MSTRG.15116.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15116.1.p1
Unique NameMSTRG.15116.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000131_pilon:529801..546035-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15116.1.p1 ID=MSTRG.15116.1.p1|Name=MSTRG.15116.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16235bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000131_pilon:529801..546035- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGAAAAACAATTCTAATGTCTAACACAATCATAAATCATATGATCTTTTT CAACACGAGGACACCCTACAATCAAGACCTACTAAGAAATACTTAGGATT TATTAAAGATATTAAAGATTTTACAAGACTTCTAACTCGAAAATGGCAAG CGCAATGTCAATGAATGATACCTTCAACGGTGGTAAGATAATTTACAAAC CTTACTTATATTATACTCACAAAAAGTAATTTTAAGTTCTATGATCGTTT TTTCATGAACTTACCATTTTATTTCCCAAAAATGAGTTATGCACCAATGA TATTAGCCTGGGAATCCAAGCATTAAACTTTTTAATCACAGTCTAGTTTA TGATATTTTTGCTGCTTGTTTAAACGCTTGGCGCAGGTAACTCGCCTCTG CAGGGAGATTTTTCCCTGCAATGCAGGTTCAGCCTGATTGGCCAGCTTTC GGTGTATTACTTAGCAGTACTTTTGCGCACATTTTGATCATTTCGATGCA CGCGCGCATAATCTATGGAAAAAGCTGACTCTGCAGAAAAAAGGAAAACA AATGAAAATGAAAACATAGATTCATTTAGTCAGTTAGCCACACTAGCGTC CCGCCAAAATGCGTATCAAAGATTAATGCTGCGAAAGCGCTATATCGTTT ACTTGACTCTCAAGCAAAACAATGCGCCGCGAAACTTCTAAAGGGATTCA TGAAAAAATAACCCGGCGCTTTTTAATGAAATTAACATTTTCAAAAACTT TGAGAAATTGCCTAAAATTTGTGCCATAGATGAAAAAAATTGAGCCAAGC CAACCTTGAAAACTAATTTGAAGATCAACTTCCCAAGAAAAAGATCTACG GGGGAGGCGGAACCCAACTAGATCCGCGCACTGCCGGATAGGCTATCTCC TGGAAATTTTGCCGGACCTCAAACAATGACCCATTTACATGTGCGTAATT 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GATCCGGAAAAAAAAATAGAATAAAGCAAACAAGGTCACAATTTGTGATA TTTCCTTTCCCTAGCTTGTAGAGAGTAATCATTTTAAAAACTTGTGATCT TTTTTTTCCCGGCTCATCCATAATTAGTTTAGAAAAACTTGGGATTTTTA CTTTCCCAATGCAATTCTGAATGGGCAACTAGAAAGTTAAAAATTTTAGT TTTCCACGTGTGGAAATCCGTTTTCACTAACACATTGGTAATACACTTCC AGCATGGAAAAATAGGTTTCCCTAGTTTCCTTACTTTCCCAAACTTAAAA TTCTAGACTAATGTGATCGAATAAAAAACCACAATCTGAAAATGAACAAT CCCTAGGCTAGGGAATCAAAAAATTTTCCTGTGAATATGAGCAGTTGTAG AGGTCATATAACACTGATTACAACACTGAATATAACACTGATTTTTGCTA TCAAAATAGAACCTAAAGATGATCAAGATTTCTTTATCATTATCATTATC AGTCCTTCCTAAAACTAATAAGTTCATCTTTTAATAAATCACTCTGTTTT GTTGTGGAAAACTATCAATCAATCAAAAATTATAAGTCAATTTTTCGGTC AGTGTTTGTACTTTGTAAATTAATTCGATTTCTACTTTATATAATATTCT CCTAAAAATTAAGATAATTGAAACTGTCAGTGTAAAATGCAGGTCACAGG TCACGGGTCACAGGTCACGGGTCACAGGTTAGTGTTGACAGGTCAGCTTC AAGTACTGTAAATCACAAATAAAATGTTTGAAAAACAGTTGTCAATGTCT AAAATATAATTCCAAAGGTATTTTATTGATCTAGAACTATTTTAAAGCCA AAAATCTATCCACGTGCTTACCACTTGCTTTCGCGTTCAGCGTTGTCGCG TTTTATGTCGTGTATAACACGGACCTGTAATACTTGTATTATATATTACA 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AATCGATGTCTGTTGATACTTTAGACTTGTACTTGTATTTTTAGAGCTTT AATAAAAACAACAAAAAATGAGATCAATTGTTGCATGTTTAGCATTGCTC AACTTGATAGTCAATGCACAATATTCTCCTTCGAATTACAATGGCACTAC ACCAGACCTTGAAAGCATCATGAAAGGGCGGTGCAGTCAATACAAAGTGT TCAATCGAGATCCTGAACTTCAAGTCAAAGTAGATTGCAATGAATTATGG AATACGTTCACAAAAGCATTCATTAACAAAGACCCCTGCAAAGTCAATTT CACTGGAGCTTACAAAAAGACTTTTGAGCTGATCGATAACAAGCATTTTT ATACAAATAAGGTTTGACTTTCTATTTGATACCGATGATGAAATGGTAGA AATTGTCGTCATTCGACCAAGTTTAAGTCGAACCCATAATTTATCCTTTC ATGAAGATTTCAGTTCATTGAATTCCTCTGATATTTTCTTCAGACAATGT TTTGGACAGGAACACGAGACGTGGTTCATGATTTCACTCATGTCAATGAT GACTATCGGACCTTAGAAGAAACTTTTGCAGGGTAAGAAAGATTTGATAT AGTTTAGTAAGACTTTATAGTTTTTTCATCCATCTTTAATTTGAAAACTT TATTTAATCACCATTACATTTTCATGGTTTTGTCACATTAAAGCGCTTCC GCTTTTTGATGGTTTTTTATCTTGTTTTTTAGATATTTTGCGAATGATTT AAATTGGTGTGGATGTGATAATTGTGCTGGAGGAATTGATTATGATTTCT GTAATGAGACATGTAATAAACTGATACCATTCCATGGTTATACGTCGGAG TATTGGGCGGAGGCATCACGAATTGTATGTTCAAATGCTCTTAAAATTAA ATGTACCACTAGTCCATTAAAAGTTTCAAAACCTTTCTTTAATAAACCTT 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TACTCATAAACGCTATTGATATTTCTTCTTCAGAACATTGGTTTTTTAAA TAAAGCCAATAGAAATCTTAACACGCCAGAAATTGATAATTGAATATAAC TGAATCTAAACAGAGAATAGAATTGAAGAGCAAGAGTGGTTTTAGATTGG AGATAAAAATATGAATTTGTAGATAAATATTCATTCAGCTGCATAAGTTG CCATTGCACCTTGGAGAATAGATAACCATCTATTTTGAATCAACTTTTTT TTAACATAATGGTTATCACAAAAAATCTTTGAAATACACTTGCCACTCGC TTGCCAAAAGTTTTTCTGCTCTAAATCCAAAAATACATTAAAACTGATGA AAACTGTGTTGCTAATTTTATTCCCTTGGAAAATAAAACAATAACAAGAT CTCTCTGCTTTTTCAAAAATTATTCGTGAATCTTGATCATTCTATATAAC AAAGCATCTGGTATTTACTCTAACCTCTTTTCAATTTACAGCTGGAAAGA AGCGACCATAGCCCTGATTGCTGTTTCGTGTGTTTTATTCATCGCTGTCA TCCTTCTCCTCGTCTTGTACAATCGACGAAGAATGGATTCGTCTACCTAC AAACGAGACATCGATACATAGAGACATCCATCCATCTTTGATATTTGTTG ATATTTGTTTTGTTGACGAACGGTGGAAATTACACCTGATTTGGAATGCG GATGATGCCGTGGAATATAAAGCATACGTGGCTATAGATTGATCTTCATT TGATATTGACTTGTTCTTTTTACGATTTTACGTTTTTGAAAGAAAAATTA CAAGATGTTTTGAGGGGTTGTGTGTGTGTGTTTCAAGGGTACTCAAAAAA ACAAAACTGAAAATGCCAAACTTTCGCACTACAAACCATGCATTTCATTG TTTTTATTCTTGTTCAGTTATTACTTTATTTCATCCATTAAATTAACCTT TTGTTTTGTAAATTTATTTTTCTATTATGGTTTTTATACAACAGTTTTTT TTTTTTACGATTGAGGAATACTAATTTAAGTCGTG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000131_pilon:529801..546035-

>MSTRG.15116.1.p1 ID=MSTRG.15116.1.p1|Name=MSTRG.15116.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=8088bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000131_pilon:529801..546035- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTGGAAAGAAGCGACCATAGCCCTGATTGCTGTTTCGTGTGTTTTATTCA
TCGCTGTCATCCTTCTCCTCGTCTTGTACAATCGACGAAGAATGGATTCG
TCTACCTACAAACGAGACATCGATACATAGGATGGTAAAAAGTGTATTAT
GTGCGAAATACCCAGATGCTAGAGAGTGCCAGCCGGTCAACGCAAGTAAA
GTCGAAAGAGAATCATGTGGTGAAAAAACCATTAAACGTTTGGTGGAAGA
CGCTCATAGATATGGAATTGAAAAGGTGCATTGCTACGATGAACCCTTTA
ATTTTGGTCATGTAGAGCTACCGACATTGGGAGAACAAGCAAAGAAAGGA
ATCGTCACTATGTTAAATGTTTACGTCATCAACGACATCGATGAAAAACC
GAATTTGCTTTGAAAGCGAAGGGCGTTGTTTCAGTTTTGATCAATGGAAC
GCAAAAAGGAAATAACACCGCCTATTATATTGGAAAATATTTTGCGAATG
ATTTAAATTGGTGTGGATGTGATAATTGTGCTGGAGGAATTGATTATGAT
TTCTGTAATGAGACATGTAATAAACTGATACCATTCCATGGTTATACGTC
GGAGTATTGGGCGGAGGCATCACGAATTACAATGTTTTGGACAGGAACAC
GAGACGTGGTTCATGATTTCACTCATGTCAATGATGACTATCGGACCTTA
GAAGAAACTTTTGCAGGATGAGATCAATTGTTGCATGTTTAGCATTGCTC
AACTTGATAGTCAATGCACAATATTCTCCTTCGAATTACAATGGCACTAC
ACCAGACCTTGAAAGCATCATGAAAGGGCGGTGCAGTCAATACAAAGTGT
TCAATCGAGATCCTGAACTTCAAGTCAAAGTAGATTGCAATGAATTATGG
AATACGTTCACAAAAGCATTCATTAACAAAGACCCCTGCAAAGTCAATTT
CACTGGAGCTTACAAAAAGACTTTTGAGCTGATCGATAACAAGCATTTTT
ATACAAATAAGCTGGAAAGAAGCGACCATAGCCCTGATTGCTGTTTCGTG
TGTTTTATTCATCGCTGTCATCCTTCTCCTCGTCTTGTACAATCGACGAA
GAATGGATTCGTCTACCTACAAACGAGACATCGATACATAGGATGGTAAA
AAGTGTATTATGTGCGAAATACCCAGATGCTAGAGAGTGCCAGCCGGTCA
ACGCAAGTAAAGTCGAAAGAGAATCATGTGGTGAAAAAACCATTAAACGT
TTGGTGGAAGACGCTCATAGATATGGAATTGAAAAGGTGCATTGCTACGA
TGAACCCTTTAATTTTGGTCATGTAGAGCTACCGACATTGGGAGAACAAG
CAAAGAAAGGAATCGTCACTATGTTAAATGTTTACGTCATCAACGACATC
GATGAAAAACCGAATTTGCTTTGAAAGCGAAGGGCGTTGTTTCAGTTTTG
ATCAATGGAACGCAAAAAGGAAATAACACCGCCTATTATATTGGAAAATA
TTTTGCGAATGATTTAAATTGGTGTGGATGTGATAATTGTGCTGGAGGAA
TTGATTATGATTTCTGTAATGAGACATGTAATAAACTGATACCATTCCAT
GGTTATACGTCGGAGTATTGGGCGGAGGCATCACGAATTACAATGTTTTG
GACAGGAACACGAGACGTGGTTCATGATTTCACTCATGTCAATGATGACT
ATCGGACCTTAGAAGAAACTTTTGCAGGATGAGATCAATTGTTGCATGTT
TAGCATTGCTCAACTTGATAGTCAATGCACAATATTCTCCTTCGAATTAC
AATGGCACTACACCAGACCTTGAAAGCATCATGAAAGGGCGGTGCAGTCA
ATACAAAGTGTTCAATCGAGATCCTGAACTTCAAGTCAAAGTAGATTGCA
ATGAATTATGGAATACGTTCACAAAAGCATTCATTAACAAAGACCCCTGC
AAAGTCAATTTCACTGGAGCTTACAAAAAGACTTTTGAGCTGATCGATAA
CAAGCATTTTTATACAAATAAGCTGGAAAGAAGCGACCATAGCCCTGATT
GCTGTTTCGTGTGTTTTATTCATCGCTGTCATCCTTCTCCTCGTCTTGTA
CAATCGACGAAGAATGGATTCGTCTACCTACAAACGAGACATCGATACAT
AGGATGGTAAAAAGTGTATTATGTGCGAAATACCCAGATGCTAGAGAGTG
CCAGCCGGTCAACGCAAGTAAAGTCGAAAGAGAATCATGTGGTGAAAAAA
CCATTAAACGTTTGGTGGAAGACGCTCATAGATATGGAATTGAAAAGGTG
CATTGCTACGATGAACCCTTTAATTTTGGTCATGTAGAGCTACCGACATT
GGGAGAACAAGCAAAGAAAGGAATCGTCACTATGTTAAATGTTTACGTCA
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TTTCAGTTTTGATCAATGGAACGCAAAAAGGAAATAACACCGCCTATTAT
ATTGGAAAATATTTTGCGAATGATTTAAATTGGTGTGGATGTGATAATTG
TGCTGGAGGAATTGATTATGATTTCTGTAATGAGACATGTAATAAACTGA
TACCATTCCATGGTTATACGTCGGAGTATTGGGCGGAGGCATCACGAATT
ACAATGTTTTGGACAGGAACACGAGACGTGGTTCATGATTTCACTCATGT
CAATGATGACTATCGGACCTTAGAAGAAACTTTTGCAGGATGAGATCAAT
TGTTGCATGTTTAGCATTGCTCAACTTGATAGTCAATGCACAATATTCTC
CTTCGAATTACAATGGCACTACACCAGACCTTGAAAGCATCATGAAAGGG
CGGTGCAGTCAATACAAAGTGTTCAATCGAGATCCTGAACTTCAAGTCAA
AGTAGATTGCAATGAATTATGGAATACGTTCACAAAAGCATTCATTAACA
AAGACCCCTGCAAAGTCAATTTCACTGGAGCTTACAAAAAGACTTTTGAG
CTGATCGATAACAAGCATTTTTATACAAATAAGCTGGAAAGAAGCGACCA
TAGCCCTGATTGCTGTTTCGTGTGTTTTATTCATCGCTGTCATCCTTCTC
CTCGTCTTGTACAATCGACGAAGAATGGATTCGTCTACCTACAAACGAGA
CATCGATACATAGGATGGTAAAAAGTGTATTATGTGCGAAATACCCAGAT
GCTAGAGAGTGCCAGCCGGTCAACGCAAGTAAAGTCGAAAGAGAATCATG
TGGTGAAAAAACCATTAAACGTTTGGTGGAAGACGCTCATAGATATGGAA
TTGAAAAGGTGCATTGCTACGATGAACCCTTTAATTTTGGTCATGTAGAG
CTACCGACATTGGGAGAACAAGCAAAGAAAGGAATCGTCACTATGTTAAA
TGTTTACGTCATCAACGACATCGATGAAAAACCGAATTTGCTTTGAAAGC
GAAGGGCGTTGTTTCAGTTTTGATCAATGGAACGCAAAAAGGAAATAACA
CCGCCTATTATATTGGAAAATATTTTGCGAATGATTTAAATTGGTGTGGA
TGTGATAATTGTGCTGGAGGAATTGATTATGATTTCTGTAATGAGACATG
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TTCACTCATGTCAATGATGACTATCGGACCTTAGAAGAAACTTTTGCAGG
ATGAGATCAATTGTTGCATGTTTAGCATTGCTCAACTTGATAGTCAATGC
ACAATATTCTCCTTCGAATTACAATGGCACTACACCAGACCTTGAAAGCA
TCATGAAAGGGCGGTGCAGTCAATACAAAGTGTTCAATCGAGATCCTGAA
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AGACTTTTGAGCTGATCGATAACAAGCATTTTTATACAAATAAGCTGGAA
AGAAGCGACCATAGCCCTGATTGCTGTTTCGTGTGTTTTATTCATCGCTG
TCATCCTTCTCCTCGTCTTGTACAATCGACGAAGAATGGATTCGTCTACC
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AATACCCAGATGCTAGAGAGTGCCAGCCGGTCAACGCAAGTAAAGTCGAA
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TAGATATGGAATTGAAAAGGTGCATTGCTACGATGAACCCTTTAATTTTG
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GCTTTGAAAGCGAAGGGCGTTGTTTCAGTTTTGATCAATGGAACGCAAAA
AGGAAATAACACCGCCTATTATATTGGAAAATATTTTGCGAATGATTTAA
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AATGAGACATGTAATAAACTGATACCATTCCATGGTTATACGTCGGAGTA
TTGGGCGGAGGCATCACGAATTACAATGTTTTGGACAGGAACACGAGACG
TGGTTCATGATTTCACTCATGTCAATGATGACTATCGGACCTTAGAAGAA
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ATAGTCAATGCACAATATTCTCCTTCGAATTACAATGGCACTACACCAGA
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TTCACAAAAGCATTCATTAACAAAGACCCCTGCAAAGTCAATTTCACTGG
AGCTTACAAAAAGACTTTTGAGCTGATCGATAACAAGCATTTTTATACAA
ATAAGCTGGAAAGAAGCGACCATAGCCCTGATTGCTGTTTCGTGTGTTTT
ATTCATCGCTGTCATCCTTCTCCTCGTCTTGTACAATCGACGAAGAATGG
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ATTATGTGCGAAATACCCAGATGCTAGAGAGTGCCAGCCGGTCAACGCAA
GTAAAGTCGAAAGAGAATCATGTGGTGAAAAAACCATTAAACGTTTGGTG
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TGCTCAACTTGATAGTCAATGCACAATATTCTCCTTCGAATTACAATGGC
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AATTTCACTGGAGCTTACAAAAAGACTTTTGAGCTGATCGATAACAAGCA
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TCGTGTGTTTTATTCATCGCTGTCATCCTTCTCCTCGTCTTGTACAATCG
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GTAAAAAGTGTATTATGTGCGAAATACCCAGATGCTAGAGAGTGCCAGCC
GGTCAACGCAAGTAAAGTCGAAAGAGAATCATGTGGTGAAAAAACCATTA
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TTGTACAATCGACGAAGAATGGATTCGTCTACCTACAAACGAGACATCGA
TACATAGGATGGTAAAAAGTGTATTATGTGCGAAATACCCAGATGCTAGA
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AAAAACCATTAAACGTTTGGTGGAAGACGCTCATAGATATGGAATTGAAA
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ACATTGGGAGAACAAGCAAAGAAAGGAATCGTCACTATGTTAAATGTTTA
CGTCATCAACGACATCGATGAAAAACCGAATTTGCTTTGAAAGCGAAGGG
CGTTGTTTCAGTTTTGATCAATGGAACGCAAAAAGGAAATAACACCGCCT
ATTATATTGGAAAATATTTTGCGAATGATTTAAATTGGTGTGGATGTGAT
AATTGTGCTGGAGGAATTGATTATGATTTCTGTAATGAGACATGTAATAA
ACTGATACCATTCCATGGTTATACGTCGGAGTATTGGGCGGAGGCATCAC
GAATTACAATGTTTTGGACAGGAACACGAGACGTGGTTCATGATTTCACT
CATGTCAATGATGACTATCGGACCTTAGAAGAAACTTTTGCAGGATGAGA
TCAATTGTTGCATGTTTAGCATTGCTCAACTTGATAGTCAATGCACAATA
TTCTCCTTCGAATTACAATGGCACTACACCAGACCTTGAAAGCATCATGA
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TAACAAAGACCCCTGCAAAGTCAATTTCACTGGAGCTTACAAAAAGACTT
TTGAGCTGATCGATAACAAGCATTTTTATACAAATAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15116MSTRG.15116Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15116.1.p1MSTRG.15116.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15116.1.p1.exon9MSTRG.15116.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
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MSTRG.15116.1.p1.exon7MSTRG.15116.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15116.1.p1.exon6MSTRG.15116.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15116.1.p1.exon5MSTRG.15116.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15116.1.p1.exon4MSTRG.15116.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15116.1.p1.exon3MSTRG.15116.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15116.1.p1.exon2MSTRG.15116.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15116.1.p1.exon1MSTRG.15116.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000131_pilongenomesc0000131_pilon:529801..546035 -