MSTRG.15060.3.p2 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.15060.3.p2
Unique Name	MSTRG.15060.3.p2
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000130_pilon:531746..585430+
coding sequence from alignment at sc0000130_pilon:531746..585430+

mRNA from alignment at sc0000130_pilon:531746..585430+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.15060.3.p2 ID=MSTRG.15060.3.p2|Name=MSTRG.15060.3.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=53685bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:531746..585430+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTTTTACTTGTTATTAACTTTTTATCTTGACCCTCCAATCAGAAATACAT
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TCTTTTTCAGGTCACTGTTTCCGTGCGAAAAAAGTAAATTGTGTCAGAAA
TTTTACTTTGGTGTCCTGCGGGCCCTAGGCGCTTGAGAAAGCGCGAATTT
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gtataattctccgaaatttcaagaatatgtgctaatttGCCGTGAAAATC
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TGCTCCAGATTCTTCAATGGATGAAATGGATCAAACTCCTGTTTGATGTG
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ttattgttttcaattttagcgACCATGTCACCGTCCAAAGCAGATCGTAT
AGCAGCTATCAGACAAACGGCTACTGCTTTGCGTGAACGCCTTATGGAAG
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TTTTTGCAACCTATGATGATTACCACTTTTTCAGTCAAAAAGAGTTAAAA
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CGCTCAAAATCGCCGGACAGTAAGTCAGCATTCAGTTCACACCGCTCAAG
ATCGAAGTCTCCTGACAGTAAAGTTACCGACCGATCGGCGTACACTTCAT
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TGATCGAATGAGCATCGAGGCAAGAGAGAAAGCAGCTCAATCTGCTAGGG
ATATCGAAATTGCGCGTCGCAATGCTTTAGAGGCTGAAACCAAAGCGCAG
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TACTCAAGCTttctccaaaCaacaaaatgaagcgactgctttATCCTTAG
ACGCTATCAAAGAGTCGGAGAAAGTTCGTCGTGACGCTTTTGAGGAGTAC
AAGAAATCCGTCGACGATCGATTAGCAAACATCGATGGCATAATGAATTC
TGCGGTTTCTGCGGCATCCACGGCTGCAGTTGAAGTGGCTCTGCGACAAC
ACCGCGAGAAATTGGAATCGCTCCGGAAAGAGTCTCTTCATAAGGTTTCA
AAGACCTTCACGTCATTTAGTGAGGAAAGCAGCACTGTTTCTGATCGTTC
AACAACTTCACCTACCAAAACTTCTTATCAGACGGGATCCAGTGTTTCCA
CTGCTAAAGATTTATCTATAGAGCAACAAAAAGACAAATCTGAAATTTCA
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GTCACCAAGCTATACTGAACCTGTATCCGAAAGCTACGTTAGTGCctcaa
aattaaaatcatcGCCTGAGATTTCTGAACGGCTACCGACTTCAAACCGA
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ATACAGATGTGACAGAGGATGTACCGACAGAAGTTGACGAAGATAAAGAA
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GTTCAAATCCCCTCTGCTactcaagtcttgttcagttcatacttttattc
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ACCAAtcagaagaaaaaattaaaatacaaactttaaagaaaatccatttc
ccttttttttttaactttctttctATTATCTGTGAAAATATTGCATTTGA
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CCTAATGACTCTAATGCTAAGAGTTTTCTTTCTTGCACCGAATCATTTTT
GGTATCTCATTCTAACCATAGTATCAAGGAACGAAACCATTCAAAGTAAT
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TGACTTTCGACAAGTTCTACCCTCCGAAAATCATCGCCGTAAAAGCTTGG
ATGTTCACCGTGATTTCATCGTGTCTGGAAATGACGAGACTTCTTCGGTA
AAGATTATAAGAATTTGTGTTTTCCTTGCCTATACTAGGCGTCGCGGCTT
TTTTCTACgcagtaacgtctattccacttttcaaaatgttttccaaggtt
ttcgggctctaaataTTCGATGTTTGACGTCATTTTACACTTTCGAGGCT
TTAAGTAGCaagaaaatcgaatttgcgtcaataAACTTAAAAGGGTTCTA
TTTCTCGAAAGTCATCAAAAacaaagtggaactcaccaagaaacggaatg
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TGAGAATTTACATTTTACGATTTAGATTTGGTGTCTTCGGCTGGACTGAT
TTATCTAAGAATTTGCTTTAATAAACAATTTATTGATCTTTTTTCTCCAG
GATGAAATGCTACCAGCGCAAAAGGTCGCAGAAAAGGTATTGCctatgat
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CTTGCACTTCGTGAGAAAGCTATCATCGATAAAACCAAAGCTGAAATCGC
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TGGCAGAATTCCGGCTTGAAAATGTATGAGATAATCAAACAGCTACTGTA
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aaaattagaATAGTAACATATTGACATTCAATCATCTTTTATCTGTATTA
AACCAGCATGACTTACTTTCCATTATCATATTTTCATTTCCTTACAGACG
ATCAAAGAAGAAGTGAAAAGCTCCTCAGCGACCTCCTCAATCATCACCAC
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TGACCCGACCACACGAAACACGTTCTGGACACTTTCTATTGGTGGCGCAT
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CAAGCTGCTAGAAGTCTCAAAGAATCCAAAAAAGCTCTTGGAATGAACAT
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GAGGATGTTGTGAAGAAAGTCAAACCTGATATTAATGATGCCGCCGCTAC
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AGATTATCATAATCCGAACGCCACTATGTATGAACAATTACGTAATGATA
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GAATTCAACGACCACGATATCTCGTTAGCTTCATGGTATTCGATGTCTTA
TCTTTGGTATGCAGCCATTGGTGTCTCTTTCACTTTCGTTACCGGTTGTT
TAGTCAGCTTGTTCTGTAAATACGTGTTAAAAGAGGAAGAGGAAGATGTG
GACGAAGATTTATTGTTCGATTATTACGGCTTCTTCCAATCACTCATCCC
CAAGAAATGCCGATCAGATAGTTATGAGATGAATAGGAGCAGCAAAGGAA
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ATGTACATTTTATACTACGTTGGGTGGAATGAAGGCTGTCATTTGGACGG
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TCAGGTCTTACCTTACTTCATCATCGACAAACTGAAAGAATACCAAGGAG
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GGTCTACTTGGAAGGGTGCTTACTGTGGTGTAGTAGTTGGCGTTAGTACA
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GCTACTGGCTTCTTACTTATCTGCTATCACGCTATTGGGTGTTCCGTCAG
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GCTGTTGTTTTGTACGCCCCCAGTTTAGCTTTGGAAGCTGtgGCAGGAGT
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ACACTTTCTATTGGTGGCGCATTCACTGCTATGCCTGTATGGACTGTCTG
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TGTGTGATGGATGGGTGTGTCATTTATGCTGTTTATTCCAAGTGTGACAT
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GGTGCTTACTGTGGTGTAGTAGTTGGCGTTAGTACAACATTATGGCTTGC
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TGGACTCGCTTATCCAACTTTAGAATTCAACGACCACGATATCTCGTTAG
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CTAATGAGtatcTTGAAAAACGTTTCACGCCTGGTGTCAGAAGTCTTGGA
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GAGAAGTGTTCTCACGGATACAAGCTGGTCAAAGAGACCGTGTTTTCGAC
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TGGCGCATTCACTGCTATGCCTGTATGGACTGTCTGTCAACCTGCCGTGC
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ATGAACATCATTGGTTTGATTTTGATTGTGTTGTTATGTGTGATGGATGG
GTGTGTCATTTATGCTGTTTATTCCAAGTGTGACATCGGGAAGTTTGGTC
TTGGTTATGTCACCTCAAATGATCAGGTCTTACCTTACTTCATCATCGAC
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CAGTGGTGCTCTCAGCACTGCTTCTTCAGGATTGAACTCGATCGCAGCAG
TTTTATTGGAGGATGTTGTGAAGAAAGTCAAACCTGATATTAATGATGCC
GCCGCTACCAGAATGTCCAAAATTATCGCCTGTGCTCTTGGATTTCTTGT
GATCGGTTTATCATTTCTTGTCTCCAAATTTGGAACCATGGTTCTTCAGT
TGGCATACAGTATTTTTGGTATCATCGGAGGCCCATATTTAGGATTGTTC
TGTCTTGGAATGCTTGTTCCCTGGTCTACTTGGAAGGGTGCTTACTGTGG
TGTAGTAGTTGGCGTTAGTACAACATTATGGCTTGCTGTGGGTGGTATTA
TCTATCCGCCCAATAAACACGCCCAAATGGTTGATGTGAGAGAATGTCAG
GTGTATAAAGATTATCATAATCCGAACGCCACTATGTATGAACAATTACG
TAATGATACCAAGATACCAAGTATTGTCCAAGGAAATGGACTCGCTTATC
CAACTTTAGAATTCAACGACCACGATATCTCGTTAGCTTCATGGTATTCG
ATGTCTTATCTTTGGTATGCAGCCATTGGTGTCTCTTTCACTTTCGTTAC
CGGTTGTTTAGTCAGCTTGTTCTGTAAATACGTGTTAAAAGAGGAAGAGG
AAGATGTGGACGAAGATTTATTGTTCGATTATTACGGCTTCTTCCAATCA
CTCATCCCCAAGAAATGCCGATCAGATAGTTATGAGATGAATAGGAGCAG
CAAAGGAAACGAGgaATCATACCCTTTGAAAGAACAGGAGGCTTAAatgg
attccTACCGTACGGAGAATGCTTTCTCCATTGCTGATTATTGCGTGTTC
GGTGGGATGTTACTCATCTCCAGTGTTATCGGTATATATTTCGCTTACGG
TGGCAAACAGAAGAGTACTAAAGAATATTTAATGGCTGGTCGTGATATGC
CGTGGTTCCCTGTTTTTGTATCGCTACTGGCTTCTTACTTATCTGCTATC
ACGCTATTGGGTGTTCCGTCAGAGATTTATACATATGGTGTGCAATATAT
CGTCTTGTGCTTCTCATACTTCATTCTGATTGGTGCAGGAGTCATTATCT
TTCTACCAATCTTCTACAAGCTTCAAGTGGTCAGCTCTAATGAGtatcTT
GAAAAACGTTTCACGCCTGGTGTCAGAAGTCTTGGATGTTGCTTGGTATC
ACTACAATACatcCTATATCTTGCTGTTGTTTTGTACGCCCCCAGTTTAG
CTTTGGAAGCTGtgGCAGGAGTTCCTCTCACAGCAACCATTATCAGTACT
GGATTAGTATGTACATTTTATACTACGTTGGGTGGAATGAAGGCTGTCAT
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TCATTATCGTCGGTGCCGTTGAATTGGATGGGTTTGGAGAAGTGTTCTCA
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CTGTTTATTCCAAGTGTGACATCGGGAAGTTTGGTCTTGGTTATGTCACC
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GCACTGCTTCTTCAGGATTGAACTCGATCGCAGCAGTTTTATTGGAGGAT
GTTGTGAAGAAAGTCAAACCTGATATTAATGATGCCGCCGCTACCAGAAT
GTCCAAAATTATCGCCTGTGCTCTTGGATTTCTTGTGATCGGTTTATCAT
TTCTTGTCTCCAAATTTGGAACCATGGTTCTTCAGTTGGCATACAGTATT
TTTGGTATCATCGGAGGCCCATATTTAGGATTGTTCTGTCTTGGAATGCT
TGTTCCCTGGTCTACTTGGAAGGGTGCTTACTGTGGTGTAGTAGTTGGCG
TTAGTACAACATTATGGCTTGCTGTGGGTGGTATTATCTATCCGCCCAAT
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TACCAAGTATTGTCCAAGGAAATGGACTCGCTTATCCAACTTTAGAATTC
AACGACCACGATATCTCGTTAGCTTCATGGTATTCGATGTCTTATCTTTG
GTATGCAGCCATTGGTGTCTCTTTCACTTTCGTTACCGGTTGTTTAGTCA
GCTTGTTCTGTAAATACGTGTTAAAAGAGGAAGAGGAAGATGTGGACGAA
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GAGAATGCTTTCTCCATTGCTGATTATTGCGTGTTCGGTGGGATGTTACT
CATCTCCAGTGTTATCGGTATATATTTCGCTTACGGTGGCAAACAGAAGA
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TCCGTCAGAGATTTATACATATGGTGTGCAATATATCGTCTTGTGCTTCT
CATACTTCATTCTGATTGGTGCAGGAGTCATTATCTTTCTACCAATCTTC
TACAAGCTTCAAGTGGTCAGCTCTAATGAGtatcTTGAAAAACGTTTCAC
GCCTGGTGTCAGAAGTCTTGGATGTTGCTTGGTATCACTACAATACatcC
TATATCTTGCTGTTGTTTTGTACGCCCCCAGTTTAGCTTTGGAAGCTGtg
GCAGGAGTTCCTCTCACAGCAACCATTATCAGTACTGGATTAGTATGTAC
ATTTTATACTACGTTGGGTGGAATGAAGGCTGTCATTTGGACGGATGTGT
TTCAAGCATTTGTCATGGTAACCGGACTTATTGTTGTCATTATCGTCGGT
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CGTTCTGGACACTTTCTATTGGTGGCGCATTCACTGCTATGCCTGTATGG
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AGAATCCAAAAAAGCTCTTGGAATGAACATCATTGGTTTGATTTTGATTG
TGTTGTTATGTGTGATGGATGGGTGTGTCATTTATGCTGTTTATTCCAAG
TGTGACATCGGGAAGTTTGGTCTTGGTTATGTCACCTCAAATGATCAGGT
CTTACCTTACTTCATCATCGACAAACTGAAAGAATACCAAGGAGTTCCTG
GACTTTTCACTTCTTGCTTATTCAGTGGTGCTCTCAGCACTGCTTCTTCA
GGATTGAACTCGATCGCAGCAGTTTTATTGGAGGATGTTGTGAAGAAAGT
CAAACCTGATATTAATGATGCCGCCGCTACCAGAATGTCCAAAATTATCG
CCTGTGCTCTTGGATTTCTTGTGATCGGTTTATCATTTCTTGTCTCCAAA
TTTGGAACCATGGTTCTTCAGTTGGCATACAGTATTTTTGGTATCATCGG
AGGCCCATATTTAGGATTGTTCTGTCTTGGAATGCTTGTTCCCTGGTCTA
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TGGCTTGCTGTGGGTGGTATTATCTATCCGCCCAATAAACACGCCCAAAT
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GTGTCTCTTTCACTTTCGTTACCGGTTGTTTAGTCAGCTTGTTCTGTAAA
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CATTGCTGATTATTGCGTGTTCGGTGGGATGTTACTCATCTCCAGTGTTA
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TTAATGGCTGGTCGTGATATGCCGTGGTTCCCTGTTTTTGTATCGCTACT
GGCTTCTTACTTATCTGCTATCACGCTATTGGGTGTTCCGTCAGAGATTT
ATACATATGGTGTGCAATATATCGTCTTGTGCTTCTCATACTTCATTCTG
ATTGGTGCAGGAGTCATTATCTTTCTACCAATCTTCTACAAGCTTCAAGT
GGTCAGCTCTAATGAGtatcTTGAAAAACGTTTCACGCCTGGTGTCAGAA
GTCTTGGATGTTGCTTGGTATCACTACAATACatcCTATATCTTGCTGTT
GTTTTGTACGCCCCCAGTTTAGCTTTGGAAGCTGtgGCAGGAGTTCCTCT
CACAGCAACCATTATCAGTACTGGATTAGTATGTACATTTTATACTACGT
TGGGTGGAATGAAGGCTGTCATTTGGACGGATGTGTTTCAAGCATTTGTC
ATGGTAACCGGACTTATTGTTGTCATTATCGTCGGTGCCGTTGAATTGGA
TGGGTTTGGAGAAGTGTTCTCACGGATACAAGCTGGTCAAAGAGACCGTG
TTTTCGACTTCAACCCTGACCCGACCACACGAAACACGTTCTGGACACTT
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TGCCGTGCAACGATTTCAAGCTGCTAGAAGTCTCAAAGAATCCAAAAAAG
CTCTTGGAATGAACATCATTGGTTTGATTTTGATTGTGTTGTTATGTGTG
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TACTGTGGTGTAGTAGTTGGCGTTAGTACAACATTATGGCTTGCTGTGGG
TGGTATTATCTATCCGCCCAATAAACACGCCCAAATGGTTGATGTGAGAG
AATGTCAGGTGTATAAAGATTATCATAATCCGAACGCCACTATGTATGAA
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CGCTTATCCAACTTTAGAATTCAACGACCACGATATCTCGTTAGCTTCAT
GGTATTCGATGTCTTATCTTTGGTATGCAGCCATTGGTGTCTCTTTCACT
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CTGCTATCACGCTATTGGGTGTTCCGTCAGAGATTTATACATATGGTGTG
CAATATATCGTCTTGTGCTTCTCATACTTCATTCTGATTGGTGCAGGAGT
CATTATCTTTCTACCAATCTTCTACAAGCTTCAAGTGGTCAGCTCTAATG
AGtatcTTGAAAAACGTTTCACGCCTGGTGTCAGAAGTCTTGGATGTTGC
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CAGTTTAGCTTTGGAAGCTGtgGCAGGAGTTCCTCTCACAGCAACCATTA
TCAGTACTGGATTAGTATGTACATTTTATACTACGTTGGGTGGAATGAAG
GCTGTCATTTGGACGGATGTGTTTCAAGCATTTGTCATGGTAACCGGACT
TATTGTTGTCATTATCGTCGGTGCCGTTGAATTGGATGGGTTTGGAGAAG
TGTTCTCACGGATACAAGCTGGTCAAAGAGACCGTGTTTTCGACTTCAAC
CCTGACCCGACCACACGAAACACGTTCTGGACACTTTCTATTGGTGGCGC
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TTCAAGCTGCTAGAAGTCTCAAAGAATCCAAAAAAGCTCTTGGAATGAAC
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ACCAGAATGTCCAAAATTATCGCCTGTGCTCTTGGATTTCTTGTGATCGG
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GGAATGCTTGTTCCCTGGTCTACTTGGAAGGGTGCTTACTGTGGTGTAGT
AGTTGGCGTTAGTACAACATTATGGCTTGCTGTGGGTGGTATTATCTATC
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Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


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MSTRG.15060	MSTRG.15060	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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MSTRG.15060.3.p2.exon27	MSTRG.15060.3.p2.exon27	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon28	MSTRG.15060.3.p2.exon28	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon29	MSTRG.15060.3.p2.exon29	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon30	MSTRG.15060.3.p2.exon30	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon31	MSTRG.15060.3.p2.exon31	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon32	MSTRG.15060.3.p2.exon32	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon33	MSTRG.15060.3.p2.exon33	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon34	MSTRG.15060.3.p2.exon34	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon35	MSTRG.15060.3.p2.exon35	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon36	MSTRG.15060.3.p2.exon36	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon37	MSTRG.15060.3.p2.exon37	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon38	MSTRG.15060.3.p2.exon38	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon39	MSTRG.15060.3.p2.exon39	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon40	MSTRG.15060.3.p2.exon40	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon41	MSTRG.15060.3.p2.exon41	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon42	MSTRG.15060.3.p2.exon42	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon43	MSTRG.15060.3.p2.exon43	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon44	MSTRG.15060.3.p2.exon44	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon45	MSTRG.15060.3.p2.exon45	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon46	MSTRG.15060.3.p2.exon46	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon47	MSTRG.15060.3.p2.exon47	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15060.3.p2.exon48	MSTRG.15060.3.p2.exon48	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.15060.3.p2	MSTRG.15060.3.p2-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000130_pilon	genome	sc0000130_pilon:531746..585430 +

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MSTRG.15060.3.p2 (mRNA) -