MSTRG.15017.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15017.1.p2
Unique NameMSTRG.15017.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000129_pilon:809099..834617-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15017.1.p2 ID=MSTRG.15017.1.p2|Name=MSTRG.15017.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=25519bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000129_pilon:809099..834617- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CCGGACTCTTGGTTCAGCCTCACTCTCATGTCTATATAAGGCCTCAGTTT CTTCACATGGACCTTTTTCAGTTCTTCATTTCTTAGTGCTGACTGCTGTA TTTTTGCTGTTCTGTATCCTGTTCTATCTACTCTGTATACTGTATACTGT ATTAAACTCTACTTCAACATGCTTGCCGAAAGATTATGCTTCACTATACT AATGTTCTTGACCACACCACCTTGTACTCCTCCACCCACCACTGAGGGAA GTGGGACACGTAAAAAGAAATGCCCTGGCTGTCAGAGGACCCATGACGAT CATACCTTTGGTCCTCCAAGCAAGAATTGTCAAGGACCAGTGTCGCCATC TCCCTCTCCTACTGATACTTCTCGTGCTGATCGTACCGAACAACGCAGAC AACAACAAACTCCAAGCTCCAGGGAAAACCCTGATGCTGGGTTGTCCTCT GATCAGATCGATCAATATCGCCGCCACTTACAATTCTTGAAGGATCAAGA GAATGAACTCCTAGAATCAATTAGGAAAGATCAAGAAAATCGCGAAGAAA ATGTTTTGAGGGATGAGATTAAACGTCAAACAGAAAAACTGGAACGTTTG AAAGCTTCAAGGTCCCTCTCTTCTCGTTCCGCCACTCCGCCCGTTTCTTC TCGCTCAGAGGAAACCCATTCGTCACGATCCGCCATTTTGAATCGCTCTT CGACTGACACTATGTCTACTTTGCTCCACCGTCCGCTCCTTGCTCAACCA CAACAACAACAAACACAATCGCATCTCTCTGGTTCTTCGTTTGATGTTGC TGCTTCCCTTCCTCATTTGAATTCTGGTTTGGCTTCGCAAGACTCGCTCC TGGCTAACCGTCCAATCTCTCACAATGAACTGTTCCTTCGTCCAACTCGT GCAAATGATGTAACTAGAGGTAAAGCCTTACGTATAATTGACTTTGTTTC 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GGGCCAAAAACTGCCTAAAAATAGGGTTTTTTGGACTTTGTGCAAAATTC TTCATTAGTTTTTTTTTTATTTTTGGCAGAAAGATAGAGTGCAAGGTACC CTAAAATATGGCCGAAAATTTTTTCGGTTTTTGGGGTAATTCCCTTTGAC CATTTTCCTGTTGCTTTCATTATAGTTGCTAATAAATTTTGATGACCATT TTGTTTATTGTTTTTGAGTGCCTAGGGGGCATTCAGAAAGTACTTTTGTC GCCAAAGGAAGGAGGGGGGGTCAAGTTTACATTCAGTGTACTTTCAGTTT TTTGAAGAAGGGGGGTCGAGCTTCGATCATGATTTTTTTCCGTAATGTTA TATGTGAAACAATGCTTTCTATCTTTATTGATAACACTTTAGGGATCTTC TCAAAAATATAATCGATTTTCGATTATCAAGTTCGATTAATGATTCGACT ATTTAATCGAATAGCTGCCGTCGTTTAGTCGAATAGGTTCGACTATTTAA TCTCCTATATTCGATTATTTAATCTCCTTTATTCGATTATTTAATCCTTG TATTCGATTAATTAATCCTTTTTTGCTTATATCTTAGGGATCCTCTCAAA AATACCGAATTTCGGTAAATTGGTTTTCGGTTAAACTCGGCTGTTTGTTT TGGACAATTTTCCCACCCATCGCAAGTGAAGAGGATAAAAAATGCTAAAA AATGATATATAAAAAAGTACAGGTTGTAATCCAATTTTCATCGATATTTT TGCCTTGAAGTTATATCTTTTTTCAACGTCAATTTTAACTTCACGTTTCA ATGGAAGCGCAATTTCGAAAAAGAAATCCCTTTATTTTACAAATCATCGA CACATATCTACTCATTCTCTTTAGCATTTTTTACCTCCAAAATAAATAAA ACTTACTGGTTATCCTTGGGAGTTTTTGATATCCAAAAATGAATCACCAT TGATAAAAACAAAGTTTAGATAAATAAAGGCTCCCATCGAAAACTAAATT TCGAAGGGAGGAAAGTCTGTAGTGAAAACTGAAGCAAACAAAGCATTCCA TTTCCATACATACATACCTCTTACAACCATATCTCAATGTAATAAATGTT ATAACTTTCTGTTTCAAAGTCTTTTCAAAAATACAAAATATGAATAAAAT CACAATATTTTAGGTTTAATTTTTAGAAAATGTTTTCTTCTCAAAACCAA ACTCACAAATGAATTCAATGTTTTGATTGCAACATTTTCGAATCTTTCGA ATGCGTGACGCAATTTGATTGGCAAAAAATAGAACTCACGCGAAAAACAA TGCAACGACTTCATTTTTTAGATGAGAAAAAGTGCAACAACATCAATAAT TCTGCGCGATGATTCGATCTCTTATCTAGCCATTAAAAAAAACCTGGATG TAAAATTCGAATCCATTTTTGCAAACAGAATAATAGAGCATGACGTAACT TGTAAGAAAAAAATGTTGCATTGACCAATCAAAATGCCATGATTGACTTT TGCGAACAGAACAATAGAGCAAAAGATTGTTTTCTTCCTGCTTTTATATG ACGTAATGACGTATTCTTGATCTTGTGAGTGCTCTCCCTTTTATCCTTTT ATCTTTTTTTTGTTTTGCCCTTTTTGATTTGAACATGAACACAGCGATGG AGTGCTATTTTCGAATCGAAAAACAATAACAAAGACATAAGAAGCAACTG TGTTGAGAGGTTGATCACAGAGGAAAGTGTGTGGAAATTAAAAAGATAGA AAAAGAAAGAAGTACTTTATCGTGGAGAGATCGTGGAATTGTTATCCAAA CATTAAGAAACTTAAAGATGATGCGATAATGTGATTCACAAAAGGATTAT TCTATCATTTCATAATTTATGATGCCCCTTGGTAGATCAAAAATCCTTAA AGGTAAGAAGAATTATGCAGTCATTGGTTGATTTGACTACGGCTTTTTGA AAATATTTTTTCTTTTGTCTTTCAAATCCACAGTAGACAAAGGCTTGTTT GCGCTGTTTTCGATCTACGTAAGAAAAAATAACCGATATTCGACTATCTT TTGGAAAAAATTCGATTATATTTTGGAATCAAAAGGATTAATTAATCGAA TCATAAGATCAAATAGTCGAACCGAGGGGACTAAATAATCGAACTGAGGG GACTAAATAATCGAACTGAGGTGACTAAATAATCGAATTTCGATTGTTAA ATAATCGAAGTACTTCGATTCTTTAAGCGAATTTTTCGCTTAAATTCGAT TATTTAAGCGAATTTATTTTTGAGAAGATCCCTTACTACATAAATGACAG AGCAGACTGACCATACATGTTATAATAATTGGAGTTTTTTTATTATAAAA ACCAACCAATTTTCAATAAGAGCATGACAAAAGAAAAGTGTAAAAAATAT TAACTTTGAAGTCACCTTGTCTAATTTTCCAATTAAGGGCAATTAACTCC AAAGTAATTTTATACACTGAAAAAACATTTTAATTTTAATGGGTATAAAA ATCAAAACTTTCACTATTTCGGGGGGGGGGGGTAAGAAATAGGAGACAAT TTAAAACAAACGTACAAAGGGGGTACCTTAAACGAACGCCGACGGAAAAA TAGGTGAAAATGGATGAACATACTATTTGTTTCTTATTTTATATCCATTT CTATTTCCATTCTATATTTATCATAAGGTAGGTCCAATATGCAATGTGCT TGTTCCATTTTCAATTTAGATTACAGATGCCGATTCTGAGCTACTGCACA CGTTGTCTCAAGATGAGAATCTAATTCAGATAATTGAGGAAGTCGGCGAA GTGTGTATTCTAAATGTAAGTTCATTTTGATCTATTGACACCCCTCCATC TTGTAGGCCTAGCCATTATAGCGTGCTATGGCTACGTCGACAGTCCAAAA TCAATTGCATGTGTCAAAAATAGCACGTCCAAACTCTGCTAAAATTTACT AGAATTTGCCGAAGTATTGGTTTGCGTATTATAGCACACACAAGGTTTGA CTCATGGGCAGGCCTAATATTGGATTTTTTTAGCGTTTGGTTTATTAGCA ATAGATTTTGCTTGTTGGCTGAACAACCAGAAGATTCATGATTTTGATTC TGATTTTGATGTCATTTTTTTGTTTTTAGGAAACAACTAAATTCATAATA ATCCAATCCATGATGATCCATGATATCATTGTAAAGAGGAAGGCATCCTT AGACCAATTGAGATGTGGTCTCCAAATCCTTGGAGTGTTACGCGCTATCA CTAACAATCCTGATTCGATGGCAAAGTTTTTCATTCAAAGCACAAATGAA ATTTCTCCAGAAGCTCTTGTCTCAAAACTTGAATTTGCGGCAAATGAATT GGCAACAGAATCCAACAAAGAAAAGTTAAGATTTGCTCTATCTACTTTTA CCAATGAAGATATAAACAAACTTTTGCTATTTGTCACAGGAACATCAAAT ATCTTTTCTCTGTACCCTTCTCAAAAAATTAAAGTGAGATTTTTACAAGT AGATGAAATTTGTGCATCAACTTGTGACTTTTCCCTCGTTATACCTGATG GAATGGAGGACGTTGACATGATGAAATCAGCACTAATTGTTGCAATGGAG GAAGATAAAAAAAAGAGCTTCAATACATATTAGTTTTACTTGTTCGGCTC TTTCAACATGCATGCCTTTTGATCTTTTGATTTGAACACTATTTGATGTC TTTTTGTTTTGTATATATTTTGAAAGTTATAGAGAGCCAACTTGTACTCC AGGAACGTTAAAATATTTTGCTCAGTAATGTTGACAGTGCCGTTAATATG CAGCTTTTGCAGTTCATTTCTCTCAGCCAATTTTTCAAAACTTATAGTGA TAAGAACAACATTAGGAATTAGAAGTTCTCGTAGGTTTTTCAGTTTCAAT ATGCACAAGACAACGTCTTCATTCATCTCTTGATAATATAGTCTTAAATT CAAATTTCTAACGTTTTTAAATTTGCTCACGATTGCAATGATGTTTTCAT TGAAAAAGTGGTAATAAAAACGTTCGCATTGTATTATAATTGTTTCAACT CTAGATGATTTACATGAATCCAGCACCCTCGTTAAATTTTGTATTGTTGC GTCCTCATTTTCATTGTCCTTCTTCCTATTTTCTTGAAACGTCAATGCTC TGGTATGTTTCAAATTATCAAGCTTTGAAGAAACTTCATCTTCTTTAATT GGTAAATGCACAAATATTGTGTGCCAAAGATGCGGTGTCACTAATTCCTT GAGAAACTTATTACAGCAAGCTATAGTTTTTAAAGTTTCAACTTTACAGT AATCAAAAACCAGCTTTATGATTTCCTCATATTTAGGTACTCCAACAGAA TTAGTTTCAGAGATTTGTTATATAACACTTATTGCAGTATTACTCTAATG GAATCTTCTAACAGAATCTCTTCAGATCTCTTACAATGTTTGAAATTGCA TAATAAGCAAGCGGAAGCTCTTTTGATTTTGTTTTATTTTTTAGGTTTTG CTGTTCCTTTTCAAGTAATTCTTTTGATATTGGCTCTGCAGTGCTTTTTC ACAATAGCATTATAGCTTCTATGAAACTCTAAAAACGAAAACACTTTATT TTTTTGATGACATTTTACATGGTGATATTTAGCTTTATACCTCACCATAG CACATCATTATATATTTTATTTTAGATTATATATTTTATATGTTGATATT TATTTTTATACCTAACCACTCAGTGCTTTTTCGCAATAGCATTATAGCTT TTATGAAAATTCTAAAAAGGTTTATTTTTTATTTTTTTTGATGACATATA TTTTACATGCTGGTATTTACCTCTATACCTCACCATAGTGTCATTATATA TTTTATTTTAGATTATATATGATTATGTTGATATTTATCTTTATATCTAA CCATATAGTGGTTAGGTTAGTGGTTGGCTTTATGGTGTGTTCATTCAAAT TTAGTATTTAAAAAAAGCCAGTGCGAAAAATCTTGCCTTCATAAGCAGAA TTACAGGTGGCTGACTCTTAATTAAATTTCCTCTGAACGTACTTGTATGA TTGACTTTTTTCTTTTGATTGTACATTAAACATATTTTTGTCCATACCTA AAACAAATTTCACAGCACATTCATTAGCAGTAATTAGGGTTAGTATTTAT CTATGTCTTTTTCTTTTTGAAACAAAATTAACTACTGGCTAGTTTATTTT CTGTGTTCAAAAGAGATTTTCTTCTGTTATATTTGATGTCCCATGTTCAT TTGTTTGTCTCCTAACCAAGTTGAATATGTGCAGGGTAGTTTCGGTGTAC CAAACAAGGATTGTTTTCGTCCAAAAAAATATTGAGTAACATGGGAAAAA TGTGACTTTTTACACCCCAGAATGCAGTTCTTCGTTCTGTTACTCAAAAT TTCTTCTTTATCATTCGAAAGTGTCCCCTGAGCTTAGGGGGGGGGGGGCT AAACCATTTTTGCTTGATTGGGGGCTGCATTTTTCAAAAAATACTGGGGC TAGCTTGCTAGAGGGGGGCTGAGTGTTGAGTAATGGAACTGGGGGCAGAG CTTATAGGTTACAAATATTTTAAATTATGTTAAAAATCTATGCTGTGGGG AAGGTTTTGACCCCTCTTTGAAAAAATTTTTTGCCTGTGGTACAATAAAT TTAGTAAAAGTTTTCAAACAATTATTCCTTGATACTTTGCTTAATGAAGG TGGGGGCTACGTTTTTAAATTAATTTAGTTGGGGGCTATTTTCCTTAGCT ATTTTCCTATTTTCCCCTGAAAAATGCTGGGGGCTGGACCCCTCTGCACA CTATGTGTCCAAACTGAAGAATACGCGAATATTCTGACAGTTTTATTAGC CTAAAAAAAGCAAAATATTGTTGCTAGGGAAAATCTGGTTATTCCCATCA TTTAGAATAATTGACATCATTTACATTTTCATTAAATCAACCATCAGTCT AAAATTGATTGCCTTTATGAATTACAAAAACTGTGAAAATTTCAGAGCAC TACCTATTTCCAATCAAAAGTTTTTTTAGCGAACATTCGATTTAGCGCAA GAAATCACTTAAAATCACAATGCACCTCAGAATGCAGGTGAAAATTGACG TTATTCAACACTTTATATCTCATGGTACAAAGAAGCTACAGATCTAAAAT TTTGACCTATTATTCTTCTCATGTGTATCTTCAAATTCCACCCTGGCTTT TTTGACTTATTTTCTAACACTGTGGCGATAGAATCATTTAAATTCAAAAA TGGCATAATGTTTTTGAAGATAATTTTGCAATAAAGCTAATAAAAGTCAA CCCTTGAGTTAAAAAGTTCAGAAACTTGTCTGATTTGGTGGTAGAATTAA CATACAATGTATTAAAGAAAGATTTGTTCCTCTTGTGAGTTTGGGTCAAA AAGTACAAAAGAAAAACTAACGACCAGCATTCTGGGGAGCAGAACCTGTA GTTGAATTATTAAATCAGTTTCAATGCTAAAAATTATAAAGATTTATAAA GACTTGCTTGTATAATTCATTTATGTTTTTAATGATAAAATTTACATGCC AAAATTTTGAAGATACCCAAAAATTGGCTCTGAAAAAAATCCAGTCATTT ATGGAAGGGTGCATTGTAATTATATTAGTTTTACATTCATGAAATTAACC CCCTGAACATTGCAATTTTTGAATCAAGGGCTATTTTTGAGGTAAAATCA ACTTCAAGAATATTTAAACCTGGCTAAACAGCAAATTTAAATCTAAAATT TAAAACACTTTTATTTTTTTTTACAGAAGTGTGTTAAAAATGGCAGAAAC ATGGGAACAGTTTTTTGATGATATAATACAGCTACTTGACACTGCTAATC AAGCTAGCACAAGAAATGAAACTGAAATTGTTATTTCTCGGCTTGAAGGT GTAGCATTTGCTCTTGCTCAGATATTGCCAGGTCCAGGGAATTATGCACC ATTCATTTCAGAAATTTTGAATAATATTAATGAATTGATTAACCTGTTTT CGTCTTCGCTGGCAACTATGGGGACTAGGCCAAGTTCACTGGCAACATTA TTTCATGAAACTCCAAGAGTAAATGATAATAGACCTGGCAGACCTAAATT TGTCATTCCTAGAGACATTTTAATTAACTTGAGGGAGATGGGTAATTCCT GGACCAAAATAGCAGAAATGTTCATGGTATCAAAGTCAACTATTTTGAGA CGTGTTCAAGAATATTGCTTAGAAAACTTTGGAAGGTTTTCAGATATTTC AGATATGGAGCTGAATCAAGTTGTACGTTCCTTTTTCCAACAACATGGCT GTTTTGTTGGTTTTTCACTGGTGTATGGATTTTTAGAAGCAAACGGAATT CATGTTCAGCAAAAACGTGTTAAAGAAAGTATTAGGTTCGTTGATCCAGA AGGTACAAGTATTAGATGGGCTATAGTTGTGTCACGAAGAAGCTATAATG TCCGCGCTCCAAATAGCCTGTGGCATATTGATGGACACCATAGTTTGGTG TCCTGGAAATTTGTTATCCACGGGGCCATTGATGGCTATTCCAGAATGAT TACCTATCTTAAGTGTTCTACAAATAATAAGTCTGAAACAGTACTGCAAA ACTTTGAACATGCAACGGAAAACTTCGGTGTGCCTTCTAGGGTTAGAAGT GACTATGGAGGTGAAAATGTTTTAGTATGGCAAAGAATGGAACAGTTACG TGGTTTAAACAGAGGTAGTGCCTTGAAAGGTACCTCTCAGCAAAACCAGC GCATCGAGAGGCTATGGCGTGATGTTTTTAGGTGTGTTTGTTGTACGTTT TATTACTTGTTTCAAAACATGGAGAGTGATGGGTTGCTTGACAGAATAAT GAGGTTCACCTTTTCATCTTACATTATGTATTCCTCCCTCGAATCAATCA TTCATTAATTTCGTTTACAATGTCCTGGAATATGCATCCTGTAAGAACAG AACATAACTGGAGTCCAATGAGAATGTGGGACAATGGAATGATTGATTTA CGTAACCGTGACTTGAATACAGTTCAAAGTCTTGCATATGACGAAGATGA TGAAAGGATTGCACTTGATGATTTAGAATGGTATGGCTATGATGCAAACG TAAATGATGTCAATCAACCTCAGTTAAGTCAAGTTGAGGTTGATGACATT GATGAGCCACAAGATGGTTTGCTAGCACGTTTAATTGATAATATTGATCC CTTACAACAGTCAGATAGTATGGGTATTGATATTTTTATTCAGGCACTAA ACTTAAACAATATTTAGAGGTTGCTTGACTTTAATTAATCTTAGTCTATT TTTTCCTCGAATTTTAAGATTAGATTGTAAAATATTTTAGGAAAATGAAA GATTGTCACGTTTTGATGAATTATTGGAGGTTTATTTCAAAATAAAAAGT TATGTTTTCTAAAACTTTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000129_pilon:809099..834617-

>MSTRG.15017.1.p2 ID=MSTRG.15017.1.p2|Name=MSTRG.15017.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=348bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000129_pilon:809099..834617- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCTGGAATATGCATCCTGTAAGAACAGAACATAACTGGAGTCCAAT
GAGAATGTGGGACAATGGAATGATTGATTTACGTAACCGTGACTTGAATA
CAGTTCAAAGTCTTGCATATGACGAAGATGATGAAAGGATTGCACTTGAT
GATTTAGAATGGTATGGCTATGATGCAAACGTAAATGATGTCAATCAACC
TCAGTTAAGTCAAGTTGAGGTTGATGACATTGATGAGCCACAAGATGGTT
TGCTAGCACGTTTAATTGATAATATTGATCCCTTACAACAGTCAGATAGT
ATGGGTATTGATATTTTTATTCAGGCACTAAACTTAAACAATATTTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15017MSTRG.15017Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15017.1.p2MSTRG.15017.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15017.1.p2.exon3MSTRG.15017.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15017.1.p2.exon2MSTRG.15017.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15017.1.p2.exon1MSTRG.15017.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000129_pilongenomesc0000129_pilon:809099..834617 -