MSTRG.14953.1.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14953.1.p2
Unique NameMSTRG.14953.1.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000128_pilon:529055..545484+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14953.1.p2 ID=MSTRG.14953.1.p2|Name=MSTRG.14953.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=16430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:529055..545484+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aaatgatgTTATAAACTTTTTCTAAAGGGGCTCAatgaatagaaaataaa
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AACATGGAATGCACTACCGCGATTTGTCATCGAGTCGACCTCAATCAAAT
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TTGACATATTAATATTGTAATTAGAAATCGGTTCGTAGAGGTCCACCTCG
GGCCTGTGAGCTTGTATACatcataataaaaataataataataataaaga
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AGGAttctttctattcatgatatgcatcattgcaaTAACTtccacagacc
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CAAGCTCAAAAGTTTGAATGATTTAAGGTATTTGGAAGGtgaagaagaaa
ttttcaaatgggGTCGTCCAAATCAATAtggtttttttagttttcgtACA
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TTTGTAGTAATTTTTCAAACGGAAACTCTTTTCTGAAAGTCTTTTTCGAG
TATTCAAAGCTCAATTAGCAGCCTAATATCCATATTTCTTGAGCGTTCTG
GGACTGAGCAAAATGTGACTTTGTTGGTTGCTCCTAAACGAGAATTGACT
GAAATGCATGtagttttttgataaataccaacttccgttttttaaccatc
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GGGTAGTTAAGTGTGTCAGTAGTGTGTAGTAATACAGCATCTATTATCAC
GTCACATCAGTTTGAGACCTACCTTTTTACCTCACCAAAATAGCTaccca
acctcgttcccgtgtatcccaggctttatttacgttactgatggacgcca
gagaatattaccTAGCGCTATCCAGTATAAGCATAAAAAGCCGATAATAC
GCAGGGGGACGAGGTTGATAGCTACCTACTGAATTGCCTACTTATTTAAG
TGAGTAAAATTATTTccattctttcaaaaatattcgtTATTGTTTAACAC
TTGGGttcactgaaatattgcttACTGTTTACTCATGTAGTATTTTTTAT
GCTTTCGCTTTCGAAATAGAGATGTGACACACGGACACCCTCTGGgacaa
aataaccaaaattaacacagaatatttttgatgacgtattTTTTAAGAAA
GTCATCACAAGGGTGCATTTGATTTCATAAATATAATGATTTTGCTTTAA
TTCTCATATTGAATTTGTTTTGGTTTAGTTCTACAGTTTCGTTGGgtctt
ttgatttaaaaaatacttttgtagaaattttgtaaattttatatcaaaaa
ttttatacaaaatatacatattagtcatttttatatagaaagtatttAGC
CAAttaatcaatttgaaaaaaatatttttg

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000128_pilon:529055..545484+

>MSTRG.14953.1.p2 ID=MSTRG.14953.1.p2|Name=MSTRG.14953.1.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=630bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128_pilon:529055..545484+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgcaGTGTAAAGCAATCCTTCAGAATGTCAACAAAAGTTTTTCGAAACT
AAATATTTTGAGAAGATCTCTTGCATCATCGTCAACCCATGGTGTGTATC
ATGATTATTTCAAAACAAGCATTGAGAGTCCAGAGGAATTTTGGGATGAA
CGTGCACAGAATGTCAATTGGTTTGAAAAATACACTCAGGTTTTGGATCA
CACAAACCCACCTTTCACAAAATGGTTTATTAATGGCAAGATGAATACAT
GTTATGAAATGATTGACCGTCATGTTGATGAAGGACATGGAGATCAAGTT
GGGTTGAATTTATGAatgcaGTGTAAAGCAATCCTTCAGAATGTCAACAA
AAGTTTTTCGAAACTAAATATTTTGAGAAGATCTCTTGCATCATCGTCAA
CCCATGGTGTGTATCATGATTATTTCAAAACAAGCATTGAGAGTCCAGAG
GAATTTTGGGATGAACGTGCACAGAATGTCAATTGGTTTGAAAAATACAC
TCAGGTTTTGGATCACACAAACCCACCTTTCACAAAATGGTTTATTAATG
GCAAGATGAATACATGTTATGAAATGATTGACCGTCATGTTGATGAAGGA
CATGGAGATCAAGTTGGGTTGAATTTATGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14953MSTRG.14953Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14953.1.p2MSTRG.14953.1.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14953.1.p2.exon1MSTRG.14953.1.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon2MSTRG.14953.1.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon3MSTRG.14953.1.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon4MSTRG.14953.1.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon5MSTRG.14953.1.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon6MSTRG.14953.1.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon7MSTRG.14953.1.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon8MSTRG.14953.1.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon9MSTRG.14953.1.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon10MSTRG.14953.1.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon11MSTRG.14953.1.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon12MSTRG.14953.1.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon13MSTRG.14953.1.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon14MSTRG.14953.1.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon15MSTRG.14953.1.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon16MSTRG.14953.1.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon17MSTRG.14953.1.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon18MSTRG.14953.1.p2.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14953.1.p2.exon19MSTRG.14953.1.p2.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000128_pilongenomesc0000128_pilon:529055..545484 +