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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:42433..49575+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15029.2.p1 ID=MSTRG.15029.2.p1|Name=MSTRG.15029.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7143bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:42433..49575+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
tttcattttcagaaagaACTAATCAAATAACATGAAAAAACTATTAACAT
TACATGAAATAATACCATCAAGGAAGATGGCATCTTATTGACAGTTCGTG
TGATGTTTCATCCATCTACACCAAAATGTTTTCATCAACAAAAGCATCAC
AATGTGAGTTCATTCTGCTGTTGACACAACAGCTTAAATCATATTTATTC
TGTTTAAAGTTGATCCTCTGCATAACTCAATACTCAAACCGTTCCCATCT
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ACCCTTTGAGGCCTTTGAGAgattgatttttcgattctttgtgtaaattt
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TTACgccatgaatatcacgaatagaGTGCTAAATGTAGCTGCTTGGTATT
ATTAAAGTTGTCTTAACTACAAGGAAGATTTGTGAAGCTGACTTTTGAAT
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AGTCTAAGTAAAGCTCAAAACTTTCAGTTTGACTGATAAACCAAAAGGAC
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AAGATCCTTCACtttttttACCTTTTAGGGGAATCATTATACAATATTGG
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GTTGTATTCTTTTTATTAAAGTCGTCACAGATTCGGATTCTTGTTCCCAG
AATCCTCTCctagaaactgaaaaaaatcgACTAAAAATTGTGAAATGGAA
CTTCGGTCCTTAATTCAATCCCCCATCATCAAGTTCTCAAGTTCTCACCA
GGTTACTGAGACAGGAGTGCTTGTAGAAAAGATATATAAGAGTGGAGATG
TTTTCTTCATTTCTCATCTTTATCATTCATTATTTCTGCTGATCCATTCT
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GAAGTTGCATTCTTTTTTGGAACTGCTCTTGATTGAACTGGGACAGCATG
TTTCATTCATGCCTAGTCCTTGACTATAGCAGATCAGtagtagagcattc
gccttgaAACCAtttttttCTTGGTAAAACCCTTGGTCGCATCCAGTCAA
ATGGATAATTGGCTTTAATTACAGTGTgaatctccataacttgaacctAT
AGAACTCGAAATTTCTTCCAAGTTGATGACAAACTTGAAATTCTAATGTG
TAGATAATTGATTTGTTGTTAATAAGCGCGAAGTCAGGCTGGGTTGCATT
TTATAATTTGCTACCACTAACCCAAATACCCCCAATAACCTAAACAATGC
GTAAATATGGTGGAGATTTCGCTAACTTCATAACCTGTACTattcgaatg
tctccttgaCTTAAACGATTTCCTCCGGCCTGCATGCTATCGAGCTTTGA
ACACTCTaacataatacatgttttttataggaacaaactatttaaaaaca
taaggcttcgatggctaaaatatgaagaacaagttaagaacattttaatg
ccttgcggactctaaaacaacctattttcttagaaaaatggacagaaata
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aacatccgaaggcttcaaaaattttaaatgctcttataaaaaaccgtgta
aCATACTTGAACAGATAGTAATTCaccattttctcatttttgttgtAGTT
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TGGTGTCAACATTGAAGTGATCAGTAGAGAAATCGTaacatctttgaaat
atttcgaaACACAATTAATAAGGTCAGAAATTATTAGATCTTAGTGATCT
TTTTCATGGAAATGCCAGAAATGATGTTATAGATGGATAGATTAGAGCCG
ATatttttacgtggatagcccagtcatctaggacttttagacagtctttc
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aacggaacattggaaagAGCGGGGATTTGAACCGCGAATCCCTGGTTTAA
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AATTCAATATTCTAAGAACAAACATTTTTGCACGAATTATTCATAATGGG
ATCAATGATTTAGTTCGAAAGATTCTAATACAATTGGTGGAATTCTCTAA
TTATGCAGAGAGAGCTCATGTTTTTTGAGTAATCTTGTGTATTGAAAGAA
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GTTCTTGaattctcaaaacttttcaTCTTGTAAGAAATAAAGCTAGTTAG
ATATACAAGTAACTTTTctccatgaaaaatattttttaatcagttttaat
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TGTATTGCATTATAAACGTTTGTAATTTTCAGTTGGATCAAAGATTCCGA
TCCATGTTACAAGCCATCAGAATGTGACTTCGATCGAAACCAGTTCCCCA
ATGTCGACTATTTACATTTAATGCAAGCTCTACTCGATTTGATACCTAAC
CTTCACAACGAGCAAGACGCCGAACTGAACAATTTAGTTCTACGTACAAT
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TGACCTTATCAGATACTCTGTACGATGTAcaacaattttttcatcttaaa
atcGTGGATTTACTCTCACAATATTTCATCCCGTTTGTTTATGGTTTTAT
GACGCACGACAAGTCGGACGATTTGGCGGAGATTAATCTACTAATACCGG
CCATTTTGAGTAACGTCTTGGACGCCACTTCGGAGCCGGCATCGTGGACG
AAGGTCATGGAATGTATCATGAGATTTAAGAAGAACGCATCTACTGATCT
TCTCATGGTTTTAGCGTATGGTAGCAAAGAATCACTAAAAGCTTCGTTAC
ATCTGCTAAACCGTTATTTTCCACCTGTCGATATAGGTATACTTTTAATT
AACTTCGGATTAGGCCAAATTTATTGTTCTATGGATTTGACCAACcctgt
tttttctaaaatcaaaaaaaaaaaatttgtaaagcTAGAAGATGGATTTG
AAAGTTCTTTTTGCAGATTATTTTTAACTGAACATGTAAATTCATTCTCA
TGTGAAAATTTATACGCCTTCCAGTATCTTACGATTTTCACACATAccgc
agatgagatggagtttttggacctaccccggtggggtggaggtcctataa
attcacctctgtccgtccgtccgtctgtccgttcgttaccagcttttctc
gagattgaatcataggaatcatttgatttttggtacaaaggtgcaaaacg
gtggtggccaaaatgtgacggagcccgattttcgaaagaaaaaatttttg
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atttttttatacgcACATTATCAAATACTTacgtattagcttttctcgag
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gctcaaaaaccgcatgtttatctataagaatcactattaataagcttaca
ttaatgttcttagccaaattactcaattttttaatgagatagatgtcttt
ttatgctcacgaagtcttgaatatgaaagaatatttcaagagcatgaaat
tttggtttctaaacgtttttttaataagaaacaaacgactaatttcaata
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agatatcaattatatatgtgttaaatgcataaccaggtaggtccataaaa
gtatcacttgttatgaTCCATTTTGCTCAAAGAAGTTGCCAAACATgcga
agttttttttaaacaccTGGTATTTTATAGAGGTTTTTCACGTTTTGTTT
TCTGCCAATATGAAAGCAAGCTTCGAATCCGTAGGGTGATCgggggtggg
ggtccgaataaacaggggggaggaaaattttctaaattctaataagcggg
ggggggggtaatttgaagacagaatttttttaattgatatcaatctcaac
aacaaaaaagaaactttaacaaatgaacacgtaaaataagaaccaatact
aacaaaaaggaaaatttaagcaattttaaggtctatctacactataATAA
AGTATTGaattatttgaatttaattagcgaggggggtcttaataagagcg
gggggatggtttttttttctcttaacaattagtgGGGAGGACGTCTggat
tcgggagacaagagtaagtaAACTAAACATCTATAAAGTCATTTCTCTTT
TCAGCCAGTATCAAAGCTTATCAGTCACCTCCATACGAAAATATCAGACC
TTATACTTGCCAATATCAAGAATGTTCAGGTTCAAACAGAGATGCCGTCA
TTGAATGCCTTGATCCCATAATATGTGCCAGATACAATGATTCACCACCT
CCGATGTATCTTTGCCAGAAATGTCACGATAGCATGGATCGTATGGAAAG
CCCAATGTTCATCCATGTCAACCAACCTGCTGATTTGGTTTCTCAGATAT
GTGATAATAGCAATTGTCGGTTCGGATTCATGAAAGCATTGTATTTTTGT
TTCTCGTTGGACTGTATCAAGAGGAATGATTATAAACCGATTCGCCTCTG
TGAAGACTGCCATCAAAGGTATTACTTCCTCACTTTTCCCCTTCGAATAT
CATAAAATCAGAGATTTTTCAAAGCACTTTTAGCTGGGGCCGTTTTGTAT
ATTTAGATTGAGTTTCTTTTGGTGCTATTAGCCAACAAATAGGCCCTGGA
TAAAATTGAGTTGGGGATACAGAGGTGAGAGGCCCCAAAAGATTAATGTA
TGAGCTAAAGTCCGAAATAGGCCAATGTTTTgacaaaatggaaagttttt
ttCGGATTGAGTTTTATGAACTCAATGTTGGATTGAGAATTTTGAGTATA
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GAGGACTCATCAGTGCGACTCGGTAAGCGAGCATAAACTACTGTTGTGCC
CAGAGTGCTAAAAACACCATTACAGCCTTATGCTCTATTCTGCGGACATG
TTTCTTTCCAGTTCTTTTTAACTTTAATCCTTCCAATTTATTAGGACCCA
CTGTTCAAAATTAAATTACTTTCATcgtaaaagttttttatcattttctt
caaaatgaagtACAGTTAAATCTCACTATTTCGAACTCAAATGGGGAATC
TGatttgttcgagttacagagacaTTAGAATTGTAGAAggtattttaaga
gggtttcttcTTGACGGGGGCTgggaattagttcgaattatagaaaaatt
cgaataatcaggaataataaAGGTTCGAAAAAGCAAGAGTCTGCTGTATC
TGTTTGCGGAGtttttttCTTACAATTAATCCTTGAGATCACCGTCATct
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aatgattgaCTAAAACCACGCGTTTATGAAGAACCTGACTGACCAAAAAT
GTAATTACATGAAAATTAgttattttttagtaaaattttttttcattttc
ttcgaaatgaaatatcttttttcgtagtttttttcTCATAATCAGCCTTG
AGATCACTGTCATCTGGTTCTCTTTTGATCTCTTTAGATTACACGCTGAC
TTGCATGAGCCTCACATCAATCATGAATGTTTGAAGGAGCTATGGATCAC
TGGTAATCCTGAACAAACTTATCTGGTTGATGCTATCATTCGCCTTGGTA
TGGAAGCTCAACCTAATTTCCAAGAAAAATGTTCTCGAATGGg Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:42433..49575+ >MSTRG.15029.2.p1 ID=MSTRG.15029.2.p1|Name=MSTRG.15029.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1638bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:42433..49575+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTTCATCAACAAAAGCATCACAATCCAGTATCAAAGCTTATCAGTC
ACCTCCATACGAAAATATCAGACCTTATACTTGCCAATATCAAGAATGTT
CAGGTTCAAACAGAGATGCCGTCATTGAATGCCTTGATCCCATAATATGT
GCCAGATACAATGATTCACCACCTCCGATGTATCTTTGCCAGAAATGTCA
CGATAGCATGGATCGTATGGAAAGCCCAATGTTCATCCATGTCAACCAAC
CTGCTGATTTGGTTTCTCAGATATGTGATAATAGCAATTGTCGGTTCGGA
TTCATGAAAGCATTGTATTTTTGTTTCTCGTTGGACTGTATCAAGAGGAA
TGATTATAAACCGATTCGCCTCTGTGAAGACTGCCATCAAAGATTACACG
CTGACTTGCATGAGCCTCACATCAATCATGAATGTTTGAAGGAGCTATGG
ATCACTGGTAATCCTGAACAAACTTATCTGGTTGATGCTATCATTCGCCT
TGGTATGGAAGCTCAACCTAATTTCCAAGAAAAATGTTCTCGAATGATGT
TTTCATCAACAAAAGCATCACAATCCAGTATCAAAGCTTATCAGTCACCT
CCATACGAAAATATCAGACCTTATACTTGCCAATATCAAGAATGTTCAGG
TTCAAACAGAGATGCCGTCATTGAATGCCTTGATCCCATAATATGTGCCA
GATACAATGATTCACCACCTCCGATGTATCTTTGCCAGAAATGTCACGAT
AGCATGGATCGTATGGAAAGCCCAATGTTCATCCATGTCAACCAACCTGC
TGATTTGGTTTCTCAGATATGTGATAATAGCAATTGTCGGTTCGGATTCA
TGAAAGCATTGTATTTTTGTTTCTCGTTGGACTGTATCAAGAGGAATGAT
TATAAACCGATTCGCCTCTGTGAAGACTGCCATCAAAGATTACACGCTGA
CTTGCATGAGCCTCACATCAATCATGAATGTTTGAAGGAGCTATGGATCA
CTGGTAATCCTGAACAAACTTATCTGGTTGATGCTATCATTCGCCTTGGT
ATGGAAGCTCAACCTAATTTCCAAGAAAAATGTTCTCGAATGATGTTTTC
ATCAACAAAAGCATCACAATCCAGTATCAAAGCTTATCAGTCACCTCCAT
ACGAAAATATCAGACCTTATACTTGCCAATATCAAGAATGTTCAGGTTCA
AACAGAGATGCCGTCATTGAATGCCTTGATCCCATAATATGTGCCAGATA
CAATGATTCACCACCTCCGATGTATCTTTGCCAGAAATGTCACGATAGCA
TGGATCGTATGGAAAGCCCAATGTTCATCCATGTCAACCAACCTGCTGAT
TTGGTTTCTCAGATATGTGATAATAGCAATTGTCGGTTCGGATTCATGAA
AGCATTGTATTTTTGTTTCTCGTTGGACTGTATCAAGAGGAATGATTATA
AACCGATTCGCCTCTGTGAAGACTGCCATCAAAGATTACACGCTGACTTG
CATGAGCCTCACATCAATCATGAATGTTTGAAGGAGCTATGGATCACTGG
TAATCCTGAACAAACTTATCTGGTTGATGCTATCATTCGCCTTGGTATGG
AAGCTCAACCTAATTTCCAAGAAAAATGTTCTCGAATG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:42433..49575 + |
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