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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000132_pilon:303578..312530+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15165.4.p2 ID=MSTRG.15165.4.p2|Name=MSTRG.15165.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8953bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:303578..312530+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CAGcaatttattgcaaaaattcgTATTTCTCTGAtgtctgctgacgtcag
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AACGCTCGAGAACGTTGTAGAACGTCCCGGAACGCTCGCGAACGATCTTT
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AGACATCCTTAAACTTGTAAATAAAAGGGAATGACCAGGAATGTTTAAGA
ACGTTCTCTAGCGTTCTTAGAACGTTCCTAAAAGTTCAAGAACGTTCCAT
AACGTTCGTCTTGCTGGAACGTTCCATTTCATTCGTATTTAAAGTTGCTT
GTGATGACACATATgtgctccaagagagctgtatTAGAGATACGAagatt
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CAATAGAAGTATCGAAAGTAATGGAAGTATCAATGGAAGTATCGAAAGTG
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GTCGacacacccctcctctaattccgacaccctttttatcagctgaaatt
tatagaaaggttgaaactgttttatttgcttagtggtcacagaggaataa
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ATTCAGAATTAGAATTTGCCCAATAAAttcttgttgtcgaactttaatcA
TACTCACAATTTTATTGGCTTTTAAAAAGATTACTTTTCTTCCCTCACTA
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aacacctcaggcattttaaggcatgtccaaattCTCTGTAATTATTAAAC
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cagcaaaacctgttttttgaataactccagatTGGCtgatggtataaaca
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tgtctgctgacgtcagcaaaatttgaaaaaaaagattatgcACACCAAAT
GGCATAGCGAAAATGCTATTTAAATCAACCCCAAgtgacaaaaaaatatt
gacgTCATCACATAATATGAGGTGTGTACTACAAtttacataaaatattt
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TCTGATCGTTCCAGAACGTTCAGAGACGTTCCAGAACGCTCGAGAACGTT
GTAGAACGTCCCGGAACGCTCGCGAACGATCTTTTGAGTCCAAAGGTTAA
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TATGGAACGTTCAGGAACGCTTCTGAACGTTTTAAGACATCCTTAAACTT
GTAAATAAAAGGGAATGACCAGGAATGTTTAAGAACGTTCTCTAGCGTTC
TTAGAACGTTCCTAAAAGTTCAAGAACGTTCCATAACGTTCGTCTTGCTG
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CTttaattcttcaaaatatagggtttgttgaacttttttgaatttaatgg
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tactcttaggttccaaataaatgcAACCCCCTGGACCTTATAAGGACTCC
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AATGTTATGTCCTTTGTAATTTGTAGCTAAGGCTCtgcttttgaataaaa
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AAATCTGCTTAAGGGATTACTACTACAGAACAAAGCGGGAACTCCTCCTA
ACATCTGGATACTTCAACTAAGTTCAtacatttgattttcaaattttgat
gcaatgaaaaaaaagtataaaaactaCAGTTTGAAATCATCAATAACTGC
TTTGGGACTTTTGATACAAGGACTTGTCGTCAAATTTGACAGAACTtcaa
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cttttaattttcaaaatttagaaaaatacttgGCACTTTCGATACTTCCA
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AGAAGTGTATGTCTTTTGTTTGAATGACGTGACATTTCAATGGTTCACTC
TATTCTCATTATAAACcctaattttctttatttttcaacagGAAAACAGC
TTAGACATTCCATTTGGAGAAAAAAGAATTCCTGCTATCATCACATCACA
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ACGGTGCTGGAGGAGATATGAATACTAAACAATTGTATACTTTATCTCAA
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ATTAGTTTATGGTAGCGATATTAGGAAAGGCTTGGATGGAATAAGGCTAA
GGAATTCTTTTCAAAGTGAAATGTTGAAACTCTAAAGAGTTGATAAGAAT
CCAAgattttcaaatattctaaaaactgaaaaatttcaattctataaaaa
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TAAGCAGAAAATCGTGAATCCacaacaatgaaaaagtttaccggacgtgt
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CTGTCGTAACTTtttatggaaatatttttagatatttttacagacctttt
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TAATATGTACCCaggatttctttcttttgtatttAGGAATATGCCAGGAC
GACGTTAAAAGCTTCGAGAGTTATTATTGGTGGTAAGTGAATTGTAAACT
ATCACCACTGCATTAGAACAAGATTTGAACCTTGAAGGATCAGAATACCT
AGATATATTCCAGTCCAGGGGGGACAACACTTACTTTAAAAAAGCCTTTG
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GTTGAGAACGgatttttgacgttttggaCTCAACGAGCTTACGGGACATA
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GCAtttttttCAGCCTTTTGTAAGACTTCAAACCCAAATGTCTCGAAATT
ATACGAAGTTAAGATTGAAAATCATCGGAATCAACAAAATGATCGAATTT
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taatttcagGGCGATCAATGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGAAATCGCATGT
CAATCACAAAGCGATTCAGTTATTGATGGAGTGTTTTGTTTAAGCTATCC
TTTACATAAATCAAACGACCATAACAATTTACGAACATCACATTTAAAAG
GAATTGAAATACCCATTCTTATAGTAAATGGTACTAAAGACACTATGTGT
GATATGAACCTAATGAATGAACAATTTAATTTATTGCCCTGTATAAGCAA
AACATTGAATTGGATAGAAAATGCTGACCATagtttagaaaacaaaaact
ttgaacaGACTATGAAAGAGGTAGGACAAATGCTTGTAAATTGGTGTTCA
TCTGTGATCTGAATTAATAGttagaaaatattctttttcttaagggctac
atacactacacaatatattgtcaggctgagtgccggcaatatattgaaaa
ggtgtccgtaATATAATAtcagcttgatttgcaattttccaacaatatag
ggggattgtttacagcaAGAAAATTCATATTTATTATAGAGCTCCTGTTA
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gtcCTTTAATGGTCACTCCAATCCAATGAATTTTGGCGGATACTGAAGTT
GTAAATTGAATCTGGGAATAAAGCACAAGATATATTTATACAGAGGAAGA
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tgttCATTGGAATCTTGCAATTCTACGTTGCATGAATTTGTTTGCTGTGT
GTCTCGTGCGTTCACCTTTTGGTGGCTGTGGAATACGGCTTTGTATTTGT
CCTTGCTTTGGTTGTGATTGTTGGATGTTTGGGAGTCGTGGAATTCTAGA
GACAGTTTGTTGGATGGATTGTTTTGGTTGAATTGGTGGTTGAGGAATCC
TTGGCAAGGCTAAGGTTTGGGGAGCTTGGTTTTGTGGAGCAACACAGCTT
TGGCGAATTTGGTTTTGTGGAGATACGGTTTGAATGAGATCTCTTTGTTG
AAAGATGGACGGTAAAACTGGAGTTTTATTCAACTCTTGGTGAACGTCTT
GTTGTTTTGGTGCACCACGTACACGAACTGACGGATCACGTAAACGGAAA
ATATCTTTGTTCAAAAGACTTGGTTTGACGATTCCTTTGATGGATGTACG
TTTGATGGCAAGTTCGTATTCAGAATGCATGCTTTGTTGTGATTCTACAA
CAATTGGCTGGCGTTTGACGACTCTGCTTTGAACAGGTGGCAAAATAGTG
GCCATGTTGAATTCGTTTCGTCTTGGTTTAGATTTTCCATAACCAGTAGA
CCCAATGTTATTGTAagatttgactttttctttgaagattttaaatttgG
ATTCAGGAGCAATTCTCTTGTTAGAAACGACGTGAGTTGGGATTGGTGGT
AATCCCTTTGGAGCAACAGCTTCCGGCATGACAGCTCTTTGTGGTTTTCG
AATCACAGAACGGTTATCATAATACATCTGCTCCTCGTCAAACTCGTTTT
CATAATCATATTCTTCATGATCTTCTGGTGATTCCAGCTCTGGAGAAACT
CGttgattttcaaagaatgatgagTCATCATCTTCATCAAGTGGTGTGTA
TCTCATGACGTGTTCTGGTGACATCACTTTCCTTTGTTCGACATCCACTG
GTGTTCTTCGATGGTAAGAAACTGGAGAGTCTTTTACTTCGGGAGAGTGT
ACAACTCGTCCTTCTGCTTCGGGAGAGTGTACAACTCGTCCTTCTGCTTC
GGGAGAGTGAACAACTCTTCTTTCTGCTTCGGGAGAACGAATAATTTGTC
CTTTTTCTTTGGGAGAGTGAACAACTCGTCCTTCTACTTCGGGAAAGTGT
ACAACTCGTCCTTCTGCTTCGGGAGAGTTAACAACTCGTTTTTCTGCCTC
GGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000132_pilon:303578..312530+ >MSTRG.15165.4.p2 ID=MSTRG.15165.4.p2|Name=MSTRG.15165.4.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1566bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132_pilon:303578..312530+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATACTAAACAATTGTATACTTTATCTCAACACTTTGCTAGCAGTGG
ATTCACTGTTCTCAGGTTCACATGCAAGCCACCAAACTTCAAATACAGAG
TCAAAGTATTTACACAGGTCATAGAATATGCCAGGACGACGTTAAAAGCT
TCGAGAGTTATTATTGGTGGGCGATCAATGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGA
AATCGCATGTCAATCACAAAGCGATTCAGTTATTGATGGAGTGTTTTGTT
TAAGCTATCCTTTACATAAATCAAACGACCATAACAATTTACGAACATCA
CATTTAAAAGGAATTGAAATACCCATTCTTATAGTAAATGGTACTAAAGA
CACTATGTGTGATATGAACCTAATGAATGAACAATTTAATTTATTGCCCT
GTATAAGCAAAACATTGAATTGGATAGAAAATGCTGACCATagtttagaa
aacaaaaactttgaacaGACTATGAAAGAGGTAGGACAAATGCTTGTAAA
TTGGTGTTCATCTGTGATCTGAATGAATACTAAACAATTGTATACTTTAT
CTCAACACTTTGCTAGCAGTGGATTCACTGTTCTCAGGTTCACATGCAAG
CCACCAAACTTCAAATACAGAGTCAAAGTATTTACACAGGTCATAGAATA
TGCCAGGACGACGTTAAAAGCTTCGAGAGTTATTATTGGTGGGCGATCAA
TGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGAAATCGCATGTCAATCACAAAGCGATTCA
GTTATTGATGGAGTGTTTTGTTTAAGCTATCCTTTACATAAATCAAACGA
CCATAACAATTTACGAACATCACATTTAAAAGGAATTGAAATACCCATTC
TTATAGTAAATGGTACTAAAGACACTATGTGTGATATGAACCTAATGAAT
GAACAATTTAATTTATTGCCCTGTATAAGCAAAACATTGAATTGGATAGA
AAATGCTGACCATagtttagaaaacaaaaactttgaacaGACTATGAAAG
AGGTAGGACAAATGCTTGTAAATTGGTGTTCATCTGTGATCTGAATGAAT
ACTAAACAATTGTATACTTTATCTCAACACTTTGCTAGCAGTGGATTCAC
TGTTCTCAGGTTCACATGCAAGCCACCAAACTTCAAATACAGAGTCAAAG
TATTTACACAGGTCATAGAATATGCCAGGACGACGTTAAAAGCTTCGAGA
GTTATTATTGGTGGGCGATCAATGGGTGGTAGAGTAGCAGCAGAAATCGC
ATGTCAATCACAAAGCGATTCAGTTATTGATGGAGTGTTTTGTTTAAGCT
ATCCTTTACATAAATCAAACGACCATAACAATTTACGAACATCACATTTA
AAAGGAATTGAAATACCCATTCTTATAGTAAATGGTACTAAAGACACTAT
GTGTGATATGAACCTAATGAATGAACAATTTAATTTATTGCCCTGTATAA
GCAAAACATTGAATTGGATAGAAAATGCTGACCATagtttagaaaacaaa
aactttgaacaGACTATGAAAGAGGTAGGACAAATGCTTGTAAATTGGTG
TTCATCTGTGATCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000132_pilon | genome | sc0000132_pilon:303578..312530 + |
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