MSTRG.15077.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15077.1.p1
Unique NameMSTRG.15077.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000130_pilon:766801..788679-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15077.1.p1 ID=MSTRG.15077.1.p1|Name=MSTRG.15077.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=21879bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:766801..788679- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTATAATGGCGGTCCTGCTTTAAACAAATTTGAATTTCTTTAGCCAATA AAGGAAAAAAAGAGAAGTTTAGTCTCATCAAAACACAACACACCGCAATA AATCAACAATCAGTGCATCAGAAAGGTATGATATTCAGGGTATAAGTACT TGAGCCTGATAAGAGAGATTTTTGTAAGATTTTCCCATTGTTTGAACAGC AAATTTTTGTTGATTTTTTAGCTGAACTGCCGTCTGCGTCTGGACTGGGC TGGTGTCTACCATCTGTACTGGCTCTGCTCTGCTGGTGTTCGAGTGCCAT CCCATTAGGATGTCAAGATGTTGTTTGAAAGTTTGTTTAGTACAGTATGG TTCTACCCATGAAAGACAATCCTTCCAAATATTCTATAGAATATTTAATT TAATTAATATCTAATGCTTTGAGCCATTCCAGAAAATTTTTGTTACCCCC TCGTCAGACAACGTGCATTTTTTCATTTTTTCATTTTTCTAGCCTCAGAA ATATTTTTTTTCTTCCAGTGGTAGTCGGAAATTCAGATGAAAATCCATGT ATTTTCGCAAAATGTGTTGAAAATTCCACTCTATTTTACCTAGTCCAGGG TCTGGAGCTCAACTATTTTTTGCCTTTGATAATTTGATGGTGGAAAAAAT AGAGAGTCCAGTGGAACCCACAAATTATGTAACTGAAACTATTAACTGTC ACACCAAATTTGAATTTAAAACCAATCAGAATTCCCTCTTTTTTAAATTT ATAACTAAGGTCTTCGCATAATTAGAGGGGCTGACACCCGGGGGGGGTAC TTAGGCAAAATGGGTGCCGTGTATGTGCGAGCCATAAGGGTACCTTTTCT CATTCCTCAAAAGTCTCTCAAAGGGGTATATACAAATTCAAAAGTAAGTC TCTGAAAGGGTCCCAAAATCACGAAAATCAAAAATTTCTCTCTCAAAGGG 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CTAAAATATTTATTCACCCTCGTATCTACGACTATAAGTCATACGACTTA AACTATACTTCGCAGGTCGATATTAATTTGAGCTGTGATACTCACAGTAA TCTATTCAAGCTGCTCACTACACTTTTTTACTCTCTTGCTATTTGTCCTA TTTTTATCTAAGTCTCATTATCAGGTAGGTCCATTCAGCATGTTGCTTGT TAATTCTTGAAAAGTTATGCTTTTGAATCTTTTCAAAATCAAATTTATAG AAATATTATTGTCAAAATCTCTAACAAAATCAGAAAAGATTTGTTCAGAA AAAAGGAAATGGAATAAGTTGAAGACTGTAGTATACCAGTCATACAAAAG ACTGAACTTATATTTTACACACTTTCTACAAGCAACGAGCCTCTTATTTA AGTAAAGACAAGATGAGGTAGATTTCTTTTAAAATTTGTTTATAACAGAA ATAACTACAGGAAAAGACAACACACCTTAAAGGTTTTCTACAGGAATAAA AGGAGCTTATTTTAGGCAGTGTCTTCATGCTGAGTCAGATAAATAAAAGC TACTTTTTTACGCAACGATATATCCTGCAAACATTCTATTGCTTTTGTAA ACAAAAAAATGGCAAAGTTGATTTCGAGCAAATTTACAATCGAATGTTTT GATTATAAGATAGAACACGTTCTGTTTATTATAAACATTCAAGTCCCTTA TTATTTGAGATATGTTTTTTTATTCAATGTATTTTCATTTTTTCAAAACC TTTTTCTAATCTTGTCGCACTTGTTTTTACTACATCAGCATCATCAGACC TTTCAATTAAAACAAAACCTTTAAATCCAATTCAGATGAACCTTGTTTAA AGGGGAAGATTATAAAGAGACAGACAGCAAGAGTTTATCAGCTTACTAGC AGGAGTCATAATGTGAGTGACGTGACAATGTAACGAGTGTTCTTTAACAT ACTTTTGCTTTTACATTGGGGTCAAGTAGGGTTTTAAAAGGTTAAGGATA AAATGCCCCTGATATATGTTATGCAACTTTTTGTTATATAATACCAAGAT TTTAAAGTCAGCTGATGCTAGGGTCACTTGGGTCAACTGAGTTTAATGAT TGATTGATATAATTCAAAAGTTATAAATGCCTTAGAGAGCACAATTTAGT TTAACAGTCTTTTTAACTTTTGTGATATTAGCTTGCTCTGAAGTTTTGAT TTTTATCAAGTTCAATAGCTCAGTTAGCTCTAAGTTTAACGACTGATATT GATATTATTCAAAACTTATAAATACCTTAGAAAGACTTTCCAATAATAAT GCTCTTCGCTTAATTGTTAGACTCTTAAGCTTTGGAATATTGTGGTGATT TTCGTGAATTAACCTCGAATCTGCGAAAATTTATGTTCTCGATAAATCAG CATCAGTGATATTTTAACTTATTTCGTTTCCATCATTAAATTGTTTTGAT ACTTCGAATCTTTTTGGTTTTCAAAACATTGCGCGCAAAATTCTTTTGAT AGACGAGCTTTTCTTTGTATTTAAAGGGCGGCTTTTTTGTCGGGTGGTCA CTAATTAAAGGCGGCTTTTGTGTAAGGTGTGAAATATGTCTGACTCATCT TTGATAATTAAATGATATAATTATTGAATATAATTATAGTTTTGCTTCTT TTGCTCATAACAAATTTATATAAAATGAAAGTGTTCTTTTACACTGATTA CGTAGAGTGATGAGCCACGTAACGTTTCAAAACAATGAATTACTCTATGT TTCAGAATAGAAGAAAAACAAGAAATCACAGGTTTAAAACACTGTCAATG TTTGGGACACCAGAGAAATTAGAAAGCAGACGTAATCACATTACCATCAC TTGTGATCAAGAGACTGGATCGAGTCCGTATCATAGCAACGGTGGTGGTA ACCATAGTGATGACACGCCAACCAAATCAAACCTTGTTGAAACATGTGGA TTAAATCTACTCAATGTCAAGAAATCAATCAATTTCGGTTTGAGCCGTGA GAATTCTTCGGATAGTTTCATACAACGTGATACAGCCACTAAGAAGAATT TGTTCTTCGAAGTCGAAAATCTCAAATTTGAAGGTATTTTTGCCGTGTCT TATTTTGCTGGTTACACTTTTTTTTTATAAGAACCAGTAAATTTTTGCTG AGGCTCGGCTGTTCTTATTTTTTTGGCACTTTGAGCCTTGAATTGTTCTT ATTTTGTTCGTATTTTTTCTAAGGTAAAAAACAAGTTTTGGCTATTTACT TTACTATTTAGAGGATTTTAGAAACCAGTGATTCTTTTTGCTATAACTCT CTAACTTCAGCACTCTCCACTGCTCTTAAGTTGTTCTTATTTTTTGGCAT TTTTGAGCCTCATTGTTCTTATAAAATTGTTCTTATAAAAAAAAGTGTAT TTTCCACGGTTGTGAAATGTCTTTTGGAGTCCTTTCAAGTATTTCAGTTT ATTACTTTAAATGTCTTTTTAAACTTTTTTTAAATGACTAAATCTTTTAT ATTATCTGAAAATCGAACAAACCGCCAATCGCATGCTGCAATTTTTTTCA AAGAAACGCTTCAATAAAATCTTTAGTTCTTAAAGTCAACTGAATAACTC AAATAATTACCAAGTATTCATTGGTAGCTTACACGTTGTTTTTTTACAAA AACATCTAAAATTTTATAAGCCTTCGGATGTTCTTAACTTTTTCAGTTTT AAGCCTAAAAATGTTCTTACTTGTTCTTATTTTTGCCATCGATGCGAAGC CTTATGTTCTTGTATAGTTTGTTCTTATAAAAAACGTGTATCTTTTTTTC AATCATAGATCTTTATGACTTCAGTCAAACACCAGAAGAGAGCAATTCAT TCGCTTTGAAACCCAAGACTGGGTCTGTAGCCAAAGTCAATAACACTAAG ATCGCTTTATTTCGGTATGGTGAGGTTGTGCATGCTATCGATGAAAAGTG TCCTCATCTTGGTAAGTATCAAGTTGAAATCACATATATATGGAGATCAG AGATCTGACCTCAAGGAAAGGAAGTTTTATACTGTTTTGTGTTACTTTGC AGGGGACTTCTCTTTTCGCCCAATACAATCGAAAGCCATTTTACACCCTT GTTTAAAAATCACAGTAGCCCAAAGTGACGCTTCTTTTATCGACTTGCAT ATTTTTTTTAAAGTAAACCCGATTTTGAGCTTATCATTTTTTTAAATCCA GGGCTTATAGGTTGCTGATAAAGTTTGCTTTGAAAGTTCACACAATAAAT GAAATATTGGAGCTTTTAGACAGTAAAGACTCCATTGAATTCCCTGTACT TTAATCATTCTCCTTTTCCGTTTCGAACAGGTGGACCTTTACATATGGGT GACATTGAGAATATAGGCGAAGCTAGTCTGCTGTGCGTCGTTTGTCCTTG GCATCGCTGGAAAATTGATCTCACTACTGGTAAAGTTAAAATGCCTTCAC GAAGACAACCTGTTCGGAATCAAATTTACCCGACTCGAATCGATGAGGAT GGATCGATTCATATCGGTTTCGAAGAAATAGATAATCAATTTTTCGATGG CGAGGAAATGGATTTTTAAAAGTAAAAATAAATAAGTATTGCTGAAAGAA TAGATTAACAGGATTTTTTATTGGATACTCGCCGAACTGGAAGAAATTAT ATACCTTATTACACGAATATTACTAGGCAAGTATTCAAGGGCCTTGAAAT TAACACGCAAGGAATTAGCGCGAATTTTTTTTGCTTTGTCAAGGACACCA CGGCTGGTTTTAATTAAGGGGGTTTTTATTAACATTTTTCAATTCGTGTT AATAAAATGACTAGTAATATTCGTGTAATAAGGGATGCTTTGGATGGATT TAACTTTGCTTGTTTTAGTGCAACTAGTTAAGAAGTACATTTATCTTTTC TTTAAATTATATGACATTGTATATACGTTTTTCACATGATGGACTTTATT CCATTTTAATGTTAGAATTTTAGTAGTGAACATGTTCATTCCCCTCTTTG AAAAAATGTCTAATTATCTTTAAAATCGGATTTTGTTTGAATAAAGTAGA AAAATTTCATTCCCTTATTTCATTTTTCGTTCTATCAGCTCTTCCTTATC TTCTAACGATCATTCTGTTTCGAGTGCTTAACATGTTTTTGTACAATACT TTCTTTTTCTTATTTTATTTATCGCGTTTAACTTAATTTTCCCCTAAAAT ATTCTATTCTCGTCCCTTTTCCCCTTCCCTTTTCTTCCATCTTTTTCCCA AAAATTTTTTTGCATATAATTTTGATAACACTTGTGTTCTCTAATCGACC TTTCCCCTGTGACCTGTGTCCTGTTTCTAGTTTCTAACTAACTGGAAGTG ATGAAAAATCTGAACTTTTGCATCCAAATCAAGTTTAGCTTCAAAAAAAT TGCAATCTTTGAAAACTGCACCACCTTCTCCAGTCTAAGCATTGTAAATC ATTTCTAATCAACACGTTCCCCAGCCCCTTTCCCAGTTTTCAGACCCAAA CCCAAAAGCAAGTATACCTGTACCTGTTCATATTTTTTGGCTCGAAGTTT TTTATTTTACACGTAGAAAAAACGATATGATATATTGTTATATAGATCCA AATGTTTTATTGCCAACTTTACTTATGGTATGATTTTTAAGTATCTTATT TTGTACATTTTGCTTTATTACAACTATTTTTATAATTTACTCTAGCTACT AGTATACGATAGAAAAAGGGAAAGTTTTTATCGATTTTTTGTTAGAGAAA GAACAACTTTGTTATGGTTTTTCATTTTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:766801..788679-

>MSTRG.15077.1.p1 ID=MSTRG.15077.1.p1|Name=MSTRG.15077.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2034bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:766801..788679- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTGGACCTTTACATATGGGTGACATTGAGAATATAGGCGAAGCTAGTCTG
CTGTGCGTCGTTTGTCCTTGGCATCGCTGGAAAATTGATCTCACTACTGG
TAAAGTTAAAATGCCTTCACGAAGACAACCTGTTCGGAATCAAATTTACC
CGACTCGAATCGATGAGGATGGATCGATTCATATCGGTTTCGAAGAAATA
GATAATCAATTTTTCGATGGCGAGGAAATGGATTTTTAAATCTTTATGAC
TTCAGTCAAACACCAGAAGAGAGCAATTCATTCGCTTTGAAACCCAAGAC
TGGGTCTGTAGCCAAAGTCAATAACACTAAGATCGCTTTATTTCGGTATG
GTGAGGTTGTGCATGCTATCGATGAAAAGTGTCCTCATCTTGATGTTTGG
GACACCAGAGAAATTAGAAAGCAGACGTAATCACATTACCATCACTTGTG
ATCAAGAGACTGGATCGAGTCCGTATCATAGCAACGGTGGTGGTAACCAT
AGTGATGACACGCCAACCAAATCAAACCTTGTTGAAACATGTGGATTAAA
TCTACTCAATGTCAAGAAATCAATCAATTTCGGTTTGAGCCGTGAGAATT
CTTCGGATAGTTTCATACAACGTGATACAGCCACTAAGAAGAATTTGTTC
TTCGAAGTCGAAAATCTCAAATTTGAAGGTGGACCTTTACATATGGGTGA
CATTGAGAATATAGGCGAAGCTAGTCTGCTGTGCGTCGTTTGTCCTTGGC
ATCGCTGGAAAATTGATCTCACTACTGGTAAAGTTAAAATGCCTTCACGA
AGACAACCTGTTCGGAATCAAATTTACCCGACTCGAATCGATGAGGATGG
ATCGATTCATATCGGTTTCGAAGAAATAGATAATCAATTTTTCGATGGCG
AGGAAATGGATTTTTAAATCTTTATGACTTCAGTCAAACACCAGAAGAGA
GCAATTCATTCGCTTTGAAACCCAAGACTGGGTCTGTAGCCAAAGTCAAT
AACACTAAGATCGCTTTATTTCGGTATGGTGAGGTTGTGCATGCTATCGA
TGAAAAGTGTCCTCATCTTGATGTTTGGGACACCAGAGAAATTAGAAAGC
AGACGTAATCACATTACCATCACTTGTGATCAAGAGACTGGATCGAGTCC
GTATCATAGCAACGGTGGTGGTAACCATAGTGATGACACGCCAACCAAAT
CAAACCTTGTTGAAACATGTGGATTAAATCTACTCAATGTCAAGAAATCA
ATCAATTTCGGTTTGAGCCGTGAGAATTCTTCGGATAGTTTCATACAACG
TGATACAGCCACTAAGAAGAATTTGTTCTTCGAAGTCGAAAATCTCAAAT
TTGAAGGTGGACCTTTACATATGGGTGACATTGAGAATATAGGCGAAGCT
AGTCTGCTGTGCGTCGTTTGTCCTTGGCATCGCTGGAAAATTGATCTCAC
TACTGGTAAAGTTAAAATGCCTTCACGAAGACAACCTGTTCGGAATCAAA
TTTACCCGACTCGAATCGATGAGGATGGATCGATTCATATCGGTTTCGAA
GAAATAGATAATCAATTTTTCGATGGCGAGGAAATGGATTTTTAAATCTT
TATGACTTCAGTCAAACACCAGAAGAGAGCAATTCATTCGCTTTGAAACC
CAAGACTGGGTCTGTAGCCAAAGTCAATAACACTAAGATCGCTTTATTTC
GGTATGGTGAGGTTGTGCATGCTATCGATGAAAAGTGTCCTCATCTTGAT
GTTTGGGACACCAGAGAAATTAGAAAGCAGACGTAATCACATTACCATCA
CTTGTGATCAAGAGACTGGATCGAGTCCGTATCATAGCAACGGTGGTGGT
AACCATAGTGATGACACGCCAACCAAATCAAACCTTGTTGAAACATGTGG
ATTAAATCTACTCAATGTCAAGAAATCAATCAATTTCGGTTTGAGCCGTG
AGAATTCTTCGGATAGTTTCATACAACGTGATACAGCCACTAAGAAGAAT
TTGTTCTTCGAAGTCGAAAATCTCAAATTTGAAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15077MSTRG.15077Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15077.1.p1MSTRG.15077.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15077.1.p1.exon4MSTRG.15077.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15077.1.p1.exon3MSTRG.15077.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15077.1.p1.exon2MSTRG.15077.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15077.1.p1.exon1MSTRG.15077.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000130_pilongenomesc0000130_pilon:766801..788679 -