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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:891254..899236- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15084.7.p2 ID=MSTRG.15084.7.p2|Name=MSTRG.15084.7.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7983bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:891254..899236- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTAAATTGTAGACGATCGATAGAAGTATAAATCTACTGGCGGATTATTGT
GCTATCAAGAGTGTATCAGGAGATGAAACACTTCGCCCCGAATGTTTCAC
AATGGTCCACCGAGTCTATTCCGTAAGTCAATGATTTTTATTAAAATAAA
TAAATGTATGTATATTTAAAGGACTGCTGCTGGGGGGATCCTGCATCGAT
CGAAAATATATTTAAATTTTTAAGACAAGAAATCTATCAAAAATGACGTA
CTAAAATATTGAAATCGCTGCTCTTAACTTGAATAAGTTATAAGCATTTT
CATAACGCATGAAAATGAATACGTTTTTTAGAAGAATAAAAGAAAATTCA
ACCCGTGAATTTTCGAACAATTTAATATTATATTATAAAAATTATGATAA
ATTTGAGTACCCTTTAATCAGGCTATATTCTCCAATCTTTAAAAAAATCT
TACGTGGACGGAACTTTAGTATTAGGCTAAGAACCCTTTTGGATAAGTCT
TTGTGGTCTTATAAAAACTCTAAAGAATTCCAGTAAAATGAGCTTGTCTT
GCTGACAGTGATTCGATAATAAAGAAAGCCGATTTGAAAAGAATCTCAAT
GCAACTTTAATGACAGAGAAAAAGTTAACAGCCCATCTGATTTCTATTAC
GTCCATGATTTGATTCGAAAACAAGGATATAAAAAGATTTTGGGTATACT
AAACAGCTTGAGATTGAAAACAGGATATCCGAAAGTCGATGTCTGACTAT
GATTATCATCGTTTCAGGATTTGCACAGTCTACTCGGCATCCCATTGGTC
AATATGAGAATCCATAACAATCCTGAAGACAAAAAACTTCCACCAATCCT
TACAGCTCACATGGGAAATGATCCTTCTAAAACCACTTTGTTGGTTTATG
GTCATTTGGATGTTCAACCAGCTCCTGATCCAGAAAACTGGGTCCACCAG
GTGAGTAAGGAACTAAACTATTTATCAATTTCATCGCCTGACGACTGACT
ATGTAAGCTATGCCCAGTATATACTTAATTGCAAATATAGTATAATGAAC
TAAAGATCGCATACATATATGCACCCTTGTCTCACAGCCCCGGTGAAACT
TTTTTCCTCAGTGGAGTAGAAATTCCTATAGAAATCCCAATGGGGATAGA
AATTCCAATCGGTTCGAAGGTTAAAATATTTAGTAGGGATGTTTTTAGAG
TTCAATTTTTAAGCATGGAATTTCTAGTGGGGAAGAAACCAAAATCACTT
TCCTGGTGGAGCTGAAATTCCAGGGTATCTTCCAACTGGGGACAAGATTT
TGGCCAAATTTTCCAGTGGGGCTGGGGTCCCAGCGGGTTTATGACACAGG
GAAATATAATTGAAAAATATTTGAGGAAAACTACTAATTTTCATTTTCTA
GGACGATCCATTTAAGTTGACGAAAGTTCCAGCAACTGGAGGAACATTCG
AGACGATTAAATATTACGCAAGAGGTTCGACTGATGATAAAGGACCTGTT
CTTGGTTGGATTAATGCTATCAAAGCTTATCAAGATCTTAATATGGAAGT
CCCTGTTAATATCAAGGTATCAATCAAGCATCATTACTTATAGCACTATC
AAAGCATAAAAAAAGCTGACAATACGCACGGAGCGTGGTTGGGTATCGAT
AATAGTCTTTCCATTTCAAGTTTCTAAGTGCCTTTATTTCTTGGTCATCC
AAAAGTTAACTTTTCGACGATTTTAACATCAGAATCAGATTTTGATTTTG
TAGACACATGCTGTAGGACTTGACCACTGGGCCACCCGAATTGGAGGAGG
TACATTCACTTGCCAAGTATCGTGAACATGCAACTTTGGAAAAGCATGAT
TAACATCATTTCTCTTTGACTATATGCGTCTTTTAATTTTCAGTTTTTGT
TTGAGTGTATGGAAGAATCTGGAGGTATTGGCTTGGAACAATTGATTGAA
GAACAATCGGCTTTCTTTGAGGTAGGGTAGATCTGAGAGCCGTCGTCAGA
TATCATAAATAAACTTTTTTACACTTTACCATCAGAACGCAAATAAGAGG
ATGATTTCAATTTTGCCACCGCATACGAGGAGTTGCTAGTTTCCACAGTA
AAGAGATAATTCTTTAAATCTTTGTACCCACCTCATCACACATTACTCTA
CTTTAAAATCTGTTTGTGTATGTTGCCAGGGCGTTGATGCAGTCTGCATT
TCGGACAACTACTGGCTTGGATTAACAAAACCATGTGTCACATATGGATT
GAGGTTCGCTTTTCATTTTTCATTTTCCCTTCAAAGTAAATATCTTCCGA
GTCGCATCATAAATTATCTCTTACTCATTCAGTTTGCAAACAAATTGTGT
TATAAATATCACACAAGGATACTCCTGTATTACTCCTTGACGCCTGGATA
AGACCCCCTTTCGCACTGGAAATATTGGTCCAAAATTCGTCCTCGGTATA
TAGATTACTCTGAAATTTCATCCCTGTGCACAATTAGCTGATTAAGTGGT
GTAAAGGACCAACAGTCCGTAGAAAACTATGTTTCTCAATTAACTTTTTC
TTTTTTAGAGGTATTTCATACTACAATGTAACAATTGAATGCGCTGCCGG
AGATCTTCATTCCGGTGTTTATGGTGGCACAGTGTGAGTATCGAGGGAAT
CTAGAGAAACAATTGTGATGGGCTCTTCCAGAAAAAAATTTTACATGGAG
GATATTTTGTCCGGGGGGGGAGGGTAGCAAAAAATCATCAAAATTTGCCT
TGTCCGGGGGGGGGGGTAAATTTGCTCTGTCCGGGGGTAATTTGGGGTGT
TCGGGGGTTCAGCAGATGCTTGTCCGGCGGGTAAAACCTATTGTCCGGGG
AGCCAAAAGTCACCCTGTTCGGGGGGTAAATCACTAAAAATTGTTATATC
CTCCACCCCCATGTACAATTTTTTTCTGGAAGAGCCCAATCGGTAGCAAA
ATAATAATGGACCGTGTCAAAAAATTAACTTTAACGTTAATAACATCATA
CCGTTGGCAAGATTCGGGCTCGAGGGTAGAAGCAATGGTCCATCTTTGGA
AAGTGCAATAATATTTTTTGCCAACTAACAGTCGGTGATTCCACTCCAGA
CTGTTTGCTGGCGCTCGTAATTTTAGTTGAATTAATTAATTCTTTACTCT
CATTCTTTGACTTTAAGATTTCACCACTTCTTTATGTATCTATCACAATA
TGCATGACATTTTACAACTGCCCAAACTTTTGACAAGCATAGCGGCAAAA
CGCTCATTTTTAATACCATTTTCTCATTGTAGGCGAGAGGCAATGATTGA
TTTGATCAATATCTTCAGTCAATTGACGGACGGTAAAGGAGGAATTAAAA
TTGATGGCGTCAATGATGATGTAAGGCTTTTACTGGATAAATGTGTAAGA
GTTTCGGCTAAAAGCTTGACTGACATGCTATACGCAATTCAAAAGCGAGA
CCATTATATAATTAACGTAGTTAAAAGTCTTTGGACTTCCTACGGTTAGT
TGGTACTGTTTACCAAAGTTATCACGTGATTTATTATTTTATCTGATCTC
TAGGTTCTTGTAATGACGGATGACGAATTAGCGTTGTATGGCCCCATTGA
TTTCGATCCTGAAGAATACCGAAAAGAAATTGGAACCAAGGAATTGCTTT
ATCCTGACAAAGTTGGAACTTTAACACACAGATGGAGATACCCAAGTCTT
TCCATCCATGGTATAATTTTTTAACATTTAGTCGAGGTGTTCCCGATTTT
CGAAATCTGCCAAATAGGGATATTCATTCACTGGTAGCTCATTTTTTCTT
TTGTAAGATTGTTTCAACTTTTCTGATCCACTTTCACTTGGAGAAATAAA
AATTAGACTTTTGTTCCATTCAATCTTTTGAAAATTTTAAACAATAAATG
TTCACACGATTTGCTTGCCTTACCACGGAATTCAGTTGTCGATATATGAC
ATTTTAATCACAATATTTTTTATTTGAAGGCTTTGTTGGGGCATCGGATG
GTAACGAAGATCAGACGGTTATCCCAAGACAAGTAAAATTTATGCTCTAC
CCATAATTAAACTTTAACCTCATCCGGGTGAAAATATTTGAAAGTTAAAC
AGCCGATGACACCTTCCAAATTTAAAAAACCCAAAATTGGCAAAAACAAG
ATAAAATCTAATTCAAAAATTGATTTTGCTATGTGGAGTCAATTCACAAA
CAAACAAAGAAACTCTCACTTCACAACAAAAGCACCGTCAAAGTGATAGA
GTTTGAGATTGTATTTATTGTGATAATTCTTTTCTTGTTTGTAGGTCAAA
GGCAAATTTTCAATCCGTCTTGTACCAAATCAAGATCCAGCAGATATTGA
TGCCAAAGTCGAAGCTTATGTTAAAAAACTTCACACTCAAAGTGGTAGTA
AAAACCCGCTGACGTGAGTAATTCAAAATCTAAGAAAGATCTAACTAAGG
AGCTTGTAGGCTGTGTAGGATCAGTTCATTAACTCTTTATCTAGAAAATT
GTATAATTGTTTGTCATAAGTAACTGACCCAGCCTAATGATTGAACCCAC
GGGCTTGCGCGCTGTAGCATACGGAATACACATTTTTTATAAGAACAAAA
ATCTTTAAGCCTTCGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAATCCTAACAA
TGTTCTTAACATGTTCTTAATTTCACCATTTTGGTCCATTTTCCTAAGAA
GGTGTTTTTAAAGTCGCAAAGCTTTGAAATGTTCTAAACTTGTTCTTAAG
ATTTTTGCCATCGAAGCCTTATGTTCTTATATTGTTTGTGTACACGTGTA
CAGTACGTTTTGCACTAGCATATAAACATCCCTGTCTCACAGCCCTATTG
GAACTTTTCCCCACATCTTGGATAAAAGTTTCTATCGGAATCCTAATGGG
ATGGAATTCTATTGTTCCAAGCTAAAGAAATCCCGTTGGGATGTTAAGTG
TCGCTCAATGGCACCAAAATACCTGAAGCTAATTTGAATGATTATAGTAA
AACTTTCTGTTTGAAAATGACACTAGAAGAACTCCTTAATCTTTATGCCT
TGAAGGTGCAATTACAAATCAGCAAGTTTGTGTCTAATAGATTGAGCGCT
TTCTTAAATAGTCCCTGAAAGAACTGTAACTGAGGGCATAACTTTCTACT
AATTTCAGTTTCGTGGCTACCACGTCAGCACCAGCTTGGGTGAGCGACAA
CACTGATGCTAACTACAAAGCCGGTATCAATGCACAAAAGAGAGGTAATA
GACCTTTTCATTAATTACATCACAAACATCACTTGCCTCGTATTCAATTA
AATACCATGGTGATAATGTCCCTTGAGACACTAAATGATTTCTTCATGAA
TGGAAAGTAGTTTCCATAAAATCCGCTGGGAGTTAATCACCTTGGCAATA
ATTTCAAAACGAGGCAAGTGATGTTCGTGACGTAATTTATGAAAAAGTCT
TCAATGATATCCAACATTTATGTACAGCACCTGACCCCGAGAATGTAGTA
AACCCCGAGAATGTAGGTTTCTTATTTTCAAGCATTGTAGCCTTAACGAT
AGTTCAACTTCATAAAAAGTTGTTTCAGGGCATACTGTTACATATTACTT
ATTATTTCTAGACATGAAATTTTAACTTGAATTAATTTTTTCCAACGGAA
ATCTGAATCGAAGTTGATTGGATACTACCCGAATTGAGACATTTTTTAAA
TAAATCCTCTCTAAATCGAAATCTATTGTTATTAAGTTATGATGATAGGG
TATTTTCTTATTCCTAATGAACTAAGGAAATGGGGAAAATAGTCCATTTC
AATATTTATTGTTCTAAGTTAAATATTTTGACGAAAATGTTTGACCTACC
TTTTGGGGTTAGTTGACCTACAATTTGGGGGCCTTCATAACCTGACATGA
AAAGTCTGTCAAATTATATAAAACTTGTTTCTTGTACTTTCATTACATGA
AAGTACTACCCTGAGAGATGATTAATGTTGATATTTTGAGCTTTTACGAC
GTGTCCCAGACCTACTGGTACACAAGCCCAATCAGAAGATTTGCCTAAGT
TTGGAACAATAGAATTTCCATCCCCATTGGGACTTTAGTAGAAATTTTTG
TCCCGCTGTGGAAAAAAGTTCCACTGGGGCTGTTAGGCAGGGGTGTTGTT
ACATTATTTACATATTTTAACACAAAATTTTCAACCTACAAAATAAAAAC
AAATTGTCTCTTCTTTTCGTCCTTTCTTTTACTTTTCCTCATTTGTAGCA
CAATAAAATTAATATCTTTGTTAAACTTTTGTGAGGGTATATTTATAAAT
CATAAATTTCACTTAGGGAACAATAATTTCCGATGAATACTAAAATTCCG
CTCTCAACAACCAAATCTTTTCACCTACATTCTGGGGGTTGAAAAGCGAA
AAAAATCAATTTTCAGAATAACAAAGTGCTCTTTAGAAAATTGTTTTGGC
ACAAAATATTTCTAAAACTTGCTGTTATAATTAATCAAATTGAAAAAATA
TCAACATTTTACTATTACTAGATTTAAAGCCATAAAACCAAACCTACATT
CTGGGGGTTATAATGAAAATGGGAGTCAACTTCAAGGACCAAAACAATTA
GCCTATCTATCACAAGTAATGAAACTAACCCCTGGGAAAGGATTTTGGTA
GTTCAGAATTTCGTTGAAAACATTCAATGTTTTCTGAAATGCAAATCTAC
ATCTTTCAGGTCTGATTCAAAATTCACCTACATTCTCGGGGTCAGGTGCT
GTAGTGATGAATTTCAAATGAAAATTGATGCAAAAAAAAAAAACTTTAAA
AAATAGATACACCCTAAAACTTCCGGGCCGTACGGCGTTTTCAGGCGGTC
AAAGTGGCCATGATACATCTCTACCGAATGGAGAACAAGCCTGCAAAATA
TGCCCTAGCCTGGGAATCCAAGCGTTAAACTTTGTTCACAGTCTAGTTTA
TGATATCTTCACTGCTTGTTTAATCTTAAAACTTTGTGAGGTGAGGTATT
TTTTGTTTTTCTAAGATTATGAGCTTGGATTCCCAGGATAAATAAGCCCT
AAAATTAAGAATTGCACAATAACAAATCTTATCTTTGAGCGTCAAAAAAA
AAGACAAACATATCTTCAACAGCACCATGCTGAATACTTTTTTTCTCCGC
TTTAGTATATGGTATTGAACCAGACCTTACAAGAGAAGGAGGAAGTATTC
CGGTAACACTTACTCTTCAAAACGCGACCAATTCAAGTGTCATGTTATTA
CCTATTGGACAATCTGATGATGGTGCTCATTCACAAAACGAAAAAATGTC
GGAGAGGAATTACATTAATGGGGTATGGGAAAATTATAGGAAAATATAGC
TAGAATTTTGTCCCGATGGGAAAAATATCCTACTATTAATTTCAGCCCTA
CTGGCAATTCAACTTTCTTTTTATCCCATTCGAAGTTATTTAATGAAAAA
AAATTGCACTCGAAAACCATCCCCACTGGATTTTTTGACCAGGGAACAAT
AGAATTCCTATTCACATTGGAATTTCGATATAAATTTTCGTCCCCACTGT
AGGAAGTAGTTTCACCGGAGCTGCGAGGAAGGGGCGTGATTTAACTAGTT
CTGTAGATACAAATCATTAACTGATTGAATGAAAACTCTTCAAATAAATT
AATAACATGAAGATTTTCGTTCTTTTTTCAGGCAAAGGTTCTTGGTACAT
ACCTCAACGAACTTGGAAAAGCTCAGAAAACATTGAAAAGCAAGAAAACT
GGCAAAAAATGAGAAGTATATACAAAAGAAAGAAAGCCTTTTTTTTATAA
CGACCGAAAAATTATTGTGCATGTAACGATGAATACCTTACTTTTAAGAC
TGTGATTTTGTAAACCGAAAATTGATAAAAAAATATTTCACTTTTTGGGG
GGTTTTTGTAAGTAACATTCTTAGTAGAATTAAACAGGAATTATTGTAAA
TTCAATTTTCTTCGAGAAAGATATTTATGAAAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:891254..899236- >MSTRG.15084.7.p2 ID=MSTRG.15084.7.p2|Name=MSTRG.15084.7.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1188bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:891254..899236- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GACGATCCATTTAAGTTGACGAAAGTTCCAGCAACTGGAGGAACATTCGA
GACGATTAAATATTACGCAAGAGGTTCGACTGATGATAAAGGACCTGTTC
TTGGTTGGATTAATGCTATCAAAGCTTATCAAGATCTTAATATGGAAGTC
CCTGTTAATATCAAGGTATCAATCAAGCATCATTACTTATAGGATTTGCA
CAGTCTACTCGGCATCCCATTGGTCAATATGAGAATCCATAACAATCCTG
AAGACAAAAAACTTCCACCAATCCTTACAGCTCACATGGGAAATGATCCT
TCTAAAACCACTTTGTTGGTTTATGGTCATTTGGATGTTCAACCAGCTCC
TGATCCAGAAAACTGGGTCCACCAGATGGTCCACCGAGTCTATTCCGACG
ATCCATTTAAGTTGACGAAAGTTCCAGCAACTGGAGGAACATTCGAGACG
ATTAAATATTACGCAAGAGGTTCGACTGATGATAAAGGACCTGTTCTTGG
TTGGATTAATGCTATCAAAGCTTATCAAGATCTTAATATGGAAGTCCCTG
TTAATATCAAGGTATCAATCAAGCATCATTACTTATAGGATTTGCACAGT
CTACTCGGCATCCCATTGGTCAATATGAGAATCCATAACAATCCTGAAGA
CAAAAAACTTCCACCAATCCTTACAGCTCACATGGGAAATGATCCTTCTA
AAACCACTTTGTTGGTTTATGGTCATTTGGATGTTCAACCAGCTCCTGAT
CCAGAAAACTGGGTCCACCAGATGGTCCACCGAGTCTATTCCGACGATCC
ATTTAAGTTGACGAAAGTTCCAGCAACTGGAGGAACATTCGAGACGATTA
AATATTACGCAAGAGGTTCGACTGATGATAAAGGACCTGTTCTTGGTTGG
ATTAATGCTATCAAAGCTTATCAAGATCTTAATATGGAAGTCCCTGTTAA
TATCAAGGTATCAATCAAGCATCATTACTTATAGGATTTGCACAGTCTAC
TCGGCATCCCATTGGTCAATATGAGAATCCATAACAATCCTGAAGACAAA
AAACTTCCACCAATCCTTACAGCTCACATGGGAAATGATCCTTCTAAAAC
CACTTTGTTGGTTTATGGTCATTTGGATGTTCAACCAGCTCCTGATCCAG
AAAACTGGGTCCACCAGATGGTCCACCGAGTCTATTCC
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:891254..899236 - |
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