MSTRG.15008.3.p3 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.15008.3.p3
Unique Name	MSTRG.15008.3.p3
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000129_pilon:672356..754193+
coding sequence from alignment at sc0000129_pilon:672356..754193+

mRNA from alignment at sc0000129_pilon:672356..754193+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.15008.3.p3 ID=MSTRG.15008.3.p3|Name=MSTRG.15008.3.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=81838bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000129_pilon:672356..754193+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTATTCAGGCTGGTATATATCCGGAATGTTTGAAGAGGGCATCGATTAAA
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CTACCTCAGCAATAGATCTCATTGTACACAGATTAACAACACATTCTCAA
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CTCTTTTTTATCATTTACATCAATGACTTAAACAAAGCAGTCATGAGCAG
TTCCACAATCCATTTTGCTGATTTTTCTGATCTGCAGTGAAAAGTCCCTC
AAAAAGctcaacaaaatggtcaatagAGATCTATCTCTTCTGGTACACTG
GCTCAGAGCCAATAAAATATGTCTAAACACTTCAAAAACAGAAATCTTgc
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CATTGACGAACACCTAGCCTGGGATGACCATTTTCAGAGTCTAACCACTA
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CTACTGCTTACAACCACTTGGCCACATCAAGGTAGGTATCCTAGACAAGA
TCGAAAAGCTTCAGAACAAGGTCATTAGAATAATACATTTCAAAGGACCC
AGAGATAACGTCAAACCGCTTTATGTTAATTGCAGGATTCTTCCAATTCC
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GTAATCTACCCAAATACTTTAAAGACTTTCTATCACCTTTAGGTCATAAT
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ATTGGAACAATATTCACCCTCATATACCTCCATTCCATCAAGTATCAAAA
TCTACCTTCAAAAAACATCTTCATGCTTATATTCTCACTGAGTTTTCCAC
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TTGTGACACCGTCGACAAGAAACAACTAATGTCGTTTTGCTTGCATGTTG
GATGTCAATCCAAGGTAAAAGGGTCAATTAGTCGGGCGATCTTATTACAA
TTtctcccgggggagggggtactacccttgtcgaccgacggttctaaaaa
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TCACAGGTTTCCGAATTCGAGTCAGTGGATGAGCACATCACAAGAAATGC
TTTACTTCATGCCAAAATGTTTTCCGAACATTACAAAGCAAACGAAACTA
AGCACCAGCAAGAAAAAACTGATATGGTTAACCAGATCAAAGGATTACAA
CTCGAGTTGCattcaacgaaagaaaaatttacaCAAACTACTCGACAAAT
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TATCCTCGAACCTCAGGAGTCGTTAAATCGTAGGCTACTTTCTTTTATTC
ACAAGAAAGATGAACGAAATACTTAGCCAAAGGATAGTTAGCCAAAGGTA
TCTACGAACGGCCTACGGGTCCTTACACTGTCTTAGGAAAGCCTACGGGt
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TTACGTCATCAGCTCCACGAAAACACGACATTCGACGGACATATGATTTG
GAAGATCGACAATTTTGAAACGCGATACCAGCAAGCGGTAATTGGAAAAA
CAACAGCTTTACACAGTGCACCTTCATTCACCTCTCGATATGGGTACAAA
TTCTGCGCACGACTCTACCTGAACGGTGACGGAATGGGTAAAGGCACCCA
TGTGTCGCTTTTCTTTGTCCTAATGAAATCTGAGTTCGATACTCTGTTAG
AATGGCCTTTTAACAAGAAAGTTACTTTCACTTTAATCAATCAGGAAAAC
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TTGTTTCGCAGGAAAAACTGAAGAAGCCAAACTCGGGTTTTATCAAGGAT
GGATGCttttttttAGAGATAAAGCTCAAGTAAATGCTGGTAAACTTAAC
CCAGAATCACGAAATGTAGTTTGTAAAATAACGCCAGTTCACTCTGAAAG
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TATCAGCAAAAGACAATCAGAACCTGCCATTGCCACATATGTTCCTGCAG
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000129_pilon:672356..754193+

>MSTRG.15008.3.p3 ID=MSTRG.15008.3.p3|Name=MSTRG.15008.3.p3|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=339bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000129_pilon:672356..754193+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGAATTTTGGGCAAGAAAAGGAGTTATGAAGTTTACGAATTTTGCAA
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GGATAATTCTGGcgtttaaagcttttttttgtTTCCATTGCCATTATTCT
CTTAAGTCACAACTTACGGTCTCCCAAATCCTTTGGTGA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.15008	MSTRG.15008	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.15008.3.p3	MSTRG.15008.3.p3-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.15008.3.p3.exon1	MSTRG.15008.3.p3.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15008.3.p3.exon2	MSTRG.15008.3.p3.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15008.3.p3.exon3	MSTRG.15008.3.p3.exon3	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15008.3.p3.exon4	MSTRG.15008.3.p3.exon4	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15008.3.p3.exon5	MSTRG.15008.3.p3.exon5	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15008.3.p3.exon6	MSTRG.15008.3.p3.exon6	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.15008.3.p3.exon7	MSTRG.15008.3.p3.exon7	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000129_pilon	genome	sc0000129_pilon:672356..754193 +

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MSTRG.15008.3.p3 (mRNA) -