MSTRG.1490.2.p2 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.1490.2.p2
Unique NameMSTRG.1490.2.p2
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:790763..821667-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.1490.2.p2 ID=MSTRG.1490.2.p2|Name=MSTRG.1490.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=30905bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:790763..821667- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TCATTGTTGTTGCTCTCTGATTGGGCGAGATCAAAACAAATTTGAAAACA GTTTGATACAGTGATTGAGTGATACTTACAATCTTCTCTATACTTTTAGG GTGTATCTTTATTTTGATGATATCTCATTTTTTGATACAATATAATTCAG ATGAAGAAAATCAATCAAATGACTCTTGTATGTAAAAAGATTTTCTGAAT ATTGGATGGTGGGTTGGGCACATTGAAAATCCCTGCTCTCCCGCAAACAA TTGTTCTAATTCTGATGTTATGGAACAGTGGGATTAACTGGTTTACTAGA AAATCATATACAATTGTATCAGGCTAATAATGCACAAGTCCGACAGAAAC ATAGGCAGAGAAGTTTATGCTCATAGAACTAGTATGCCATCTTCAAGAAA AACTGGTTCTTCTGGACAAAGATCCAGTCATGGATCAAGAGGTTCATCAA GCTCTGGTTCAAATGTTTTGATGGTTGGACCAAATTTTCGAGTGGGTAGA AAAATTGGATGTGGAAATTTTGGTGAATTGAGACTTGGTAAATAGCAATA TCAATTATATTTGAAATACCTTGGTTTGAAAATATTGTTTGTTTTATATT TTGAAGACTAATTAATCTTCATAATTTTAGGTTTCTCAACAGAGCTGATT TTGACAAGTGTACCGGGTGACCCACGAAAAAGTTTGGACGTTTCTCGGCG TCTTGAGGCCGAACAAATGTCCCAAAGTGCTTGGAGTTTTATTATTTAGA AAGTAGATATCCTAACTTAAAATTTGAGCTATCACTTTTTAAATTTGACC GACTAGTTCTCTACTTGTGAGCTTTTAAACTCAAAATTCACTTTTCGGAA AGTGTAAAAAACACGTAAAAAAGAGGTATTAAATTAATGCAATCAATTAG AAAATCTCTTATAAATTGACTTATTTAACGAGTTTTATGACATTAATAAT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:790763..821667-

>MSTRG.1490.2.p2 ID=MSTRG.1490.2.p2|Name=MSTRG.1490.2.p2|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4179bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:790763..821667- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCTCAGGTATCGGTAAAGGGGCAGCAATCTACTTGGCAAAGAATGGTGCA
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GAAGATTATGCAAAGGTTGAAACATTGTAAATGTATCAAGCGTAACTGGC
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TCAAAACTAAAGGTAAACAGCGCGGGTATTGTTGTGAATGGGACAGCAGA
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CGTTCGGTCGGTTTTTCACATTACGAAACTAGCAATACCACACTTGATCA
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AACAAGCCTTCAGGATTACGACATGCAAATGAACATTAACTTGAGGTATT
GACGATCGTTGGTGATTTAAGCAAAGAAGAAGATACAGCAAGAACAATAG
AAGAGACTATCAAACACTTTAACCAATTGGATATCTTGGTGCGAGCTCAG
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TATGCAAAGGTTGAAACATTGTAAATGTATCAAGCGTAACTGGCCTTCGT
TCGGTCGGTTTTTCACATTACGAAACTAGCAATACCACACTTGATCAAAA
CTAAAGGTAAACAGCGCGGGTATTGTTGTGAATGGGACAGCAGAGTCAAC
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TAAGAACAGAGATTCATAAACGAGGCGGTATGTCTGAAGAAGATTATGCA
AAGGTTGAAACATTGTAAATGTATCAAGCGTAACTGGCCTTCGTTCGGTC
GGTTTTTCACATTACGAAACTAGCAATACCACACTTGATCAAAACTAAAG
GTAAACAGCGCGGGTATTGTTGTGAATGGGACAGCAGAGTCAACAAGCCT
TCAGGATTACGACATGCAAATGAACATTAACTTGAGGTATTGACGATCGT
TGGTGATTTAAGCAAAGAAGAAGATACAGCAAGAACAATAGAAGAGACTA
TCAAACACTTTAACCAATTGGATATCTTGGTGCGAGCTCAGGTATCGGTA
AAGGGGCAGCAATCTACTTGGCAAAGAATGGTGCAAAATTAGCAATCACT
GGAAGAAACGAAGAAAATTTGAAGCTTGTGGCGACTCAATGTGAAGATGT
TTGCCCAAATAAAGAAAAGATGTTCTTTG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1490MSTRG.1490Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1490.2.p2MSTRG.1490.2.p2-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.1490.2.p2.exon19MSTRG.1490.2.p2.exon19Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon18MSTRG.1490.2.p2.exon18Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon17MSTRG.1490.2.p2.exon17Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon16MSTRG.1490.2.p2.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon15MSTRG.1490.2.p2.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon14MSTRG.1490.2.p2.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon13MSTRG.1490.2.p2.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon12MSTRG.1490.2.p2.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon11MSTRG.1490.2.p2.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon10MSTRG.1490.2.p2.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon9MSTRG.1490.2.p2.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon8MSTRG.1490.2.p2.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon7MSTRG.1490.2.p2.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon6MSTRG.1490.2.p2.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon5MSTRG.1490.2.p2.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon4MSTRG.1490.2.p2.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon3MSTRG.1490.2.p2.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon2MSTRG.1490.2.p2.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.1490.2.p2.exon1MSTRG.1490.2.p2.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:790763..821667 -