MSTRG.1490.4.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1490.4.p1
Unique NameMSTRG.1490.4.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:795311..812313-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1490.4.p1 ID=MSTRG.1490.4.p1|Name=MSTRG.1490.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17003bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:795311..812313- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTAAACTTCTTAAAATATGTTACATACTGCATGCGAAGATCAGGTTATAT TCCGTTATGGTACTAACAATTTAATCGAATACACAGGAATTTCCCAGGAA GATAATTCAATATAGGACTAGAAGTTTCTCAAAATTCATCATTTTGTCCT AATTTTTATTCAAATGTTGATTCGCGAAATGACTTACGGATTTATCCAAA ATTGAAACAGAATCAACCAGTCAAACTGAACGTTTACCAGTTAAACTACC TTATCGGCCCTTTTTACGCCGGTCCTAATTTAACGCCGACCTCCTTTACG TCGGCCCTTATTCCGCCACAGCCTAATAGTGTATTGCCGATAATAATGTA TTGTTTTTTTCAATTAAGTAACGCATGATTGTGAAACCTATATAGTTCGT TAGAAAATGATCAATATTGATTTTTCTCTCCACGAACAATCTACTAATAA GATGTTCAGCCTTCGCTATTAAGCAAAAATAGCCATTATTGTAAAAGTGA GAAAATTTTGATACTGTATTGGTCCTTCCTGTCAAGGTTTTAGTATTCTT CATAATATCTAAATCGAGATTCCACACGAGAAGTGCTGGAGACATTCAAG GAAATGGTGGCATTTTATTACCCCCCCCCGCCCCTAAGCTAGCTAGCGTT AAAAGAATCTTAAAGAAATATGTATTGCTTTAAGAATCTTCTGAAAATTT GAAAATGAAGATGAAAAAATGATTTTTTGAGTGATTAAATATCTTGATTT TTGCTTTTCTAAAACTCTAAATATCGCTGATTTCTAAAGTGTTCTTTTGA GGGGGCCCTTTTGATTTTTCACATCTTTTTCAGATCAAAAGTTATAGCCC TAAAAAAATTGTGTGATAAAGAGTTTAAAAGGGTCGAAATAGACCCATTT TTGATCCAAAAGGGTTAATATGAAAAATCGGAATGTTTGAAATCAGTGAG GTTTGGAATTTCAGAAAAGTGTACAATGAAATGTTTTGCTCAAGTAGGAA AATCTTCTTTTCTTCAATCTCTTCATTTCATTTTCAGATTTTCAGAAGTT TCTCCAACACTTACATCAATCCGCTTGAAATTATATTTCCAACGATGTAT AACTTTTCTTCTTTTCGTCAGGAAAAAATGTTTGAAATGGTACGAACTGA CATTTTGTGGAACAAAATTGCTAGACGAATTTTTCAGAGATAGCAGAAAC CATACAAAAGTTCACGTTTTTATTAGAACCCAGTTTATAAGAATATTTGG ACTGAAATTTGGGATAAGTGAGAGTATTATAAGAACATGGTAAGTCTGAG AATTTATAAGAGATTAGCCAAGTTTTCTTGAAACCATTTGAATTAACAAG AAGCTTTTGTAACTGCCGTAACTCTTTTACTTCCCGACTTCAAAATAGAA GATCGACTTAAGGGTCAATTCATATAACCCAAGGTAATTCTGTATATTTC GGTGAATTGATTTTCAAGTATACTAATATTACTGTATTGCATGGATCTAT CCTACTTGTCTAATTTTGGCGAAATGTTTAAGAGTGGAGTTCCATTAATT ATACGATCGACACACGAAACCGTCTTTTCAGCCAAAACAATGTTTGATTG GAATTTCAGCTTCGACTTCAACACACAACACACCGAAACAGACGTTGTAT GTAATCTTCTTTTTAAGCGTGAAACAAACATCATGTGTTCGTTGTTTTCT TTCCGGTCTTAACTGTCTTGGTTGGTTAAAAAGTGCACGCTTTGTTGACA GGTGTGGAAAACCATTTAGTCTTTCTTCCAATTTGCTGCTTCTCACGTAT TCTGGTTGGTTGGATAATTTGATTCTGCTTTGTGATTGGTTTAACATTTC AAAGGTCTTATTCCTGTGTTCATAATTTGAATCATTTCTGTATTTCTTTG ATTTGATTATTCGACTATTGGCCAGTGATAGATGAATGATCACCAAAGTT ACTACTACTGTAACCTTCATAATTTTCAATTTATTTGGTATGAAAACAAA CTTCGCTAATGATGTGTTCCAAATTTAAGCAAAGCAACTTGTATGTTGGA AAATGGAACTCTGTTACGAAAGGGTTTGGAATATCGTGACAGCTTTTATG GGAATTCCCACATGTAGGAAATTCAGGAAAGGGAACAAAATATAATGGAA TTTGGATTTTAATAAATTCTCAGGCTTGAAACTACTTTAATATATTGATC TTAACATCCGTTCAAATTCAAGAATGATATTTAAACTTCTAACTCAATTG CAACACAGCCTATTTAACTTCGATAGTATTATCATCGTTCAATCGCGATC ATTTTACGATTCTTCTTTTGAAAAAGTGATGATTCAAGTGCTCTTATCAT CTTCAGATATCGAGATCGTTACTGGCGTGATCAATATAAAGGCGGCATTC AAGTCATCCAAAAAGTCCTCTCAGAGACTTACAACAACGATGTTTCATTG CTTCAAGCAGCGATGCGCTGGATGGTTCATCATTCACAGCTCAAATATAA CGACGGTGTCATTTTGGGTTTTTCCAAAGAAGAGCATTTGATACCAAATG TGGACGCACTGGATGATGGGCCGTTACACGAGGACGTGGTCAAAGTGTTT GATGAAGCATGGCAGAACATCAAATCTGGTTGTCCATCTTATTACCGTTG ATTGCCAAAATGACGAATGTTCTTTGGTTCGTTTTAAATAATTGACCAAT CCTTAGTCTATTAGATGGTTAACCTTCATCTCGTTTAACCCTTTAAGTGC CAC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:795311..812313-

>MSTRG.1490.4.p1 ID=MSTRG.1490.4.p1|Name=MSTRG.1490.4.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1992bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:795311..812313- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATATCGAGATCGTTACTGGCGTGATCAATATAAAGGCGGCATTCAAGTCA
TCCAAAAAGTCCTCTCAGAGACTTACAACAACGATGTTTCATTGCTTCAA
GCAGCGATGCGCTGGATGGTTCATCATTCACAGCTCAAATATAACGACGG
TGTCATTTTGGGTTTTTCCAAAGAAGAGCATTTGATACCAAATGTGGACG
CACTGGATGATGGGCCGTTACACGAGGACGTGGTCAAAGTGTTTGATGAA
GCATGGCAGAACATCAAATCTGGTTGTCCATCTTATTACCGTTGACTTGC
AGGAGGAATGTTGAGCGGGAAATACAATTTCAATGAGGAAGATACGGATC
AACCCAAAGGAAGATTTTTCGCTACTGGCAAAGCTGATTTGTCAAACCAA
TGGGTGAAAGCAGATATTGAACAAGAACTCATTCCAGCTCTCCGCCGTTT
TGGTATCCGATTCTATGTCTATAATCCGATGTACAATGCTTTGACCAGAT
ATCGAGATCGTTACTGGCGTGATCAATATAAAGGCGGCATTCAAGTCATC
CAAAAAGTCCTCTCAGAGACTTACAACAACGATGTTTCATTGCTTCAAGC
AGCGATGCGCTGGATGGTTCATCATTCACAGCTCAAATATAACGACGGTG
TCATTTTGGGTTTTTCCAAAGAAGAGCATTTGATACCAAATGTGGACGCA
CTGGATGATGGGCCGTTACACGAGGACGTGGTCAAAGTGTTTGATGAAGC
ATGGCAGAACATCAAATCTGGTTGTCCATCTTATTACCGTTGACTTGCAG
GAGGAATGTTGAGCGGGAAATACAATTTCAATGAGGAAGATACGGATCAA
CCCAAAGGAAGATTTTTCGCTACTGGCAAAGCTGATTTGTCAAACCAATG
GGTGAAAGCAGATATTGAACAAGAACTCATTCCAGCTCTCCGCCGTTTTG
GTATCCGATTCTATGTCTATAATCCGATGTACAATGCTTTGACCAGATAT
CGAGATCGTTACTGGCGTGATCAATATAAAGGCGGCATTCAAGTCATCCA
AAAAGTCCTCTCAGAGACTTACAACAACGATGTTTCATTGCTTCAAGCAG
CGATGCGCTGGATGGTTCATCATTCACAGCTCAAATATAACGACGGTGTC
ATTTTGGGTTTTTCCAAAGAAGAGCATTTGATACCAAATGTGGACGCACT
GGATGATGGGCCGTTACACGAGGACGTGGTCAAAGTGTTTGATGAAGCAT
GGCAGAACATCAAATCTGGTTGTCCATCTTATTACCGTTGACTTGCAGGA
GGAATGTTGAGCGGGAAATACAATTTCAATGAGGAAGATACGGATCAACC
CAAAGGAAGATTTTTCGCTACTGGCAAAGCTGATTTGTCAAACCAATGGG
TGAAAGCAGATATTGAACAAGAACTCATTCCAGCTCTCCGCCGTTTTGGT
ATCCGATTCTATGTCTATAATCCGATGTACAATGCTTTGACCAGATATCG
AGATCGTTACTGGCGTGATCAATATAAAGGCGGCATTCAAGTCATCCAAA
AAGTCCTCTCAGAGACTTACAACAACGATGTTTCATTGCTTCAAGCAGCG
ATGCGCTGGATGGTTCATCATTCACAGCTCAAATATAACGACGGTGTCAT
TTTGGGTTTTTCCAAAGAAGAGCATTTGATACCAAATGTGGACGCACTGG
ATGATGGGCCGTTACACGAGGACGTGGTCAAAGTGTTTGATGAAGCATGG
CAGAACATCAAATCTGGTTGTCCATCTTATTACCGTTGACTTGCAGGAGG
AATGTTGAGCGGGAAATACAATTTCAATGAGGAAGATACGGATCAACCCA
AAGGAAGATTTTTCGCTACTGGCAAAGCTGATTTGTCAAACCAATGGGTG
AAAGCAGATATTGAACAAGAACTCATTCCAGCTCTCCGCCGTTTTGGTAT
CCGATTCTATGTCTATAATCCGATGTACAATGCTTTGACCAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1490MSTRG.1490Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1490.4.p1.exon10MSTRG.1490.4.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.4.p1.exon9MSTRG.1490.4.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.4.p1.exon8MSTRG.1490.4.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.4.p1.exon7MSTRG.1490.4.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.4.p1.exon6MSTRG.1490.4.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.4.p1.exon5MSTRG.1490.4.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.4.p1.exon4MSTRG.1490.4.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.4.p1.exon3MSTRG.1490.4.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.4.p1.exon2MSTRG.1490.4.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.4.p1.exon1MSTRG.1490.4.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1490.4.p1MSTRG.1490.4.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:795311..812313 -