MSTRG.15019.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15019.1.p1
Unique NameMSTRG.15019.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000129_pilon:916024..929456-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15019.1.p1 ID=MSTRG.15019.1.p1|Name=MSTRG.15019.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13433bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000129_pilon:916024..929456- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCATGGATATGTGCAGATGCTTTGTCGGTGTTCTGTCTAAGGTATGTGTT TATTTTTATTGCTATTTTTCTGTCATTTTCCAATAAAAATTTCATATTAT AAATTCTTTGACATCAGGTATGTTATCTCGCATTCCCAACCCATGAAAGA AGCGTAAATCAATTTCATTCCAGCTTTTTTTTTGACGTTTATCTAACGTT CACAACGTCCATAAAACGTTAGGTGAACGTTGAAACAACGGTGTGTGCCA GCTGGGATTGATTGAACAAACACACCAAAGTAATTCTGACTCTTAACGCT CAGTTTAAAAAACCTGCTTGACTTCTAATAATTAACCTGCATTGCCTTTA AGACTTTAAATCAAACTTTTTCAGAGTCTTAAAAAGAAAGGAAATTTGAC ATGTAAAATGTTGATTATATAGATGTGACGCAACTTAATGTTTAAAAATC TCCTTAAAACTCTTAAAATCCAATCATTTTCTTGAAAATCTGATCAAAAT ATTTGAATAACAAAGCTATTAGAACGGATACTCTTATAAAAACATATCGA TATAAAATTAGATGCCTTCAAAATTATAGCAATGTAGCTAGTGCTGTGTA ATAAAACCGTCACATCCAGTAACTAGCCTTTATAGTAATGCTCCTGCTAA CTGCAGTTAGCTGTTAGTATACAAACTGAAATTCATTTTTGAAATATTGA AATTAGAATACTTGGCTGCTCTGTTCTAGATCTGATCTAAATCTCAAAAG ACTTTATATTAGATGAAGTAACTTCTACCATACCGTAGTCAAGATCAACA ATCCAAAAGTTTGTCCAACAATCAAATGAAAACCTCCGAATACTTCTAGA GACGAACCAAGCTGGCTTGTCTTCTTAATTTTGTCTTTTGAATTATTCGA AAATCTATATTGGATTGTTAATCGTGACTACGATGATTCTTCAAAACGAG 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CAGTTCATAGTTCAGCCGAATCGGCTGGTCATTTGATCCTGTAAATACAA TCGAAAGACTGTCTGAAAGTCCTAGAATACTGGACTATCTACACAAAATA TCTAACTATATCTAACTACACTAGATGTCTACCGAATCATCTCAATTCTA ACTGAAGCTTCAACAACGCGAGACTTTCCTAGCTGGTGAGCAAAGCTCAT CATTCAATATTCTTTAGTCAACTAAGAACCAGTTTAATTGTCCAGACATT ATATCATTACATTCTCATTATGAAGACTTGTAACAAACAAACTTCCAAGC TGGCATCCAGCAAAATATTACCAAAATTTCAAAACACGATCCTTCTAACA TCTAACGGACATACAAACAACACTGTGTGAACGTTTGGACAATGTTGTGA TCACTGGCCTCTATAAAGATCTTGGACTAAGCCATATCCGCCATTTTTGA TCGAAGTTTTGAGAACGGTGATTCCCTAATGGTAGCATTCCTCGATGTAG GTCAATTCATTGTTCATTGCAATTTCCCTTGAAAATGATTTGACCCATAT CAAATGGCATTAGGATACCCTTTCAAAAAGAAAACTTCGATCAAAGACTT TGGTCGGCTGCAATCGAGAAACTGCTTTCGGAGTTTATATAAAGCTCAGT GGAGTAAAAAGATGATGTGCAAACGTAGAAACATGTATCAATAAGTATAA GTTCCTTTCTATGCTGATGTCTAGCAGAAAATGATAAATATAGCTCCCAA GTAGAGCTCAAATAAAGCTCACTGCAAGCCATATGCAACGAATCAATTCC TGGTAGCTTTAGACCAGCAATTGTAGCGACTAACTAACGTATTGATGATT ATAACATACATTCGACCCAACCTCACAACAAAATTAAGTCTTCCTTAACT TAATCTTTTACAACTCTCGCTAAACCTCAAAATCCTCGATACCGGCACAT 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GGGAAAATAAACTTTAACTTTAAGACTCGATAGACTGAACTTAAATGTGT GTTTTATTTTTATGATTCAGAGGACCTGTAAGATTTGCCTCATTTCAGTC AAATATATAGAAAAAAATTCAAAGAATTTCTGCCCAACTATCTATCTTCT TTCAAGAGATTTGGGTGGCAGAGCAGCAGTATGCATTTCGTCCTCGTTAA GACTCGTCAGCACTGCATACTGCACCCTGGCTAGGCAGAACGAACTGCCT AGCATCTCACGCCATAAAACTAATTGTGGCGCAGACTGAAAGAAGAAGTC TATATATTTTCAGGGTAAAAACGGTTAAAATATCTCCTCCTAATTATTCA TATATAAGCCTTTTAAACGTCTAAACCCTCTGAAAATTCAAAATACTGTC GATTTAAAACAAATTTAAACCACTCCAATTGACACAATCCATACCAATAT GAACGAAAAGTTCACCAAACCATAAAACCCTGTACTCTTCTCAAAACAAA ACACAGAATTTGTAACATCGATGCGGAAAACTGAATGTTTTGAAAATCAA CGTTTTCATACACCTATGTCATTCCTCACTTCCTCTGAGGAGAAAAAATA TATTTTCCTTTTGGTAAAGATTAGAAACAGTTACATTCGAGTTCCCACAG TGCACTGCGCGATCATATTGGTCAAGTTAATTGAGCCTTGCTGTGATTGA GTATCACATTTTGTTCACATTTTGTTATTAAGTCTATCCTGACTTCAAAA TGACTTTTAATTTCCTCTTTCTATCCAACATTCTTTCTATTCTCTAAGAC AGATAGATAGATAGATATGAGCCCTCCGAATGCATTCGGAATGGGTCCTA CTCCCAAAGGAGTAGGAATCACGGTGACAGACACTGCGACTTGACAGACG CGGCTGCCAAGTCATGACGTTTACCATGACACACGAACATGACATGGGAG 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AGTGGTTTCATTTCCCATCCATGAGTCTCGCCTCTAGCCCTTCGGGCTTG AAACTCATTGGTTTTGGCCTTTTTGAATCTTTGAAATTTCTAAGCTTGTA GTTGTATTATTTTTCAAAAAATGTTTAATAGCATTCAGAGTCTAAACCAG GTCTTACCTATTAATATCATTCACAGTCTAAACCAGTTCTTACTTCAAAT TCTTCTTTAAAAAACAATGAGGATAACTCCAAAAATAATGCTATGTCTAC TACGTGTTTCAAAATAAAAGGCCAAACTTAAGGAAATTTTATGTTTTACC CACTTCGACTAATGCAAGCATTTTGACCATAATAATAAAGCTTTACAGGT TAGCAAGCCACCGTGAAGACACATGGGCCTCTATAAACCGCTCGTACTTT TTACAATGATCTTTTTGAAATAGAGTTTTTTTCGCGGGCTCCCCCGGACT TTTCATTTTGTGTTGTCTCCCTTGATTTTGGCATTCATTTTTTCCGCTTC CTTACACCATTCTTTGATTATTTGTTTTTCATTTTTGGTCAAATCCTCTG TCACTCGGTAAGGAAAGCTTTTTTATTTCGTTATTGCTTGCAACACTGTG TTCTTGTCCTCTTCGTTCGTAAATGTAACTTTAATTGGTCGGTATCTCGC TTTATCTTCTCTTTCTTTCGTAAATTTCCCGATCCGCTGCGTCTCGGTAA TCTTTATATTCCTCAGATGGAGCCGCTGACCAATAATTTTCTCATGGATA AATTTTTCGTCCTCGACTTTTGTTTCTTCTTCAGCTTCATCTGTCGATTC ATCAATCCCATGAAAAATTAGGTTGCGTGCTGTCGATCGAATCAGCTGCT TCTCCTGCTTTTCTTTTCGAATTTAGCGTAGCTCATTGGTATGGTCTTTC CTCTTCTTTCTTTTCGATGATGCTTTTAATCTTATTTTCAAGTGTGGTTA 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CATCTTAACCAGTCTAGTGTTGGACGATAAATTCAAACATAGTAGAAAAT AACTAAAAGTTTATATTATGGAAGGGGGCCGTCCACATAGTACGTACGCA CCAAAATGTCGTAAATCGAGTACCTCCCCCCTGTACGCAAGCGCACGCAA ATGGCTATACCCCCCTCTGGTAAGTAAGTACTTTTTCTTTCACCCCCCCC CCCCCCCTCGGTTGAAGAAGATTTCGAATTCAAATCGTTTGGTTCGGACC TACTTTATTTCATACATGAAACTCAATGTTTACCAAGAAACTTTTCTTTT CCTTGATGCGTATAACAAGCGTAAAAGTTGACAAAAAAACAATGGCGAAA ATGGGCTATGAAAAAATTTTCCTTTGACCCCTCCCCTCCCCCTGTACGCA AGCATAAAATTCTTCACTCTTGACACCCTCAAAACACCTTAAAACGTTAT CTAATTGAGGAGAATAATAGTTTTTGTGGCTTAAAATAGTAACTTAAAAA AAATTATGGCATGGTCTACAAAAAAGTGGGGGCCCATGAATGAGTATTTC TTTGTATGAGTTCTCCTTGTTTCACCGCAATCACAAGGGTCTGTCGACAT TTAATGGTTCTTATAAAAAAGTATTTAACCTGCTTACGGTCATCAGGCAG GTTGCTTATGAAACATACAGTATGTTCAAATGAATAATTCAACGAGTGAG ATTTCTCATCACTTTCCGAAACACATTTCTCATTGTTTACAACTTGTTAA TTAGCCCTCATTAAAATCCTCATTAAGACATGAAAAGAAACTGTTTAATG AGTCGCCGTAAACAAGTCATTAAAATTAGCAATCTCCTGTCTATCTTATG AAATGCTGTTCCGCCTTGATGAAGAACTTTTGAAAGCTTCTCGTTGATTG GCTAATACAAATAAAGAATACGGTATTTGATGTCTTTAGATGTATCATTG TAAAAATGTTCAATAGAGGTTGCTTACGTAATGGCGTGGTATGGAAAAGA ATATAAAATGGAGGCTTTGCAATGAGGAGAACCACAAACCAACTTGAGAA GATTCAACAATAGTTCAACTAAAGAAATCGAAGAACAGATCGAGAAGAAA TTTTGAGGAAAATAACGAAATCAAAAGTACGGTTTACGAAGAAGAATTAA TATCAAACAATGAAGACATCAATCACTTTCACGCTCTTAGCCGCCCTCTT TGGATCAAATTACGCCTTAGTTGCGCCCACCGTTACTGGAACCACACCGC CTGCAGTTGCCTGTCCTAATTCATTATGTAAAGGGCTTGCTGATGGGAAT TATGGGTACGTCGATCCCACCACGTACAAACCCAACAAACACTATTTCAC ACAATGTCTCCAAGGACTCGCCTACTGTCAAGCTTGCTGGCCAATGAATC TCGAATTCTCCGCAAACTGCAATCAATGTTTATATTCATCCACAGATGAT TGCGTCACCACGAAACCATGGGAACCAGCCACCACTTTCACTTGCCCTGA TGAATGTCCAAACCGAGGACCAGATTTCACTGGGAATATCGCCGACCCAG GAAATCAACGACAATATGTCGGATGTTGGAATGGCGTCACTGTCGGATGT ATCGCATGTCCAAGTAATCTGTTATTTAATGAATATGAGAATGCTTGCTT GTTCGAAGGTAAGTATCTCACTCAACCATTGGATAAAAAGCATTAGAGAC ATCTCATTTGATGGCAATAGTTGAGAATTCTCCATTCCCTAGGAACTTTT TCCAAGATTCTTTACATTAGATTCTTCTTAAACTTGAACCTCTACAATTC CAACCTTTTTTTCGACTCAAAGAAATTTTCATGTTAGATTCACTGAAGAT TTGAAGATTGCCATCATCTTGGATGGCATGAAACTTTGAGTATGAAATTA ACTTAAATCGTTTTCTTTACTCAAACTATTTTCTTTTTACTACAATATCT TCGTAAATGGCACTCTTATCCAAACACTTTAAATTGATGAATTCTCTCGT CTAGGAATGGATTTGGGGAAAGTAGATTCTTTT

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000129_pilon:916024..929456-

>MSTRG.15019.1.p1 ID=MSTRG.15019.1.p1|Name=MSTRG.15019.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=537bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000129_pilon:916024..929456- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGACATCAATCACTTTCACGCTCTTAGCCGCCCTCTTTGGATCAAA
TTACGCCTTAGTTGCGCCCACCGTTACTGGAACCACACCGCCTGCAGTTG
CCTGTCCTAATTCATTATGTAAAGGGCTTGCTGATGGGAATTATGGGTAC
GTCGATCCCACCACGTACAAACCCAACAAACACTATTTCACACAATGTCT
CCAAGGACTCGCCTACTGTCAAGCTTGCTGGCCAATGAATCTCGAATTCT
CCGCAAACTGCAATCAATGTTTATATTCATCCACAGATGATTGCGTCACC
ACGAAACCATGGGAACCAGCCACCACTTTCACTTGCCCTGATGAATGTCC
AAACCGAGGACCAGATTTCACTGGGAATATCGCCGACCCAGGAAATCAAC
GACAATATGTCGGATGTTGGAATGGCGTCACTGTCGGATGTATCGCATGT
CCAAGTAATCTGTTATTTAATGAATATGAGAATGCTTGCTTGTTCGAAGG
TAAGTATCTCACTCAACCATTGGATAAAAAGCATTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15019MSTRG.15019Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15019.1.p1MSTRG.15019.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15019.1.p1.exon2MSTRG.15019.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15019.1.p1.exon1MSTRG.15019.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000129_pilongenomesc0000129_pilon:916024..929456 -