MSTRG.15003.8.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.15003.8.p1
Unique NameMSTRG.15003.8.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000129_pilon:529716..549260-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.15003.8.p1 ID=MSTRG.15003.8.p1|Name=MSTRG.15003.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=19545bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000129_pilon:529716..549260- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TAACCTATGAGGGAATACTATTGTTTCCTTAAAGGGATTATCAGGCTATT TGATGGACTGGTAATTTGTAATTTTGGAATTGAAATAAATTCTTTTTGAA ACTTGAAATGCTAAAAAGTAATTCGTTAAGTTTCCTTTTAAAAAACTTTT TTTTTATTTCAGAAGAGAAAATTGGACGGAAACGCAAAATTCAAAAAGTT GCCAGGTCCAAGAAAGAACCAAAGAAAGTGAAAGTAAAAGTAAAAGACAC CAAGAAGGTTGGAGAAGGAGACGAAAAAGAAAACGAAAACAAACCTGATG GTACTGGCGATTTTGACGACTTGGTCGATAAAAATGTCGATCACTTAACA CCCCCTGATACTGATATCACATCCATGGAAGGTGAGGACGAGAAATTCGC TTATCCCGAAGACAAGGGTCCATGTACGTGTAATATTTGTGGAAAAGTCA TCTCTAATAAATATGGTTTGCGTGAGCATCAAAGTGTTGTCCATTTCAAA AATGGGAAATTTCAATGCGAAATCTGTGGTAAACGTGTCACCAATAAACG CGCTTTGACCCTTCACATGACGTCACATTCCACCGAACGGAAATTTGTTT GTGAGCTGTGCGGAAGCAGCCATAAAACGAAAGGAAACTTGAATTACCAC ATCAAGACTATGCATACAATGATCAAAAACTTTCGTTGCGATATTTGCTT CAAAACATTCAAAGTGCAAGCTGAGTTGAAAGAACATTGTTTTACAGTGC ATTCAAACGAAGGTGTTATCACTTGTATTGTGTGCAAAAAGAAATTGACC ACAGCTCTGTCTATTTACACCCACAGTGTGATGCACTCGGGTGCACGCGA ACACGAATGTACTGAATGTGGGTACGCGTTCAAGACGGCGACCGGCTTAA AAGAACACATGGTCACTCACTCAGAAGAGAAACCAGTTCGACAATGTCCT CATTGTGACCGAAAGTTCTATTCACGTTCTCAGTACAATGCTCACGTGAT GAGACACACCGCAGACGGGGGTTTGATCACCTACAAATGCCCAGAATGTG ACGTCAAATTTCAACACAAATCAAGTTACAATCGCCACGTGATTCGTCAC CAACCTGGTGGGGATTTAGAATTCCCGAAGAAGAATCCTTATCTGCTTTT GGACGAATCAGAACTACCAGAAGGCGTTTGCCACAAATGTCGAAAACATT ACAGCTCCAAGTCAGGCTTCTATCTTCACTTGAAGAAATGTAGGGATGGT ATCGTACAGCAATTCCAATGTCCATTCTGCGAGCGTGGTTGCTCAAACCG TTCTAGCTTGAAACGTCATATCCAACGTCGTCACAAAGGAATGGAATTTG AAGGGCAGACAGTGCGTGGCCGTGAGCTTCAAACAGATGATGTGGACGAT ACAGGAGGTACACAACAGGCACAGGCTGTACTCACACAAGATGGTATTCA ATACCAACAATATTTCGACCATGGTTATGGTAACCAAATTACCACAGTTG ATGCGTCGCAACTCACCGCAGTGGATGTTCAACTGCTCATCGATACAGCA ACGGCACAAGGAGATGGCCAGGCTGCTCAAATATTGAGCAATGTGAACCA AGTTGCTCAGCTAACACAAAACGGTGATAACACGCAAAGCCTTCATATCG TCAGTGAGAATGAAGTAGCTCAGTTAGCGGCTCACTTGTCTCAACACGGT GTTATTGTGCGTAGTTCGAACAATGTACCTTCCAACGAAGCAACAGTACA AGGACATCATCTCATCGTCAGTTCCACACAACTGGACGCGCGCACCGGCC AATTATTAATGAACGAAAATCAAGCCACACAAATCATCACTGATGCAGAA GCTCTTCAAAACCGTGCGCAACTCGATAGCAGCGAAGCGGCCGCTCTTGG TATCCAAACGACGGATCAAAACAATTTATTGCGATCAGAAAACGTTTTGC ATTTCAACAACCGTACAGCGGTCATCCAAATCCAACACAATTCAGATGAA GTTATCACTAGCCAACAAGTTCTAACACTTCCTGAACAGCAAGTCAACCA GCTGACCACGCAAGCCATCCAATCAATGAAAGACCTTCAACCGACAGCCA CTATCACTGAAATCACAGACCAAGATACTACACAACAGTCTTTCATTCAA GAAGAGCAGATTGTATCGAACATTACAGAAACGGATGTAGATGTAGGACA AGCTTATCAAGATATTAATCTTTAGATTCCTTATTGTGTACACAAATAAT TTCATTTTGATACAGGTGGAACATTCTTAGTTTGCAGAAGGTTTCTGTCC AATCAGAATTTTGCACTTAGCAGATTCGTTAATTTTTTTTCAGAAATTAT CGTGCTTGCTTGCCTTTTCGAAGGAAGAGAAAGATGTTCGATCTGACGTA CACGTTGATTTTTATTAGACCCTCCTAATTTGGGCTGTGCGTGGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000129_pilon:529716..549260-

>MSTRG.15003.8.p1 ID=MSTRG.15003.8.p1|Name=MSTRG.15003.8.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1851bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000129_pilon:529716..549260- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGGTGAGGACGAGAAATTCGCTTATCCCGAAGACAAGGGTCCATG
TACGTGTAATATTTGTGGAAAAGTCATCTCTAATAAATATGGTTTGCGTG
AGCATCAAAGTGTTGTCCATTTCAAAAATGGGAAATTTCAATGCGAAATC
TGTGGTAAACGTGTCACCAATAAACGCGCTTTGACCCTTCACATGACGTC
ACATTCCACCGAACGGAAATTTGTTTGTGAGCTGTGCGGAAGCAGCCATA
AAACGAAAGGAAACTTGAATTACCACATCAAGACTATGCATACAATGATC
AAAAACTTTCGTTGCGATATTTGCTTCAAAACATTCAAAGTGCAAGCTGA
GTTGAAAGAACATTGTTTTACAGTGCATTCAAACGAAGGTGTTATCACTT
GTATTGTGTGCAAAAAGAAATTGACCACAGCTCTGTCTATTTACACCCAC
AGTGTGATGCACTCGGGTGCACGCGAACACGAATGTACTGAATGTGGGTA
CGCGTTCAAGACGGCGACCGGCTTAAAAGAACACATGGTCACTCACTCAG
AAGAGAAACCAGTTCGACAATGTCCTCATTGTGACCGAAAGTTCTATTCA
CGTTCTCAGTACAATGCTCACGTGATGAGACACACCGCAGACGGGGGTTT
GATCACCTACAAATGCCCAGAATGTGACGTCAAATTTCAACACAAATCAA
GTTACAATCGCCACGTGATTCGTCACCAACCTGGTGGGGATTTAGAATTC
CCGAAGAAGAATCCTTATCTGCTTTTGGACGAATCAGAACTACCAGAAGG
CGTTTGCCACAAATGTCGAAAACATTACAGCTCCAAGTCAGGCTTCTATC
TTCACTTGAAGAAATGTAGGGATGGTATCGTACAGCAATTCCAATGTCCA
TTCTGCGAGCGTGGTTGCTCAAACCGTTCTAGCTTGAAACGTCATATCCA
ACGTCGTCACAAAGGAATGGAATTTGAAGGGCAGACAGTGCGTGGCCGTG
AGCTTCAAACAGATGATGTGGACGATACAGGAGGTACACAACAGGCACAG
GCTGTACTCACACAAGATGGTATTCAATACCAACAATATTTCGACCATGG
TTATGGTAACCAAATTACCACAGTTGATGCGTCGCAACTCACCGCAGTGG
ATGTTCAACTGCTCATCGATACAGCAACGGCACAAGGAGATGGCCAGGCT
GCTCAAATATTGAGCAATGTGAACCAAGTTGCTCAGCTAACACAAAACGG
TGATAACACGCAAAGCCTTCATATCGTCAGTGAGAATGAAGTAGCTCAGT
TAGCGGCTCACTTGTCTCAACACGGTGTTATTGTGCGTAGTTCGAACAAT
GTACCTTCCAACGAAGCAACAGTACAAGGACATCATCTCATCGTCAGTTC
CACACAACTGGACGCGCGCACCGGCCAATTATTAATGAACGAAAATCAAG
CCACACAAATCATCACTGATGCAGAAGCTCTTCAAAACCGTGCGCAACTC
GATAGCAGCGAAGCGGCCGCTCTTGGTATCCAAACGACGGATCAAAACAA
TTTATTGCGATCAGAAAACGTTTTGCATTTCAACAACCGTACAGCGGTCA
TCCAAATCCAACACAATTCAGATGAAGTTATCACTAGCCAACAAGTTCTA
ACACTTCCTGAACAGCAAGTCAACCAGCTGACCACGCAAGCCATCCAATC
AATGAAAGACCTTCAACCGACAGCCACTATCACTGAAATCACAGACCAAG
ATACTACACAACAGTCTTTCATTCAAGAAGAGCAGATTGTATCGAACATT
ACAGAAACGGATGTAGATGTAGGACAAGCTTATCAAGATATTAATCTTTA
G
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15003MSTRG.15003Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15003.8.p1MSTRG.15003.8.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.15003.8.p1.exon4MSTRG.15003.8.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15003.8.p1.exon3MSTRG.15003.8.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15003.8.p1.exon2MSTRG.15003.8.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.15003.8.p1.exon1MSTRG.15003.8.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000129_pilongenomesc0000129_pilon:529716..549260 -