MSTRG.14847.2.p1 (mRNA) -

Overview


Name	MSTRG.14847.2.p1
Unique Name	MSTRG.14847.2.p1
Type	mRNA
Organism	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000126_pilon:562632..647385+
coding sequence from alignment at sc0000126_pilon:562632..647385+

mRNA from alignment at sc0000126_pilon:562632..647385+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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>MSTRG.14847.2.p1 ID=MSTRG.14847.2.p1|Name=MSTRG.14847.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=84754bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:562632..647385+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GCGTCGAACAGTGTAGCGCGCGTGCGGCCCAGAACATCTAAGGGCATCAC
AGACCTGTTATTGCCTTCCTGACTTTGGTTGAACACCAACAGTCCCTCTA
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TTATTTTACTCACGACCAGTCCAGATCAAGGGCTTATCGATGGGGTGAAG
ACGGTCTTCTTGGATTCTGTGATCGACAATGTCgtctatgttttggattg
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TGTTACCTTATTATGACCTTActtcaaatgtttttataagaacaaactat
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GATTGACCTTCATTTCTTTTATCATTGGAAATACAAAGCCCCTTAGCTTA
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AATCTTTAAAGGCTGACAATTTTGCTAAAACCTTCAAGGAAGTTTAACAC
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GGCGTCGAACATCCTGAATATGAGCTTCTTGATACAGGTACACAGTGTTT
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GAGAATTTATATCTCTTGGTCGCGAAATTCGCaagttttaaatcttaaaa
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CCCCTCTATTTAAACCTAGTTCAAAACATTTTGGTACCGAGGATTGAATG
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CCTCTGGAGATGTTTCGTGTTCTAATCATTACAGTATATTAAAAGTATCA
CCCAATGCTAGTCAAAAGCAAATCAAAGCAGCTTACTACAAACAATCATT
AGTCTTGCATCCTGATCGAAATTTGGATTCTGAAAATACTTCCGACACAC
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ataaaactttgttgtCTACTTCATGctgaaattttaactttttgacataG
AAATTGTGGAAATTCttcggttgaaaatattttagctCTAATTCAGAAAA
CGGG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000126_pilon:562632..647385+

>MSTRG.14847.2.p1 ID=MSTRG.14847.2.p1|Name=MSTRG.14847.2.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=594bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:562632..647385+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAATTTTTATGGTGTTGTAGATCTAATCAACGATTACTTTGGAGCTT
ATCAGCAAGACGACAATTATCCTCTGGAGATGTTTCGTGTTCTAATCATT
ACAGTATATTAAAAGTATCACCCAATGCTAGTCAAAAGCAAATCAAAGCA
GCTTACTACAAACAATCATTAGTCTTGCATCCTGATCGAAATTTGGATTC
TGAAAATACTTCCGACACACATGCCAAATTTTCAGAATTGAACGAAGCTT
ATAAAATTTTAGGCAATAATAAATGGCGGAAAGAGTACGATCAAAAACTC
AAGATACACAATCATTATAAGAAccaaaaaagtgttttcaatTCTGATGT
TATCGAAAAGGATAGTGTCAGAGGTTCTATACAACAACGAAGTCAGCAAT
TTGACACCTGGACAAAATCACACTATCAAGGCTCTttacaaaaaagaaac
catCGACAAAATAAAGATTCTTTGAGACAAAATATATCAAGGgaagaatc
aaagcaacaaTCGTTGAGAGTAACCATTGTTTTATCAGTGGCTTTAATGG
CTTTTGTGTTGGTGTTCTTTCCTCCGAAAAAGAAGGACAAGTGA

Gene-mRNA-Prot

This mRNA is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.14847	MSTRG.14847	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.14847.2.p1	MSTRG.14847.2.p1-protein	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this mRNA:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
MSTRG.14847.2.p1.exon1	MSTRG.14847.2.p1.exon1	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon
MSTRG.14847.2.p1.exon2	MSTRG.14847.2.p1.exon2	Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000126_pilon	genome	sc0000126_pilon:562632..647385 +

You are here

MSTRG.14847.2.p1 (mRNA) -