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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:745377..753308- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15076.2.p2 ID=MSTRG.15076.2.p2|Name=MSTRG.15076.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7932bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:745377..753308- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGGCCTTCGAAGACATCTGATTCCATTATTGGATTAAGCGACAAAATATT
ATAGACTGTTTTAATCTAAACTTTTCATCTTTTTTTTTCGGTGTGTAAAA
GCCTCGATCAATGAATTGTTCGACGTATTTATAATAATCGAGAGAAAAAT
GGTTCTCAGTTTTATTTTTTAAAGGAAATAAACTTCAGACGTTGTTAAGA
AAAATAATAAAATTCAGATGAGGAAAAACGTAAGATAAATGGATAAAAAT
TAGCGCATAAACATATATCGGTATTGTTTGGGACGACACCGAGGGTTATA
AGCAAATTGATCGGAGGTATTTTTTAAAAGACGTTTGCCATCACCACAAA
AATGTTCAGCTTGATTTTTAAGAAGACAACTGCTTCTGCTTCACTTTCAG
AGTTTATGAGATCGAGGCCGTTGCCTGGGATACCACCACCGACATCAACC
AGCTCGGCGTCCACACCATCAGAGACTAGCAATGATTTCCCGCCATCGCC
GGTGGCCGATAATTCTTTCGATACAGCAACTGGTGTTGCTACGGACAACG
GAGATGCAGAAATGTATTATGTTCAGTATGATTTTGATGCTGGAGATAAT
GAGAATCAATTATCCATCCATAAAGGAGAGCTCATTCGAGTCATTAGTTA
TGATGACACTAAAGTTTGGTGTGAAGGACAAAATCGTAACGGCAAAATTG
GTTGGCTCCCTTTTGCATATATAGTTGCTCACACAAGTTTTCATAAATTC
GATTGGTATCATGGACGAATATCAAGGAACAGAGCTGAGTACCTTTTAAA
CAGTGGCATAAATGGCAGTTTTTTGATGCGTGAAAGTGAAAGTGCTCCCG
GACAACATTCTTTATCGCTGCGATTTGACGGACGTGTTTATCATTATAGA
GTGTATTTCGACGATAACGATTTCGCTTACGTACGTGAGGAGGCTAAATT
TAAGACGCTAGTAGAATTAGTACAATTTCATACGGAACAAGCTGGTGGAC
TAGTCACTAATCTTCGTTACGCTGCATTAAAAGTTGATAAGCCACCTGTC
TATGGGTTTTCCCCTTCTGAAGATGAATGGGAAATCCCTAGAATGGATAT
TTGGATGGGCCAAAAGTTGGGTGGAGGGCAGTATGGAGATGTTTATAAAG
CAGAGTACAAGAAATATGGTGCCACGGTAGCTGTGAAGACGCTCAAGGTA
AGAGATACGGTATCCTACTTCATTGTTTTGTCACATGAAGCGATCGTCCC
ACTACACTTAAAGTAATGTTTTAAATTAGTTTTCTACAAATTTGATCCCG
CTTGACGAAAGACATCACGCTATGTAACATTTTATTCTTAAGTAAGAAGA
TCCGAAGGATTCGTCCTTTATTTCGATATCAGTATAATTGGTCGAAAGTA
TCATTTCAGCCGGAGGTTTAGCTTGGACCGGCGATCTGCAAAAGACGAAA
ATCAGGATTTTTTAATGCCTCGCAAGCATTCTAATAATAATATAATAATA
ACATAAAATGTTTTAAGTGGCATGCTCCGAAAAATTCAAAAGTTTTTAGG
CAGCTGGAGAATTGTTTCCACGAAGGGCCACTCTGTTCTAAGAGTGATCT
TTTTTTTCTTCAAAATGCACGAGTTGTAATGCCTGCCTCGCAAGTTGACC
TCTTTTTATTTCAATATCGAGCTCTCTGTTCATATCAATGCACTGCATTT
CAACCCTATTTTAACATAACATTGAGAAATCAAAAGTAAATCAAAAGTCT
ATTTTTGAACGCTGTTTTAATTTCTTTGATCTTCTAACTTCCGTATTTTA
AGAGTTTGTTAAGAGTTGTCATTTTAAAAGAATTTTATAGGATTTGTGGT
GACTTTTTGTCATTTTATCAGGAGTGAGGGGGTTGGAGATAACATATGAC
GTCATAAATTGATATTATGTCATAAAACTCACTTGTTTACTAATGACTCT
TTGTAGCAAACTAACAAAAGACAATCGGAGTTTTGTATATCTTATGTCTA
CGAATTATGAAGTGCCTTAGATTTTTAAATTGCCCATAATGAAGGCCTTG
TTAAGATGCTTACGTTGTATCGTGTTTTAATAAGATATTTATGGTTTGTA
CTTTCGATGAATTTCCGAATGATGTAATAATTAAAAATCATCAAGCTATG
ACGACAACTTTTTTTGACAAATGATTCTCTTTCTCTTACTCTTTCTCATA
CATAATTTTAATAAGTTTATTTCATGTTGATTACATTCCCCTACGCGCTT
TATAAGGCTTGATACCAAAATGATAGTAATACCTTGTAATACCATTGAAA
AGAACCAACCGAACATCAATGTCATTAAGATACAATCTCTCAGTTATGGA
AACCATGTACATTACAATGATTATTCTTTTTATAAGCAGTTATAGTATTT
TTTCAATAGCTATATCTTCTGAGAAAGCTAAGAATATAGAAGGTAATCCC
CTTGCTTTAGATGGCCGATATTTTTACAGTCATACCTCTGTTCGATGGAA
GAATTGTCGGTAACTCAATTTTTATCAAAACCATTCGTTCTTTTTATAAA
ATTAATGTTTTTTTGTGTTAACTTTTAAGAGTTTACAGGAACTGCTAATA
AAAAAGCTATCTTGGCTAGCTTTTGCCTAAAACGTGCATGCTTTTAGACC
TTTCTAGAGACTTTCGAGAATATCGAGCTTCAAATTCTTCAAACTCCAGT
CACTTTTTCTTTCTTAGTGACCTCTTGAGATTATATTTTCTGTATTCTAG
GAAACACATACTGACGTGGAAGAATTCCTTAAAGAAGCAGATATGATGAA
GCAAATCAAACATGACAATCTGGTAAAACTTATCGGTGTTTGTACCAAAG
AAACACCCATCTATATTGTGACTGAGTACATGCCTCTTGGTAACCTGCTA
GAATTTTTAAGACAAGCAGACAAGAGCGAGTTACCGGCCAAAACGTTATT
GTATATGGCGTCACAGGTGGCCTTAGCAATGAAGTATCTGGAATCGAGAA
ATTTCATTCATAGGTATGATGGCTCACTTTTTGTTTCGATACTGTTTTCT
CTTCCCTTTCCTGGTCTACTGGCCTGGCCTACTTTGGATCAATACTGAAA
AAGATGTTTTGAGTAACTTGATTTCGTAGAAACTGCTTATGTAATAGGGT
TGTTTATTTAGATGAAGTGACTTGGACCCCCTTCGATCCTTCAATTCACG
CAATCGTGCAAAATTTTTTTTCCCGCAAAGTTTTCCAATTCACGCACTCA
CACAGTTTTTTTAAATTTAAGAATCTTCTTATTTTTTGCCACCGTAGGGA
TTTAGCGGCACGTAATTGTTTGGTGGGTGAAAACCACTTGATCAAAGTTG
CAGACTTCGGGCTGGCCCGTTCCGTCGACCAAGATTACTATAAGGCCCAT
TCCGGAGCCAAATTCCCGATCAAATGGACTAGCCCTGAAGCACTGGCTTA
CAATAAATTTTCAACCAAATCAGACGTTTGGGGTAATTTTCTTGTAATTT
TATTGCTTTTTCCTCTTTTTGCTTAGCTTTTCTTAATGTTTGCTAACGAT
CTCATTCTTGAGTGAATGATGAGGGTTAATTTGAGTAGATCATTACACGG
GTAGAAAACTCTCTTTTCAGTCCCAATTGTAATAATGGTAGACACTCGCA
AATTTGATCTTCTACGTCGATCTTCTATATTAATTCGAACCCATTTTCTG
TTCCTGTTAAAGGAAAATCCTTGTAGAATACTCTTCATAATTAGAATCTT
TCTGTAATTCAAACAAATTAGATTTTGAATTAACAAAGTCTAACTTTACA
TATGACTAAAACGTTTCTTTTTTCGATTCACGTGAACAGCGTTTGGTATT
TTGATGTGGGAGATTGCAACGTACGGCATGTCACCTTACCCTGGGCACGA
CTTGAATCAGGTATATGGCTTCATAGAGAAAGGCTTACGAATGGAATGTC
CCAGTGGCTGTCCTGAACCCGCATATCAACTGATGCTTGATTGTATGTAT
AATTTTATTTTGTTTAGCTGAACTGCCAAATTGGGGTAAGGTTTCAAATG
TTTTTAAAAATTACTGTAGATTTGGATTAGTTTTTGGGAGAGAAGGCGCG
CGATAAGTGCTAAGTGTCAAAGAAGTAGTAACTTAACTTATAGTGGCGTT
GAAAACTTTGTTAAACATTGCGTTCCCCTCTGGCTTACCTTATCTTGGGG
ATCGTCAAATAACTCAACTAGGCAATGTCTTTTCACGATCTATTAGAAGT
TTCCACACAACAACTTTGAATTCATCCTTTTTAGTAGTGGTAGATTAAAC
TCTTAAACTATAACTTATTGGTTTAAATGTAATCGATTTTAGGATAATTG
ATTTGAATTTCTTTGCAGGTTGGGAATGGAAAGCAGAAAACCGGCCGACT
TTTATTGATATTTGTACTCGACTCGAACATATGTTAGATGTGCTTGATGA
AGGTTTGAAATTCTTTTGTTATCGGTCAAAAGAAATACTGCTGTTTCTGC
GTGTTGTCTGATTAAAATGAAGGTGTCACTCTGCCTCTAACTTGTATCTT
CGATATTTTGACTTGTTTTTCTTCTTATCTTATGCTGAATTTGTTTAATT
ATCAAAATTTCATACTTTCTCATATTTGGACGAACCGATATTTCCTTCTT
ATTTCTTTCTACATTTACATGAAAATCATAATGATCTTCTTTTAAATTGT
TCACTTTTCACAAAATATAGAAGTAAAGAAGGCGTTGAAATCACGCCCTC
TTTCCATGCATTCAAGCGATATTGAGGGGCTTGTTTTACCACCCAAACCG
CCCAAACGAAAGGGTGACAAAAAGGAAAAGGACGATGAGAAACTCAACAA
TAACACTGAGCAAAAACCGAAGAAAGAAAAGAAAGAAAAATTCAATTTTA
AAAACACTCTACGCAAAGATAAAAAGAATAAAGATACGTCACCCTCTCAT
CAACCCGTAACGCCCAACGACAGGCGAGGCTCAGCCTCCAGTGGCTCTTC
TACTATCTCAGAACAAAGCTACCCACCACCCGTACCGACATCGAGTGCTC
CTCCTCCTCCTGTACCCAATTCTCAAGGAAGTAAATCTGTCTCAATGAAT
GAGCTGCAAGATAGTTTGAAACTGTTGGCCAAACGGAACCCACAAGTAGC
TTCATTGAACGAATCTCTTGCTTCCAGACTGGAAGAGCAACGACGTAGCT
CAGTATCTACACCATCCAATAGGCCACCGCCTCCTCCGAGACCAGCCGAA
GATAATCCTCCATCGAGCACCTTACCACGCCCAAAGAAGCCACCATTGCC
ACCCAATCGTCCTCTGACGTCGAGAACCCTACCACAGGGTAGTGATCCCA
ACATCCCTGCAACACTATCTCACAGTCCACCTCGTCATCCTGCGCCGCCA
CCCCCTGGTTTCCAAACGTCGAGGACATTACCACCTGGAAGTTCAAGCCC
GATCGCCAACCATACCCCACTGCAAGCGCCTCCCTCGCCACCTACTGTCA
GCAATAGACCATTACCGCCACCTTCTGCTAACAAACCCTCACTACACACT
CCCTTGCAACCACCACCACCTCCTCCGTCGCAATACAACAAACCTGAGCC
TCCTTCAGAACCAGTTGAAGAGAAACCAAAAGTAGTGCCACCACGCCCTA
TTCCAGCTGCTCGCCCTTCTGTCAAACCTCGCCCTGGTAAGCCACGCCCT
GATAGCTTACCACCAAAGCCAGGAACACCAGCTAAACCAGCTGCCCATGT
AAGCAATAGTAAACAGAGTTGTATAACAGTTGACCGTTCTAAGGTCAAGG
AACAGTTGCACCCAGTAGCAGACACATTGGAAACATTGGATAGTGTACTT
AAGAACTTGATTCACTTAGCTAACCAAAGACTTTCTGAAAATATCGGTGA
AAAATCAAACGATTGCTTGAGTTGCTGTAACGAGTTGGTCGATCGTATTT
CATCATATCGAGATTCAATCGGGCCTGTTGCTCGAATGAAAGTTAACAAA
CATTTAACGGGTATCGAATCGAGTGTCAACGATTTTACGAGTTTATCGAA
GAATTTACCTCGCATACCTACTGCGACAGACTTAGAAAAGATGAGCAAGA
CTTTGAAATTACTTTGTTCCGGGCTAGATAATTTATCACAGGCTTTGCCG
TCTCTATAGAAAGAGTTATTTCTTCAATATATTGAAATTATTTTATTAAC
CAAAAAATTGAGATTCATTTTTTATAATGTTATCTATATACTAGCTGTTA
TTATTTTTAGTCTTTTTTTTTTACAATTTTTCACTTGCAATGTTTTAATT
TTCCTCGCGTATTTCATTTTTACGTTCTGTTTTTAATCAGTTTTGATGTA
TATTTTACTATTGATTCAATCTTCGATTTATGTTCGAATGTTTCGAATAT
CACGAGCCTATAAGTCCTTCTAACTTTTTACTCAACGAATGTACCCTTCC
AGACGTTACTAATCGATTATCGATTAAAATCGATAGCTAATCGATAATTA
TTCGATTGATTAAATATCGATTAAAAACGATAATCGATAGCTCATCGATA
CGCTCAATTTTTCAGGACTCAATTAAATTATCACCATAGATTCTTAATCG
ATAATATCGATTACAGTGTTAATAATTGATAATATCAATTAATATCGGTA
TAATCGATACCTCGACCCTATCGATTTTAATAGATAATTTCGATGAAACT
TGGTTTAATATCTTACATCAGATCGATATAATCGATACTCGATATTTTTT
AGGCTCCGATTATTTATCGATTATCGTTTTTAATCGATATTTAATGAATC
GATTAATTATCGATTAGCTATCAATTTTAATCGATAATCGATTTTATTGA
TTAGTAACCTCTGGACCCTTTGAATAAAAATGATAATTGAAAGCTGTGGT
TGCTTCTTAAACAACAATTTTTTGACATGCGCTGAATTTCAATCTGCAAT
TTCAAGATCAAAATGCTAAATAGGGTAGAAAACGGCTCACTACAATCAGC
ACCGAAATATAATGGCAATTTTGGGTATTTTAAAGTTTTTCAGAATTTAA
AGGTCGAAGCCAGAATTGCCGTTTCAGTTTTCCACTTTGCTTCATCGGAT
TTTTCGATTTAGGAGGGGTTGAGTGGCTTCCAGGCTATATTCTCTGCCTT
ATTGGAACATTTTTGAGCTTTATGATCTGTGATCCTAAGGTCGTAAGTCT
TAAGTCTAATGTTATAACTCAGAGTTAAAACTCTACTTCCGAGCTATACT
TCAAAATACTTAAAAGTCACTTGCGGTTTTAAAGTTTTGAGGGAATTCCC
ATGTCAAATATTTCGGCGCCGAGAATAGTACCTCCAATCTGCTTAAAAAA
TGAGAACAGCTAACAGTAGAGTTTAGAAAGAAACTAACAATCTTTTGTAA
AATGTGTTTCTCGGAAACAGGGACAAGGGGTTATTTCCTTCATTTAATTA
TTCTTTAATATTTTGTCATAAAATGAAGAGCTGCATTTTTTACCTGAAAA
TTATAATATGTCACTAATTATTTTATTAAAATACTTTTAACTTTTTTGTT
CATAATTTTTCTACCCAATAATTGTAGCATTTTCCTGTATTTTTTCATAA
TTATCAGTGAAGTTTCTAATAACTTCTAACTAGCTCTCAAGAAAATTGCA
GTTGGAATGTTCTATTTGATTTAATATTGATAATGAATGGAATCAAAGGC
TAATAAATTGACGACTCTAAAATATAGTGTTCCACAACTTGGAAAACCAC
ACAGAATTTCGGACAAACCTTCCTTAGCATCTTTCACTGATAAGAAAGTT
AACTTTATTGTTATTATTATTTGTCGATTAGATAATTTTAGAATCGAGAA
ATATTATTTTGTAAAATAGAAGAATTTTTTTTTTGGTTTTTCTTAGAGAT
ATCTTGAATAATACGTTATTGTAAGGACCAGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:745377..753308- >MSTRG.15076.2.p2 ID=MSTRG.15076.2.p2|Name=MSTRG.15076.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1404bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:745377..753308- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCATTCAAGCGATATTGAGGGGCTTGTTTTACCACCCAAACCGCCCAA
ACGAAAGGGTGACAAAAAGGAAAAGGACGATGAGAAACTCAACAATAACA
CTGAGCAAAAACCGAAGAAAGAAAAGAAAGAAAAATTCAATTTTAAAAAC
ACTCTACGCAAAGATAAAAAGAATAAAGATACGTCACCCTCTCATCAACC
CGTAACGCCCAACGACAGGCGAGGCTCAGCCTCCAGTGGCTCTTCTACTA
TCTCAGAACAAAGCTACCCACCACCCGTACCGACATCGAGTGCTCCTCCT
CCTCCTGTACCCAATTCTCAAGGAAGTAAATCTGTCTCAATGAATGAGCT
GCAAGATAGTTTGAAACTGTTGGCCAAACGGAACCCACAAGTAGCTTCAT
TGAACGAATCTCTTGCTTCCAGACTGGAAGAGCAACGACGTAGCTCAGTA
TCTACACCATCCAATAGGCCACCGCCTCCTCCGAGACCAGCCGAAGATAA
TCCTCCATCGAGCACCTTACCACGCCCAAAGAAGCCACCATTGCCACCCA
ATCGTCCTCTGACGTCGAGAACCCTACCACAGGGTAGTGATCCCAACATC
CCTGCAACACTATCTCACAGTCCACCTCGTCATCCTGCGCCGCCACCCCC
TGGTTTCCAAACGTCGAGGACATTACCACCTGGAAGTTCAAGCCCGATCG
CCAACCATACCCCACTGCAAGCGCCTCCCTCGCCACCTACTGTCAGCAAT
AGACCATTACCGCCACCTTCTGCTAACAAACCCTCACTACACACTCCCTT
GCAACCACCACCACCTCCTCCGTCGCAATACAACAAACCTGAGCCTCCTT
CAGAACCAGTTGAAGAGAAACCAAAAGTAGTGCCACCACGCCCTATTCCA
GCTGCTCGCCCTTCTGTCAAACCTCGCCCTGGTAAGCCACGCCCTGATAG
CTTACCACCAAAGCCAGGAACACCAGCTAAACCAGCTGCCCATGTAAGCA
ATAGTAAACAGAGTTGTATAACAGTTGACCGTTCTAAGGTCAAGGAACAG
TTGCACCCAGTAGCAGACACATTGGAAACATTGGATAGTGTACTTAAGAA
CTTGATTCACTTAGCTAACCAAAGACTTTCTGAAAATATCGGTGAAAAAT
CAAACGATTGCTTGAGTTGCTGTAACGAGTTGGTCGATCGTATTTCATCA
TATCGAGATTCAATCGGGCCTGTTGCTCGAATGAAAGTTAACAAACATTT
AACGGGTATCGAATCGAGTGTCAACGATTTTACGAGTTTATCGAAGAATT
TACCTCGCATACCTACTGCGACAGACTTAGAAAAGATGAGCAAGACTTTG
AAATTACTTTGTTCCGGGCTAGATAATTTATCACAGGCTTTGCCGTCTCT
ATAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:745377..753308 - |
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