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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:776..8975- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >MSTRG.15025.2.p1 ID=MSTRG.15025.2.p1|Name=MSTRG.15025.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8200bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:776..8975- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTCTTTTTCAGCATTTTTAGATAATAAGATAAGAAAAGTAATTTAGATT
AAAACACAAATTGGTCGTTATGGATGAAGTTTAATTCTTGAAAGAATTTT
GATGCCATTAAAAGTTTTCGAAGAGGTAATTAAAGAGTTGTTGTTGGTGG
AATGTTTTGAGTTTCGTACTTGACAAACAAAGAATTAAACTATGGACAAC
ATAAAATTATTTTTTGGTAAGTTTATAATATTTCTTCTTTCACAATCAGG
ATCTTTGACCAGATCGAAAAATCTCCAAAATGTCCTGAACTGTCTGCTGT
TTGTGAAGATAGCTTCGTTCCTCTGGTGCATAGCTTCTTTTCTTGAATCT
TGAAATTGTTTCAAGGAAAATCAACAACACGAAAACTGAAGAGTTTCTTT
CTTTGATTGAATCCATTCAAATTTTGACGCTTTGCTTTTTTTGAACTTTG
CCTTTGAAAATACGATTCTGGCTATTTTTATTGATGTTTAAGATTTTGAA
TTCTATTTTGAGTACAAGAAGGTCATTTAACCCCATTTTTAGGTCCACTG
ATTCCTCTTGCCATGTTTTGAAAAATACACGTTTTTTTATAAGAACACCA
AACACTTTGGATGTTCTTAACTTTTTCAGTTTTAAGCCAAAAAATGTTCT
TAACATGTTCTTATTTTCACCATTTTTTGACCATTATCATCTATTTTTCT
CTAAGAAATCGGGTATTTTCGAGTTCGCAAAGCCTTAAAATGTTCTTAAC
TTGTTCTTAAAGGGACATAACAGTACTTGCGAAATTTGTCAACAAACTGT
ATGCAGCGGATACAAAATCAAAATAAAAAATCAAACCAAATATGGCTAAT
TTTGATTGCTCAATTGTTTTACAAGTTTGTTTTGGACACGTAATTTTAAA
CACGTGGTTCGCGCAATGTTTACATTTTACTACTTTAATGTCCCTTTAAT
ATTTTGGCCATCGAACTGTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAG
AATTGTGTAATTACTTTTTTCAATTCTTTCACATGACAGTTACAATTTTA
CGAATTATTTACTGCTTTCCAACATTTTTAATAGTTTCTTTAAGTTGCAC
GTGCTTGTCTTGTTTTGCCAAAATGTCTTAAATATTTGACATATGTGAAC
TTCCTTATAATGACATCATTTTTACCTGAATTTGATTGCCTCAGAATTAA
GACTAGACTCGAATAAGAAAATGATGTGCCATGGTCAGTACAGATAGACT
GCTCTCTTCCACCCCCCATGCCGTATGTTAATTTTCAAATTACAACACAG
TTTTATAAGATTACTGGAACAATTAGTGTTGGTTTGAAGATGTTCTAAAT
TTTGAAAAAAAATCATAGTATTGTAGTAATGTATATAGCTACAATCATAT
TTCTTCCAATTCACTTTTTATTATAAAAACATCCAAAATTTTGAAAGCCT
TCAAATGTTCTTAACTTTTCGGGTTTCAAGCCTAATAATGTTCTTAACAT
GTTCTTATTTTCAGCATTTTTTGAGTATATTTGTCAATTTTCCTGCGAAA
TCAGGTGTTTTAGATACCACGAAGCCTTAAAATGTTCTTATTATAGTTTG
CTCTTGTAAAAAAAACGTGTATATAAAACAGAAATCCTACTATAAATGTC
GAAACCATTTTAATGAACAAATGTACCTTTAAATTTGAAGTGAATCAATG
TCAAATCTAAAGTTAGTGAATAAGAACATGACAGGCTGAGGAAAATGAAG
CACAGGCACAGCCAAGACTTAAGGTGTTTCAATTAAAGGTTTTATTTTTT
ACATAAGTGTTCCCGTTTCATATCAGACACATGTTTCATATCAGGACAGT
GTCTACCTATTGCTATAAAATGCTGATATACGCAAAAAGTTGTTATTCTT
TTCCTCTTTCTGACCAATCTTGCTTCACATCAGTGTCAATCTAATGTGAA
AAAGATTGTGAATTAAAATTTAAAAATAAGCAAGCGATATCACTCTTACT
TAAAAACAAAAGAAAATGTGTAATAGTTTCTTATAACAATCAACAAGAAA
GAAGCACGTTACTAAGAGCCTCTCCTTTTTTAAAGAAAAAACTATTATGG
TATCTCTCTAATCATATTTATCTCTATGATGTCACTAGGATGCCAAAATA
TTTTGTTATTAAGTGGTGTCATATGTCTCGAAGTCACATCCGGAAATTCT
AGCTTAGTTGCTCTTACGCCTTGAGTATCTCTCTGTGTTAACAGCTTGTC
TGATACCTACACGTTTTTTATATAAGGAGCCTTCCGATGTTCTTAACTTT
TTGAGTTTTAAGCCTAAAAATATTCTTAATACAGGGTGTCTACGGGACCT
TGAAAACCTTGAAAACCTTGAAAACCTTGAAAATGAACCACCCAACCTTG
AAAACCTTGAAAACTATCAATTTTCTGGGAAAAACCATGAAAACCTTGAA
AAATTGTTAAAAACCTTGAAAAGCACTATCCAGTCATTCGAAAAGTAAGA
ATAAGTAAAAAACCGCCTGCGGCGCTAAACCTTTACATGTTTTTTTTTTA
TAAGCATATGTTTTTTGGAAAACAAGCTCAGAGATATTTTAGACTCAGGC
TCGAAGTATGGTTATCATATGCTTATTTTTCCGAAAAATTCGAGTCTCCA
ATTATTCCAAAATCTGTCGTTGCTATACATGAGGATAGGGAAATAAGTAA
TGACACAAAGATTGTTCAGGAAAGTAGTGAACGATTGCCGCGTTTACGCT
TGTATTTTTTTAAATTAAAATGTTCACTTACTCACCTTAAAAGCAAGCTT
AGTAATATGCTTGTAATATGCTTATTTTTTAGACAAATTCGGGTCTTGGT
ATGCTTATAAACGTTATGCTTATAAAAAAAAAACATGTATAACATTTATA
GAATTCCATTTTTCCCTGTTTCTGTTGCGATTCTGTCGCAACGAATGCAA
CATATTCTTTTATCATTAGCTGAGTTTTTGTCACAAATTTTCCGTTTGCA
TGAGCCCTAAGAAATCGACTGTTCTCCAATTTTCAAATCGCTTCAGGGCG
TCTTGGAATAATGGCCGTTCATCAATAAAATTTCGAGGATTCCTTAAAAC
AACTCTTTTGGCAATTGATTTTTGTAAAAACAAAATCAAAAACAAGGCGT
TTTTTAGCCATTTGAAAGAGTCAAAATCAAAATTTTCTCTCGTCGGCGCA
AACCATGGTTGCGTCTCCTCGGTCACTGTAAACAATTGGTTATGCTTCTA
ATTCTTTATTTCTACAGTTGGAAGACTAGGGAGCTGGAGTATTTCTTTTT
GTGGTATTGTTCTCGAGAGGGAGATAGGAATTTAACTGCGGAAGCAATTC
CCCGGGCACCAAAAGTAAATAAATTTTATTTGCTGTCCTCTATTTTTCTT
TTTTCTTTCACCTACCACTCTGAAAAAAAACAAAAATTCCTGTAAAGAGT
TTCAACTGAGTTTCAAAAAACCTTGAAAAGTGCCAAAGTTTTTGCCAAAA
AACCTTGAAAAACCACTTAAAAATGACCAAAAAAACCTTGAAAACCTTGA
AAATCCGTAGACACCCTGTAATATAATATGTGTTTTTATTTTCGCCTTTT
TGTATTTAGTCCATTTTCGATATCAGGTGTTTCAGAGCCCGCCAAGCTTT
AAAATGTTCTTTACTTGTTCTTAAGATTTTGACCATCGAAGCCTAATGTT
CTTATATAGTTTGTACTTACAAAAAAAACGGTATTAGACTATTTCCTTGT
TTGAACATGCAGGTTACTGATGTATGTTATTTTATTATTGACATTCTTTA
AATCGATATTTTAAGGAACGAAAAACTTCGAATGAGAGAATCTTCTTTCG
AATCAAAGCTAAAGGAGATTGGTTTTTAAGTAGGATCAAATACACGCTGT
TTTTTTTTATAAGAACACCTAAAATTTGGCTGAGCCTGGATGTGCTAATT
TTTTTTAGCAATTTTCAGCCTAAAATGTTCTTAAATGCGTTCGTAATTTT
TCATACTACTCTAAATCGACAATATCATGCAAAATAAAGAGCACTTAAAC
ACGAATTAAAATTGGTAAAATTTGGACAGTATTTAACTCTCGATTTTAGA
AAATTCATCCTTAAGTTCGGTTAAAACTGCTTTAAAAGAGGAAAAAAATT
GTAGTTTCTGGTCATTTTCTTCCAAACTGAGGCTGGGCATGTTATTACGA
TGTTCTTAATTCGTCGACGAATTTCAGCCTGAATGTTCTTATAAACTGGG
TTCTAATAAAAAAAAAATGTGTAATGAAATTTTGAATCGAAGAAAGTTGA
CGATATTACGCATGTACATTTATTTTTAACTTTTGACTGCTTTTGATAAG
GTCACGAACCTTGATTTAAAATTAAATTTAGGCTTAAAAAGTGCATGACC
TTTTTAAGTTTGTTGAAATAATATTATGCGATACATAATGCTTTACTATA
AGGCCATACTTTCGGCTTCTCATCGATAGAAACCATTTCTTGGATTTGAT
AAAGAAGGATCATTATTGTTAACAACTAGACAATTATACCACGTTAATTG
GTTGGTGGATGAAACTCATGATATCACGGAACGAAAGAAGTAGAGAAATG
AAATGATTACGTTATGCAAAGAAAACAAATAATGAAACAAATTTACTCAG
TTGTTGTTAAGAGCAACTTTTTTTTCTGTTTTGTAAATGATTAAGTGGCC
GCCTTTAATAAATCATTGTTGATTTTTCGTAAGCAGTTATATAAAACGTA
TGTATGAAGAAAAATATTGGGAAGTTTTATTTGGTATTTATAATAACAAT
ATGACCATGTTCTGATTTCGGTTGTTTGACATTTTCGAAAGAGGAGTAAA
ACTTGACTTTGATTTGATTTTTGTTTTGGTTTGAAGAACGAACAGTGGAC
AAAATGAAGAATGTATTTGCTTCTCTGCTTCAAATCTTTGTTTTTATTCA
AAGTAATAATCAATTTATGTTTTTTTATATATATATGAAAAAGGGTTTAG
TGAATCATGGAGGTATAAAGAAAAACAGGAGTTGAATTTGTCGGTAATTT
GTCGTTAAAGTCTTTTGATTTCTTTTACGAAATATATCAAAAGAAAATAT
TAAGCTCGTCCGACAAAATGAGCTTTTCCAGAAAAAAACCGTACACCCCC
TGTTGAGGAGGTCCAACCTTTTGTGACCTACCCCTTTGGAATTCCAGGCA
ATTTTAGGATCATATCCCTCTGGAATTCCGAATTTTTACAAATTTTCAAT
CATTACCCCCTTGGAATTCCGCTTATTTTTGACGGATTTTCGTCTACCCT
TATGGAATTCCACTGCATTTCAAACCTTACCCCCTTGGAACAGAAATGGA
CCTCCTCAACAGGGGGTGCACAGCCCAATGCAACTTTTTAGTAGAACTCA
GAATTTCTCTCTGAACATTCTTACTATCAGTATTAAAGATTTCTAGCCTT
CTGATATACAAATATTAAATAAAACTTCGTCCACGAAACAAGTTTATGTT
AAATTTCGTTACCCGTTAAATTTTGTTTTGAAAAGATATTTTCTCAAGCC
AGAAAATGAAAAGTTCTTTATAAGCACACACGATTTCAGACTCACTTGTA
AACATAAAGTCGCTGGAGAATTTTGGAGGAAAGTATCAAGCAATAAAGTT
CACCTTAAAGAAAACATTGATCGAAAAATCTTATCATTTGATGAAGGATT
GCCAAGTTTACAGACCTTTTTTTTAGTCCAAATATTTCTTACACTGATGT
CAGAAACAATGAATCTCGTCTCATCTAATTTCTAAAGCTTAAATGAGCCC
AATAAGATTTCATCAATAGACAAACAAGTTCATTAAAAATGCAAGATACG
TATGAGATTGTGAGATTACAAACCTCGTATTTTTTCAATTAGTGAGCTTG
GTTACATAGTACATACATCTCCTGTTTCTTTATACCTCCATGAGTTAATA
AAGGCTTTTTTGATAGTCCTAGGATTACACTTTTTTCATAAGAACAAACT
ATATAAGAACATAAGGCTTCGATGGCCAAAATGTTCAGAGGATTTTAAGA
ACATTTTTAGGCTTAAATCTTGAAAAGTTAAGAACGGCTTCAAAAATTTT
GGATGTTCTTATAAAAAAAATGTGTACGGGCCTACTAAAGGCCAATTATA
TGTTAGATTGGTGTATATCATGGAGTCTGTCAAATAAATCAGCAGACTAT
GTTCGCCAAGAAAAGCCTGAGTTTTTCTCTTTTTTCTTCATGTTTTTATC
AACCAAAACGAAAGAGTAATCCATATCTAAGCCTATTGCAAAACCATTTT
ATGCCATTTTCAAAGTTCTTTCCTTATTTTCTTTTCCTTTGGAAAATCCC
TATTAATGAAAAAAAACCTATTTTTCAAGACTTTGCTGAAAATAATTCTC
TCGAGAACAGTATAATAGATAAGAAACTTAAAAATTGTCTTCCTTTTCTG
ATAAATTTCAACATTATCATCAACTAAGAACACCATGACTAGGATGATTA
TGATAAGTACCATGACAGAGGCATACTATTATAATAATGTTCTTGTAGAG
AAGATGATTTTGATAATAAATACGTTCATATTTTCCTTTTCTCAGGTTTG
GTCACGTGTATCGTGTTAGCATCCCCTTTAACCATTGATCTGAACACCAA
TACCACAACACTGGAATCTGCATCAATCCAACCGTCATCCTCGTCAATCA
TGATGATTTCATCTAGCATTGTTGCCAATAATTCTTCAATGAACGGTACC
GCCTCGGGTGGAGGGAAAACAGACGAAGAACTTGCACGAATGGCGTCGCT
TTATGTGGCTGTTGGTTTCATCCCAGGAATGATCATGTTAGCAGTTATTT
GTCGTTACTTGCCAGACTACATGTACAAATGGTGCTCCGACATGTGAGCT
TTTTGTTGAAAGTTAAAAATCTCCGAGGAGGCGGTGAACTTCTTTTATTT
GGATGGGCGGACGAGTGAAGTCTGTCTTACTCAATATTTTTGAAATGAAA
AAAGGAAAGGAACAGACGTACAAAGTTATAAATTAAACAAGAATATTATT
TTGAAAAACTGTTGGCTCTTGTGGAAAGAAACTATCAAACGATACAAATG
ATACCGACTGAATTAGTAGCAGCCAGAAGCATCTCAAACACATGCAGATT
GTGGACTTCTTTACCGGTCCCTTACCGGTGCAAACTACACGAAGGAGGCT
CAAAGGCTTACTTATGATAAAGATTCGACGTTTTCCCTTTTCCAATAGAT
AAGGAGCTATTAAGGTTTAGGTGTTAGGGAGGACGAATTTTGTCCCTTTG
ACATCGCATACTTAATCCATGAATATATAGAGTTGTTTTGTCTCTTATTA
AACCATACTAGCCACGCAATATGTTTTCTCAACGAGGCTCAGAAAACCTG
AGTTGCAAAAACCTGAGTTACAAATTACGACAATTGTGACGTCATTAGAC
TCAAATCATAACGTCATAAGGGTTTTCTAACTTGAAAAAAGTTTTTATTT
TGAAATTATTACGTAGTATAAATGGGTTTTTGTAACTTTGGTTTTCTGAG
CCTCGTTTTCAACCTTCTCATGCAAAGTTCTTCTCCAAGAAGAGATCAAT
CCATAAAAATCACGAGTATTCATGATTTGCACCACTGCAATGATTTTACG
AAATTATGCAATTTTTCTGGGTTTTGTTCCACCCAATACGTCACTTTTTC
TTTTGTTTAAGTGACGTATTGGATGGAAAATTTTAAAAGTTCTCTCGACT
CTTCCAGTCGTGGTGCATATCATGAATAAGCTTATACAATCTTTTATGCC
ATCTTCGTCACAACTCAATCAATCACGGGTCAATCACATATCACAGGGAA
AAGCAGGGAAAAGTTCAGATATCCTGACCTCGAGAGTATTGGTAATGGAA
GATACTTATCAACGGAGCGGTTTGCAACCAAAGGGCTATATGTACTCTTT
AAATTTACCTTTACTCACGGATCAATGAACATTTGTATACAAAAAGAACA
GGCGGGTAACAAACCATTAACAGAAGGAATCCAAGAAAATTTCTTTAAGA
AAATTTTTTTTTTTTTAATTTTTCATAAACTATTTTTTTCCCCTTTTAGC
TGTATCATAGTTTTTATAATTATTATTTTATGGTGATATTTAAAGAATTT
TTGATTAAAAAATACACTTCATGATTTCAGATTCGAATGGGTGGGAGACA
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:776..8975- >MSTRG.15025.2.p1 ID=MSTRG.15025.2.p1|Name=MSTRG.15025.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=654bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:776..8975- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GTTTGGTCACGTGTATCGTGTTAGCATCCCCTTTAACCATTGATCTGAAC
ACCAATACCACAACACTGGAATCTGCATCAATCCAACCGTCATCCTCGTC
AATCATGATGATTTCATCTAGCATTGTTGCCAATAATTCTTCAATGAACG
GTACCGCCTCGGGTGGAGGGAAAACAGACGAAGAACTTGCACGAATGGCG
TCGCTTTATGTGGCTGTTGGTTTCATCCCAGGAATGATCATGTTAGCAGT
TATTTGTCGTTACTTGCCAGACTACATGTACAAATGGTGCTCCGACATGT
GAATGGACAACATAAAATTATTTTTTGGTTTGGTCACGTGTATCGTGTTA
GCATCCCCTTTAACCATTGATCTGAACACCAATACCACAACACTGGAATC
TGCATCAATCCAACCGTCATCCTCGTCAATCATGATGATTTCATCTAGCA
TTGTTGCCAATAATTCTTCAATGAACGGTACCGCCTCGGGTGGAGGGAAA
ACAGACGAAGAACTTGCACGAATGGCGTCGCTTTATGTGGCTGTTGGTTT
CATCCCAGGAATGATCATGTTAGCAGTTATTTGTCGTTACTTGCCAGACT
ACATGTACAAATGGTGCTCCGACATGTGAATGGACAACATAAAATTATTT
TTTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:776..8975 - |
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