MSTRG.14847.1.p1 (mRNA) -

Overview
NameMSTRG.14847.1.p1
Unique NameMSTRG.14847.1.p1
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000126_pilon:562615..591399+

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>MSTRG.14847.1.p1 ID=MSTRG.14847.1.p1|Name=MSTRG.14847.1.p1|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=28785bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:562615..591399+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
cagataaaaaacagataaaaaaattcactccattaagaattagtgaataa ggctGATCTATGTGGAAGAGAAgcctttctttttttcaggaaaagcaaga aaaaaagaaaaacaaagaaaaagaactaATGAAATGTACGGCAAATGCTG CTATGTCGGTTAAGGACCAGCACTACCCACTTAATTATTAAGTCAGTCAg tagggaaatccctcaattgcggtataccGCAATTGCGGTAGTGGAATTTT CATCGGGGAATCATTTTACCGCAATTGCGGTATCTATTTTCCATTTCAAA TAAGTACCGCAATTGCGGTATAACGAACTtttcatataccgcaattgcgG TAAAATAAATACTTAAAACTTGTTATAATACATCAGAACACTTCATTTCC ATCATAATAACATAACAATGAAGCGGAGAAGTTGTGCATCAGAAAGTGAC TTTTCAAAAGTGTGTAAGTGTATTGTTCACGACAAAACGGTATCATCAGA AAAGGCATGGCATATTGAGACCTCGCGAGTGTTCCGGCCCGTCATTATAG ACGagttgaaaaaacaaaacctgCTACCAGAGAGGGCAAATTTCTTGTGC GCTACATGTTACGGGCGATACGGCAAACGACTTTGCCCTATATCCTCTGC GTTCACCCGAACAGACAAGTCCGTCGAACCAATTTCATCCCACCAATAAA CCCACCCACTGAACAAGCGTTGAATTCGACTTCACCAACAGTCCAACCTA TCGAAACCCCAGATGGTTCATACCCAATTAGttcctcaaatttttcaatt cgtgatGCACTTTTGCAAAtgatcaatgttttgatgaaTCACTCGTCAGA CAACCTCTTGGAAGGAAACGAATCTCTCTGGTCGTCGTTACTATATCTTT TGGGAAATAAGATTCTCAATAAAGCAATATACGAAGACGGTATGTTAATA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000126_pilon:562615..591399+

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CAACAAGCTACCTGGATTCAAGAAACGATTGGATTGGTTCTTAAAGAAca
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TATTTGTTGTCCATTGCTGGTCCCAAACATTTTGAACGAATCAGTAAATA
CATGTTCGATGAAGAAGAATTCTTATCGGAATACGGAATCAGATCATTAT
CACGTTACCATAAAGAGCATCCATTCGAAATGTGTTTGGATGGACAGACG
TATCGTGTTCCATACACGTCAGGCGAATCCAAAAGTAACTTGTTTGGTGG
AAACAGTAATTGGAGAGGACCTATCTGGTTCCCCGTGAACTATGTGATTA
TGAAAGCATTAGAGAgatatgatttcttttatgGTGATTCGTTGAAAGTG
GAATTTCCAACAGGCTCAGGGAACTACATGCGTTTGAAGGACACCTCTGT
TGAAATTGCGTCTCGCTTATCCAAACTGTTCTTGCCAGATGGTGAAGGGA
AACGACCTTGTCATGGCAACGATGAAATTTATTGGAAGAACGAACATTGG
AAAGATGAGATActgttttatgagtttttcgATGGGTGCACAGGACGTGG
TTGTGGTGCAAGtcaTCAGACAGGATGGACAGCTCTGGTCACTGATTGTT
TACAACAAGTTGCACGTGCAAGGGCCAGCAAAGATGCCGAGACTTCTTAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14847MSTRG.14847Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilongene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14847.1.p1MSTRG.14847.1.p1-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
MSTRG.14847.1.p1.exon1MSTRG.14847.1.p1.exon1Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon2MSTRG.14847.1.p1.exon2Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon3MSTRG.14847.1.p1.exon3Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon4MSTRG.14847.1.p1.exon4Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon5MSTRG.14847.1.p1.exon5Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon6MSTRG.14847.1.p1.exon6Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon7MSTRG.14847.1.p1.exon7Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon8MSTRG.14847.1.p1.exon8Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon9MSTRG.14847.1.p1.exon9Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon10MSTRG.14847.1.p1.exon10Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon11MSTRG.14847.1.p1.exon11Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon12MSTRG.14847.1.p1.exon12Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon13MSTRG.14847.1.p1.exon13Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon14MSTRG.14847.1.p1.exon14Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon15MSTRG.14847.1.p1.exon15Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
MSTRG.14847.1.p1.exon16MSTRG.14847.1.p1.exon16Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000126_pilongenomesc0000126_pilon:562615..591399 +