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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000132_pilon:305260..312530+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15165.5.p2 ID=MSTRG.15165.5.p2|Name=MSTRG.15165.5.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7271bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:305260..312530+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGcaatttattgcaaaaattcgTATTTCTCTGAtgtctgctgacgtcag
caaaatttgaaaaaaaagattatgcACACCAAATGGCATAGCGAAAATGC
TATTTAAATCAACCCCAAgtgacaaaaaaatattgacgTCATCACATAAT
ATGAGGTGTGTACTACAAtttacataaaatattttttcatgctcaatagg
atgtTGACGGTGCaggtggatatagattgacatgttttgaaaacaatatg
tgtcatcacaagcgatttgaagtacaaatAAAACGGAGcgttcttgagac
gttcctgAACGTTCATGAACGCTCCATAGCGTTCCTAGAACGTTCCAGAA
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CGTTCAGAGACGTTCCAGAACGCTCGAGAACGTTGTAGAACGTCCCGGAA
CGCTCGCGAACGATCTTTTGAGTCCAAAGGTTAATATTGACTCAATAAGA
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ACGCTTCTGAACGTTTTAAGACATCCTTAAACTTGTAAATAAAAGGGAAT
GACCAGGAATGTTTAAGAACGTTCTCTAGCGTTCTTAGAACGTTCCTAAA
AGTTCAAGAACGTTCCATAACGTTCGTCTTGCTGGAACGTTCCATTTCAT
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CAGATATTTTGACTATTACAATAGAAGTATCGAAAGTAATGGAAGTATCA
ATGGAAGTATCGAAAGTGTCAagtatatttctaaattttgaattttgaaa
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tcgatattagaccaacttacggtatgttGAATACTttaattcttcaaaat
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ACTTTTCTTCCCTCACTAAAAATGACTTGTGGGTCGTGGCTTAATACCTG
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taattgttttgcttgcctaaataaagatatatgaatcaatattgcaaaaa
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aaattcgTATTTCTCTGAtgtctgctgacgtcagcaaaatttgaaaaaaa
agattatgcACACCAAATGGCATAGCGAAAATGCTATTTAAATCAACCCC
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AAtttacataaaatattttttcatgctcaataggatgtTGACGGTGCagg
tggatatagattgacatgttttgaaaacaatatgtgtcatcacaagcgat
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GAACGCTCCATAGCGTTCCTAGAACGTTCCAGAACGTCCTCGATCGTTCT
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AGAACGCTCGAGAACGTTGTAGAACGTCCCGGAACGCTCGCGAACGATCT
TTTGAGTCCAAAGGTTAATATTGACTCAATAAGAACGTTATGGAACGTTT
GAGAACGTTCGAGAACGTTATGGAACGTTCAGGAACGCTTCTGAACGTTT
TAAGACATCCTTAAACTTGTAAATAAAAGGGAATGACCAGGAATGTTTAA
GAACGTTCTCTAGCGTTCTTAGAACGTTCCTAAAAGTTCAAGAACGTTCC
ATAACGTTCGTCTTGCTGGAACGTTCCATTTCATTCGTATTTAAAGTTGC
TTGTGATGACACATATgtgctccaagagagctgtatTAGAGATACGAaga
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TGTCAagtatatttctaaattttgaattttgaaaaaaggaaatttgagaG
CTGTCGacacacccctcctctaattccgacaccctttttatcagctgaaa
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CGTACTGTTGAAAccatgtactcttaggttccaaataaatgcAACCCCCT
GGACCTTATAAGGACTCCCCGTTTAATaattcagctgtcaaagagaaggc
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CTCtgcttttgaataaaaaattatctaTTAAAACCATTTTAAGCAAATTG
TGATAAGGATGTGACTTTCATAGGACGGTTTAGTTGAGGATGATTTTGAT
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AAGCGGGAACTCCTCCTAACATCTGGATACTTCAACTAAGTTCAtacatt
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AATTTGACAGAACTtcaaaattaggtgaatttcaattttcaaattttcaa
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GCACTTTCGATACTTCCATTGGGGCCATCTATATAGTATGTACGAAGTGA
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CATTTCAATGGTTCACTCTATTCTCATTATAAACcctaattttctttatt
tttcaacagGAAAACAGCTTAGACATTCCATTTGGAGAAAAAAGAATTCC
TGCTATCATCACATCACACCATTCATCAAATAAAGACAATAATGAAAATG
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TTGTATACTTTATCTCAACACTTTGCTAGCAGTGGATTCACTGTTCTCAG
GTTCACATGCAAGCCACCAAACTTCAAATACAGAGTCAAAGTATTTACAC
AGGTCATAGTGAGTAATCATTAGTTTATGGTAGCGATATTAGGAAAGGCT
TGGATGGAATAAGGCTAAGGAATTCTTTTCAAAGTGAAATGTTGAAACTC
TAAAGAGTTGATAAGAATCCAAgattttcaaatattctaaaaactgaaaa
atttcaattctataaaaatttcaattgtttAGATAATTCTCCTTGAGAAT
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CATTTGATATGACCTTTCTAAGCAGAAAATCGTGAATCCacaacaatgaa
aaagtttaccggacgtgtccagaaatatttatatttttgatgacatcaca
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AATCGAAGCGTTTTCTAACGCAAATTAACAAAAAGGTCAATATCCATGTC
TGTAAAACGTTTCAAAACCTGTCGTAACTTtttatggaaatatttttaga
tatttttacagacctttttcttaatctatgATTGACAACGCTTcaattgg
tatataatatgtctttTTTGatcttgaaaatcttttagTTACCCTATGGG
TATAaagtaaatgacgtcattgtgacCTCAAATTTTACCGAACGCTTCCA
GGTAAATAATTCTACAACCGTTGGCAGGGCATTTTGGGGTATTCAGGTTA
TATATGACCGATTTAAATTAGTTTGGGATTGTTCgctcaatttttatttt
ttatgtgtCATCAGCTACTTGTCCAAATATCTTACCAACAGTCTataact
atttttgaaatagCATAAGACTTAAATCTAAAGACAGATCTAAAAGATCG
ATAGGAATATTTGGTATGTAATATGTACCCaggatttctttcttttgtat
ttAGGAATATGCCAGGACGACGTTAAAAGCTTCGAGAGTTATTATTGGTG
GTAAGTGAATTGTAAACTATCACCACTGCATTAGAACAAGATTTGAACCT
TGAAGGATCAGAATACCTAGATATATTCCAGTCCAGGGGGGACAACACTT
ACTTTAAAAAAGCCTTTGTATGTAAAAAATCAGGGTTTCAAAATTGGACC
CTTTACATTAATCCATGAGTTGAGAACGgatttttgacgttttggaCTCA
ACGAGCTTACGGGACATAtcatttatcaaattctgttattAATTCTAAAT
CGGTATTTATATTTAATGGCAtttttttCAGCCTTTTGTAAGACTTCAAA
CCCAAATGTCTCGAAATTATACGAAGTTAAGATTGAAAATCATCGGAATC
AACAAAATGATCGAATTTTCCTTAAGTTTGCACCAAACAAATTTACCTAa
atgtatatttattttaattaatttcagGGCGATCAATGGGTGGTAGAGTA
GCAGCAGAAATCGCATGTCAATCACAAAGCGATTCAGTTATTGATGGAGT
GTTTTGTTTAAGCTATCCTTTACATAAATCAAACGACCATAACAATTTAC
GAACATCACATTTAAAAGGAATTGAAATACCCATTCTTATAGTAAATGGT
ACTAAAGACACTATGTGTGATATGAACCTAATGAATGAACAATTTAATTT
ATTGCCCTGTATAAGCAAAACATTGAATTGGATAGAAAATGCTGACCATa
gtttagaaaacaaaaactttgaacaGACTATGAAAGAGGTAGGACAAATG
CTTGTAAATTGGTGTTCATCTGTGATCTGAATTAATAGttagaaaatatt
ctttttcttaagggctacatacactacacaatatattgtcaggctgagtg
ccggcaatatattgaaaaggtgtccgtaATATAATAtcagcttgatttgc
aattttccaacaatatagggggattgtttacagcaAGAAAATTCATATTT
ATTATAGAGCTCCTGTTATTTACTTCGTATATTACTGTCCGAAAAcgata
tattgtgtagtctaagtagtcCTTTAATGGTCACTCCAATCCAATGAATT
TTGGCGGATACTGAAGTTGTAAATTGAATCTGGGAATAAAGCACAAGATA
TATTTATACAGAGGAAGATATATATTGTAAGATAAGAAAAGACCCGGTAT
TGAAATTgttattaaaaattatttacaaaagtttttttttatatttttgt
actgttttggtgtttttgtgttCATTGGAATCTTGCAATTCTACGTTGCA
TGAATTTGTTTGCTGTGTGTCTCGTGCGTTCACCTTTTGGTGGCTGTGGA
ATACGGCTTTGTATTTGTCCTTGCTTTGGTTGTGATTGTTGGATGTTTGG
GAGTCGTGGAATTCTAGAGACAGTTTGTTGGATGGATTGTTTTGGTTGAA
TTGGTGGTTGAGGAATCCTTGGCAAGGCTAAGGTTTGGGGAGCTTGGTTT
TGTGGAGCAACACAGCTTTGGCGAATTTGGTTTTGTGGAGATACGGTTTG
AATGAGATCTCTTTGTTGAAAGATGGACGGTAAAACTGGAGTTTTATTCA
ACTCTTGGTGAACGTCTTGTTGTTTTGGTGCACCACGTACACGAACTGAC
GGATCACGTAAACGGAAAATATCTTTGTTCAAAAGACTTGGTTTGACGAT
TCCTTTGATGGATGTACGTTTGATGGCAAGTTCGTATTCAGAATGCATGC
TTTGTTGTGATTCTACAACAATTGGCTGGCGTTTGACGACTCTGCTTTGA
ACAGGTGGCAAAATAGTGGCCATGTTGAATTCGTTTCGTCTTGGTTTAGA
TTTTCCATAACCAGTAGACCCAATGTTATTGTAagatttgactttttctt
tgaagattttaaatttgGATTCAGGAGCAATTCTCTTGTTAGAAACGACG
TGAGTTGGGATTGGTGGTAATCCCTTTGGAGCAACAGCTTCCGGCATGAC
AGCTCTTTGTGGTTTTCGAATCACAGAACGGTTATCATAATACATCTGCT
CCTCGTCAAACTCGTTTTCATAATCATATTCTTCATGATCTTCTGGTGAT
TCCAGCTCTGGAGAAACTCGttgattttcaaagaatgatgagTCATCATC
TTCATCAAGTGGTGTGTATCTCATGACGTGTTCTGGTGACATCACTTTCC
TTTGTTCGACATCCACTGGTGTTCTTCGATGGTAAGAAACTGGAGAGTCT
TTTACTTCGGGAGAGTGTACAACTCGTCCTTCTGCTTCGGGAGAGTGTAC
AACTCGTCCTTCTGCTTCGGGAGAGTGAACAACTCTTCTTTCTGCTTCGG
GAGAACGAATAATTTGTCCTTTTTCTTTGGGAGAGTGAACAACTCGTCCT
TCTACTTCGGGAAAGTGTACAACTCGTCCTTCTGCTTCGGGAGAGTTAAC
AACTCGTTTTTCTGCCTCGGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000132_pilon:305260..312530+ >MSTRG.15165.5.p2 ID=MSTRG.15165.5.p2|Name=MSTRG.15165.5.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:305260..312530+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATACTAAACAATTGTATACTTTATCTCAACACTTTGCTAGCAGTGG
ATTCACTGTTCTCAGGTTCACATGCAAGCCACCAAACTTCAAATACAGAG
TCAAAGTATTTACACAGGTCATAGAATATGCCAGGACGACGTTAAAAGCT
TCGAGAGTTATTATTGGTGGGCGATCAATGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGA
AATCGCATGTCAATCACAAAGCGATTCAGTTATTGATGGAGTGTTTTGTT
TAAGCTATCCTTTACATAAATCAAACGACCATAACAATTTACGAACATCA
CATTTAAAAGGAATTGAAATACCCATTCTTATAGTAAATGGTACTAAAGA
CACTATGTGTGATATGAACCTAATGAATGAACAATTTAATTTATTGCCCT
GTATAAGCAAAACATTGAATTGGATAGAAAATGCTGACCATagtttagaa
aacaaaaactttgaacaGACTATGAAAGAGGTAGGACAAATGCTTGTAAA
TTGGTGTTCATCTGTGATCTGAATGAATACTAAACAATTGTATACTTTAT
CTCAACACTTTGCTAGCAGTGGATTCACTGTTCTCAGGTTCACATGCAAG
CCACCAAACTTCAAATACAGAGTCAAAGTATTTACACAGGTCATAGAATA
TGCCAGGACGACGTTAAAAGCTTCGAGAGTTATTATTGGTGGGCGATCAA
TGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGAAATCGCATGTCAATCACAAAGCGATTCA
GTTATTGATGGAGTGTTTTGTTTAAGCTATCCTTTACATAAATCAAACGA
CCATAACAATTTACGAACATCACATTTAAAAGGAATTGAAATACCCATTC
TTATAGTAAATGGTACTAAAGACACTATGTGTGATATGAACCTAATGAAT
GAACAATTTAATTTATTGCCCTGTATAAGCAAAACATTGAATTGGATAGA
AAATGCTGACCATagtttagaaaacaaaaactttgaacaGACTATGAAAG
AGGTAGGACAAATGCTTGTAAATTGGTGTTCATCTGTGATCTGAATGAAT
ACTAAACAATTGTATACTTTATCTCAACACTTTGCTAGCAGTGGATTCAC
TGTTCTCAGGTTCACATGCAAGCCACCAAACTTCAAATACAGAGTCAAAG
TATTTACACAGGTCATAGAATATGCCAGGACGACGTTAAAAGCTTCGAGA
GTTATTATTGGTGGGCGATCAATGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGAAATCGC
ATGTCAATCACAAAGCGATTCAGTTATTGATGGAGTGTTTTGTTTAAGCT
ATCCTTTACATAAATCAAACGACCATAACAATTTACGAACATCACATTTA
AAAGGAATTGAAATACCCATTCTTATAGTAAATGGTACTAAAGACACTAT
GTGTGATATGAACCTAATGAATGAACAATTTAATTTATTGCCCTGTATAA
GCAAAACATTGAATTGGATAGAAAATGCTGACCATagtttagaaaacaaa
aactttgaacaGACTATGAAAGAGGTAGGACAAATGCTTGTAAATTGGTG
TTCATCTGTGATCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000132_pilon | genome | sc0000132_pilon:305260..312530 + |
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