTCAGGA
ACGCTTCTGAACGTTTTAAGACATCCTTAAACTTGTAAATAAAAGGGAAT
GACCAGGAATGTTTAAGAACGTTCTCTAGCGTTCTTAGAACGTTCCTAAA
AGTTCAAGAACGTTCCATAACGTTCGTCTTGCTGGAACGTTCCATTTCAT
TCGTATTTAAAGTTGCTTGTGATGACACATATgtgctccaagagagctgt
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CAGATATTTTGACTATTACAATAGAAGTATCGAAAGTAATGGAAGTATCA
ATGGAAGTATCGAAAGTGTCAagtatatttctaaattttgaattttgaaa
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tttttatcagctgaaatttatagaaaggttgaaactgtttttatttgctt
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attttcaaattttcaaatttatgaaatttctcatcttttaattttcaaaa
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AGTATGTACGAAGTGAAGGCGGAGAGGGCTAGGCAGAAGTGTATGTCTTT
TGTTTGAATGACGTGACATTTCAATGGTTCACTCTATTCTCATTATAAAC
cctaattttctttatttttcaacagGAAAACAGCTTAGACATTCCATTTG
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TATGAATACTAAACAATTGTATACTTTATCTCAACACTTTGCTAGCAGTG
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GTCAAAGTATTTACACAGGTCATAGTGAGTAATCATTAGTTTATGGTAGC
GATATTAGGAAAGGCTTGGATGGAATAAGGCTAAGGAATTCTTTTCAAAG
TGAAATGTTGAAACTCTAAAGAGTTGATAAGAATCCAAgattttcaaata
ttctaaaaactgaaaaatttcaattctataaaaatttcaattgtttAGAT
AATTCTCCTTGAGAATTAGACAATAAACAAATAGCTGATGACAACTAAGA
AATGCAGTCATGTGAACATTTGATATGACCTTTCTAAGCAGAAAATCGTG
AATCCacaacaatgaaaaagtttaccggacgtgtccagaaatatttatat
ttttgatgacatcacaagcaaaatgatttttttttgtgaaagaataTAAT
GGGTATATTATACATCAATCGAAGCGTTTTCTAACGCAAATTAACAAAAA
GGTCAATATCCATGTCTGTAAAACGTTTCAAAACCTGTCGTAACTTttta
tggaaatatttttagatatttttacagacctttttcttaatctatgATTG
ACAACGCTTcaattggtatataatatgtctttTTTGatcttgaaaatctt
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TTACCGAACGCTTCCAGGTAAATAATTCTACAACCGTTGGCAGGGCATTT
TGGGGTATTCAGGTTATATATGACCGATTTAAATTAGTTTGGGATTGTTC
gctcaatttttattttttatgtgtCATCAGCTACTTGTCCAAATATCTTA
CCAACAGTCTataactatttttgaaatagCATAAGACTTAAATCTAAAGA
CAGATCTAAAAGATCGATAGGAATATTTGGTATGTAATATGTACCCagga
tttctttcttttgtatttAGGAATATGCCAGGACGACGTTAAAAGCTTCG
AGAGTTATTATTGGTGGTAAGTGAATTGTAAACTATCACCACTGCATTAG
AACAAGATTTGAACCTTGAAGGATCAGAATACCTAGATATATTCCAGTCC
AGGGGGGACAACACTTACTTTAAAAAAGCCTTTGTATGTAAAAAATCAGG
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tgacgttttggaCTCAACGAGCTTACGGGACATAtcatttatcaaattct
gttattAATTCTAAATCGGTATTTATATTTAATGGCAtttttttCAGCCT
TTTGTAAGACTTCAAACCCAAATGTCTCGAAATTATACGAAGTTAAGATT
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AATGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGAAATCGCATGTCAATCACAAAGCGATT
CAGTTATTGATGGAGTGTTTTGTTTAAGCTATCCTTTACATAAATCAAAC
GACCATAACAATTTACGAACATCACATTTAAAAGGAATTGAAATACCCAT
TCTTATAGTAAATGGTACTAAAGACACTATGTGTGATATGAACCTAATGA
ATGAACAATTTAATTTATTGCCCTGTATAAGCAAAACATTGAATTGGATA
GAAAATGCTGACCATagtttagaaaacaaaaactttgaacaGACTATGAA
AGAGGTAGGACAAATGCTTGTAAATTGGTGTTCATCTGTGATCTGAATTA
ATAGttagaaaatattctttttcttaagggctacatacactacacaatat
attgtcaggctgagtgccggcaatatattgaaaaggtgtccgtaATATAA
TAtcagcttgatttgcaattttccaacaatatagggggattgtttacagc
aAGAAAATTCATATTTATTATAGAGCTCCTGTTATTTACTTCGTATATTA
CTGTCCGAAAAcgatatattgtgtagtctaagtagtcCTTTAATGGTCAC
TCCAATCCAATGAATTTTGGCGGATACTGAAGTTGTAAATTGAATCTGGG
AATAAAGCACAAGATATATTTATACAGAGGAAGATATATATTGTAAGATA
AGAAAAGACCCGGTATTGAAATTgttattaaaaattatttacaaaagttt
ttttttatatttttgtactgttttggtgtttttgtgttCATTGGAATCTT
GCAATTCTACGTTGCATGAATTTGTTTGCTGTGTGTCTCGTGCGTTCACC
TTTTGGTGGCTGTGGAATACGGCTTTGTATTTGTCCTTGCTTTGGTTGTG
ATTGTTGGATGTTTGGGAGTCGTGGAATTCTAGAGACAGTTTGTTGGATG
GATTGTTTTGGTTGAATTGGTGGTTGAGGAATCCTTGGCAAGGCTAAGGT
TTGGGGAGCTTGGTTTTGTGGAGCAACACAGCTTTGGCGAATTTGGTTTT
GTGGAGATACGGTTTGAATGAGATCTCTTTGTTGAAAGATGGACGGTAAA
ACTGGAGTTTTATTCAACTCTTGGTGAACGTCTTGTTGTTTTGGTGCACC
ACGTACACGAACTGACGGATCACGTAAACGGAAAATATCTTTGTTCAAAA
GACTTGGTTTGACGATTCCTTTGATGGATGTACGTTTGATGGCAAGTTCG
TATTCAGAATGCATGCTTTGTTGTGATTCTACAACAATTGGCTGGCGTTT
GACGACTCTGCTTTGAACAGGTGGCAAAATAGTGGCCATGTTGAATTCGT
TTCGTCTTGGTTTAGATTTTCCATAACCAGTAGACCCAATGTTATTGTAa
gatttgactttttctttgaagattttaaatttgGATTCAGGAGCAATTCT
CTTGTTAGAAACGACGTGAGTTGGGATTGGTGGTAATCCCTTTGGAGCAA
CAGCTTCCGGCATGACAGCTCTTTGTGGTTTTCGAATCACAGAACGGTTA
TCATAATACATCTGCTCCTCGTCAAACTCGTTTTCATAATCATATTCTTC
ATGATCTTCTGGTGATTCCAGCTCTGGAGAAACTCGttgattttcaaaga
atgatgagTCATCATCTTCATCAAGTGGTGTGTATCTCATGACGTGTTCT
GGTGACATCACTTTCCTTTGTTCGACATCCACTGGTGTTCTTCGATGGTA
AGAAACTGGAGAGTCTTTTACTTCGGGAGAGTGTACAACTCGTCCTTCTG
CTTCGGGAGAGTGTACAACTCGTCCTTCTGCTTCGGGAGAGTGAACAACT
CTTCTTTCTGCTTCGGGAGAACGAATAATTTGTCCTTTTTCTTTGGGAGA
GTGAACAACTCGTCCTTCTACTTCGGGAAAGTGTACAACTCGTCCTTCTG
CTTCGGGAGAGTTAACAACTCGTTTTTCTGCCTCGGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000132_pilon:306944..312530+ >MSTRG.15165.6.p2 ID=MSTRG.15165.6.p2|Name=MSTRG.15165.6.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:306944..312530+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATACTAAACAATTGTATACTTTATCTCAACACTTTGCTAGCAGTGG
ATTCACTGTTCTCAGGTTCACATGCAAGCCACCAAACTTCAAATACAGAG
TCAAAGTATTTACACAGGTCATAGAATATGCCAGGACGACGTTAAAAGCT
TCGAGAGTTATTATTGGTGGGCGATCAATGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGA
AATCGCATGTCAATCACAAAGCGATTCAGTTATTGATGGAGTGTTTTGTT
TAAGCTATCCTTTACATAAATCAAACGACCATAACAATTTACGAACATCA
CATTTAAAAGGAATTGAAATACCCATTCTTATAGTAAATGGTACTAAAGA
CACTATGTGTGATATGAACCTAATGAATGAACAATTTAATTTATTGCCCT
GTATAAGCAAAACATTGAATTGGATAGAAAATGCTGACCATagtttagaa
aacaaaaactttgaacaGACTATGAAAGAGGTAGGACAAATGCTTGTAAA
TTGGTGTTCATCTGTGATCTGAATGAATACTAAACAATTGTATACTTTAT
CTCAACACTTTGCTAGCAGTGGATTCACTGTTCTCAGGTTCACATGCAAG
CCACCAAACTTCAAATACAGAGTCAAAGTATTTACACAGGTCATAGAATA
TGCCAGGACGACGTTAAAAGCTTCGAGAGTTATTATTGGTGGGCGATCAA
TGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGAAATCGCATGTCAATCACAAAGCGATTCA
GTTATTGATGGAGTGTTTTGTTTAAGCTATCCTTTACATAAATCAAACGA
CCATAACAATTTACGAACATCACATTTAAAAGGAATTGAAATACCCATTC
TTATAGTAAATGGTACTAAAGACACTATGTGTGATATGAACCTAATGAAT
GAACAATTTAATTTATTGCCCTGTATAAGCAAAACATTGAATTGGATAGA
AAATGCTGACCATagtttagaaaacaaaaactttgaacaGACTATGAAAG
AGGTAGGACAAATGCTTGTAAATTGGTGTTCATCTGTGATCTGAATGAAT
ACTAAACAATTGTATACTTTATCTCAACACTTTGCTAGCAGTGGATTCAC
TGTTCTCAGGTTCACATGCAAGCCACCAAACTTCAAATACAGAGTCAAAG
TATTTACACAGGTCATAGAATATGCCAGGACGACGTTAAAAGCTTCGAGA
GTTATTATTGGTGGGCGATCAATGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGAAATCGC
ATGTCAATCACAAAGCGATTCAGTTATTGATGGAGTGTTTTGTTTAAGCT
ATCCTTTACATAAATCAAACGACCATAACAATTTACGAACATCACATTTA
AAAGGAATTGAAATACCCATTCTTATAGTAAATGGTACTAAAGACACTAT
GTGTGATATGAACCTAATGAATGAACAATTTAATTTATTGCCCTGTATAA
GCAAAACATTGAATTGGATAGAAAATGCTGACCATagtttagaaaacaaa
aactttgaacaGACTATGAAAGAGGTAGGACAAATGCTTGTAAATTGGTG
TTCATCTGTGATCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000132_pilon | genome | sc0000132_pilon:306944..312530 + |
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