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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000131_pilon:198255..211566+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15098.3.p1 ID=MSTRG.15098.3.p1|Name=MSTRG.15098.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13312bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000131_pilon:198255..211566+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGAGCtagattaaaatattaaaaaaagaggaaaattgaGAGAGGGAAAAT
GAGAAGGCTGGACTCCGTTTGGATTCGCTGAAGTTTTGGgctgaaaaaac
aacaaagaaggGAACAGATACTCCAAGGATACTTGGCGACCAGCTCAACA
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CCAGCagttatcttttattttccaaaatccaATATATAATCTTCAAAAAG
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tgcttttgtactttagtttgCCTTGAATGGCTTTTTATCGATATCAATCT
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GCCCCCATCAGTCAAAAGGGGTTCTTTGTCCTCATTGGTATTTGCCCCCC
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TTTTGTCTTACCTATTAACCTTGAATGAGAACTTTAGTGGAGACTCCaaa
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GCAACTTGAAACCTTACGCAATTGTAGTGTATTCAATCTTACAATCTTAC
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tgaaaataaatgctTCAACAAAACGCTACTAATCTTATCTTGTATGTCTT
AATTTATCTTTATACACTTGCACGATGTCTGGTCTTTCGTTGAAGTGCAT
TCTTTTTGCAGTCGAAACTGTGACATGCTGTTGTTTGTAAGGTAGAGAGT
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TGTGGTTAAAAATTAGtctagacactttcaaaaaatttatttaatcaaaa
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ttaaaaaggtttataaGAGAGTGAACAAACTTTCAGTGACCATTGGTTTG
AATGGAAAAGGAggttattattttgaaaatttcttgacTGTGCTCTAAAT
TGCTTATTCTAATCTGCATTTATTCAATCAATCTTCTTGTTTATAGGTTT
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TAAAAGCCTTGATTTTTCGTACCATCTTTCATTGGCTTCATAAAAGGTTT
TTATACCATTATGTTAAAGACCAAAGCAGTGGTTACCATTTTACCTGTAT
TGTAAAGATTTCATAGACTTTATCAAAGGTTTTTCATATAATTGTGTTGA
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TTTATCAAAGGTTTTTCATATAATTGTGTTGAGGATAAAGTCAGTGGTTA
CCATATTACCTGTATTGTAAAGATTTCATAGACtttatcaaagttttttc
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TAAAGATTTCATAGACtttatcaaagttttttcaTATAATTGTATTGAGG
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TATAATTGTGTTGAGGATAAAGTCAGTGGTTACCATATTACCTGTATTGT
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ACCATATTACCTGTATTGTAAAGATTTCATAGACtttatcaaagtttttt
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GTAAAGATTTCATAGACTTTATCAAAGGTTTTTCATATAATTGTGTTGAG
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tttatcaaagttttttcaTATAATTGTGTTGAGGATAAAGTCAGTGGTTA
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ATATAATTGTGTTGAGGATAAAGTCAGTGGTTACCATATTACCTGTATTG
TAAAGATTTCATAGACtttatcaaagttttttcaTATAATTGTGATGAGA
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ttatcaaagttttttcaTATAATTGTGTTGAAGATAAAGTCAGTGGTTAC
CATATGACCTGTATTGTAAAGATTTCATAGACTTTATCAAAGGTTTTTCA
TATAATTGTGTTGAGGATAAAGGCAGTGGTTACCATATTACCTGTATTGT
AAAGATTTCATAGACTTTATCAAAGGTTTTTCATATAATTGTGTTGAGGA
TAAAGTCAGTGGTTGCCACGAGGTTTTAATGATGTTCTTCTATAAGTAAT
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tttcgttttttataaaaaagacatcaaagaatttttgaagcccacggatg
ttcttaactttttaagtttaaagcctaaaaatgttcttattccCACCAAT
TTgcaagtatttttgtgcaattttttaagaaattggatgttttaaagtcc
gcaaagccttgaaatgttcttaacttgttcttaatattttggccatcgaa
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CTCAGGTCATCTTTCTCTAATAACAATGTTACTAAGGCTTTGGTTCAAGC
TGCAAAAGCTGGTCTGTCTTGTGTCCAACATATTATGGCTTTCTTACAGA
TGATAGTTGCACTGTGAATTGCGGTGGATAGTTTTTTAATGCTTACTTTA
ACAATGTTACTAAGCCTTTGGTTCAAGCTGCAAAAGCTGGTCTGTCTTGT
GTCCAACATATTATGACTTTGCTTATAGATGATAGTTTCACTGTGAATTG
CGGTGGATAGTTTTTTAATGCTTACTTTATTAAAATCTTACATTCTGATA
GTCATCGTCGTTTTTTGCTGGTTCTACAGAAATGTCCATACTCTCTTCTC
TCTTATCAAACACTCTTCGTGCTTTCTTGAGACGGGCTACAACACCAACA
TTTATTTTGTTTCTCTGAAACTCGACTTTCACTCTCTGTGTATCGAACAA
TTACTGATCCTGTCTTCATGATGTTAGCGATTGGTTTACAAACCTTCTTC
TCACAACAACGTTATGCCTTTTTGTTCAATCTGCTAAAGCTGGTTTGTTG
TGCCCACCATTTTGTTAAATATGCGATCTGACAAAACCCTCACCAGGTCC
TCAATGTGTGTTTAATTGTTACAAATCACTGTTCATCTGGCTTCGTTTAC
CAGACCTTTAGGTGTTCCTTTTCATAGAGATTACGTCATGTTTaacaaga
aaaatagttttggcATCCCAAACGCTCGCTTTTGTCACCTGTGACGTCAC
CTAccatttgtttatttatctCCACCAATAGAGAGCGCGATGCTTGAAAT
TTTTCGATGTCCATTCATCATGGCGTGTCACTTTGACCCTTCACAAAAAC
CCTCTTAAAGCTGTCGTGGAAGACCTCCAATCCTTAAGAATAAAATTTTC
TGTAAGCACATCAAATGATCGGAGACAGTTATAAGATCGCATGCTGTCTT
CTAACTCTAAGAGGTGTTTCTTCAGAGAATAGCTACCCATGGCCTCCTCT
CCTTGGTTATTTGAAATTAAAGACTTGCAAAACCCATGTTTGACACATTC
CTTTAATCACTCTTCTAATTTTATTGTATGCTGAACTTGAGATCTTCTAA
CTCTTTGTTGTTGCATCATTATAACCTGTgccttttctttcttctttggT
AATTTCAAATTCCATGCCAGCTTAACTGTGTTGCACTTCAACAAGGGCCA
TTAGCCCTCTTTaccatttattttttgtaagaacgtTTTACTAAAAACCA
TTTTATTCATCGAACAATAATACCACATTTTCCGTGTAATGTAATTTTAA
GTATGTTTAACTCATGTTCATATCCTGGCTATCCTGTTTGATGAACCCTT
ATTTGCGGCACTACAAATCGGCGCTATTTTGGTGCAGATAAAGATCCTAC
AaagttttgttttatgttttgtgttcttataaataacttctATTGTGTGT
GTCATCATAAAGAGCTCTTTTTTAAGGGCActcttattttcttctttttg
ttgtgGGTCCTTCATACTCCTCACTAAATACCGAATGCATGCTCGAGTTT
TGATATATGGAAAGAGTGATATCCATAACTTTGATGGCTTTAGTTATAAT
TGATATGATATTTTGGTTATTTCTCTTCAAATGGTTTGAATAAGTAAGCC
TTTTGACCAAGGCAACCATGTTTAGATTTCAAACATTGAGCTAAGAAAGG
GATGGCAGGGGGTCAGGTGGCAATTGTCCCTTCAGTGGCCGAtttttttA
GCGGACGCTGAAAGACAAGGAACGCAAAGAACacctctgattactaattt
cggcaCCCCCTTTTTTAGTAGTTTAACATTAGTAgttcaagaaaaagaaa
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attttataagGCGCCAAAATCCTAAATTCGAAAATTTCCTCCCTAGTTTG
GTGAGATTTTTGTCTACCCGGCATGCTACTTGAGTCAGCCAAGGTGTAAT
GACTTAACGCAGAATCTGTCTAGGCTACTATTTTGTAGCATTAAAACCTG
TAAGTTTTCTCTGGATTTTACTTCTATAGTTTTTAGCTCAGTCAACCACC
AGGATTGGATTGAAATGCTGTATTTTGAGTTGAGCTGAAAACCTCGAAAA
TATATTTAGCCTTTAGATTCACCCATACCCCTTTGGATTCCTCAAGGATa
gattatttttcataaagagATAATGGCACTAAGGTATAAGTACAATAATC
TGAACTATTTCAACGATTTCTGTTTTGGTATTGATATCGTCCATTTTGGT
ATGTGTAGAATGTGCATTTGTGGGATATAAAATGAATAAAGATACCGGCA
TTCTAATCCTATCAAGGATAGTTAATGCTAAATCCTCACGTCATGGCGTG
CTAAAGATTTACACTTAAATTCAGTCTTCACATTTACTTTACATTCTCTT
GTGAATCGATCAGGATTTTAGGTTGAACGCCTTTAGGTGCTTATTTTTGT
GCTTTCAAGTTTTCCTACtggtacacacttttttatagaGAACAATGTTA
TAAGAACACGAGActgaaaattggctaaaattaAGAGCAACCCtcagcct
cagatttcagaaataaCTTTAAAAGTATATACTGactttaacagatttta
aacccattttaaggttttaagtaaagaaactaagcgtattaGGAACAACg
caagaacatttaagcctgaaaatgtcaaaaaattaagaatggcCCATTCT
GAGCCAAAATGtgctagttcttataaaaaagagtgtttcGATCGTTTTTA
GACGGTTTAATAAATTTCGAACGAGCTCAAACATTTTTGCTGACAACAGC
AACTTTCATGctgttgctttttataagatacgattattgttattttcgat
tttaaatAAACATCGAAAAACCAAATATTAACCAAAAACATATTTACAAA
GAGTATTTTACTTTTTGAGGAGTTTTTTAAGTCCGAAGGAGAAGTTCTTA
TCAAAATATAACatagttttaactttttgtttgaactttttatctctgtt
gttttacactttgataagaactttCCAAGTAGCTTTTCCTTCCAATAATA
TTAGACTTTCTACTCTTCAAAATTTCCGCCCTTTTTTAATTAACGTTGGA
GAAAATTGGTATAACTTTGCTACAATCtggtaagattttttaaattaatt
tgacAATCTTCGTAGAAGGTTTGATTATAGCCTCGTTTTCATAATGTTTG
ATTTATACGGTGCCGATCTTGATACTTTTGATTATGGAGACCTTtgtgaa
aattattttgctGACATCCTATTAGAGGTaggatatttttttattttttc
atcaaatttgtatTACAATTCTCCACCAGGGTTTTTCAAATAACATTCTA
GGGTATCATAGCACCAACTGAGAGTAATATAACCCCGAGGGAGGATGGGG
GTAAGTgcccttttttaaacccttgaaAGTCTCTCATTAAAGGTGCAAAA
AACGATAATTAGACCTTTTAAAAAGGTCccaaaatatcgaaatatgaaaa
attgaccccCTCAAAGGGTCGTCAAATCTAGtaattttgagccaaaaatt
gcaaaatatagactcaaatagatagacaaaagatagactcaaaaggtctc
aaaaaCGTTTAAatttagtctctcaaagggtcgattttcgaacctTGGGT
CGGACATACTAGTAACCCCGGGACTACCGCGTTCCACGAggggggggCTG
TGTACCGCGGAAGTATTATTTTTGGactaaaaactttttgtcacAATCTA
TGAATAACATTAGGAACTGCATTTTCCTACCCCACGACGAAACGATTATT
TATTCCCTAATAAGGTATAAATAATAACAACtggatgttttttattttct
tcttccatcatccatttctttgtttcttaattcttctcttttctttttcg
tttcattagcctgatgtttttttcattactttttctcaaaaataaaaccC
TTGCTAGAATTTAATCtaataacagatcatccattctgcgcataTCATGc
tttgctctaaagggatgtgggGAATGTGGtgatctgacctggttgttcaa
ccaaaacattcaaaaccgcgttaccttttgcttgaaaacgaaagtgaaag
cgaATGTGTTTTAATATTTATGCACATGATTGATGTTTGACTTGTTGCGA
TTGTTTTGCGCAAAAAGCTCGTTATTAATATTCTTCCCATATCTCGATGA
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GGCCTTTAAGGTGAAACCATAAGTGGAGTAATCAGAATCTACTCGGAGAT
AAGCTCGAagttaaatgtattttttaaaaattccttttaaaGCCGTTTAC
CTTTTTGAATCAAGGAACTTGCGGAAAGGAATCAATTTCATTCGATTTTT
GGTCGGTGATGAGGAATGAGGCGAGTTTTCTCACTCATTCATTGGTCAAC
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aaaaacatataattataaaaatattagtgcctttttatgtttcatcttta
ttttatttagtattttcaacactttctctccttgaggtcagatctctgat
cttcaccatatatatagacaatattataaaaacataaaacacaATTTCTT
TGAACGATATTTCGACCTTTACAGATCTTTATCAAATTTCAGACAATATT
AgatataaagtaaacaaaaaaaaaacaccacaaCCAGCCGTTCGGCTGCA
CTCTCCACATACACACATCATGATGAGAAACATATTAACCAATCAAAACC
CTTCTTTTTACCCTTACTCTTTCCCTGAATATCAAAATCGTTTGCTCAAC
AGAGTAAGTGTTATCGCTTCATCTCACTCTGATTCGACTTGATAGTCTTT
ATAGTTCGACTAGTTCGTTTATAGCTTCCTTAATTCAACTATTAGGGCTC
AAACTAACAAAGTTCAGCAGACCTTTTGTTTTTTGTTctctgaagatttt
tttctcttccCTGAATATTTCAAGTACCGGACCAGGGACTTCTTTCTACC
TTGATTTGATATGGAAAGTCAGCCGGCATTTGTGCAAATGAATGATATTT
CCCATCTGCAATCAGGTGATTTTGAACTCCTTTTGCACCTTTCAGACGGA
TAGACACATCAATGTGGAGGATGATGATAGTGATACTTCGTCAACAATCT
CCAACAACGATGTAGATGTTAAAGAGGCTCTTCGTTCATCTATCAGCCTC
AATCTCAAATCCAAATTCCAAAAAGGTTTGTCAACACTGTTCAATTTTGC
TTTGCCTGCACCAGACTATCACGAGCTTTTTAGACAACGTTTTGCCTGTA
ATCTTTTTACAATACTCCCCCATAAGATTCTACCTACCTATTTGTACCTA
TTTGTGGCTTCTCCTTGAACATCTCATCCAACTCGTTGAGTCCGATGCTT
CGACATTTCCTTGAGGCTGTTGGAGTCAGCTTGCCTAAGGTTGAAATAGT
GGGCAAGCAGTGGTTCGCCCGGAACAATTGTGAGGAAGGTgtctaagtgt
tttttgaatacttctttggggCAGTTTTTCTAATCTCTTATTGGTCTGGG
TCTTATTGTTGGATGAAGATTAACATTTAGGATGATGGACATTCTGGGAT
GAATAATTTGAAGTCAATACAGTATTATTTTAAGAAATTGGCCTCACTTC
GATGGAAAACAGAACACCTAAGACGTAATAGCccaacaaaatgaagaaat
cttTGTCTTAAAATTCGGTGTAGAAAAATCTTTGCTTTAACTCTGTTTAC
AATTTTGTGACTTGGTTTTCACAAAAGTTTAAACTATGATATTTACAAGA
AATCTCCTTCATGCATTTCATGTACGTCCTTCAAACTTGATTGATGTTCA
GTTCTTAAAATCAAAGGAAATTAAGCAATATTTATTTAAAGAATTTGGTC
TGATAATTTTTTGGGTAAACTCTTTGTTTTCCGTTTGCaacaaaatcttt
attttgactACTTTGTTAAAAAATAGCCGATCAGTGAAAACCTATTCAGA
TTTGTGAGTCAAATAATTCAACAAATCTCGATCGTCAATTCTTTCAGGAG
ATTATCCACCGACACTTCACAACAGTCTGACGTCATCATCTACGTCATCA
ACCTCGGCCCCATACCTTTACCGCCCACATCTCGACCTTCTGGACAAACC
AGCACGACAAGACGACGAAATGTCTCACGTTTCAACGGATAGTATTGATA
TTGGAACGCCCGCATCGATGGCGGCCGCCCCtggtaaaaaagaaaagaaa
cctaAAGTAAGGCTTTAGTCTGCAATCTGTTTGAGAaacggttggcaaac
gatatcatactccaggatgcatcgtctcttattttctccctattttctac
ttttctatcttctatcctgattttctgtctttctcaagtgtttctaactg
ttttctaagtatttttctgaaatttgcccgtaccggtgaaacaggtctcc
gaccccggctcgaaccaccaaatgcaagcaaccttggtttacaaacccaa
tgcctaaccgcttACGCCAACGAGACACACCAGAAAGccgtcattcacaa
atacttatagcgtgtaaattacagaccttaattaagaaagctcccaaccc
taccggtgctcctacaaggatccctacgggatcctaagttaagtcacagg
gtacgaatgcccctaagaaggccttcggccttatattgtgactctcgagc
tccaaccctaaccctaactgataataaccgaacccccgtctaggtccgcg
gattgaaaaatttcatttgcatcctggagtatgatatcgtctgccaacct
tGAGAAACAGTgaacataattttaaaaagataatgacttttttgtgccAA
CGTTATGACCTATCATTTCTTGGGAATAGAATATCCATTGATTGAACAAA
CAAGTTATTTCATTAAATATAACGAACTCTAACTGATGAATTTTTTACCA
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AAGAAACGGCTGCCATGCGACGAGAACGAAACAGATTGGCCGCTCAACGC
TGCCGACAACGCAGAAGGGATCGAATCGACAAACTCGAAAAAGTAAGTTT
GATCTCGTTTTCCTAGATTGTTCACCAGTTATAAAACTatgtatttaaat
tttaagtcgTCAAGAATTTTTATAGCTGAATTGATATACCTTcctaaaat
cttcaaaatatctCTGAAATAACTGAATTCTCGTATATGTCTGGTTCGTA
GACACATAGAAACCATGCGGGTCACGCATTTTTAATGGCAAATAAAAAGG
TTTTATTTCCCACCCAAGAGATCCCTCTCTAGCTTTTCGGGTTTTGAAGT
TAATCTTTTCACACAGATCTTTTTCAGGTAACTTTCAACCTTTTTAATGA
TCTCTATtctcttctttttattttagatatGCGATAAGCTTGAAAATGAC
GGTCAAAAGCTTGAAACAGAAATTACCGGACTTCAAAGTGAGATGTcaca
tttacaaaaaattctGAACAATCATAAATGCATGGCCATGCCTCCTCGAA
TAAAAAACGAACGCGAATATCCATTTGATAGATACGATAGTCGGATTGTG
TCGAGTTAGTTAACGTTGTTTATGTTCATTACCTGTGAAAAGCTCAAATT
GTTGCTTTGAGAACGCGGGAGTAGGTATTGGTGACAAGCGGGAAAACTGA
TTCCAATCGTAGGACAGGAGATTTACAATGGCGATAGCAATGGATTAtgt
ttgaaatctttttgatcttttgaatctggttttgttaaacgttggttgtt
tgattttgaGTACCGAAAAAACTTAGCTTGAATCTTTTCACTTTTGGTAT
TACATCGCAAAACGTAAAAGCTTCTATTAAGCTTTGCGAGATGATTTCTC
ACTGAACAATATCATTGAGTGACAAACAGGACCTCTCATTCTAATCATTG
ATATTATATCTCAAGTTATATGGACTATTTGGAAATAGATGTTCAAGAGG
AAAACGAGAGGATCCACCTGGGGTACTTAAGCAACACaggtgatgggtat
gtgcgagccattagggtaccttttcataccttaaaagtccctcaaaggga
tACAAATTAATAGGTTTGTCTGAAAGGGGCTCAAAACCACTAAAGTCGAG
AACTTCCCTCTCAAAGGGTGATGATTTACGAATATTTTGATCAGATCTTG
GACATACTCGTCACCTTGCATACCTGTACCAGAcccccccccTTGACCTT
TTACTTACTGGTTATAaatgtttttaagttttaaattgttgtagattttt
aaaaataacagtTACATGCAAGTATATATATGATCGTTACATAAAATTAT
ACCACATTTTTATGTATcaatgtttttagaaaaaggttttgtttatattt
attaTATCAACAAAATTCATCAATTCTCCAAAAATTCTACTGCTCCTTAT
AAGACCGAACCTAGATTGAGCCTAGGTAAAAAATACAAGCTTTGACTTAC
ACATTTACCTTCAGGCAAAGAATCCAGGTGGTTTATTTAAGCCTAGCGAA
CGGTGAATTTCAACTCCACGGAAAAGAATTATGATACAAACATTAGCAGA
TTCGTGTTAAAAAGTCACAAagaaaaacgtcgagtaaagctctgattggc
tgaatatTGCAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000131_pilon:198255..211566+ >MSTRG.15098.3.p1 ID=MSTRG.15098.3.p1|Name=MSTRG.15098.3.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1125bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000131_pilon:198255..211566+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTCACGTTTCAACGGATAGTATTGATATTGGAACGCCCGCATCGAT
GGCGGCCGCCCCtggtaaaaaagaaaagaaacctaAAAAACCAGAAGATA
AAGAAACGGCTGCCATGCGACGAGAACGAAACAGATTGGCCGCTCAACGC
TGCCGACAACGCAGAAGGGATCGAATCGACAAACTCGAAAAAatatGCGA
TAAGCTTGAAAATGACGGTCAAAAGCTTGAAACAGAAATTACCGGACTTC
AAAGTGAGATGTcacatttacaaaaaattctGAACAATCATAAATGCATG
GCCATGCCTCCTCGAATAAAAAACGAACGCGAATATCCATTTGATAGATA
CGATAGTCGGATTGTGTCGAGTTAGATGTCTCACGTTTCAACGGATAGTA
TTGATATTGGAACGCCCGCATCGATGGCGGCCGCCCCtggtaaaaaagaa
aagaaacctaAAAAACCAGAAGATAAAGAAACGGCTGCCATGCGACGAGA
ACGAAACAGATTGGCCGCTCAACGCTGCCGACAACGCAGAAGGGATCGAA
TCGACAAACTCGAAAAAatatGCGATAAGCTTGAAAATGACGGTCAAAAG
CTTGAAACAGAAATTACCGGACTTCAAAGTGAGATGTcacatttacaaaa
aattctGAACAATCATAAATGCATGGCCATGCCTCCTCGAATAAAAAACG
AACGCGAATATCCATTTGATAGATACGATAGTCGGATTGTGTCGAGTTAG
ATGTCTCACGTTTCAACGGATAGTATTGATATTGGAACGCCCGCATCGAT
GGCGGCCGCCCCtggtaaaaaagaaaagaaacctaAAAAACCAGAAGATA
AAGAAACGGCTGCCATGCGACGAGAACGAAACAGATTGGCCGCTCAACGC
TGCCGACAACGCAGAAGGGATCGAATCGACAAACTCGAAAAAatatGCGA
TAAGCTTGAAAATGACGGTCAAAAGCTTGAAACAGAAATTACCGGACTTC
AAAGTGAGATGTcacatttacaaaaaattctGAACAATCATAAATGCATG
GCCATGCCTCCTCGAATAAAAAACGAACGCGAATATCCATTTGATAGATA
CGATAGTCGGATTGTGTCGAGTTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000131_pilon | genome | sc0000131_pilon:198255..211566 + |
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