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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000131_pilon:453473..462200- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15109.3.p1 ID=MSTRG.15109.3.p1|Name=MSTRG.15109.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8728bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000131_pilon:453473..462200- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTCAATTTCAACCTTAAGTACGGGTAAATAACAATTGTCAGTGCTTTTAA
GTGTGGTTATTCAAGCTATAATAGGCAAAGTGCGACATTCTATCATCATG
GCTAGATTTGTTCTATCAATATCTTTGGTGGTTCTTCTATTTGGTATAAC
TCTCGGAGAACAGATTCGTCCGACTCCATTTGTGATTCGTCCGACTCCAC
TGATCCACCGATGCCCTGCAGCAAAGCAGAAGTGGAGATATTGTAAGATA
ACCTTTCAGTATTTGCCAATCACGTGAATGTAGCACAAGAACCACAGGCG
ACTTTTTGCTGTGGAGGACTCTACCGACTGTTTATTTGCTATCCGCAACT
ACATCGAGGTTTTTGTGATACACGATATCATAGTGGGCAACACCCCTCCA
ACCCCCACCTGAAAAAGGTCACCCCCACCTACATAGGGTTACCCCCACCT
GAAATCTCATATCAGCCCAACCCCCACCTTTTTCAGCAACCTCGTCGGTA
GAAAGGGGCTACACCATACTCCAACTCATATGCGCAAAACGGCGCAATCG
AATCACACCTTCGAATTTGGAGGTCTTGTTCCTTTTAGGAACACTAAAGA
TCCCAGTTAAAAGTCCTGAGGACTACAAACTGGAAAGGAAAAGACTGGAG
AAAAAATGAACTTTTTTTAACCTTCAGAACTTATGAGAGTCATTTATTTA
TATTTTTATCTAGTATAGTATATATGTGGAAAGTTGAAAAAGACAAAAAA
GTACAAAATCAAACGGAGTTAAATACAGAAAACTTGACAACCCCCACCTG
AAAAATGTTACCCCCACCTACATAAGGTTACCCCCACCTGAAATTTCTCA
TCAACCCAACCCCCACCTATTTTTTAAAATCTGAAAATCCTCAACCCCCC
CCCAGAATCCAGGGGGGGGTGCCCACTATGGATATACTGTTCTTTGGTGG
ATTTAATCTTTTTTAATTGCATGTGGTATAACTTTCACGACATTTGCAAA
TTCTTTCCATTTTTTTACGTGATTTTTGCCAGAGGATATTGATTGGTAAA
ATTTAGTCTACACAAAAATTTGAAATCCAAAATAGGGACTCTCCGAAGGC
TTCAGACGGTTAAGTTATGAATAACTTTAAATTGTAGAGCTTTTTTCGTA
CATTTTTGTAGGTGGCGGAGAGAGGTATGATCGAGTTGCAGAATTTTGTT
GTGATGGTGTGAAACTGGCAAAAGAACCTTTCAAACGGTGCTGTGGGTGA
GTTAATGTTTGTAAGAATCATTTTCTTTAGCTTTTAGAATCAAACCACTA
ATTCCCAATATCAAGATGTTTGTTTTTAATGTTTCATTACGATATATTTC
GAATTATTACAATTTCAGAAAGCGCCTTTATGATATCGAATCAGAGGTTG
TCAAATGGTTTCGTCTTTGGCAAGGAAAAGAGGTGCAGAGGACAAACCTA
CGATCCTAAGGATAGTTTTTGCCACCGATGCCAAGTGTTCTCCCATAATG
AGTTTGTGTATTGCGATGGCAGCCTCTATCCTAAGACATCCCGAAAACAA
ATTTAAAGATCCCTATGATAACTTCGAAATTCATTTACCATCGTATCAAT
CAATACCAAGTCACGTGACGTTGTATGGATGAACTATTTTGTTTGCACAA
TAAATTATTATGAAAATTTAAAAATTATTTATAAGACAAGTATTGTGTTA
TTAAAACTTTCTGTATCCAAGAATTTATAATTTGTTATGGAGTATATTTC
AAATCTTTTAAGATTTGCATGTAATAAGATTTCTGAAATTACTTATCCAA
TTTTGTCCCGTGGGGAGTGGGGCACTCGGCACTCGAATTTGGGCGAAAAA
TTGACCCTTACCATGCATTTTCTTGAAGATTTTTGACCATTTTTAGGCAA
AATATGGTTAGATTTTCAAAATTTTACACCCTTAGAATGCACTTTTTCTC
ATCTTTGCTCATTTTGATCAATAATTGAATTATAATGATACATAAATCGG
AATATATGACATTTTATCACAAACTTACCAAAATGGAATCGCCACCACCA
AAACAAACATGTGTAACGGAAAATTATACCAACACTATTACTACGTCCTC
TGTAATGGAAATGTTTACCGCAAAATATAGGAAAACAAGTTTATTAGTTT
AGTAAAACTAGTATTTGCTCATTATTATTAATTTTGCATAGCGAAAGTAT
TACGATAGCCTTTCGCGGTGTAATAATAAAAAAAATAGAAAACGAAAATA
CTTGATAACCTGGACGAACTCACTAAAATCAATTTACAAAATACACGCTA
GTATAACCACGGACAATTTTGGATTACGTCATAATCTTTGTGTCTTTAGC
TGCACAGTTTTGATTTTTTCTTTATTTTCTTATAAACATATCCTTTATAA
AAATCAAATCAATAAGTATTGACCGACGGGGATATACCTTTCGGTAATTA
GTTCTTACAAAGTAAACAACGGACGGTGCACAATATGAGCATATTCATTT
TTCTCATAGGCATTTACTTTATAAGAATCAAATCAATAACTCTTGATAGA
CGGTGATATACCTTTCGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACAAAGGATGG
CGCACAATATGAGCATATTTATTTTTCTTATAAGCATATACTTTATAAGA
ATCAAATCAATAACTATTGATAGACGGTGATATACCTTTCGGTAATTAGT
TCTTACAAAGTAAACAAGGGATGGCACATAATGTGAGCATATTCATTTTT
CTTTACTTTATAAGAATCAAATCAATAACTCTCGATAGACGGTGATATAC
TTTTCGGTAATTAGTTCTTTCAAAGTAAACAAGGGATGGCGTGCAATAAG
AGCATATTTATTTTTTATAAGCATATAATTTATAAGAGTTCTTAAATATT
AAACAACGATTGTTGTTAAGTTGGTCTTATTTTTAGCAATTTTAAGCCTC
GTTGTTCTTGTAAAATTGTTTCATTAAGGCTTGATGTAAAGTAGATTTCA
GATTAGCTTCATCTCTACTTCTTGTTTTTCCCATGCAGTTCAAATTCTAG
GCGAAATTTTCGACTTCAAGTCGTCTTGTTAATTTCGCTTAGCGAAAGTA
TTACGATAGCCTTTCTGCGGCGGCGGCGGCGGTGTCATCGGAAAAAAAAT
TAGAAAACGAAAGTGCTTGATACGGTGGACGAACTCACTAAATTTAATTT
ACAAATTACACGCTCGTATAACCACGGACGATTTTCGCGGGTTTTCTTTG
GATTACGTCATATATCTTTGTGTCTTTAGCTCCACAGTTTTGATTTTTTC
TTTATTTTCTTATAAGCATATACTTTATAAGAATCAAATCAATAACTCTT
TATAGACGGTAATATACCTTTCGCTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACAAA
GTTTGGCGCACAATATGAGCATATTTATTTTTCTTATAAGCATATACTTT
ATAAGAATCAAATCAATAACTCTTGATAGACGGTGATATACCTTTCGGTA
ATTAGTTCTTACAAAGTAAACAAGGGATGGCTCACAATATGACCTTATTT
ATTTTTCTTATAAGCATTTACTTTATAAGAATCAAATAAATAACTATTGA
TAGACGGTGATATACCTTTTGGTAATTAGTTCTTACAAAGTAAACAAGGG
ATGGCACATAATGTGAGCATATTCATTTTTCTTTACTTTATAAGAATCAC
ATAAATAGCTTTTGATAGACGGTGATATTACCTTTGTTTATTAGTTCTTA
AAAATTAAACAACAGTTGTTCTTAAATTAGTCTCTTTTTTTAGCGATTTT
AAGCCTCGTTTTTCTTGTAAAATTGTTTATTTCAAATTGGCTTCAATCTC
TACTTCTTGTTTTTCCTATGTAGTTTAAATTCTAGGCGAAATTTTCGACT
TTAAGTCGTCTTGTTTATATCTTAGACTGTATGTAATTGGATCAAAATAT
TATATAAAGGAATATAAGTTACTTATAATTTAAATTTGTCTATGCAATAA
AATTTACATAAGACAATCATTGTATTTTCATTTCATCCGGAAGATACCCA
AACAAAAGGAAGCGCTATCAAAATTTAATACCAATCCCTTGTAGAACAAG
TCTTATTTGCTACCACTTCTCACAAGATCAAAAAAAAATTCGGTATTTGC
CCTCCGAAGATAACCAAAAGTAAACTTTTCAAGATTCAGTTGTCGAGTTC
CTCTAAGAATTGATTTTGAGTTTTGGATAACATATTAGATTTAGACAACA
CGTCCATTTGTCATCTTGAAAACTTGGTACTTTAACACTGGGATAGCCTT
TACAAAGTCCCCAAAAGGGTAAGAAATTTAGAGTTAAAAATTTAGTTTGC
GACGATCTTCTTTGAACCTGCTGTTTTCACATGTCCGACATATAAATTTC
GATCTCTAAGTATAAGTCTGTCCAGGAAAATTCTTAATCTTAGAAATTAG
CATATGTTCTTTTTCTCGATTCCACAGACCCTGGATGTGTAAAAACTTCA
AATTGATCCGCTGTGCTTACATTGTACCCTGTCTCACTGTGTCTCAGAAT
ACTTTGACTACTTATCTTGCAGGTTGTCTCAAACAAAATTGACTTGCTGC
TCTTGAGCTTTACCCTGTCTCACAAAATATGGTATGTAGTGGAGTCGTTT
AGCATAATTTACGGGAAAAAAAATAACATCTAGCTGAAACTTTCTCCAGA
CCTTCTCTATAGGATGGTTATGCCCCAGGAAAAAATCCCCTAAAATCCCA
CTGGTGAACATCCCTTTTTTAGGACATTTCTTTTTTCCCCAGGCAAAACC
CTAAGGGCGAAATTTTTTGAGAATTTCAAACTCATTTTCAAACATTATCA
AGTATACCATTCGAAAGCTCTCGAAAAACTATATGGAAGACTACTCAAGA
TAAATCAAGCAGAAAATGCAATTTATGGTCAATTTTAGACCAAAATGTGG
CGAAAAGTGGAACTTGCGCATGAAGGTTTGGAGAAAATTTCATCTAGATC
TTATTTTTTCTCTACAAACAGCCTGTATTTTTGTAACACGACCACACTAG
TGCTGTTCTTGTGTAGAAATTTATCTAATATTGTCCGGGCGTTTGGCGTG
CCTAGAAAAAAGTATCTGCTGGTCACCGATGAGAGAGTGCGCGGAGGGAT
TCCATGTCAAATACACATTCCCAGGGCTCGCCTCTTCAGAAACCCCCACA
TGAAATGCTTCCTATGTCCTACCTCAAGTAAAGGCTGATTCCAATAAAAA
ATCTAATTTTAAACACATAACTAAATAAAAGTTTTTTAACGACTTTCAAA
GAAGTTAGTACAGTATGTGGCCCCCAAAACGTCTATCCAAATTGAAATCT
TTCTAGTGAAATCAGAAAATAAGGAAAGTTAAATATTGTTTTGCGAAACA
AGCTTCAACATGTCTAGTTTCCTTCCCAAAATGCAATCTTCTTAGAATAA
AGGTTTTTCTATGATTTTTTTCAGTCAAAGTTGAGTGACATTTTTCTAAT
TGTTTTTTTTCGAAATATCTTAATCAAAAAGCATAGTACCGAAATCAAAT
TACTATCAATAGGTATGAAGGCAATGCTTTACGACTTTAAAAAGTCAAAA
TTTACTTTTCTCTTTATCTTCATACAAATGGTTGTCAAAACGGAGGTTAA
TGGCCCCAAAAGGTCGATTCAATTAAATTGAAATTGTTAAAAAACCATCA
TTTAATCATGTCTCGAACTAATGAAACGATAAAATAATTATTTTTTTGAT
AATTTGGCAAAAAAAATTCATACCAAAACAATAATTGTTTCAGGCCAGGA
TAAGTGCAAAATCCCGTGCAAAATACTAGCAGTATCTAATTTGAATTGTA
TTGTTGGTATATGTTTATACTTTCCCGATTTACCAAGTTTTTAGGGGTTA
ATTTCCGATCTTGTTTGACTTTTGACGATTTTAGTCAAAACAAAGGAATT
TTCGAAACTAATTTTTGAAAAAACAAAAGGAAGAAGAAAATTAGCCACGT
TAAAAATGAAATTTTGATATTTTTTAAAGAGAAATGTGTTAAGATTAAAT
CTGAAGCTTTTCCAGGTTTTAAAGTACCAACATGGCTTATTAAGGGAAAA
CCTCCGTTTTAGGGGCCGTCTCCGTTTTGGGGGCCATATACTGTAGCCTA
ATATCAGAAAAAAACTCAAGCTGTTAGTTACAGACAGGTTTTGGAAATGA
ATTTAGAGCATTGTTTAACGATTTTGGATTGATATTGTTGGAACTTAAGC
TGAGAATAAGACCATGTTCACACTATACTCGATAGCTTTTCGAAACGGTT
CGATAGCCCATCCGATATAATTGATATAATTTCGGTATGAAACGCTACAA
AGGACTTTCTTTGTTTAATGTGTTCACATTTGAGACGCGATGTAACGATA
AAAAAGAGTAATAATAATATCTCAAAAAATTATTATCGTCTCGAAAATCA
TATCGGATAGGGTGTTCAAACCCAAAAGATACACGGGTCCAGAATGTGAC
GGAACGCGACGTAGCACTTAGGACATCGTATCGTCTCAACACCTATCCGC
TACAAAAATCGGTTCGATAGGTTTTCTATCGTCATATCGGATAGGGTGTT
CACATTAACCACTTTCTATCGTCACGAAAAGCTATCCGGTATAGTGTGAA
CATGGTTAATACGATAATTATTTTTTTTAAAGATCTCCAAAAAGTCCCTT
TCTAGTCCCACCAAATTTCAATTTCCCACCCGAGCATAGTGCGGATATAC
ACTAAACGATGAAAACGTTTACCCGGACAAAAATACTACTATCTTTATTT
AACTAATGGTATAACAACTTTAAAGCACCAAAGGTCTGTAGGTCAATTTT
CATCAAGAGTCATTCCTTAATAAATAACAGCAGATATATATATATGGGAA
AATTATAAGGAAAAAAGGTCAATGGGTGCAGAAATATTGTGGAACCACTT
TCTAGGAGAATCAAGTCCAACATCGTCTTTTAGGTAAGGTGGTAACCCCA
CCCACTAAAGTAAGAAAATCCTGTCACAAAATGTTATTTCGAATTTCATT
TTAACGGATGTTGGATCGACATTAACAATATTTTTATCAGGGATAGGAAA
AAGTGACAAAAAAATTGAGTAAGAAAGAAGGAGAAAGGCATATCGACCTT
TGACTCGTATGAAGCAAAAGGGAACGAAAAAAGCCCATTAAAATAATATG
GTACATAGAGTTTGTTCAAAAATTATGAAGCAATCGTATGAAGCAAAAGG
GAACGAAAAAAGACCATTAAATAATATGGTACATAGTGTTTGTTCAAAAA
ACTTTTTTCTAGGTAGAACGATCAGTATAAAAAGGCCAATGCCTGTAGAC
ATAGATACACATCGCTTGCTTTAATTTCAACCTTAAGTACGGGTAAATAA
AATTTTCCAGTGCTTTTAAGTGTAGTTATTCAAGCTATAATAGGCAAAGT
GCGACATTCTATCATCATGGCTAGATTTGTTCTATCAATATCTTTGGTGG
TTCTTCTATTTGGTATAGCTCTCGGAGAACAGATTCGTCCGACTCCACCT
GTGATGACTCCACTGATCCACCGATGCCCTGCAGCAAAGCAGAAGTGGAG
ATATTGTAAGATAACCTTTCAGTATTTGCCAATCACGTGAATGTAGCACA
AGAACCACAGGCGACTTTTTGCTTTTGAGGACTCTACCGACTGTTTATTT
GCTATCTGCAACTACATCGAGGTTTTTGTGATACACGATATACTGTTCTT
TGGTGGATTTAATCTTTTTTAATTGCATGTGGAATAACTTTCACGACATT
TGCTAATTCTTTCCATTGTTTTACGTGATTTTTGCCAGAGGATATTGATT
GGTAAAATTTAGTCTACACAAAAATTTTAAATATAAAATAGGGACTCTCC
GAAGGCTTCAGACGGTTAAGTTTTGAATAACTTTAAATTGTATAGCTTTT
TTCGCACATTTTTGTAGGTGGCGGAGAGAGATATGATCGAGTTGCAGAAT
TTTGTTGTGATGGTGTGAAACTGGCAAAAGAACCTTTCAAACGGTGCTGT
GGGTGAGTAAATGTTTGTAAGAATCATTTTCTTTAGCTTTTAGAATTAAA
CCACAATTCCCAAAATCAAGATGTTTGATTTTGATGTTTCACTACGATAT
ATTTCGAATTATTACAATTTCAGAAAGCGTCTTTATGATATCGAATCAGA
GGGTTGTCGAAATGGTTTCGTCTTTGGCAAGGAAAAGAGGTGCAGAGGAC
GAACCTACGATCCTAAGGATAGTTTTTGCCACCGATGCCAAGTGTTCTTC
CATAATGAGTTTGTGTATTGCGATGGCAGCCTCTATCCTAAGACATCCCG
AAAACAAATTTAAAGATCCCTATGATACCTTCGAAATTCATTTACCATCG
TATCAATCAATACCACGTCACGTGACGTTGTATGGATGAATTATTTTGTT
TGCAAAATAAATTATTATGAAAATTTAAAAATTATTTATAAGACAAGTAT
TGTGTTAGTAAAACTTTTTGTATCCAAGAATTTATAATTTGTTATGGAGT
ATATTTCAAATCTTTTGAGATTTGCATGTAATAAGATTATAAGATTTCTG
AAATTACTTATCAAATTTTGTCCCGGTGGGGGTGGGGCACTCGATTAAAA
AACGACTATACGTGCGGCCTAAAATTAGGTCTTTGAAGTCAGACCCTTAC
AGTGCAAAGAAAATTTAGCCAAATTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000131_pilon:453473..462200- >MSTRG.15109.3.p1 ID=MSTRG.15109.3.p1|Name=MSTRG.15109.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1260bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000131_pilon:453473..462200- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAAGCGTCTTTATGATATCGAATCAGAGGGTTGTCGAAATGGTTTCGTCT
TTGGCAAGGAAAAGAGGTGCAGAGGACGAACCTACGATCCTAAGGATAGT
TTTTGCCACCGATGCCAAGTGTTCTTCCATAATGAGTTTGTGTATTGCGA
TGGCAGCCTCTATCCTAAGACATCCCGAAAACAAATTTAAGTGGCGGAGA
GAGATATGATCGAGTTGCAGAATTTTGTTGTGATGGTGTGAAACTGGCAA
AAGAACCTTTCAAACGGTGCTGTGGATGGCTAGATTTGTTCTATCAATAT
CTTTGGTGGTTCTTCTATTTGGTATAACTCTCGGAGAACAGATTCGTCCG
ACTCCATTTGTGATTCGTCCGACTCCACTGATCCACCGATGCCCTGCAGC
AAAGCAGAAGTGGAGATATTAAAGCGTCTTTATGATATCGAATCAGAGGG
TTGTCGAAATGGTTTCGTCTTTGGCAAGGAAAAGAGGTGCAGAGGACGAA
CCTACGATCCTAAGGATAGTTTTTGCCACCGATGCCAAGTGTTCTTCCAT
AATGAGTTTGTGTATTGCGATGGCAGCCTCTATCCTAAGACATCCCGAAA
ACAAATTTAAGTGGCGGAGAGAGATATGATCGAGTTGCAGAATTTTGTTG
TGATGGTGTGAAACTGGCAAAAGAACCTTTCAAACGGTGCTGTGGATGGC
TAGATTTGTTCTATCAATATCTTTGGTGGTTCTTCTATTTGGTATAACTC
TCGGAGAACAGATTCGTCCGACTCCATTTGTGATTCGTCCGACTCCACTG
ATCCACCGATGCCCTGCAGCAAAGCAGAAGTGGAGATATTAAAGCGTCTT
TATGATATCGAATCAGAGGGTTGTCGAAATGGTTTCGTCTTTGGCAAGGA
AAAGAGGTGCAGAGGACGAACCTACGATCCTAAGGATAGTTTTTGCCACC
GATGCCAAGTGTTCTTCCATAATGAGTTTGTGTATTGCGATGGCAGCCTC
TATCCTAAGACATCCCGAAAACAAATTTAAGTGGCGGAGAGAGATATGAT
CGAGTTGCAGAATTTTGTTGTGATGGTGTGAAACTGGCAAAAGAACCTTT
CAAACGGTGCTGTGGATGGCTAGATTTGTTCTATCAATATCTTTGGTGGT
TCTTCTATTTGGTATAACTCTCGGAGAACAGATTCGTCCGACTCCATTTG
TGATTCGTCCGACTCCACTGATCCACCGATGCCCTGCAGCAAAGCAGAAG
TGGAGATATT
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| sc0000131_pilon | genome | sc0000131_pilon:453473..462200 - |
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