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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:877177..888635+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15082.1.p1 ID=MSTRG.15082.1.p1|Name=MSTRG.15082.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11459bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:877177..888635+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CTTGTTACAGAAATCGAAAGTGTCtacattttaacattttcatagCGAGG
ATCGATGATCACATGACGACTGTCAGGTATAGGTATTTTACACTTAGATT
TTAGTATgttctttgatattttgatatctTATGGTTTCATTATGTGAAGA
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tccggcgtccaaaattccctgcatgcaacaccggactgacaccagactta
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gaacaggataagaacaatttgataaAAACTGCAAAGCCTCAGAAAGTGTA
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GTAGACtccagggctgcaaataagcgtcggcCATaggtcaatgtccgact
gaaaaagccatttgaccgactgaaaatcttttgtgtctgTCATGATGTCA
GAATGAAAAGaggaataaaccattaacttgagagttgaaaataattCTCT
TACACCActgtctcttacttagcctattcttttaatacttgATTTCTTCG
TAACTTTAAAGAGtatttctaagatcacttttccTATTTCTCTGTTACGG
TAACGAATTCTTCCAAGGTCACTTTTATTTTACTTGCTCGCTTTCTCCCT
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gaaaatatttatttgcagccatggtaGACTAATTCAGCTTggaattcatt
gaaatattggGAAAAGAATTTAGGAACAGGAGAGTTTCTATGTAGATAAA
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tcaacataatcaaataataagaaaattgcTGTGATTTGAATTGCTGAGTT
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atttcatatacAGGCATTTTTGTGAACTAGATATATTTTACACATAGTTC
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ccctgaaaatgaaaaaaatcctttTCCCACCCCTTATTAGTccccccccc
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TCTCCCCCCTCCGAAAAATTTTGTTGCACCTTTTtgaaagcccccccccc
tcccccaggAAAATGTGTTACATTATCAGGGCAGGTTACTGAACTTTGAA
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AactgatttttttatcaaagaaaagGTCAAATTGGATTGATgaaccaaca
ttttttaaagtcCAGCTGGTATAGGAATATTGATAATAATAAACTATTAA
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GATTTTAGATTTGTCGACAACAACAAGGTATGCATTCAAAATTTACTTTC
GATCTGTTAGTttgaaagtcaaaataaaagaaataaactcTCAAATCTGA
TTGGAATATTAGAAATGAGacacttttttaataagatGCCCTTTTAGTGT
CCAGTTATTGGGTGCAGCCCCTCCTGGACTCTTTTTGGACTCTTACAGAG
ACtcgattttctttttaatggttttttcaAAGGGGTTAAAAAGAGACTtt
tgagggtgtgaaaaagggactcttatggctcgcacatacccgacatccat
tttgcctaagtacccccccccccccacaggAATGGACGCTACCGTGCCCG
GCTGAGGTTATAAATACACCACATCTGACACTTTCAATTCTATGATCCTG
ATAatgaatattttcattattttctgtAGAAAAGCTACATTGAAGGGCTG
AGAACATGggttgaaatcgaaagtgtttcTGCAGAACCTGCTCGCAGACC
CTATGTTTTCCAAATGATGGAGCAATGCAAAAAGGTAATGATAGGATTTC
GAACTGTTTCagttctttttgaatttcattaccttctttttcatcattat
tttcaaattaacaATCCTTTAGCATTTGAGTTTGACTTAATAACATATAG
TGGACAATCGTCAGAGCTGCATAAATAAATTTAGATAAACTCTGCACAAA
ATATAAACTTCAGAATCAATTTTGAACGTCGACTTCTCTTTATCATCACT
TTAGCAACTCGAGGATTTAGGTGCTAAAATCGAGTTAGCTGAAAACCCTC
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TCAAATTGACAGAGACAGAGGATGGCAAACTTTACGGACGAGGGTCAACC
GATGATAAGGGACCTGTTCTCGGTTGGATTAATGTTTTATCAGCATACCA
AGCTCTGAAGATGGAAATCCCTGTTAATCTAAAGGTTTATTATGTCATTC
TATTAGCATTTTGGTTGGTTTAGGCTTCATTCGTTATCAACTAAATGAAA
CTTTTTGCTGCTAGTTCTATTATAGTATCGAAAATTatcttttgttctta
ttttttaaacgttttatGAGTATTCTAGTGTCATTTTATAAGAAGTTAGA
TGTTGTAAAGCCCTGAAAACCTCAAAATGCCTTTAATTTTTGGCTCTGAA
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AATGTAGTTTTGTTTCGAAGGTATGGAAGAGTCTGGCAGTGAAGGATTAG
ATCAATTGATCGATGAACGAAAGTCCACTTTCTTTTCGGTAAGAgccttt
ttttactttgaacaAGAGTATTCGAAACATAGTGACTTTGCTTTCCTTGG
TCttgaaatgatgaaaaagaattaATTACACACTTGATTTTGGTCAAGAC
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TACAAACAAACGAGTCTCTAAGACCATGTTGTCTctgtttcaaaactttt
ttgtaaGCTATTTGTTGTTTCCAGGGTGTAGACTATTGCTGTATTTCTGA
CAATTATTGGTTGGGAAAGAGTACTCCTTGTGTGACTTATGGATTGAGGt
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aaatttttcgcgtggacaaaatttcgcgaaaatggccaaaatacgcgaaa
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TATGTTCTTCTGattagtttttttgatttttttttgtaaaagatatGTCA
TTTTTTCCTTCAGTTTAATGATTAACATAAAATCAGTAAAGGAACTTCTA
ATGAAACAAGAACTCAAATCTGCgggggggggtatttagtttaatgggtg
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tctaagaaaGACAAAAAGTTGTCTTTTTCAGAGTCgcaaaacttttaact
tttacgaacattttttagttttcactAAATTTGGTCTCTCTGACACtgag
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GCTGATCTTCACTCTGGTGTTTTCGGTGGCACTGTGTAAGTTTTTCTCTA
AATAAATGTTTAATCCTTGACTTTCATTTGAAACCATCTAGCATCTTCTT
ATTAGCTGTCTTTTTAGGGAATTttactctttcttttttattaagaAACC
ATCTAGCATCTTCTTATTAGCTGCCCttttagggaattttaaaagttctt
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accaatcttgctccacatacgtgtcaatccaatgtgaaaagcttgtgaat
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gaaaCACCCCTGCTAGCCTCTAGTACCTTTTGCCATTTGACCTTGTTCCT
GGGAAAGGCGGGATGTCGAATTTTATAGCTGTAGTAGTTTCTTAAGTTTT
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TATTACATCACGGTGGCGATTGTAAAAAGAAGACTCTCCAACATCGATGG
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TTGTTTAAGATGAGCTAAGCTTTAAGTGAATGTTTCGAGTTTAGATAATA
AGCAATTCGAGGCGATTTTCTTTCCACATTGATACTATCTCTCTATTTTA
GGTTTCCAGAATGCTTTTGATGGTGAAGGATGCAAGACTGTCATTCCCAA
GGAGGTGAACATTTTCTCCTCTTTAATTCTCCATGTATCTCGAACAACAA
CTTGAACCACTTTACCCAAAGTTACCGAAAGTCGAAtgcattgggctatt
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TCAGTAAAATTGGgattgaaaatccagggtggccctgaaaaatttgacaa
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tttctggattAGCACATTAAGTAATAAGAGCGCTAGGTAGCAAAATTAAG
ATGACTTTGGACCCATTTACCATTGGTTATATGGAGGTTCTTCAAATTGA
ATAAATCTTTCGTCGTTATGGAAACAAATGTGTGATTTAGCAAACCTCTA
CAAAACCTCTATTGGTCATATCGCCTCGGTAAAATGATTCAATTGGCCGT
GGATCATCCTACTTTCACCCATCATTCGGAATCTGATAGGAAATAACCAG
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AACGTAAGTTTTTTAACAAAGCCTCAAACAAATTAAATACGAAAGTTAGT
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TTGGGGAAAGAGTCTATTACTCTACTTCACCTTAACCAAAACTTGCCACT
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TTTTTAATTCAGATTTGCGCCATGAATTCAAAAGTTTGAATAACTGTTCG
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AGAGGTACTTTGCGGGAGGGGAGGGATCATATAGTGGTATTATATGTTTG
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GAAAATtatcgagattttaataaggggggggggggtaattacttgggggt
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tttttttttttcaaatttatagtTATAAGAGACATGAATAAGTATTCGAG
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GAGGAGTGTTGACTGAGAGTTTTAAGGCATCACAAATCAGGAGTTCTCAA
GTCCCTGCCTTTTTCAACACTCCATTCTGCTCATACGggaagaatttaat
ttcgtaATTCGTATCTCAAAATTTGgaagtttcgcggaatttaaatTCGC
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CCGAAATAACCAATTTTAGAGGTGACTTTTTAATTCctgagaatattcgt
gttttgcggaatttaatttcgtggatttGTCGAAAAACCGTGAACCGTGA
ATATTTGTTTcacgaaaatttctttccttaaagTAGATAGCCGATCTAGC
TGGTCGTGGAGTCCCCGAAAGCATTCGAAAGACTGTCTTGTCCTAGATCA
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GCGACTTTACGACTTCACACAAATCACCTTTGCGCTGTTTTCTCCATAGT
CTTTGGAAAAGAACCTGACTTGACACGTGAAGGTGGAAGCATCCCAGTAA
CACTTTCTTTACAAAATGCAACGGAGAAGAGTGTGATGCTGTTACCTATA
GGTGCTTCTGACGATGGTGCTCATTCACAAAACGAAAAAATCAACGTCTC
TAATTACATCAATGGAGTAAGTGACTTTGAATGCCACTGACCTTGATaca
tccctggaccaagctatatccgccatctttgatcgaagtttttttgaatt
ggtaccactgacctttatataaccctggaccaaacaatatctgccatctt
tgattggagtttttttagaattggtacccaaggagaagccattgcaatgt
taaaaattaacgtctaacgccgctacatcatcaaaagaatttgaggaaaa
gtagacctagcgctctcgatgcaaatacaccgctatcgagtagtgccgac
attagggtaccaattttcaaaaaactccgatcaaagattttgcttggctg
ggattgagaagctttgtccagggtatataaaggtcagtgattggTACCTG
TAAAGaggccattgcaatgttaaaaattaacgtctaacggtgCTACATCA
TCAAATGTTTTCCCAGAGAAAGTAGATCTAGCCCTCTCGacgcatttaca
ccgctattgagtagtgccgccattaaggtaccatttaaaaaaaactccga
tcaaagattttgcttggccaggtttgagaaacttggtctagggtatataa
aggtcagtggataaTACACGAAATACACGCTTTGATATAAGAAAGAATCG
ATTTCTGACTGAGGTTCTGCTGTTTTTAAGTTTAAAGACCTAAAGTGTTT
TGACCGTGTACTTTACTGAAGGGCTTTAATAATTTCGGAAATGTAACGGT
TCAGGTTTTCCTTAATTTCATCTTTGCTTTCGCTAAATTCTAGACATCTT
TTTGTATTCgatgtaaaatgtgtgtggatcaaaaatgcaaaatctaTGTC
TTGAAAAAATCCTTCTTATGCCATTTGATGTAATGTCTCGATATCCGTTA
TTAAGATGTTTTGATTGTTCTTATCTTTCCCCCTTAGATCAAAGTTCTCG
GAGCATACATTGACGAATTAGGAAAACTGAACTAAACTGAACAACTGATG
CAATTGTAATGGTCAAGAGtttttttGTCTTAAAAGCTTTAGCAATGGCT
TTTAATGAACGAGAAGCTTGATCTAGTTTCAAATCTTTTTAGAGGGTata
attttcttagaaaaatgaatGTCGTAGTACatagaatatttttattttta
atttttctaacagGAGATAATTAATGATTATgagaaaaatgaatgaattt
aaATTATAT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:877177..888635+ >MSTRG.15082.1.p1 ID=MSTRG.15082.1.p1|Name=MSTRG.15082.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=18798bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:877177..888635+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) aTGAACATGGCTGATTCTTTATCTCAACTTTTCGAATTTGTCGACAACAA CAAGAAAAGCTACATTGAAGGGCTGAGAACATGggttgaaatcgaaagtg tttcTGCAGAACCTGCTCGCAGACCCTATGTTTTCCAAATGATGGAGCAA TGCAAAAAGCAACTCGAGGATTTAGGTGCTAAAATCGAGTTAGCTGAAAA CCCTCTCAACAAAGGAAAGAAGGAAGGTGATCTCATGTTACCACGTATCA TCTTGGGGAATCTCGGTGATGATccaaaaaagaagacactaTTAGTCTAC GGGCATCTTGATGTTCAGCCAGCAAACAGATCTGACGGTTGGGATTATGA GCCTTTCAAATTGACAGAGACAGAGGATGGCAAACTTTACGGACGAGGGT CAACCGATGATAAGGGACCTGTTCTCGGTTGGATTAATGTTTTATCAGCA TACCAAGCTCTGAAGATGGAAATCCCTGTTAATCTAAAGTTTTGTTTCGA AGGTATGGAAGAGTCTGGCAGTGAAGGATTAGATCAATTGATCGATGAAC GAAAGTCCACTTTCTTTTCGGGTGTAGACTATTGCTGTATTTCTGACAAT TATTGGTTGGGAAAGAGTACTCCTTGTGTGACTTATGGATTGAGAGGTAT TTGTTATTATCATGTCAAGATGAGATGCGCTGGCGCTGATCTTCACTCTG GTGTTTTCGGTGGCACTGTgcACGAGGCAATGATCGATTTAGTACATCTG CTCAGCAAGATTGTAAACCAACGAGGTCGTATTTTGATTCCTGGTGTCAA CGAACTTGTGGATAAACTTACCCCGGAGGAAGATGCACTGTATGCACCCA TTGATTTCGACCCTGAAGAATACCGACAAGACATTGGAGCTGATAAATTA TTACATCACGGTGGCGATTGTAAAAAGAAGACTCTCCAACATCGATGGAG ATACCCATCTCTCTCTATTCACGGTTTCCAGAATGCTTTTGATGGTGAAG GATGCAAGACTGTCATTCCCAAGGAGGTCATTGGTAAATTCTCCATCCGC TTGGTGCCATCACAAACTCCAGAAATGATTGATAAATTAGTTGAAGATTA TTTGAAGAAAGTGCACGCTGAAAGTGGATCTGCCAACAGGCTAACTGTCA TCAGTGAACACGGTGGCAAACCCTGGTTAAGTGATTACACTGACGATAAC TTCAAATCTGGACGGAATGCCATGAAAAGAGTCTTTGGAAAAGAACCTGA CTTGACACGTGAAGGTGGAAGCATCCCAGTAACACTTTCTTTACAAAATG CAACGGAGAAGAGTGTGATGCTGTTACCTATAGGTGCTTCTGACGATGGT GCTCATTCACAAAACGAAAAAATCAACGTCTCTAATTACATCAATGGAAT CAAAGTTCTCGGAGCATACATTGACGAATTAGGAAAACTGAACTAAaTGA ACATGGCTGATTCTTTATCTCAACTTTTCGAATTTGTCGACAACAACAAG AAAAGCTACATTGAAGGGCTGAGAACATGggttgaaatcgaaagtgtttc TGCAGAACCTGCTCGCAGACCCTATGTTTTCCAAATGATGGAGCAATGCA AAAAGCAACTCGAGGATTTAGGTGCTAAAATCGAGTTAGCTGAAAACCCT CTCAACAAAGGAAAGAAGGAAGGTGATCTCATGTTACCACGTATCATCTT GGGGAATCTCGGTGATGATccaaaaaagaagacactaTTAGTCTACGGGC ATCTTGATGTTCAGCCAGCAAACAGATCTGACGGTTGGGATTATGAGCCT TTCAAATTGACAGAGACAGAGGATGGCAAACTTTACGGACGAGGGTCAAC CGATGATAAGGGACCTGTTCTCGGTTGGATTAATGTTTTATCAGCATACC AAGCTCTGAAGATGGAAATCCCTGTTAATCTAAAGTTTTGTTTCGAAGGT ATGGAAGAGTCTGGCAGTGAAGGATTAGATCAATTGATCGATGAACGAAA GTCCACTTTCTTTTCGGGTGTAGACTATTGCTGTATTTCTGACAATTATT GGTTGGGAAAGAGTACTCCTTGTGTGACTTATGGATTGAGAGGTATTTGT TATTATCATGTCAAGATGAGATGCGCTGGCGCTGATCTTCACTCTGGTGT TTTCGGTGGCACTGTgcACGAGGCAATGATCGATTTAGTACATCTGCTCA GCAAGATTGTAAACCAACGAGGTCGTATTTTGATTCCTGGTGTCAACGAA CTTGTGGATAAACTTACCCCGGAGGAAGATGCACTGTATGCACCCATTGA TTTCGACCCTGAAGAATACCGACAAGACATTGGAGCTGATAAATTATTAC ATCACGGTGGCGATTGTAAAAAGAAGACTCTCCAACATCGATGGAGATAC CCATCTCTCTCTATTCACGGTTTCCAGAATGCTTTTGATGGTGAAGGATG CAAGACTGTCATTCCCAAGGAGGTCATTGGTAAATTCTCCATCCGCTTGG TGCCATCACAAACTCCAGAAATGATTGATAAATTAGTTGAAGATTATTTG AAGAAAGTGCACGCTGAAAGTGGATCTGCCAACAGGCTAACTGTCATCAG TGAACACGGTGGCAAACCCTGGTTAAGTGATTACACTGACGATAACTTCA AATCTGGACGGAATGCCATGAAAAGAGTCTTTGGAAAAGAACCTGACTTG ACACGTGAAGGTGGAAGCATCCCAGTAACACTTTCTTTACAAAATGCAAC GGAGAAGAGTGTGATGCTGTTACCTATAGGTGCTTCTGACGATGGTGCTC ATTCACAAAACGAAAAAATCAACGTCTCTAATTACATCAATGGAATCAAA GTTCTCGGAGCATACATTGACGAATTAGGAAAACTGAACTAAaTGAACAT GGCTGATTCTTTATCTCAACTTTTCGAATTTGTCGACAACAACAAGAAAA GCTACATTGAAGGGCTGAGAACATGggttgaaatcgaaagtgtttcTGCA GAACCTGCTCGCAGACCCTATGTTTTCCAAATGATGGAGCAATGCAAAAA GCAACTCGAGGATTTAGGTGCTAAAATCGAGTTAGCTGAAAACCCTCTCA ACAAAGGAAAGAAGGAAGGTGATCTCATGTTACCACGTATCATCTTGGGG AATCTCGGTGATGATccaaaaaagaagacactaTTAGTCTACGGGCATCT TGATGTTCAGCCAGCAAACAGATCTGACGGTTGGGATTATGAGCCTTTCA AATTGACAGAGACAGAGGATGGCAAACTTTACGGACGAGGGTCAACCGAT GATAAGGGACCTGTTCTCGGTTGGATTAATGTTTTATCAGCATACCAAGC TCTGAAGATGGAAATCCCTGTTAATCTAAAGTTTTGTTTCGAAGGTATGG AAGAGTCTGGCAGTGAAGGATTAGATCAATTGATCGATGAACGAAAGTCC ACTTTCTTTTCGGGTGTAGACTATTGCTGTATTTCTGACAATTATTGGTT GGGAAAGAGTACTCCTTGTGTGACTTATGGATTGAGAGGTATTTGTTATT ATCATGTCAAGATGAGATGCGCTGGCGCTGATCTTCACTCTGGTGTTTTC GGTGGCACTGTgcACGAGGCAATGATCGATTTAGTACATCTGCTCAGCAA GATTGTAAACCAACGAGGTCGTATTTTGATTCCTGGTGTCAACGAACTTG TGGATAAACTTACCCCGGAGGAAGATGCACTGTATGCACCCATTGATTTC GACCCTGAAGAATACCGACAAGACATTGGAGCTGATAAATTATTACATCA CGGTGGCGATTGTAAAAAGAAGACTCTCCAACATCGATGGAGATACCCAT CTCTCTCTATTCACGGTTTCCAGAATGCTTTTGATGGTGAAGGATGCAAG ACTGTCATTCCCAAGGAGGTCATTGGTAAATTCTCCATCCGCTTGGTGCC ATCACAAACTCCAGAAATGATTGATAAATTAGTTGAAGATTATTTGAAGA AAGTGCACGCTGAAAGTGGATCTGCCAACAGGCTAACTGTCATCAGTGAA CACGGTGGCAAACCCTGGTTAAGTGATTACACTGACGATAACTTCAAATC TGGACGGAATGCCATGAAAAGAGTCTTTGGAAAAGAACCTGACTTGACAC GTGAAGGTGGAAGCATCCCAGTAACACTTTCTTTACAAAATGCAACGGAG AAGAGTGTGATGCTGTTACCTATAGGTGCTTCTGACGATGGTGCTCATTC ACAAAACGAAAAAATCAACGTCTCTAATTACATCAATGGAATCAAAGTTC TCGGAGCATACATTGACGAATTAGGAAAACTGAACTAAaTGAACATGGCT GATTCTTTATCTCAACTTTTCGAATTTGTCGACAACAACAAGAAAAGCTA CATTGAAGGGCTGAGAACATGggttgaaatcgaaagtgtttcTGCAGAAC 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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
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