MSTRG.1496.2.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1496.2.p1
Unique NameMSTRG.1496.2.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:911622..930364+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1496.2.p1 ID=MSTRG.1496.2.p1|Name=MSTRG.1496.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18743bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:911622..930364+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCCATATTGAGGCCTGAGCCCTAATcaactcggttgcttataaaaaaaat gtgtaatcgaCCCTGACAAAATGTTGACGATTTttgcacccattttgcct aagccACCTCCAGGAGTAGTTTATCGTTATCTTGTGATCACATATCCTTT TTGCTACTCTCTCTTGATCCAGCTTATCCTTTGATCTATCTTATCCTTta gggctgaccttccagcgcagctggtttattttataTCGATTCGACTCGGT TCCCAACCCATCCATAACGTCATAAAACGAATGAATGTTATTGATTATCT TTGCTGATATTCCCAACCCATTGACTCTATACCATTACCAATACTTGTTT ACGTTTTGAATTCTTAGTTTTGAtggtttcaatttcttttagGTTTCATG AAATTCCTAAATCACATCGGTTCGTTCAAAGATGTTTACGTTGTCAGTGG ATCACAGGCGTTAGATTGGATCCGCAGCCCTGTATCGAGCGAGAAAAAGA TTGCCGATCGTCTAAAGTCTTGGTcgtgttaaaaaaattcccatgtttta tGTTTTAATGTGACAACATTCACAGCTGAATGGCAGAGAGGGGTCTTTTG ATTCCAAACTCAGATCTTGTAGATAGTTTATATTATAGAAATTATTTATt ccaaaagaaatatttacccAATATAAAACATTGCTCTTGCTTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:911622..930364+

>MSTRG.1496.2.p1 ID=MSTRG.1496.2.p1|Name=MSTRG.1496.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3384bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:911622..930364+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTCTCATCTCATTCGATGGGCCTGTCAATCAAGCAAATCATGAATT
TTTCACTGAAACTTTTGATGCTCGGTTGAATCCAAATCGATGTCCAGTAA
AAGTGTCCTTCTTCGTATCGGATCATGGAAATGATTATAAATTGACTCAG
AAGCTTCATCGGAAAGGTCATGAAATCGCTGTCCGATCGTTAGCACCTGA
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TTCATCGGAAAGGTCATGAAATCGCTGTCCGATCGTTAGCACCTGACCAA
ACACACGGATACTGGAAAAACATCAGCTATCTTGATCTCGTCAAAGATGT
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GTTATCGAGCACCTTTCCACCAATCAGCTGGTGACACAACTTTCGCGGCT
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GGAGAAACAATGGTGGCCGTTCACGATGGATTCTGGGATACATTCGTTTG
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GGATCACAGGCGTTAGATTGGATCCGCAGCCCTGTATCGAGCGAGAAAAA
GATTGCCGATCGTCTAAAGTCTTGGTcgtgttaa
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1496MSTRG.1496Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1496.2.p1.exon1MSTRG.1496.2.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1496.2.p1.exon2MSTRG.1496.2.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1496.2.p1.exon3MSTRG.1496.2.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1496.2.p1.exon4MSTRG.1496.2.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1496.2.p1.exon5MSTRG.1496.2.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1496.2.p1.exon6MSTRG.1496.2.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1496.2.p1.exon7MSTRG.1496.2.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1496.2.p1.exon8MSTRG.1496.2.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1496.2.p1MSTRG.1496.2.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:911622..930364 +